Name: דגימה סביבתית של מיקרובים פוטוסינתטיים ווירוסיהם: מהשדה למעבדה (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-07-03T14:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 1 s
Description: למד שיטות לדגימה סביבתית של ציאנופאג'ים ומארחיהם במערכות מימיות באמצעות ריצוף מתקדם ומיקרוסקופיה אלקטרונית. השיטות מאפשרות בידוד גנוטיפים יחידים ומידול דינמיקת וירוס-מארח.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Zhang, D., You, F., He, Y., Te, S. H., Gin, K. Y. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+characterization+of+the+first+freshwater+cyanophage+infecting+Pseudanabaena%5BTitle%5D)+AND+%22J+Virol%22%5BJournal%5D)">Isolation and characterization of the first freshwater cyanophage infecting Pseudanabaena.</a> J Virol. 94 (17), 10-1128 (2020).</li>
<li>Dong, Z. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDong%2C+Z+%22Isolation%2C+Characterization+and+Ecological+Dynamics+of+Tropical+Freshwater+Cyanophages%22">Isolation, Characterization and Ecological Dynamics of Tropical Freshwater Cyanophages</a>. , National University of Singapore. Doctoral dissertation (2022).</li>
<li>Sime-Ngando, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Environmental+bacteriophages%3A+viruses+of+microbes+in+aquatic+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Environmental bacteriophages: viruses of microbes in aquatic ecosystems.</a> Front Microbiol. 5, 355(2014).</li>
<li>Sigee, D. C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSigee%2C+DC+%22Freshwater+microbiology%3A+biodiversity+and+dynamic+interactions+of+microorganisms+in+the+aquatic+environment%22">Freshwater microbiology: biodiversity and dynamic interactions of microorganisms in the aquatic environment</a>. , John Wiley & Sons. (2005).</li>
<li>Jacquet, S., Miki, T., Noble, R., Peduzzi, P., Wilhelm, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Viruses+in+aquatic+ecosystems%3A+important+advancements+of+the+last+20+years+and+prospects+for+the+future+in+the+field+of+microbial+oceanography+and+limnology%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Oceanography+Limnol%22%5BJournal%5D)">Viruses in aquatic ecosystems: important advancements of the last 20 years and prospects for the future in the field of microbial oceanography and limnology.</a> Adv Oceanography Limnol. 1 (1), 97-141 (2010).</li>
<li>Tucker, S., Pollard, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+cyanophage+Ma-LBP+and+infection+of+the+cyanobacterium+Microcystis+aeruginosa+from+an+Australian+subtropical+lake+by+the+virus%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Identification of cyanophage Ma-LBP and infection of the cyanobacterium Microcystis aeruginosa from an Australian subtropical lake by the virus.</a> Appl Environ Microbiol. 71 (2), 629-635 (2005).</li>
<li>Bhardwaj, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cyanobacteria%3A+a+key+player+in+nutrient+cycling%5BTitle%5D)+AND+%22Cyanobacteria%22%5BJournal%5D)">Cyanobacteria: a key player in nutrient cycling.</a> Cyanobacteria. , 579-596 (2024).</li>
<li>Douterelo, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methodological+approaches+for+studying+the+microbial+ecology+of+drinking+water+distribution+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Res%22%5BJournal%5D)">Methodological approaches for studying the microbial ecology of drinking water distribution systems.</a> Water Res. 65, 134-156 (2014).</li>
<li>Brandt, J. P., Flannigan, M. D., Maynard, D. G., Thompson, I. D., Volney, W. J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+introduction+to+Canada%27s+boreal+zone%3A+ecosystem+processes%2C+health%2C+sustainability%2C+and+environmental+issues%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Rev%22%5BJournal%5D)">An introduction to Canada's boreal zone: ecosystem processes, health, sustainability, and environmental issues.</a> Environ Rev. 21 (4), 207-226 (2013).</li>
<li>Ramanan, R., Kim, B. H., Cho, D. H., Oh, H. M., Kim, H. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Algae-bacteria+interactions%3A+evolution%2C+ecology+and+emerging+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnol+Adv%22%5BJournal%5D)">Algae-bacteria interactions: evolution, ecology and emerging applications.</a> Biotechnol Adv. 34 (1), 14-29 (2016).</li>
<li>Atkinson, C. L., Capps, K. A., Rugenski, A. T., Vanni, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Consumer-driven+nutrient+dynamics+in+freshwater+ecosystems%3A+From+individuals+to+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Rev%22%5BJournal%5D)">Consumer-driven nutrient dynamics in freshwater ecosystems: From individuals to ecosystems.</a> Biol Rev. 92 (4), 2003-2023 (2017).</li>
<li>Mojica, K. D., Brussaard, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Factors+affecting+virus+dynamics+and+microbial+host-virus+interactions+in+marine+environments%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Factors affecting virus dynamics and microbial host-virus interactions in marine environments.</a> FEMS Microbiol Ecol. 89 (3), 495-515 (2014).</li>
