Riparazione per escissione di nucleotidi

La riparazione per escissione nucleotidica, o NER, risolve le lesioni ingombranti del DNA causate dalle radiazioni UV e dagli agenti chimici cancerogeni.

Queste lesioni voluminose, come i dimeri pirimidinici, distorcono l'elica del DNA e interferiscono con la replicazione e la trascrizione del DNA.

In E. coli, le proteine di riparazione UvrA e UvrB formano un complesso che scansiona il DNA genomico alla ricerca di lesioni strutturali.

Una volta che incontra una lesione, l'UvrA si dissocia, facendo sì che l'UvrB si leghi strettamente al DNA distorto.

L'UvrB legato al DNA recluta quindi UvrC, un'endonucleasi, che esegue un'incisione su entrambi i lati della lesione.

Successivamente, l'elicasi UvrD svolge il DNA e asporta il frammento che trasporta la lesione.

Dopo l'escissione, la DNA polimerasi riempie il divario con nuovi nucleotidi complementari e l'enzima DNA ligasi sigilla il divario tra il nuovo e il vecchio DNA, completando la riparazione.

In alternativa, se una RNA polimerasi trascritto attivamente incontra la lesione voluminosa, può reclutare direttamente l'UvrB nel sito della lesione.

Questo avvia la riparazione dell'escissione nucleotidica accoppiata alla trascrizione che procede allo stesso modo del normale NER per completare la riparazione e continuare la trascrizione.