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Articolo metodologico

Tecnica di microgravimetria dissipativa per studiare l'interazione a doppio strato proteina-lipidi

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8 luglio 2025

In questo articolo

Abstract

Fonte: Matos, A. L. L., et al. Microgravimetria dissipativa per studiare le dinamiche di legame della proteina legante i fosfolipidi Annexin A2 ai doppi strati lipidici supportati da solidi utilizzando un risonatore al quarzo. J. Vis. Exp. (2018).

Questo video mostra una tecnica di microgravimetria dissipativa per studiare il legame delle proteine ai doppi strati lipidici. Piccole vescicole unilamellari vengono aggiunte per rivestire la superficie del sensore al quarzo di una microbiana. Utilizzando il legame io-dipendente dello ione calcio della proteina legante i fosfolipidi bersaglio al doppio strato, le variazioni della frequenza di oscillazione del sensore e la dissipazione dell'oscillazione vengono monitorate per determinare la natura del legame del doppio strato proteina-lipide.

Protocollo

NOTA: I tamponi devono essere filtrati utilizzando un filtro da 0,22 μm e degassati sotto vuoto per 1 ora.

1. Preparazione delle vescicole lipidiche

  1. Utilizzare provette di vetro da 2 ml. Sciogliere ciascun lipide, 1,2-dioleoil-sn-glicero-3-fosfocolina (DOPC), 1-palmitoil-2-oleoyl-sn-glicero-3-fosfocolina (POPC), 1-palmitoil-2-oleoil-sn-glicero-3-fosfo-L-serina (POPS) e colesterolo (Chol), in una miscela di cloroformio/metanolo (50:50 v/v) per preparare una soluzione lipidica limpida da 5 mM. Sciogliere l'1,2-dioleoil-sn-glicero-3-fosfo-(1'-mio-inositolo-4',5'-bisfosfato) (PI(4,5)P2) in una miscela di cloroformio/metanolo/acqua (20:9:1 v/v).
  2. Combinare i lipidi disciolti nel rapporto molare desiderato di POPC/POPS (80/20), POPC/PI(4,5)P2 (95/5), POPC/POPS/Chol (60/20/20), POPC/POPS/PI(4,5)P2/Chol (60/17/3/20) e POPC/DOPC/POPS/PI(4,5)P2/Chol (37/20/20/3/20) (Tabella 1) in provette di vetro da 10 mL.
    nota: La quantità finale di lipidi totali è di 500 μg.
  3. Evaporare i solventi organici utilizzando un flusso secco di azoto. Lasciare la miscela lipidica in un sistema ad alto vuoto (liofilizzazione) per 3 ore per rimuovere eventuali tracce residue dei solventi.
    nota: Ciò si traduce in un film secco e trasparente.
  4. Risospendere il film lipidico in 1 mL di tampone citrato (10 mM di trisodio-citrato, 150 mM di NaCl, pH 4,6). Incubare la sospensione lipidica a 60 °C (questa temperatura è di circa 10 °C al di sopra della temperatura di transizione di fase del lipide con il più alto punto di fusione nella miscela) per 30 minuti a bagnomaria e agitarla energicamente ogni 5 minuti
    nota: Ciò si traduce nella formazione di grandi vescicole multilamellari (MLV). Mantenere la sospensione al di sopra della temperatura di transizione.
  5. Preriscaldare l'estrusore (in questo caso a 60 °C) dotato di una membrana in policarbonato di 50 nm di diametro al di sopra della temperatura di transizione (che qui è di 40 - 50 °C) per 30 minuti.
  6. Caricare la sospensione MLV nell'estrusore preriscaldato e far passare delicatamente la miscela 31x attraverso la membrana in policarbonato per formare piccole vescicole unilamellari (SUV). Mantenere la temperatura al di sopra della temperatura di transizione.
  7. Trasferire la sospensione SUV in un recipiente di reazione in plastica da 2 mL e aggiungere il tampone citrato (vedere passaggio 1.4) per portare il volume finale a 2 mL.
    nota: Ciò produrrà una concentrazione lipidica finale di 250 μg/mL.

2. Manipolazione dei sensori al quarzo

NOTA: Maneggiare sempre i sensori al quarzo con una pinzetta.

  1. Incubare quattro sensori inseriti in un supporto di politetrafluoroetilene in una soluzione SDS al 2% per ≥ 30 minuti. Lavarli accuratamente con acqua ultrapura per rimuovere completamente la SDS e lasciarli asciugare utilizzando un getto di argon secco o azoto.
  2. Utilizzare un sistema di pulizia al plasma per rimuovere completamente eventuali contaminanti. Inserire i sensori a secco nella camera di pulizia al plasma, evacuare la camera e lavarla 3 volte con ossigeno. Accendi il pulitore al plasma. Utilizzare i seguenti parametri di processo: 1 x 10-4 Torr di pressione, alta potenza a radiofrequenza (RF) e 10 minuti di tempo di processo. Spegnere la macchina ed estrarre i sensori.

