1. Costruzione di un sistema concentrato di confezionamento di lentivirus per fattori di trascrizione
- Produzione del virus concentrato (Figura 1A, B)
- Piastriare 1,5 × 106 cellule HEK (renee embrionali umane)-293T in una piastra da 60 mm e coltivare queste cellule con mezzo normale (vedere Tabella 1) a 37 °C in un incubatore umidificato con 5% di CO2.
NOTA: Se il virus deve essere confezionato in lotti, si può utilizzare una piastra per coltura cellulare da 100 mm (per dettagli, vedere Tabella 2). - Dopo 24 h, assicurarsi che le cellule HEK-293T abbiano raggiunto una confluenza dell'80-90% nel giorno della trasduzione e sostituire il mezzo con 3,5 mL di DMEM (Dulbecco’s modified eagle medium) (150 µL di DMEM per 1 cm2). Lasciare le cellule a 37 °C in un incubatore umidificato con 5% di CO2 per 2 h.
NOTA: Il mezzo sostitutivo deve essere privo di siero, in modo che le cellule possano essere "privati di nutrimento" per una migliore trasfezione del plasmide. - Preparare la miscela di plasmidi (miscela A) contenente 3 µg dei plasmidi bersaglio Mitf, Sox10, Pax3, Sox2, Sox9 o Snai2; 1 µg del plasmide di confezionamento PMD2.G e 2 µg del plasmide di confezionamento PSPAX2. Portare il volume della miscela A a 150 µL con DMEM privo di siero. Preparare la miscela del reagente di trasfezione (miscela B) aggiungendo 12 µL del reagente di trasfezione (il volume è il doppio della massa totale di tutti i plasmidi) e portare il volume della miscela B a 150 µL con DMEM privo di siero.
NOTA: Durante la preparazione delle miscele, è importante aggiungere il liquido lentamente per evitare bolle d'aria. - Mescolare la miscela A e la miscela B dopo averle lasciate a riposo per 5 min a temperatura ambiente. Incubare la miscela a temperatura ambiente per 20-30 min per formare il complesso di trasfezione.
- Prelevare le cellule HEK-293T dall'incubatore, sostituire il mezzo con DMEM + 2% FBS (siero fetale bovino), aggiungere la miscela del passaggio 1.1.4 goccia a goccia e mescolare delicatamente il liquido.
- Dopo 8 h, cambiare il mezzo con 3,5 mL di mezzo normale. Dopo il cambio del mezzo, raccogliere il sopranatante virale ogni 24 h e 48 h.
- Mescolare i sopranatanti virali raccolti in due diversi momenti temporali. Centrifugare a 200 × g per 5 min a 4 °C. Far passare il sopranatante attraverso filtri da 0,45 µm e raccoglierlo in un tubo conico sterile da 50 mL.
NOTA: Il virus raccolto a 24 h può essere conservato a 4 °C e mescolato con il virus raccolto a 48 h. - Concentrare il sopranatante virale centrifugando a 6000 × g a 4 °C per tutta la notte (~16 h). Assicurarsi che il pellet virale sia visibile sul fondo del tubo conico dopo la centrifugazione.
- Versare lentamente il sopranatante. Sciogliere il pellet virale in un volume di mezzo normale pari a 1/100esimo del volume del sopranatante virale. Utilizzando una micropipetta P1000, aspirare e rilasciare delicatamente fino a ottenere una miscela omogenea. Dividere il virus concentrato in provette microcentrifuga secondo necessità. Conservare a −80 °C.
NOTA: Il virus viene concentrato 100 volte con questo metodo. Il virus concentrato (100x) può essere conservato per >1 anno a −80 °C. Evitare cicli ripetuti di congelamento e scongelamento del virus.
Tabella 1: Componenti dei mezzi normali e di riprogrammazione.
| | Componenti | Dose (concentrazione, volume) | Concentrazione finale |
| Mezzo normale (100 mL) | DMEM/GLUCOSIO ALTO | 89 mL | |
| FBS inattivato termicamente | 10 mL | |
| Antibiotici (Pen/Strep) | 10000 U/mL, 1 mL | 100 U/mL |
| Mezzo di riprogrammazione (100 mL) | RPMI-1640 | 88 mL | |
| FBS inattivato termicamente | 10 mL | |
| SCF umano ricombinante | 200 μg/mL, 50 μL | 100 ng/mL |
| bFGF umano ricombinante | 4 μg/mL, 250 μL | 10 ng/mL |
| Insulina umana ricombinante | 10 mg/mL, 50 μL | 5 μg/mL |
| EDN3 umano | 100 μM, 100 μL | 0.1 μM |
| Toxina del colera | 0.3 mg/mL, 0.56 μL | 20 pM |
| Forbolo 12-miristato 13-acetato (TPA) | 1 mM, 20 μL | 200 nM |
| Idrocortisone | 100 μg/mL, 500 μL | 0.5 μg/mL |
| Adenina | 40 mg/mL, 60 μL | 24 μg/mL |
Tabella 2: Dettagli del sistema di confezionamento del lentivirus.
| Piatto per coltura | Densità di semina (cellule/piatto) | Mezzo (mL) | Sistema di plasmidi | Reagente di trasfezione (µL) |
| Plasmide bersaglio (μg) | PMD2.G (μg) | PSPAX2 (μg) |
| 35 mm | 6 ×105 | 1.5 | 1.5 | 0.5 | 1 | 6 |
| 60 mm | 1.5 × 106 | 3.5 | 3 | 1 | 2 | 12 |
| 100 mm | 4 × 106 | 8 | 8 | 3 | 6 | 34 |