<li>Graham, E. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbes+as+engines+of+ecosystem+function%3A+when+does+community+structure+enhance+predictions+of+ecosystem+processes%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microbes as engines of ecosystem function: when does community structure enhance predictions of ecosystem processes.</a> Front Microbiol. 7, 214(2016).</li>
<li>Ceballos, R. M., Stacy, C. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantifying+relative+virulence%3A+when+%C2%B5+max+fails+and+AUC+alone+just+is+not+enough%5BTitle%5D)+AND+%22J+General+Virol%22%5BJournal%5D)">Quantifying relative virulence: when µ max fails and AUC alone just is not enough.</a> J General Virol. 102 (1), 001515(2021).</li>
<li>Hour, S., Pierce, A. J., Heng, S. Y., Plymale, R., Ceballos, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantifying+Resilience+in+Single-Host%2FSingle-Virus+Infections%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Quantifying Resilience in Single-Host/Single-Virus Infections.</a> Appl Microbiol. 5 (1), 18(2025).</li>
<li>Ceballos, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+virus+host-ranges+of+the+Fuselloviridae+of+hyperthermophilic+Archaea%3A+implications+for+evolution+in+extreme+environments%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Differential virus host-ranges of the Fuselloviridae of hyperthermophilic Archaea: implications for evolution in extreme environments.</a> Front Microbiol. 3, 295(2012).</li>
<li>Ceballos, R. M., Drummond, C. G., Stacy, C. L., Padilla-Crespo, E., Stedman, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Host-dependent+differences+in+replication+strategy+of+the+Sulfolobus+spindle-shaped+virus+strain+SSV9+%28aka%2C+SSVK1%29%3A+infection+profiles+in+hosts+of+the+family+Sulfolobaceae%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Host-dependent differences in replication strategy of the Sulfolobus spindle-shaped virus strain SSV9 (aka, SSVK1): infection profiles in hosts of the family Sulfolobaceae.</a> Front Microbiol. 11, 1218(2020).</li>
<li>Rippka, R., Deruelles, J., Waterbury, J. B., Herdman, M., Stanier, R. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generic+assignments%2C+strain+histories+and+properties+of+pure+cultures+of+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Generic assignments, strain histories and properties of pure cultures of cyanobacteria.</a> Microbiology. 111 (1), 1-61 (1979).</li>
<li>Kliphuis, A. M., Janssen, M., van den End, E. J., Martens, D. E., Wijffels, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Light+respiration+in+Chlorella+sorokiniana%5BTitle%5D)+AND+%22J+Appl+Phycol%22%5BJournal%5D)">Light respiration in Chlorella sorokiniana.</a> J Appl Phycol. 23, 935-947 (2011).</li>
<li>Lea-Smith, D. J., Vasudevan, R., Howe, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+marked+and+markerless+mutants+in+model+cyanobacterial+species%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Generation of marked and markerless mutants in model cyanobacterial species.</a> J Vis Exp. (111), e54001(2016).</li>
<li>Noroozi, M., Amozegar, M. A., Rahimi, R., Shahzadeh Fazeli, S. A., Bakhshi Khaniki, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+isolation+and+preliminary+characterization+of+native+cyanobacterial+and+microalgal+strains+from+lagoons+contaminated+with+petroleum+oil+in+Khark+Island%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+J+Microorg%22%5BJournal%5D)">The isolation and preliminary characterization of native cyanobacterial and microalgal strains from lagoons contaminated with petroleum oil in Khark Island.</a> Biol J Microorg. 5 (20), 33-41 (2017).</li>
<li>Nübel, U., Garcia-Pichel, F., Muyzer, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PCR+primers+to+amplify+16S+rRNA+genes+from+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">PCR primers to amplify 16S rRNA genes from cyanobacteria.</a> Appl Environ Microbiol. 63 (8), 3327-3332 (1997).</li>
<li>Tragin, M., Lopes dos Santos, A., Christen, R., Vaulot, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diversity+and+ecology+of+green+microalgae+in+marine+systems%3A+an+overview+based+on+18S+rRNA+gene+sequences%5BTitle%5D)+AND+%22Perspect.+Phycol%22%5BJournal%5D)">Diversity and ecology of green microalgae in marine systems: an overview based on 18S rRNA gene sequences.</a> Perspect. Phycol. 3 (3), 141-154 (2016).</li>
<li>Uchida, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+coupled+assay+system+for+the+lysis+of+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Japanese+J+Water+Treatment+Biol%22%5BJournal%5D)">A coupled assay system for the lysis of cyanobacteria.</a> Japanese J Water Treatment Biol. 34 (1), 67-75 (1998).</li>
<li>Drummond, C. Characterization of Sulfolobus. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDrummond%2C+C+%22Spindle-shaped+Virus+replication%22">Spindle-shaped Virus replication</a>. , Portland State University. (2010).</li>
