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Articolo metodologico

Un test per studiare l'impatto della rigidità della matrice extracellulare sull'infezione batterica

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8 luglio 2025

In questo articolo

Abstract

Fonte: Bastounis, E. E., et al. Un test a base di poliacrilammide in formato multipozzetto per studiare l'effetto della rigidità della matrice extracellulare sull'infezione batterica delle cellule aderenti. J. Vis. Exp. (2018).

Questo video mostra un test per studiare l'effetto della rigidità della matrice extracellulare (ECM) sull'infezione batterica delle cellule aderenti. Gli idrogel di poliacrilammide di rigidità variabile, ricoperti di collagene, sono stratificati in una piastra a più pozzetti per imitare la rigidità della ECM fisiologica. Dopo aver sovrapposto cellule endoteliali umane sugli idrogel e aver infettato le cellule con batteri Listeria monocytogenes ingegnerizzati per esprimere una proteina fluorescente una volta intracellulare, la citometria a flusso viene utilizzata per confrontare i batteri internalizzati nelle cellule che risiedono su idrogel più rigidi rispetto agli idrogel più morbidi.

Protocollo

1. Produzione di idrogel sottili di poliacrilammide (PA) a due strati su piastre multipozzetto

  1. Fabbricazione di idrogel di poliacrilammide
    nota: Vedere la Figura 1.
    1. Preparare soluzioni acquose che contengano il 3-10% della soluzione stock di acrilammide al 40% (vedere la Tabella dei materiali) e lo 0,06-0,6% della soluzione stock di bis-acrilammide (vedere la Tabella dei materiali) per produrre idrogel con rigidità regolabile che varia da 0,6 kPa a 70 kPa. Vedere la tabella 1.
      1. Per gli idrogel da 0,6 kPa, miscelare il 3% di acrilammide con lo 0,045% di bis-acrilammide. Per gli idrogel da 3 kPa, mescolare il 5% di acrilammide con lo 0,074% di bis-acrilammide. Per idrogel da 10 kPa, mescolare il 10% di acrilammide con lo 0,075% di bis-acrilammide. Per idrogel da 20 kPa, miscelare l'8% di acrilammide con lo 0,195% di bis-acrilammide. Per idrogel da 70 kPa, miscelare il 10% di acrilammide con lo 0,45% di bis-acrilammide.
        NOTA: Ulteriori dettagli su come ottenere la desiderabile rigidità dell'idrogel PA sono disponibili altrove.
    2. Preparare due soluzioni acquose per ogni rigidità dell'idrogel desiderabile. Preparare la soluzione 1 in modo che sia priva di microsfere e la soluzione 2 in modo che contenga lo 0,03% di microsfere fluorescenti di diametro 0,1 μm (vedere la tabella dei materiali).
    3. Degassare le soluzioni 1 e 2 sotto vuoto per 15 minuti per eliminare l'ossigeno che è noto per inibire la polimerizzazione delle soluzioni.
    4. Aggiungere lo 0,6% dei 10 g/mL della soluzione madre di APS e lo 0,43% di tetrametiletilendiammina (TEMED) alla soluzione 1 per consentire l'inizio della polimerizzazione. Agisci in fretta.
    5. Aggiungere 3,6 μl di soluzione 1 al centro di ciascun pozzetto della capsula a 24 pozzetti.
    6. Coprire immediatamente i pozzetti con vetrini coprioggetti circolari non trattati da 12 mm e lasciare riposare la soluzione 1 per 20 minuti in modo che polimerizzi completamente.
    7. Picchiettare delicatamente l'ago di una siringa su una superficie per creare un piccolo gancio sulla punta per facilitare la rimozione dei vetrini. Sollevare i vetrini coprioggetti utilizzando l'ago della siringa.
    8. Aggiungere lo 0,6% della soluzione stock APS da 10 g/mL e lo 0,43% di TEMED alla soluzione 2. Depositare 2,4 μl della miscela sopra il primo strato in ogni pozzetto della capsula a 24 pozzetti.
    9. Coprire la Soluzione 2 con vetrini circolari in vetro da 12 mm, premendo delicatamente verso il basso con un paio di pinze per garantire che lo spessore del secondo strato sia minimo. Lasciare polimerizzare la soluzione 2 per 20 minuti.
    10. Aggiungere 500 μl di 50 mM HEPES pH 7.5 a ciascuno dei pozzetti, quindi rimuovere i vetrini coprioggetti con l'ago della siringa e la pinza.
  2. Sterilizzazione, rivestimento di collagene ed equilibratura di idrogel di poliacrilammide
    1. Esporre gli idrogel ai raggi UV per 1 ora nella cappa di coltura tissutale per consentire la sterilizzazione.
    2. Preparare una miscela di 0,5% peso/volume di sulfosuccinimidil 6-(4′-azido-2′-nitrofenilammino)esanoato (Sulfo-SANPAH, vedere la Tabella dei materiali) in DMSO all'1% e 50 mM di HEPES pH = 7,5.
    3. Aggiungere 200 μl di questa soluzione alla superficie superiore degli idrogel. Agendo rapidamente, esponili ai raggi UV (302 nm) per 10 minuti per attivarli.
    4. Lavare gli idrogel due volte con 1 mL di 50 mM HEPES pH = 7,5. Ripetere se necessario per assicurarsi che l'eventuale reticolante in eccesso venga rimosso.
    5. Rivestire gli idrogel con 200 μL di 0,25 mg/mL di Collagene I per coda di ratto (vedi Tabella dei materiali) in 50 mM di HEPES. Incubare gli idrogel, con la soluzione di collagene sopra, per una notte a temperatura ambiente.
      nota: Per prevenire la disidratazione/evaporazione, posizionare le piastre a pozzetti multipli in un contenitore secondario e aggiungere fazzoletti per la pulizia da laboratorio imbevuti d'acqua nella periferia interna del contenimento.
    6. Utilizzare un microscopio a epifluorescenza o confocale con un obiettivo 40X per misurare lo spessore degli idrogel. A tale scopo, individuare le posizioni z del piano inferiore (dove si trova la superficie di vetro) e superiore dell'idrogel (dove l'intensità delle perle fluorescenti è massima). Quindi sottrai le posizioni z per determinare l'altezza.
      nota: Abbiamo utilizzato un microscopio a epifluorescenza invertita e un obiettivo 40X con apertura numerica 0,65 per misurare lo spessore degli idrogel. A questo punto è possibile eseguire anche misurazioni al microscopio a forza atomica (AFM) per confermare l'esatta rigidità degli idrogel (vedi Figura 2).
    7. Prima di seminare le cellule di interesse sugli idrogel, aggiungere 1 mL di terreno sugli idrogel e incubarli a 37 °C per 30 minuti a 1 ora per garantire l'equilibrio.
      nota: Abbiamo aggiunto il terreno completo MCDB-131 perché è il terreno in cui sono state coltivate le cellule ospiti del modello (HMEC-1) (vedere il passaggio 2.1 per i dettagli).

