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1. Saggio di tossicità liquida di C. elegans con Aeromonas
NOTA: Per evitare contaminazioni, si devono eseguire i passaggi in una cappa a flusso laminare.
- Il giorno dopo la semina dei vermi L1 sulla piastra ENGM (Enhanced Nematoid Growth Medium) distribuita con E. coli OP50, si seleziona una singola colonia di ciascuno dei quattro ceppi di Aeromonas e di E. coli OP50, e si coltura con 5 mL di brodo da 5 mL ciascuno a 37 °C per 16 ore.
NOTA: Nel protocollo sono stati utilizzati i seguenti ceppi batterici: E. coli OP50, la fonte alimentare normale di C. elegans. A. dhakensis AAK1, il primo isolato clinico patogeno completamente sequenziato di A. dhakensis . A. hydrophila A2-066, A. veronii A2-007 e A. caviae A2-9307121 sono isolati clinici rappresentativi provenienti dall'Ospedale Universitario Nazionale Cheng Kung.
NOTA: Per preparare NGM arricchito (ENGM), sciogliere 3 g di NaCl, 5 g di peptone batterica, 1 g di estratto di lievito e 30 g di agar in 1 L di acqua deionizzata. Autoclave a 121 °C per 20 minuti. Attendi che sia raffreddato a 55 °C in un bagno d'acqua e aggiungi 1 mL di 1 M CaCl2, 1 mL di 1 MMgSO 4, 1 mL di colesterolo al 5% in etanolo e 25 mL di fosfato tampon. Fai roteare per mescolare bene. - Misura l'assorbanza OD600 del brodo batterico.
- Centrifuga il brodo batterico a 3.500 x g per 15 minuti per rimuovere il brodo LB. Risospensi i batteri e regola il brodo batterico a OD600 = 3.0 con mezzo S. Aggiungi 195 μL di brodo batterico in mezzo S ad almeno 8 pozzetti di una piastra da 96 pozzetti.
NOTA: Composizione del mezzo S: Per preparare il mezzo S, miscelare 40 mL di S basale, 0,4 mL di citrato di potassio 1M, 0,4 mL di soluzione di metalli traccia, 0,12 mL di 1 M CaCl2, 0,12 mL di 1 MMgSO 4, 40 μL di colesterolo al 5% in etanolo e 1 mL di 8 mM FudR prima dell'uso. - Lava via i vermi L4 sulla piastra ENGM con E. coli OP5 usando mezzo M9. Regolare la soluzione di verme a una concentrazione di 5 vermi per μL e aggiungere 5 μL di soluzione di verme a ciascun pozzetto della piastra a 96 pozzi. Assicurati che ci siano circa 25 vermi per pozzo.
- Incubare la piastra da 96 pozzi su uno shaker a 200 giri/min a 25 °C.
- Contare il numero di vermi vivi e morti dopo 24, 48 e 72 ore. Calcola i tassi di sopravvivenza di ogni pozzo con la seguente formula: (vermi vivi/Vermi totali) × 100%.
- Disegna un grafico a scatter con il calcolo dei dati giornalieri.