Tutte le procedure relative alla raccolta dei campioni sono state eseguite in conformità con le linee guida IRB dell'istituto.
- Metodo del vetro di copertura a camera per la formazione di biofilm
- Coltivare l'isolato batterico di interesse durante la notte nel substrato desiderato a 37 °C con scuotimento (200 rpm).
NOTA: Sono stati utilizzati diversi batteri, tra cui gli isolati clinici Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, complesso Burkholderia cepacia e Achromobacter xylosoxidans. La scelta del mezzo dipende dalle varietà e dalle condizioni di interesse, tuttavia (brodo Luria) i substrati LB possono essere utilizzati per gli esperimenti iniziali. - Dalla coltura notturna, si inseriscono 40 μl di coltura in 4 ml di substrato fresco e si colvono per 3-4 ore a 37 °C con agitazioni (200 RPM) per ottenere una coltura con una densità ottica a 600 nm (OD600) di circa 0,5-0,6.
- Diluire la coltura dal passaggio 1.2 a 1/5 nel substrato desiderato con filtrato di spettoro al 10% o senza filtrato di sputto (come controllo). Altre concentrazioni di filtrato di sputto possono essere testate (cioè 50% o 100%).
- Usa 200 μl di diluizione per seminare pozzi nelle camere delle vetrine.
- Lascia che i batteri si attacchino per 4 ore a 37 °C senza scuoti.
- Dopo 4 ore, rimuovi il substrato e lava delicatamente il biofilm con 1x fresco. Sostituisci con un substrato fresco da 200 μl.
NOTA: Per studiare gli effetti dell'espettorato sul biofilm, il substrato fresco dovrebbe contenere supernatant dell'esputato. - Lasciare che i biofilm crescano per il tempo desiderato a 37 °C senza scuotere, sostituendo il substrato ogni 12 ore, senza lavare fino al momento della microscopia.
NOTA: Per studiare l'effetto dei supernatanti dell'espettorato sulla suscettibilità agli antibiotici biofilm, gli antibiotici vengono aggiunti al substrato dopo 24 ore di crescita del biofilm e vengono mantenuti nel mezzo fino alla colorazione e all'imaging dei biofilm.