2. Coltura di cellule endoteliali microvascolari umane e semina su idrogel

  1. Coltura di cellule HMEC-1 (endoteliali microvascolari umane) in terreni completi MCDB-131 contenenti terreni MCDB-131 integrati con il 10% di siero fetale bovino, 10 ng/mL di fattore di crescita epidermico, 1 μg/mL di idrocortisone e 2 mM di L-glutammina (vedere la Tabella dei materiali).
  2. Dividere le colture confluenti 1:6 ogni 3 - 4 giorni e conservare le cellule fino al passaggio 40.
  3. Un giorno prima dell'esperimento, staccare le cellule dal loro recipiente di coltura utilizzando tripsina/EDTA allo 0,25%. Per prima cosa, lavare le cellule e il loro recipiente di coltura 1 volta con soluzione salina tamponata con fosfato sterile (PBS), quindi aggiungere la quantità appropriata di tripsina/EDTA allo 0,25% (2 mL per piatto da 100 mm o pallone da 75 cm, 1 mL per piatto da 60 mm o pallone da 25 cm), incubando il pallone a 37 °C per 5-10 minuti per consentire il distacco delle cellule dal loro substrato.
  4. Neutralizzare la tripsina aggiungendo il volume desiderato di terreno pieno MCDB-131, pipettare delicatamente per rompere i grumi di cellule, quindi posizionare la soluzione in una provetta da centrifuga conica.
  5. Agitare delicatamente la soluzione di cellule per assicurarsi che le cellule siano distribuite uniformemente, quindi estrarre 20 μl di soluzione e riempire molto delicatamente le due camere sotto il vetrino coprioggetti di un emocitometro di vetro.
  6. Pellettare la soluzione delle cellule contenute nella provetta conica da centrifuga mediante centrifugazione per 10 minuti a 500 x g.
  7. Durante il periodo di attesa di 10 minuti, contare le cellule utilizzando un emocitometro. Utilizzare un microscopio, mettere a fuoco le linee della griglia dell'emocitometro con un obiettivo 10X, quindi utilizzare un contatore di conteggio manuale per contare il numero di cellule in un quadrato di 1 mm x 1 mm.
  8. Spostare l'emocitometro su un altro quadrato di 1 mm x 1 mm, contare le cellule e ripetere il processo altre due volte. Calcola la media delle quattro misurazioni e poi moltiplica la media per 104. Il valore finale è il numero di cellule vitali/mL nella sospensione cellulare che viene centrifugata.
  9. Rimuovere il liquido dalla provetta da centrifuga conica assicurandosi che il pellet della cella non venga interrotto. Risospendere le cellule nel terreno pieno MCDB-131 a una concentrazione di 4 x 105 cellule/mL.
  10. Seminare le cellule in sospensione sugli idrogel rimuovendo prima il terreno con cui sono stati incubati gli idrogel e poi aggiungendo 1 mL di sospensione cellulare su ciascun idrogel.

