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Articolo metodologico

Una tecnica per l'estrazione magnetica dell'acido nucleico mediata da particelle di vetro dal sangue

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8 luglio 2025

In questo articolo

Abstract

Fonte: Rosenstierne, M. W., et al. Estrazione manuale rapida, sicura e semplice dell'acido nucleico al letto del paziente per la rilevazione del virus in campioni di sangue intero. J. Vis. Exp. (2018).

Questo video mostra una tecnica per l'estrazione dell'acido nucleico da sangue umano intero utilizzando particelle di vetro magnetiche (MGP) - piccole perle magnetiche rivestite di silice. Dopo aver lisato le cellule del sangue utilizzando un tampone di lisi, gli acidi nucleici rilasciati si legano alla superficie degli MGP rivestiti di silice, estraendo le molecole dal campione.

Protocollo

Tutte le procedure che prevedono la raccolta dei campioni sono state eseguite in conformità con le linee guida IRB dell'istituto

1. Prelievo di sangue dai pazienti

ATTENZIONE: Adottare adeguate misure di sicurezza di laboratorio quando si raccoglie sangue intero dal paziente. Indossare guanti e occhiali. Se il paziente è in isolamento, seguire le procedure di biosicurezza di livello 4.

  1. Per prelevare sangue intero per via endovenosa dal paziente, utilizzare un ago a farfalla con tubo di prolunga di piccolo diametro e un tubo a vuoto per la raccolta del sangue contenente un tampone di lisi/legante. Appoggiare il braccio del paziente in posizione abbassata e posizionare la provetta di raccolta più in basso dell'ago a farfalla. Inserire l'ago a farfalla nella vena del paziente e collegare il tubo a vuoto per la raccolta del sangue alla prolunga di piccolo diametro.
    nota: Ciò impedirà il riflusso.
  2. Dopo il prelievo di sangue, mescolare il contenuto della provetta capovolgendo la provetta 5 - 10 volte.
    nota: A causa del vuoto rimanente nella provetta per la raccolta del sangue contenente 1,6 mL di tampone di lisi/legante, il volume del campione raccolto sarà automaticamente di 1,6 mL.
  3. Disinfettare l'esterno del tubo con etanolo al 70%.
  4. Incubare le provette per 20 minuti a temperatura ambiente.
    nota: Il protocollo può essere messo in pausa e le provette per il prelievo di sangue completo possono essere conservate a -20 °C, 5 °C, 25 °C o 37 °C per almeno 1 mese.
  5. Continuare direttamente con il metodo di estrazione NA semplificato.