3. Funzionamento della microbilancia

NOTA: È stato utilizzato un sistema di microbilancia con quattro camere di flusso a temperatura controllata in configurazione parallela, collegate a una pompa peristaltica e impostate su una portata di 80 μL/min. Nella modalità a flusso aperto, il tampone è stato pompato dal serbatoio di alimentazione nel serbatoio di ricezione. Nella modalità loop, il serbatoio ricevente è stato collegato al serbatoio di alimentazione per generare un circuito chiuso. La temperatura è stata impostata a 20 °C.

  1. Agganciare con cautela i sensori puliti al plasma nelle 4 camere di flusso, utilizzando una pinzetta. Evitare qualsiasi pressione o torsione delle camere e dei tubi che potrebbe causare perdite.
  2. Lavare il sistema con tampone citrato (10 mM di trisodio-citrato, 150 mM di NaCl, pH 4,6) in modalità a flusso aperto per 10 min.
    nota: Ciò richiede esattamente 3,2 ml di tampone, ma è consigliabile utilizzare un tampone in eccesso (10 ml).
  3. Avvia il programma. Iniziare a registrare eventuali cambiamenti nella frequenza e nella dissipazione del primo tono fondamentale (n = 1°) e degli armonici (n = 3° - 13°) utilizzando il software, fino a quando le linee di base di frequenza e dissipazione sono stabili (questo richiederà circa 40 - 60 minuti).
    nota: I livelli di rumore in frequenza (picco-picco) devono essere inferiori a 0,5 Hz e, per la dissipazione, inferiori a 0,1,10-6, con una deriva massima (in soluzione acquosa) di 1 Hz/h in frequenza e 0,3,10-6/h in dissipazione.
  4. Quando i valori di base sono stabili, applicare la sospensione del SUV in tampone citrato (2 mL in un tubicino). Utilizzando un recipiente di reazione, rimuovere 1,5 mL del volume morto. Quindi chiudere il sistema in modalità loop-flow. Registrare lo spostamento di frequenza/dissipazione per altri 10 minuti.
    nota: Durante questo periodo, le vescicole si diffonderanno sulla superficie del SiO2 e si fonderanno per formare un doppio strato continuo (passaggio 2 nelle Figure 1, Figura 2 e Figura 3). L'adsorbimento del SUV sulla superficie del sensore è bifasico e ha una frequenza minima e massima tipica nella dissipazione. Una nuova linea di base stabile di frequenza/dissipazione con uno spostamento di frequenza caratteristico (a seconda della composizione lipidica) da 26 a 29 Hz (vedi Tabella 1) indica un doppio strato continuo sulla superficie.
  5. Quando l'SLB è stabile (vedere il passaggio 3.4), equilibrare il sistema con il tampone in esecuzione (10 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7,4) alle concentrazioni di Ca2+ richieste (comprese tra 50 μM e 1 mM di CaCl2, a seconda dell'esperimento) in modalità a flusso aperto per 40 minuti.
  6. Aggiungere la proteina (in questo caso, AnxA2) al tampone di corsa contenente Ca2+ (vedere il passaggio 3.5). Eseguire l'applicazione della proteina in modalità loop-flow fino al raggiungimento di uno stato stazionario di equilibrio (passaggio 3 in Figura 1, Figura 2 e Figura 3).
    nota: La concentrazione proteica può variare da 1 a 400 nM. L'adsorbimento delle proteine determina uno spostamento di frequenza dipendente dalla concentrazione che riflette l'adsorbimento della massa (proteina).
  7. Dissociare la proteina legata chelando gli ioni Ca2+ con 5 mM di EGTA nel tampone in esecuzione in modalità a flusso aperto (passaggio 4 nelle Figure 1 e Figura 2).
    nota: Un recupero della frequenza e della dissipazione al basale SLB indica la totale reversibilità del legame proteico. I cicli di associazione-dissociazione possono essere ripetuti per confrontare diverse concentrazioni o proteine.

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Risultati

Tabella 1: Dati sulla composizione e la formazione dei lipidi dell'SLB

...
composizioneΔΔF/Hz dopo la formazione di SLBΔΔD*10-6 dopo la formazione di SLB
POPC/POPS(80 : 20)26,3 ± 0,20,26 ± 0,03
POPC/PI(4,5)P2(95 : 5)26,5 ± 0,5

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Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
prodotti chimici
cloruro di calcioMerck017-013-00-299%
cloroformioRoth4432.199%
DOPCAvanti850375P
EGTAPanReac AppliChemCodice: A087899%
HEPESPanReac AppliChemA1069
metanoloPanReac AppliChemA3493
PiP2Avanti850155P
POPCAvantiCodice 850457P
PopsAvanti840034P
cloruro di sodioPanReac AppliChemA1149
SdsRoth183
Citrato trisodicoPanReac AppliChemA3901
attrezzatura
Estrusore LiposofastAvestin
Analizzatore Qsense E4Senso di credito
QSense DfindSenso di credito
Pompa IPC 4IsmatecISM 930
QSX 303 SiO2 Biossido di silicio 50nmSenso di creditoPannello QSX 303
Membrane in PC 0,05 μmLipidi polari Avanti610003
OriginProSocietà OriginLabVersione 8 e 9

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