3. Infezione di cellule endoteliali microvascolari umane con L. monocytogenes

  1. Tre giorni prima dell'infezione, strisciare il ceppo Lm da utilizzare da una scorta di glicerolo (conservato a -80 °C) su una piastra BHI-agar che contenga 7,5 μg/mL di cloramfenicolo e 200 μg/mL di streptomicina, se appropriato.
    nota: Il ceppo da striare può essere un wild-type o mutante, che esprime costitutivamente la fluorescenza (per l'immunocolorazione è stato utilizzato JAT1045) o che esprime la fluorescenza sotto il promotore ActA (per la citometria a flusso o la microscopia della forza di trazione sono stati utilizzati JAT983 o JAT985).
  2. Incubare le piastre a 37 °C fino a formare colonie discrete (1 - 2 giorni).
  3. Il giorno prima dell'infezione, coltivare il ceppo desiderato durante la notte, agitandolo a 150 giri/min a 30 °C in terreno BHI con 7,5 μg/mL di cloramfenicolo (se appropriato).
    1. Posizionare 5 mL di terreno BHI in una provetta da centrifuga conica da 15 mL, aggiungere 7,5 μg/mL di cloramfenicolo (se appropriato) e quindi inoculare una singola colonia dalla piastra di agar utilizzando un puntale sterile da 10 μL.
  4. Il giorno successivo, appena prima dell'infezione, misurare la densità ottica della soluzione batterica a 600 nm (OD600) diluendo il campione 1:5; utilizzare una cuvetta contenente solo BHI come bianco.
  5. Diluire la coltura per una notte a un OD600 di 0,1 e incubarla, agitando per 2 ore a 30 °C, in terreno BHI con 7,5 μg/mL di cloramfenicolo (se appropriato) per consentire ai batteri di raggiungere la fase logaritmica.
  6. Misurare l'OD600 della soluzione batterica, che dovrebbe essere di circa 0,2 - 0,3. Se l'OD600 è superiore, diluirlo a 0,2 - 0,3 con il solo BHI.
  7. Assumere 1 mL di soluzione batterica in una provetta da microcentrifuga. Centrifugare per 4 minuti a 2.000 x g utilizzando la centrifugazione a temperatura ambiente. Rimuovere il surnatante e risospendere il pellet batterico in 1 mL di PBS per coltura tissutale, nella cappa di coltura tissutale. Lavare i batteri altre due volte facendoli girare per 4 minuti a 2.000 x g a temperatura ambiente. Rimuovere il surnatante e risospendere i batteri in 1 mL di PBS.
  8. Preparare la miscela per l'infezione mescolando 10 o 50 μL di batteri risospesi in PBS con 1 mL di terreno completo MCDB-131 per una molteplicità di infezioni (MOI; cioè il numero di batteri per cellula ospite) di circa 50 batteri per cellula ospite o 10 batteri per cellula ospite.
  9. Rimuovere il terreno dai pozzetti delle piastre a 24 pozzetti, facendo attenzione a non danneggiare gli idrogel o le cellule. Lavare le cellule 1 volta con 1 mL di terreno pieno MCDB-131 e quindi aggiungere 1 mL di batteri a ciascun pozzetto.
  10. Coprire il piatto con il suo coperchio e avvolgere i piatti con pellicola per alimenti in polietilene per evitare perdite. Posizionare le piastre nella centrifuga e centrifugare i campioni per 10 minuti a 200 x g per sincronizzare l'invasione. Spostare le piastre nell'incubatore per colture tissutali e incubarle per 30 minuti a 37 °C.
  11. Lavare i campioni 4 volte con il terreno pieno MCDB-131 e spostarli nell'incubatore per colture tissutali. Dopo altri 30 minuti, sostituire il terreno con un terreno integrato con 20 μg/mL di gentamicina.

