1. Elaborazione di organoidi per istologia: il metodo di spin down dell'agarosio
NOTA: Questo protocollo è adattato da una precedente pubblicazione di Vlachogiannis et al. Abbiamo aggiunto una fase che coinvolge l'inclusione dell'agarosio per incorporare con successo tutte le popolazioni di organoidi.
- Rimuovere il supporto esistente dal pozzo. Fare attenzione a non aspirare le cupole della membrana del seminterrato.
- Aggiungere un volume uguale (uguale al volume del terreno rimosso dalla fase 1) di soluzione di recupero cellulare e incubare per 60 minuti a 4 °C.
- Smuovere la cupola della membrana basale utilizzando una pipetta e schiacciare la cupola della membrana basale utilizzando una punta per pipetta. Raccogliere la cupola dissociata e la soluzione di recupero cellulare in una provetta da 1,5 mL.
- Centrifugare a 300 x g e 4 °C per 5 min.
- Rimuovere il surnatante (soluzione per il recupero cellulare). Conservare tutti i surnatanti in provette separate fino alla fine, quando la presenza di organoidi è confermata nella fase finale di pellettatura.
- Aggiungere il volume desiderato (Tabella 1) di PBS freddo e pipettare delicatamente su e giù per disturbare meccanicamente il pellet.
- Centrifugare a 300 x g e 4 °C per 5 min.
- Rimuovere il surnatante (PBS).
- Fissare il pellet in un volume corrispondente (ad es. 500 μl per un pellet dalla condizione di coltura su piastra a 24 pozzetti, Tabella 1) di PFA al 4% per 60 minuti a temperatura ambiente.
- Dopo il fissaggio, centrifugare a 300 x g e 4 °C per 5 min.
- Rimuovere il surnatante (PFA).
- Lavare con un volume corrispondente (ad es. 500 μl per un pellet dalla condizione di coltura su piastra a 24 pozzetti, Tabella 1) di PBS e centrifugare a 300 x g e 4 °C per 5 minuti.
- Preparare l'agarosio caldo (2% di agarosio in PBS).
nota: Qui, i pellet cellulari per sezioni congelate possono essere risospesi direttamente in 200 μL di composto OCT.
- Risospendere il pellet cellulare in 200 μL di agarosio (2% in PBS).
- Immediatamente dopo l'aggiunta dell'agarosio, staccare delicatamente il pellet cellulare dalla parete della provetta da 1,5 mL utilizzando l'ago da 25 G collegato alla siringa da 1 mL. Come mostrato nella Figura 1, se il pellet cellulare non viene fisicamente staccato dalla parete della provetta da 1,5 mL, c'è il rischio di perdere tutto o parte del pellet cellulare durante il processo di inclusione dell'agarosio.
- Attendere che l'agarosio al 2% nella PBS sia completamente solidificato.
- Staccare il blocco di agarosio solidificato dalla provetta da 1,5 mL utilizzando un ago da 25 G collegato alla siringa da 1 mL.
- Trasferire il blocco di agarosio staccato contenente il pellet cellulare in una nuova provetta da 1,5 mL.
- Riempire la provetta con il 70% di EtOH e procedere ulteriormente utilizzando il protocollo convenzionale per la disidratazione dei tessuti e l'inclusione di paraffina.
Tabella 1: Densità di semina, volume della membrana basale e volume medio necessari per una cupola
| Piatto di coltura | Densità di semina (cellule) | Volume della membrana basale (μL) | Terreno (μL) |
| 48 pozzetti | 25.000-50.000 | 20 | 250 |
| 24 pozzetti | 50.000-250.000 | 40 | 500 |
| 6 pozzetti | 50.000-250.000 | 40 | 2.000 |