<li>Flores, E., Wolk, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Production%2C+by+filamentous%2C+nitrogen-fixing+cyanobacteria%2C+of+a+bacteriocin+and+of+other+antibiotics+that+kill+related+strains%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Production, by filamentous, nitrogen-fixing cyanobacteria, of a bacteriocin and of other antibiotics that kill related strains.</a> Arch Microbiol. 145, 215-219 (1986).</li>
<li>Wick, C., McCubbin, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+purified+MS2+bacteriophage+by+the+physical+counting+methodology+used+in+the+integrated+virus+detection+system+%28IVDS%29%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Methods%22%5BJournal%5D)">Characterization of purified MS2 bacteriophage by the physical counting methodology used in the integrated virus detection system (IVDS).</a> Toxicol Methods. 9 (4), 245-252 (1999).</li>
<li>Marei, E. M., Elbaz, R., Hammad, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Induction+of+temperate+cyanophages+using+heavy+metal-copper%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Microbiol+Res+Rev%22%5BJournal%5D)">Induction of temperate cyanophages using heavy metal-copper.</a> Int J Microbiol Res Rev. 5 (5), 472(2013).</li>
<li>Bratchkova, A., Kroumov, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microalgae+as+producers+of+biologically+active+compounds+with+antibacterial%2C+antiviral%2C+antifungal%2C+antialgal%2C+antiprotozoal%2C+antiparasitic+and+anticancer+activity%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Microbiol+Bulgarica%22%5BJournal%5D)">Microalgae as producers of biologically active compounds with antibacterial, antiviral, antifungal, antialgal, antiprotozoal, antiparasitic and anticancer activity.</a> Acta Microbiol Bulgarica. 36 (3), 79-89 (2020).</li>
<li>Storms, Z. J., Teel, M. R., Mercurio, K., Sauvageau, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+virulence+index%3A+a+metric+for+quantitative+analysis+of+phage+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Phage%22%5BJournal%5D)">The virulence index: a metric for quantitative analysis of phage virulence.</a> Phage. 1 (1), 27-36 (2020).</li>
<li>Omata, T., Murata, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+characterization+of+three+types+of+membranes+from+the+cyanobacterium+%28blue-green+alga%29+Synechocystis+PCC+6714%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Isolation and characterization of three types of membranes from the cyanobacterium (blue-green alga) Synechocystis PCC 6714.</a> Arch Microbiol. 139, 113-116 (1984).</li>
<li>Wilson, W. H., Joint, I. R., Carr, N. G., Mann, N. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+molecular+characterization+of+five+marine+cyanophages+propagated+on+Synechococcus+sp.+strain+WH7803%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Isolation and molecular characterization of five marine cyanophages propagated on Synechococcus sp. strain WH7803.</a> Appl Environ Microbiol. 59 (11), 3736-3743 (1993).</li>
<li>Grasso, C. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+of+cyanophage-host+relationships%3A+Highlighting+cyanophages+as+a+potential+cyanobacteria+control+strategy%5BTitle%5D)+AND+%22Toxins%22%5BJournal%5D)">A review of cyanophage-host relationships: Highlighting cyanophages as a potential cyanobacteria control strategy.</a> Toxins. 14 (6), 385(2022).</li>
<li>Srivastava, A., Gupta, N., Mishra, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cyanophages%3A+interacting+mechanism+and+evolutionary+significance%5BTitle%5D)+AND+%22Cyanobacteria%22%5BJournal%5D)">Cyanophages: interacting mechanism and evolutionary significance.</a> Cyanobacteria. , 255-282 (2024).</li>
<li>Cai, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Abundant+and+cosmopolitan+lineage+of+cyanopodoviruses+lacking+a+DNA+polymerase+gene%5BTitle%5D)+AND+%22ISME+J%22%5BJournal%5D)">Abundant and cosmopolitan lineage of cyanopodoviruses lacking a DNA polymerase gene.</a> ISME J. 17 (2), 252-262 (2023).</li>
<li>Komárek, J., Kaštovský, J., Mareš, J., Johansen, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Taxonomic+classification+of+cyanoprokaryotes+%28cyanobacterial+genera%29+2014%2C+using+a+polyphasic+approach%5BTitle%5D)+AND+%22Preslia%22%5BJournal%5D)">Taxonomic classification of cyanoprokaryotes (cyanobacterial genera) 2014, using a polyphasic approach.</a> Preslia. 86 (4), 295-335 (2014).