4. Citometria a flusso per quantificare la suscettibilità dipendente dalla rigidità della matrice extracellulare delle cellule ospiti alle infezioni

  1. Pesare 5 mg di collagenasi e metterla in una provetta da centrifuga conica da 15 mL. Aggiungere 10 mL di tripsina-EDTA allo 0,25% e mescolarli bene.
  2. 8 ore dopo l'infezione, rimuovere il terreno dai pozzetti della piastra a 24 pozzetti e lavare i pozzetti 1 volta con PBS per coltura tissutale. Rimuovere il PBS dai pozzetti e aggiungere 200 μl della miscela tripsina-EDTA/collagenasi a ciascun pozzetto. Metterlo nell'incubatore di coltura tissutale per 10 minuti per consentire il completo distacco delle cellule.
  3. Utilizzare una pipetta nuova per ogni pozzetto e pipettare la miscela su e giù 8 volte. Essere delicati in modo da non danneggiare le cellule. Aggiungere 200 μl di terreno pieno in ciascun pozzetto per neutralizzare la tripsina.
  4. Trasferire la soluzione cellulare da 400 μl di ciascun pozzetto in una provetta di polistirene da 5 mL con un tappo filtrante da 35 μm (vedere la tabella dei materiali).
  5. Analizza 10.000 - 20.000 cellule per campione mediante citometria a flusso. Eseguire l'acquisizione dei dati tramite citometria a flusso e determinare la percentuale di cellule infette per pozzetto utilizzando il software disponibile in commercio. Utilizzare i grafici a dispersione diretta rispetto a quelli a dispersione laterale per controllare la maggior parte della distribuzione del conteggio delle celle.
    NOTA:: Ciò garantirà l'analisi di singole cellule ed eliminerà detriti o doppiette o triplette cellulari.
    1. Misura il segnale di fluorescenza dalle cellule non infette da controllo e controlla la popolazione di cellule infette escludendo l'autofluorescenza.

Tabella 1. Composizione di idrogel di poliacrilammide (PA) di rigidità variabile. In questa tabella, la percentuale di soluzione madre di acrilammide al 40% e la percentuale di soluzione madre di bis-acrilammide al 2% per raggiungere una data rigidità (modulo di Young, E) sono indicate in diverse colonne.

Modulo di Young (E, kPa)% acrilammide (dal 40% di scorte)Bisacrilammide % (da 2% di scorte)
0,630,045
350,075
10100,075
2080,195
70100,45

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Risultati

figure-results-1
Figura 1: Saggio di infezione batterica di cellule ospiti che risiedono su idrogel di poliacrilammide (PA) sottili a due strati fluorescenti incorporati in perle di rigidità variabile.I vetrini coprioggetti sono modificati chimicamente per consentire l'attacco dell'idrogel. B. 3,6 μL di miscele di PA vengono depositati sul fondo del vetro. C. La miscela viene ricoper...

