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Natura eterogenea dei tessuti ha dimostrato di essere un fattore limitante per la quantità di informazioni che possono essere generati da campioni biologici, compromettendo le analisi a valle. Considerando le associazioni complesso e dinamico cellulari esistenti in molti tessuti, per ricapitolare le interazioni in vivo analisi molecolare si deve essere in grado di analizzare popolazioni di cellule specifiche all'interno del loro contesto d'origine. Laser-mediata microdissezione può raggiungere questo obiettivo, consentendo l'identificazione univoca e la raccolta di successo delle cellule di interesse sotto il diretto visualizzazione microscopica, pur mantenendo l'integrità molecolare. Abbiamo applicato questa tecnologia per analizzare l'espressione genica nelle aree definite di sviluppare disco Drosophila ala, che rappresenta un vantaggioso sistema modello per studiare il controllo della crescita, differenziazione cellulare e l'organogenesi. Larvale dischi immaginale precocemente sono suddivise in compartimenti anteriore e posteriore, dorsale e ventrale da confini restrizione lignaggio. Avvalendosi della inducibile GAL4-UAS sistema di espressione binario, ciascuno di questi comparti possono essere etichettate in modo specifico le mosche transgeniche esprimere un transgene UAS-GFP sotto il controllo del competente GAL4-driver costruire. Nei dischi transgenici, il profilo di espressione genica di sottoinsiemi discreti di cellule possono essere, appunto, determinata dopo microdissezione laser-mediata, utilizzando il segnale fluorescente GFP guidare taglio laser.
Tra le varietà di applicazioni a valle, ci siamo concentrati sulla profilazione trascrizione RNA dopo localizzato interferenza dell'RNA (RNAi). Con l'avvento della tecnologia RNAi, GFP etichettatura può essere accoppiato con knockdown localizzata di un dato gene, che consente di determinare la risposta trascrizionale di una popolazione di cellule discreti per il silenziamento genico specifico. Per convalidare questo approccio, abbiamo sezionato aree equivalenti del disco dalla parte posteriore (l'etichetta di espressione GFP), e la parte anteriore (non marcato) su vano tacere regionali nel comparto P di un altro gene ubiquitariamente espresso. L'RNA è stato estratto da microdissezionate aree tacere e unsilenced e comparativa profili di espressione genica determinata dalla quantitativa real-time RT-PCR. Abbiamo dimostrato che questo metodo può essere efficacemente applicato per trascrittomica accurata di sottoinsiemi di cellule all'interno dei dischi immaginale Drosophila. Infatti, mentre la preparazione del disco di massa come fonte di RNA assume generalmente omogeneità cellulare, è ben noto che l'espressione trascrizionale può variare notevolmente all'interno di queste strutture a seguito di informazioni di posizione. Utilizzando localizzato segnale fluorescente GFP per guidare taglio laser, analisi trascrizionale più accurata può essere eseguita e proficuamente applicati alle domande più disparate, tra cui profili trascrizione di linee cellulari distinte nel loro contesto d'origine.