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1 משאבת העברה מפלדת אל-חלד של HP&nbsp;</td><td>Utilitech, שארלוט, קרוליינה הצפונית, ארה"ב</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>צינורות 1.5 מ"ל</td><td>www.eppendorf.com</td><td>30123611</td><td></td></tr><tr><td>10K NMWL Centricon Plus 70 רכז סיבוב&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>UFC701008</td><td></td></tr><tr><td>250 מ"ל צלוחיות Erlenmeyer מבולבלות&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>CLS4450250</td><td></td></tr><tr><td>מחולל אינוורטר 3800 וואט&nbsp;</td><td>WEN Products, ווסט דנדי, אילינוי, ארה"ב</td><td>WEN 56380i</td><td></td></tr><tr><td>3K NMWL Amicon 15 מ"ל&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>UFC800308</td><td></td></tr><tr><td>500 מ"ל צלוחיות Erlenmeyer מבולבלות&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>CLS4450500</td><td></td></tr><tr><td>קנקני מים בנפח 5 ליטר&nbsp;</td><td>www.homedepot.com</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>אורך 80 רגל, 0.5 אינץ' קוטר, ניילון&nbsp;</td><td>https://facomex.mx/producto/combo/</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>קונסולה מרכזית בעומק V 26 רגל Sailfish 2660 עם שני מנועים חיצוניים של ימאהה 150 כ"ס&nbsp;</td><td>https://yamahaoutboards.com/</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>אמוניום אצטט (CH3CO2NH4)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>631618</td><td></td></tr><tr><td>חומצה בורית (H3BO3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10043353</td><td></td></tr><tr><td>סידן כלוריד דיהידראט (CaCl2. 2H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10035048</td><td></td></tr><tr><td>צנטריפוגה 5920&nbsp; R</td><td>www.eppendorf.com</td><td>5948000107</td><td></td></tr><tr><td>חומצת לימון (C6H8O7)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>77929</td><td></td></tr><tr><td>קובלט (II) ניטראט הקסהידרט [Co(NO3)2.6H2O]</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10026229</td><td></td></tr><tr><td>צינור גמיש מגומי עמיד בפני התמוטטות&nbsp;</td><td>swanhose.com</td><td>CELTF58050</td><td></td></tr><tr><td>נחושת (II) סולפט פנטהידראט (CuSO4.5H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7758998</td><td></td></tr><tr><td>צינורות צנטריפוגה קורנינג 50 מ"ל&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>CLS430291</td><td></td></tr><tr><td>דיפוטסיום פוספט (K2HPO4)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7758114</td><td></td></tr><tr><td>דיסודיום אתילנדיאמין-חומצה טראצטית (Na2EDTA)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>6381926</td><td></td></tr><tr><td>DS-11 FX+_Microvolume וספקטרופוטומטר ופלורומטר</td><td>www.denovix.com</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>סרט דביק&nbsp;</td><td>www.homedepot.com</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>צינורות אפנדורף</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>EP022364120</td><td></td></tr><tr><td>אתנול</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>64175</td><td></td></tr><tr><td>חומצה אתילנדיאמינטטראצטית (EDTA)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>60004</td><td></td></tr><tr><td>אמוניום ציטראט ברזלי (C6H8O7&middot; xFe3+&middot; yNH<תת>3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>1185575</td><td></td></tr><tr><td>צינורות PVC כחולים גמישים פלוס&nbsp;</td><td>www.carlonsales.com</td><td>12008-750</td><td></td></tr><tr><td>Innova S44i - שייקר אינקובטור הניתן לגיבוב</td><td>www.eppendorf.com</td><td>2231001081</td><td></td></tr><tr><td>LVEM5 מיקרוסקופ אלקטרונים Microscope_Transmission אלקטרונים שולחניים (TEM)</td><td>delongamerica.com</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>מגנזיום גופרתי הפטהידרט (MgSO4.7 H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10034998</td><td></td></tr><tr><td>מנגן (II) כלוריד טטרהידרט (MnCl2.4H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>13446349</td><td></td></tr><tr><td>עוגן פטריות שחור מצופה ויניל/30 פאונד</td><td>www.homedepot.com</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>צלחות פטרי, פוליסטירן</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>עמ' 5481</td><td></td></tr><tr><td>מסנן ממברנה Polyethersulfone (PES) עם 0.22 מ"מ</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>Z358193-1CS</td><td></td></tr><tr><td>מסנן ממברנה Polyethersulfone (PES) עם 0.45 מ"מ</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>Z370622-1CS</td><td></td></tr><tr><td>אשלגן אתיל קסנטוגנאט (C2H5OCSSK)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>140896</td><td></td></tr><tr><td>נתרן פחמתי (Na2CO3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>497198</td><td></td></tr><tr><td>נתרן דודציל סולפט [CH3(CH2)11OSO3Na]</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>151213</td><td></td></tr><tr><td>נתרן מוליבדט דיהידראט (Na2MoO4.2H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10102406</td><td></td></tr><tr><td>נתרן חנקתי (NaNO3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7631994</td><td></td></tr><tr><td>טריס(הידרוקסימתיל)מתיל]-2-אמינואתן-סולפוניק אצי (TES) (C6H15NO6S)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7365448</td><td></td></tr><tr><td>טריטון X-100&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>T8787</td><td></td></tr><tr><td>טריזמה הידרוכלוריד (Tris-HCl)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>1185531</td><td></td></tr><tr><td>משאבת ואקום/לחץ&nbsp;</td><td>קול-פארמר; ורנון הילס, אילינוי, ארה"ב</td><td>EW-79204-00</td><td></td></tr><tr><td>צינורות ויניל&nbsp;</td><td>www.homedepot.com</td><td>לא ישים</td><td></td></tr><tr><td>אבץ גופרתי הפטהידראט (ZnSO4.7H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7446200</td><td></td></tr></tbody></table>

