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Articolo metodologico

Saggio di screening dei nematocidi di piccole molecole: un metodo a medio rendimento per lo screening di potenziali nematocidi contro Ditylenchus dipsaci

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8 luglio 2025

In questo articolo

Abstract

Fonte: Cammalleri, S. R., et al. Coltura e screening del nematode parassita delle piante Ditylenchus dipsaci. J. Vis. Exp. (2022).

In questo video, dimostriamo un test di screening per identificare l'efficacia dei nematocidi a piccole molecole contro i nematodi. I nematocidi sono considerati efficaci se causano una diminuzione del numero di nematodi mobili nel campione dopo l'esposizione.

Protocollo

Tutte le procedure che coinvolgono modelli animali sono state esaminate dal comitato istituzionale locale per la cura degli animali e dal comitato di revisione veterinaria JoVE

1. Screening in vitro di piccole molecole

  1. Preparare le piastre di analisi seguendo i passaggi seguenti.
    1. Versare l'acqua distillata autoclavata in un trogolo sterile e, utilizzando una pipetta multicanale, erogare 40 μl di acqua distillata dal trogolo in ciascun pozzetto di una piastra a 96 pozzetti a fondo piatto.
  2. Preparare lo strumento di spillatura e aggiungere le sostanze chimiche.
    1. Posiziona i vassoi per pinner (vedi Tabella dei materiali) vicino alla fiamma di un bruciatore Bunsen su un banco da laboratorio. Aggiungere quanto segue ai vassoi successivi: 25 mL di soluzione per la pulizia dei pinner, 35 mL di DMSO al 50% (in acqua), 45 mL di acqua distillata, 55 mL di EtOH al 70% e 65 mL di EtOH al 95%. Posizionare un foglio di carta assorbente davanti a ciascun vassoio.
    2. Pulire lo strumento di bloccaggio immergendo i perni nella soluzione detergente e muovendo i perni su e giù tre volte (3x) nella soluzione. In questo protocollo, '3x' e '10x' sono definiti come lo spostamento del pinner su e giù in una soluzione rispettivamente tre o dieci volte. Tampona gli spilli sulla carta assorbente. Ripetere questa procedura ancora una volta.
      1. Quindi, sciacquare gli spilli 3 volte in acqua distillata, quindi asciugarli. Ripetere la procedura ancora una volta.
      2. Infine, sciacquare gli spilli 3 volte in EtOH al 95%, quindi tamponare gli spilli. Ripeti ancora una volta. Fiammeggiare la matrice e lasciare evaporare l'etanolo.
    3. Aggiungere le sostanze chimiche dalle piastre di riserva chimiche a 96 pozzetti alle piastre di analisi fissando 3 volte nella piastra chimica, quindi trasferendo i perni 10 volte nella piastra di analisi. Tamponare sulla carta davanti alla soluzione detergente.
    4. Pulire lo strumento di spillatura tra le piastre lavando nel seguente ordine, tamponando tra una spruzzatura e l'altra su carta assorbente: 3 volte in DMSO al 50% (una volta), 3 volte in acqua distillata (una volta), 3 volte in EtOH al 75% (una volta), 3 volte in EtOH al 95% (due volte). Fiammeggiare il pinner e lasciare evaporare l'etanolo.
    5. Ripetere il passaggio 1.2.2 quando tutto il blocco è completato.
      nota: Lo screening è stato eseguito ad una concentrazione finale di 60 μM.
  3. Aggiunta di vermi
    1. Contare il numero di nematodi dalla raccolta prima risospendendo e poi pipettando 5 μl utilizzando puntali a bassa ritenzione su un vetrino per l'osservazione. Contare il numero di nematodi in 5 μl utilizzando un microscopio da dissezione.
      1. Regolare la concentrazione a 2 vermi/μL utilizzando acqua distillata sterile. Utilizzando una pipetta multicanale e un trogolo, aggiungere 10 μL (~20 vermi) a ciascun pozzetto delle piastre a 96 pozzetti.
        nota: Saranno raccolti circa 15.000 nematodi D. dipsaci per piastra di coltura utilizzando il metodo di coltura e raccolta descritto. Vengono utilizzati venti worm per pozzo perché il numero ridotto facilita la visualizzazione e la contabilizzazione chiara di quelli mobili e immobili.
    2. Sigillare le piastre nella pellicola da laboratorio e avvolgerle con un tovagliolo di carta umido. Mettere nella scatola e applicare su un tampone adesivo in un'incubatrice con agitazione a 20°C impostata a 200 giri/min. Assicurarsi che le piastre siano stabilizzate nella scatola aggiungendo un extra damp tovagliolo di carta per garantire un movimento minimo delle piastre.

2. Raccolta e analisi dei dati

  1. Osservare le piastre il giorno 5 con un microscopio da dissezione. Contare il numero di D. dipsaci mobili e il numero totale di D. dipsaci nei controlli con solventi DMSO e nei pozzetti trattati con farmaci.
    1. Se i vermi sono relativamente immobili, aggiungere 2 μL di NaOH 1 M a una concentrazione finale di 40 mM nel pozzetto per stimolare il movimento.
      nota: Dopo aver aggiunto NaOH, i vermi si muoveranno istantaneamente e dovranno essere visualizzati entro 5 minuti. Il numero di worm mobili e il numero totale di worm verranno utilizzati per calcolare la percentuale di worm mobili. La lunghezza del test può variare a seconda dell'obiettivo dello schermo.
  2. Calcola la percentuale di worm mobili. Negli schermi di D. dipsaci, i pozzetti che hanno prodotto in modo riproducibile lo 0% di worm mobili sono classificati come colpi forti.
    nota: Si evita l'esposizione prolungata delle lastre sul tavolino dei microscopi di dissezione perché la sorgente luminosa può riscaldare le piastre e indurre effetti variabili sul biotest.

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Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Bicchiere da 50 mlpirexCLS100050
Piastra a 96 pozzettiSarstedt83.3924
AlluminioAlcan Plus
cannocchiale di dissezioneLeicaLeica MZ75
DmsoSigma-Aldrich472301-500ML
scivolo in vetroMagna60-1200
Carta assorbente priva di lanugineV&P ScientificoVP 522-100
Puntali per pipette a bassa ritenzione (200uL)LABFORCECodice 1159M44
pipetta multicanaleEppendorf research plus3125000036
NaOHSigma-AldrichS8045-500G
parafilmBemisPM-996
Soluzioni per la pulizia dei perniV&P ScientificoVP110A
PinnerV&P ScientificoVP381N
vaschette di risciacquo pinnerV&P ScientificoVP 421
Serbatoio per reagenti con coperchio per pipette multicanaleSigma-AldrichBR703459
incubatore a scuotimentoNuovo Brunswick ScientificoI26

Tag

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