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Articolo metodologico

Screening per le modifiche genomiche: un metodo per identificare i mutanti generati da CRISPR in Drosophila

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30 aprile 2023

In questo articolo

Abstract

Fonte: Du, L., et al. Una strategia efficiente per la generazione di sistemi di trascrizione binaria tessuto-specifici in Drosophila mediante l'editing del genoma. J. Vis. Exp. (2018).

Questo video descrive un metodo di screening per identificare le mosche transgeniche Drosophila, il cui genoma è stato modificato utilizzando CRISPR-Cas9. CRISPR-Cas9 è un potente strumento di editing del genoma che ha rivoluzionato il modo in cui gli scienziati possono manipolare il genoma di un organismo. Nel protocollo di esempio, vedremo come identificare mutanti generati da CRISPR, in cui l'inserimento di una sequenza di transattivazione sostituisce il primo esone del gene branchless (bnl), creando così una linea driver specifica per il gene bnl, bnl-LexA.

Protocollo

Questo protocollo è un estratto da Du et al., Una strategia efficiente per la generazione di sistemi di trascrizione binaria specifici per i tessuti in Drosophila mediante l'editing del genoma, J. Vis. Exp. (2018).

1. Genetica e screening delle mosche (Figura 1 e Figura 2)

  1. Quando gli embrioni iniettati si sviluppano in adulti, incrocia ogni singola mosca G0 con mosche bilanciatrici. Selezionare il bilanciatore adatto per il cromosoma contenente l'allele bersaglio.
  2. Anestetizzare la prole F1 da ogni incrocio G0 su un tampone di CO2 e scegliere casualmente 10-20 maschi sott....

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Risultati

figure-results-1
Figura 1: Una panoramica del flusso di lavoro per l'editing del genoma mediato da CRISPR/Cas9 per generare un sistema di trascrizione binario. Viene indicata la durata approssimativa del tempo necessario per ogni passaggio. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Tris-HClSigma AldrichT3253biologia molecolare
EdtaSigma AldrichE1161biologia molecolare
NaClSigma AldrichS7653biologia molecolare
Acqua ultrapura senza DNasi/RNasiThermoFisher ScientificoCodice 10977-023biologia molecolare
PrimerIDT-DNAMisurazione della PCR
proteinasi KThermoFisher Scientifico25530049biologia molecolare
2x PCR PreMix, con colorante (rosso)SydlabMB067-EQ2Rbiologia molecolare
MKRS/TB6BLaboratorio KornbergVolare la cima
Stazione di CO2Genesee Scientifico59-122WCUspingere la mosca
StereomicroscopioOlimpoSZ-61spingere la mosca
Pestelli omogeneizzatori a microprovetteFisher-Scientifico03-421-217isolamento del DNA genomico

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