דגימה סביבתית של מיקרובים פוטוסינתטיים ווירוסיהם: מהשדה למעבדה

Environmental Sampling of Photosynthetic Microbes and Their Viruses: From Field to Lab

Environmental sampling of photosynthetic microorganisms and their viruses plays a critical role in understanding contemporary marine and freshwater ...

environmental-sampling-photosynthetic-microbes-their-viruses-from

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

שיעור התחלופה של וירוסים במערכות ימיים מים מתוקים ניתן לאמוד על ידי ירידה וטכניקה הישנותם. הנתונים לאפשר לחוקרים להסיק ששיעורי התמותה וירוס בתיווך של חיידקים במערכות מים.

הערכת הפקה חליפין וירוס במערכות Aquatic

כאן, אנו מציגים פרוטוקול מקיף להערכת זמינות החומרים המזינים האורגניים והאנאורגניים ואת השפע והמבנה של קהילות מיקרוביאליות וויראליות בסביבות ימיות מרוחקות.

להתיר את השחקנים הנעלמת באוקיינוס ​​- מדריך שדה לכימיה מים והימי מיקרוביולוגיה

כאן, אנו מציגים גישות פנומיות לאפיון פונקציונלי של גנים משוערים של פאג'ים. הטכניקות כוללות בדיקה מפותחת המסוגלת לנטר את חילוף החומרים האנאבולי של המארח, לוחות הבדיקה הרב-פנוטיפיים (MAPs), בנוסף לשיטה המבוססת של מטבולומיקה, המסוגלת למדוד השפעות על חילוף החומרים הקטבולי .