2. Estrazione NA semplificata del sangue intero

  1. Per purificare NA dal sangue raccolto inattivato dal tampone di lisi/legante, mescolare il contenuto della provetta capovolgendo manualmente la provetta a vuoto 5 - 10 volte.
  2. Rimuovere con cautela il coperchio del tubo e scaricare il coperchio.
  3. Versare l'aliquota preparata di MGP (1 mL) direttamente nella provetta per il prelievo del sangue.
  4. Posizionare un nuovo coperchio di una provetta per la raccolta del sangue non utilizzata sulla provetta contenente il campione.
  5. Posizionare un dito sul coperchio per assicurarsi che la provetta sia ben chiusa e mescolare il contenuto della provetta capovolgendo manualmente la provetta per la raccolta del sangue 5 - 10 volte.
  6. Posizionare il tubo nel supporto magnetico e tenere un dito sul coperchio per assicurarsi che il tubo sia ben chiuso.
  7. Capovolgere il supporto magnetico con il tubo alcune volte a mano per assicurarsi che tutti gli MGP siano raccolti sul lato del tubo con il magnete.
    nota: Il supporto magnetico può essere sostituito con un magnete allungato e un elastico.
  8. Rimuovere il coperchio della provetta ed eliminare il contenuto della provetta utilizzando una pipetta monouso o semplicemente versando il contenuto in una provetta di raccolta da 50 ml.
    nota: Evitare la formazione di aerosol dalla provetta di raccolta da 50 ml chiudendo la provetta con un coperchio.
  9. Versare l'aliquota preparata del tampone di lavaggio-1 (WB-1, 4 mL) direttamente nella provetta per il prelievo del sangue.
  10. Posizionare il coperchio sul tubo e posizionare un dito sul coperchio per assicurarsi che il tubo sia ben chiuso.
  11. Rimuovere il tubo dal supporto magnetico, mantenendo il coperchio ben serrato con un dito.
    nota: Se si utilizza un magnete e un elastico, è sufficiente rimuovere l'elastico e il magnete dal tubo.
  12. Risospendere gli MGP capovolgendo manualmente la provetta per la raccolta del sangue 5 - 10 volte.
  13. Ripetere i passaggi 2.6 - 2.8.
  14. Versare l'aliquota preparata di WB-2 (1,5 mL) direttamente nella provetta per il prelievo del sangue.
  15. Posizionare il coperchio sul tubo e rimuovere il tubo dal supporto magnetico.
    nota: Se si utilizza un magnete e un elastico, è sufficiente rimuovere l'elastico e il magnete dal tubo.
  16. Metti un dito sul coperchio per assicurarti che il tubo sia ben chiuso.
  17. Risospendere gli MGP capovolgendo manualmente la provetta per la raccolta del sangue per alcuni secondi.
  18. Ripetere i passaggi 2.6 - 2.8.
  19. Versare l'aliquota preparata di WB-3 (3 mL) direttamente nella provetta per il prelievo del sangue.
  20. Posizionare il coperchio sul tubo e rimuovere il tubo dal supporto magnetico.
    nota: Se si utilizza un magnete e un elastico, è sufficiente rimuovere l'elastico e il magnete dal tubo.
  21. Metti un dito sul coperchio per assicurarti che il tubo sia ben chiuso.
  22. Risospendere gli MGP capovolgendo manualmente la provetta per la raccolta del sangue 5 - 10 volte.
  23. Ripetere i passaggi 2.6 - 2.8.
  24. Versare l'aliquota preparata del tampone di eluizione (EB, 100 μL) direttamente nella provetta per il prelievo del sangue.
  25. Posizionare il coperchio sul tubo e rimuovere il tubo dal supporto magnetico.
    nota: Se si utilizza un magnete e un elastico, è sufficiente rimuovere l'elastico e il magnete dal tubo.
  26. Risospendere gli MGP nell'EB picchiettando la provetta per la raccolta del sangue 5 - 10 volte con un dito.
    nota: Il protocollo può essere messo in pausa e le provette possono essere conservate a -20 °C.
  27. Trasferire una goccia (5 - 8 μL) degli MGP risospesi nella miscela di reazione di amplificazione NA a valle utilizzando una pipetta monouso da 1,5 mL (può essere utilizzato qualsiasi saggio diagnostico di amplificazione NA a valle, come i test di amplificazione isotermica mediata da loop (LAMP)/LAMP a trascrizione inversa (RT-LAMP) o la reazione a catena della polimerasi quantitativa (qPCR)/RT-qPCR).
    nota: Gli NA si attaccheranno agli MGP, quindi assicurati di utilizzare gli MGP nella reazione di amplificazione degli NA a valle. Miscelare le sospensioni MGP prima dell'uso. Dopo la miscelazione, gli MGP si raccoglieranno sul fondo del tubo.

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Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Provette Vacutainer K2 EDTA (4 mL)Becton Dickinson368861
Più raccolta di sangueBecton Dickinson362725
23G x 1 agoBecton DickinsonCodice 300800
Siringa LUER LOK (3 mL)Becton Dickinson309658
Ago a farfalla con tubo di prolunga di piccolo diametroJørgen Kruuse A/S121714
1% VirkonNomeco A/S849265
Kit di isolamento del DNA LC puro MagNA I - Tampone di lisi/legante - RicaricaRoche Diagnostics A/S3246752001
Kit di isolamento dell'acido nucleico totale MagNA Pure LCRoche Diagnostics A/S3038505001
Nunc™ Provette criogeniche per biobanche e colture cellulari (1,8 mL)Thermo Fisher Scientifico375418
Provette criogeniche per biobanche e colture cellulari Nunc™ (3,6 mL)Thermo Fisher Scientifico379189
Nunc™ Provette criogeniche per biobanche e colture cellulari (4,5 mL)Thermo Fisher Scientifico379146
Magnete DynaMag-5™Thermo Fisher ScientificoCodice 12303D
Pipetta di trasferimento (3,5 mL)Sarstedt86.1171.010
Thermo Scientific™ Pipette per trasferimento con puntali fini Samco™ (1,5 mL)Thermo Fisher Scientifico231
Thermo Scientific™ Nunc™ 50 mL Provette da centrifuga sterili coniche in polipropileneThermo Fisher Scientifico339652

Tag

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