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Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Reagenti
Pellet di idrossido di sodiopescatoreS318-500
(3-amminopropil)trietossisilanosigmaVisualizzazione del materiale A3648
25% di gluteraldeidesigmaG6257-100ML
40% acrilammidesigmaA4058-100ML
Soluzione di bis-acrilammide (2% p/v)Fisher ScientificoBP1404-250
Fluorosfere microsfere modificate con carbossilato, 0,1 μm, fluorescenti giallo-verdi (505/515)InvitrogenF8803
Persolfato di ammoniopescatoreBP17925
TEMEDsigmaT9281-25ML
Sulfo-SANPAHProteochemC1111-100 mg
Collagene, soluzione di tipo I da rattosigmaC3867-1VL
Dimetilsolfossido (DMSO)J.T. BakerCodice 9224-01
HEPES, Acido liberoJ.T. BakerCodice: 4018-04
L-15 medium di Leibovitz, senza rosso fenoloThermofischer21083027
MCDB 131 Medium, senza glutamminaTecnologie di vita10372019
Fondazione Siero Fetale Bovino, Lotto: A37C48AGemini Bio-Prod900108 500ml
Fattore di crescita epidermico, EGFsigmaE9644
idrocortisonesigmaH0888
L-Glutammina 200mMpescatoreSH3003401
DPBS 1XpescatoreSH30028FS
Gentamicina solfatoMP biomedicaliCodice: 194530
CloramfenicolosigmaCodice C0378-5G
DifcoTM Agar, granulatoBdCodice 214530
BBL TM Infusione cervello-cuoreBd211059
Hoechst 33342, tricloridrato, triidrato - 10 mg/ul soluzione acquosaInvitrogenH3570
Formaldeide 16% grado EMMicroscopia15710-S
Anticorpo anti-Listeria monocytogenesAbcamab35132
Anticorpo secondario IgG (H+L) di capra anti-coniglio, coniugato Alexa Fluor® 546ThermofischerCodice A-11035
0,25% tripsina-EDTA , rosso fenoloThermofischer25200056
COLLAGENASI DA CLOSTRIDIUM ISTOLITICOsigmaVisualizzazione del materiale C8051
Streptomicina solfatoFisher Scientifico3810-74-0
saccarosioCalbiochemCodice: 8510
Sodio dodecil solfatoThermofischerCodice 28364
Polvere MESsigmaMotore M3885
KclJ.T. BakerCodice 3040-05
MgCl2J.T. BakerCodice 2444-1
EGTAAcrosNumero 40991
Attrezzature da laboratorio monouso
Vetrini circolari in vetro da 12 mmFisherbrand12-545-81N. 1.5 Vetrino coprioggetti | Diametro vetro 10 mm | Non rivestito
Piastre a 24 pozzetti con fondo in vetroMattekP24G-1.5-13-F
Provette in polistirene da 5 ml con tappo del filtro cellulare da 35 μmFalcone352235
Palloni T-25Falcone353118
Tubi conici da 50 mlFalconeCodice 352070
Tubi conici da 15 mlFalcone352196
Pipette sierologiche monouso (1 ml, 2 ml, 5 ml, 10 ml, 25 ml)Falcone357551
Pipette in vetro PasteurVWRCodice 14672-380
Puntali per pipette (1-200 μl, 101-1000 μl)DenvilleP1122, P1126
Guanti da esplorazione senza polvereMicroflexXC-310
Cuvette batteriSarstedt67.746
RasoiVWRCodice: 55411-050
Ago per siringaBd305167
0,2 um bottiglie sterilizzantiTermo Scientifico566-0020
Siringhe da 20 mlBdCodice 302830
Filtri da 0,2 umTermo Scientifico723-2520
bastoncini di legnoGrainger42181501
Impacco SaranSanta Cruz BiotecnologieSC-3687
Piastre batteriFalcone351029
Attrezzature da laboratorio di grandi dimensioni/non monouso
Cappa per coltura tissutaleFornaioS.r.l. SG504
EmocitometrosigmaZ359629
Incubatore di batteriTermo ScientificoIGS180
incubatore per coltura tissutaleNuAireNU-8700
Camera a vuoto/degasatoreBelartCodice: 4202537 °C e 5% di CO2
Microscopio a epifluorescenza Nikon Diaphot 200 invertitoNikonNIKON-DIAPHOT-200
Incubatrice a gabbiaHaisoncostume
Analizzatore Scanford FACScanStanford e Cytek hanno aggiornato il FACScancostume
Pipetta di ausilioDrummond4-000-110
Pipettatori (10 μl, 200 μl, 1000ul)GilsonF144802, F123601, F123602
Misuratore di pHMettler Toledo30019028
forcipeFSTCodice: 11000-12
Pallone da 1 litroFisherbrandFB5011000
Macchina per autoclaveAmscoAnno 3021
Piastra magnetica per mescolareBellco7760-06000
Barre di agitazione magneticheBellcoCodice 1975-00100
spettrofotometroBeckmanDU 640
Analizzatore Scanford FACScanCytek BioscienzeFACScan personalizzato Stanford e Cytek aggiornato
software
Software per microscopi (μManager)Apri Imaging
MatlabMatlab Inc
FlowjoFlussoJo, LLC
Software automatizzato per l'analisi delle immagini, CellChttps://sites.google.com/site/cellcsoftware/Il software è disponibile gratuitamente. I file eseguibili e i codici sorgente MATLAB possono essere ottenuti all https://sites.google.com/site/cellcsoftware/

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