Phenomics הפאג: גישות פיזיולוגיות לאפיין חלבונים חדשים ויראלי

הבנת ההרכב הביולוגי של חלקיקי סביבתי חשוב לחקר שלה השפעות משמעותיות על בריאות האדם ואת התפשטות המחלה. . היינו שלושה סוגים של שיטות דגימה bioaerosol, ניתוח הביולוגי של חיידקים באוויר כדאי לחקור את קהילות חיידקים באוויר בתנאים סביבתיים שונים.

הלחנה וניתוח הפצה Bioaerosols בתנאים סביבתיים שונים

פרויקט מדעי אזרחי תוכנן לגייס את תושבי סן דייגו לאסוף דגימות סביבתיות עבור SARS-CoV-2. פלטפורמה רב-לשונית מבוססת אינטרנט נוצרה לשליחת נתונים באמצעות ממשק מכשיר נייד ידידותי למשתמש. מערכת ניהול מידע במעבדה אפשרה איסוף של אלפי דגימות מגוונות גיאוגרפית עם מעקב אחר תוצאות בזמן אמת.

סניקה של הסביבה העירונית - צינור לדגימה וזיהוי של SARS-CoV-2 ממאגרים סביבתיים

פרסום זה מתאר את התכנון של פוטו-ביוריאקטורים מעבדתיים (PBRs) עם משטרי אור הניתנים להתאמה אישית. הצמיחה של ציאנובקטריה או מיקרו-אצות, תוך שימוש בביקרבונט כמקור הפחמן שלהם, מנוטרת באופן רציף על ידי מדידת ייצור חמצן נפחי. PBRs אלה מאפשרים השוואות מהירות ומשוכפלות של צמיחת מעבדה עם התערבות מועטה של משתמשים במהלך ניסויים.

הפעלת פוטו-ביוריאקטורים מעבדתיים עם מדידות צמיחה מקוונות ומשטרי אור הניתנים להתאמה אישית

ריכוז הנגיף מדגימות מים ושפכים סביבתיים הוא משימה מאתגרת, המתבצעת בעיקר לזיהוי וכימות נגיפים. בעוד מספר שיטות ריכוז וירוסים פותחו ונבדקו, אנו מדגימים כאן את היעילות של ultrafiltration ו flocculation חלב דל שומן עבור וירוסים RNA עם סוגי דגימה שונים.

ריכוז חלקיקי הנגיף מדגימות מים ושפכים סביבתיים באמצעות חלב דל שומן ואולטרה-סינון

צורות אמינות ומדויקות של ניתוח DNA שניתן לפרוס בשטח הן קריטיות לתעשיות רבות. מאמר זה מציע שתי שיטות לניתוח מיקרוביאלי סביבתי בשטח: 1) בידוד DNA מיקרוביאלי מדגימות סביבתיות באמצעות ערכת שדה חילוץ ביולוגית, ו-2) ניתוח DNA באמצעות יחידת qPCR בשטח.

ניתוח DNA מיקרוביאלי בשטח באמצעות ערכת שדה חילוץ ביולוגית ויחידת qPCR שדה

וידאו זה מדגים את הטכניקה להפקת DNA של זנים של חיידקים במעי האחורי תושב טרמיטים. ההכנה של שקופית הר רטוב, אשר הוא שימושי עבור לדמיין את הקהילה חיידקים במעיים מודגם גם, סיור דרך הסביבה, מינים עשיר הבטן הוא נתון.

חילוץ ה-DNA של חיידקים במעיים של טרמיטים (Zootermopsis Angusticollis) באופן חזותי חיידקים גוט

סרט הווידאו הזה מתעד שיטות לאיסוף דגימות מים חוף הים ועיבוד אותם במורד הזרם עבור יישומים שונים, כולל ריכוז ביומסה, טיהור חומצות גרעין, שפע תאים, מזין ומנתח גז עקבות.

מי ים דגימה אוסף

למד שיטות לדגימה סביבתית של ציאנופאג'ים ומארחיהם במערכות מימיות באמצעות ריצוף מתקדם ומיקרוסקופיה אלקטרונית. השיטות מאפשרות בידוד גנוטיפים יחידים ומידול דינמיקת וירוס-מארח.

דגימה סביבתית של מיקרובים פוטוסינתטיים ווירוסיהם: מהשדה למעבדה

גלה סרטונים נוספים