Proteomica

La proteomica può essere definita come lo studio sistematico su larga scala del proteoma, l'insieme completo di proteine espresse da un organello, una cellula, un tessuto o un organismo in un determinato momento.

A seconda del tipo di studio, l'approccio proteomico top-down che analizza le proteine intatte dai sistemi biologici, o l'approccio bottom-up che studia le proteine analizzando i frammenti peptidici, potrebbero essere utilizzati per ottenere informazioni sul set di proteine bersaglio.

In un flusso di lavoro tipico, i campioni di proteine vengono raccolti, ad esempio, da pazienti COVID-19 e controlli sani e digeriti in peptidi. Quindi, le tecniche ad alto rendimento come la SM, consentono l'identificazione e lo screening comparativo di proteine significativamente regolate o alterate tra le popolazioni di studio, che possono essere identificate utilizzando i database disponibili. Questa profilazione approfondita del proteoma consente il rilevamento di biomarcatori proteici specifici della malattia e l'identificazione di potenziali bersagli terapeutici.

La proteomica dell'espressione studia le differenze nell'espressione proteica tra i campioni. La proteomica strutturale aiuta a mappare la struttura proteica all'interno di un organello specifico, mentre la proteomica funzionale identifica le funzioni biologiche di un individuo o di una classe di proteine.