פרופיל מרחבי מקיף של טרנסקריפטומים אגנוסטיים למינים באמצעות סטריאו-רצף
1.4K צפיות
•
10:22 דק׳
•
31 באוקטובר 2025
DOI :10.3791/68619-v
31 באוקטובר 2025
•1.4K צפיות
Anna K. Casasent*1 , Danielle L. Stolley*1 , Basant T. Gamal*2 , Arnold Dahay2 , Samuel Mok2 , Lidia Rocha3 , Vincent Li3 , Arizona T. Nguyen3 , Boyu Zhang4 , Clay T. Brasuell4 , Erika J. Thompson4 , Thomas Huynh3 , Jared K. Burks1 , Sammy Ferri-Borgogno2
1Department of Hematopoietic Biology and Malignancies, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, 2Department of Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, 3Department of Veterinary Medicine & Surgery, University of Texas MD Anderson Cancer Center, 4Department of Genetics, The University of Texas MD Anderson Cancer Center
* These authors contributed equally
מאמר זה מציג פרוטוקול לביצוע פרופיל טרנסקריפטומי מרחבי מקיף של RNA מארח, ויראלי, פטרייתי ומיקרוביום מקטעי רקמה משובצים בפרפין קבוע פורמלין באמצעות Stereo-seq, המאפשר מיפוי ברזולוציה גבוהה של טרנסקריפטומים מגוונים תוך שמירה על ארכיטקטורת רקמות.
Chapters in this video
0:00
Introduction
0:58
Stereo-Seq Random Oligonucleotide Capture Chip (N-Chip) Preparation
3:06
Nuclear Imaging and ssDNA Staining of the FFPE Tissue Sections
5:08
Decrosslinking Process of the Stained FFPE Sections
7:43
Collection of the cDNA Release Mix
8:56
Results
9:36
Conclusion
Related Videos
זכויות יוצרים © 2026 MyJoVE Corporation. כל הזכויות שמורות.