1. Colture cellulari batteriche e preparazione del surnatante libero da cellule di Lactobacillus (LCFS)
NOTA: Le fasi 1.2 – 1.9 vengono condotte in una camera anaerobica.
- Preparare una piastra di agar De Man-Rogosa-Sharpe (MRS) e un brodo contenente L-cisteina e sterilizzare in autoclave.
- Pre-incubare la piastra di agar MRS in camera anaerobica H2 mantenuta a 37 °C con 20 ppm di ossigeno.
- Scongelare il ceppo batterico di Lactobacillus e inoculare la piastra di agar con la coltura batterica (Figura 1A (i)).
- Incubare i batteri per 2 - 3 giorni in camera anaerobica H2 a 37 °C e 20 ppm di ossigeno fino ad ottenere singole colonie batteriche.
- Lavare e asciugare la provetta per coltura anerobica di tipo Hungate. Autoclavare la provetta di coltura a 121 °C per 15 minuti.
- Quindi incubare la provetta in camera anaerobica H2 a 37 °C e 20 ppm di ossigeno per rimuovere l'ossigeno.
- Mettere 2 - 3 ml di brodo MRS nella provetta. Sigillare il tubo con un tappo di gomma butilica e avvitare il tappo.
- Ottenere una singola colonia con un ansa e inserirla nella provetta di coltura da 1,5 ml con 500 μl di 1x PBS. (Figura 1A (ii)).
- Sospendere la colonia utilizzando una siringa da 1 ml (Figura 1A (iii)). A tale scopo, inserire l'ago della siringa da 1 mL al centro del coperchio del tubo, aspirare la colonia sospesa e quindi risospenderla nel terreno di brodo MRS. (Figura 1A (iv)).
- Incubare il terreno di distillazione MRS in un'incubatrice con agitatore per 2 giorni (37 °C, 5% CO2, 200 giri/min).
- Misurare la densità ottica (OD) utilizzando uno spettrofotometro per monitorare le curve di crescita batterica fino a quando l'assorbanza a OD620 raggiunge 2,0.
- Separare i pellet batterici e il terreno condizionato centrifugando a 1.000 x g per 15 minuti. Lavare i pellet batterici raccolti con 1x PBS e risospendere in 4 mL di RPMI 1640 integrato con il 10% di siero fetale bovino. Non includere antibiotici nel terreno.
- Mantenere i pellet batterici in RPMI e incubare in un incubatore shaker per 4 ore a 37 °C con il 5% di CO2 ad una velocità di 100 giri/min.
- Per la preparazione del surnatante probiotico, rimuovere il pellet batterico mediante centrifugazione a 1000 x g, per 15 minuti a 4 °C. Filtrare sterilemente il surnatante recuperato utilizzando un filtro da 0,22 μm e conservare a -80 °C fino al momento dell'uso.
2. Generazione di sferoidi
- Preparazione di linee cellulari di cancro del colon-retto
- Coltivare le linee cellulari DLD-1, HT-29 e WiDr in monostrati fino alla confluenza del 70-80% e incubare la piastra a 37 °C in un incubatore al 5% di CO2 (terreno di crescita: RPMI contenente il 10% di siero fetale bovino (FBS) e l'1% di penicillina-streptomicina).
- Per le cellule coltivate in piastra di Petri da 100 mm, lavare la piastra due volte con 4 mL di 1x PBS. Aggiungere 1 mL di tripsina-EDTA allo 0,25% e incubare la piastra di Petri per 2 minuti a 37 °C in un incubatore al 5% di CO2 per dissociare le cellule.
- Dopo l'incubazione, controllare la dissociazione cellulare al microscopio e neutralizzare la tripsina-EDTA con 5 mL di terreno di crescita.
- Trasferire le cellule dissociate in una provetta conica da 15 mL e centrifugare per 3 minuti a 300 x g.
- Scartare il surnatante e risospendere delicatamente con 3 mL di terreno di coltura.
- Contare le cellule con il blu di tripano per determinare le cellule vitali utilizzando un emocitometro. (Figura 1B (i))
- Formazione di sferoidi
- In una provetta conica da 15 mL, diluire le cellule da 2.1.5 per ottenere 1 - 2 x 105 cellule/mL (Figura 1B (ii))
- Aggiungere la concentrazione finale di metilcellulosa allo 0,6% alla sospensione cellulare e trasferire le cellule diluite in un serbatoio sterile.
NOTA: Per ogni linea cellulare, la quantità di metilcellulosa necessaria deve essere titolata e determinata di conseguenza.
- Utilizzare una pipetta multicanale per erogare 200 μl di cellule in ciascun pozzetto di una micropiastra a fondo tondo a 96 pozzetti con attacco ultrabasso. (Figura 1B (iii))
- Incubare la piastra a 37 °C in un incubatore al 5% di CO2 per 24 - 36 ore.
- Dopo 24 - 36 ore, osservare la lastra al microscopio ottico per garantire la formazione di sferoidi.
3. Trattamento delle cellule tumorali del colon-retto 3D con LCFS
- Generare sferoidi come descritto nei passaggi 2 e 3.
- Prima di eseguire il trattamento LCFS, scongelare l'LCFS congelato a temperatura ambiente (RT) per 10 - 20 minuti.
- Inoculare la soluzione madre LCFS in un terreno di coltura. Diluire in serie al 25%, 12,5% e 6% nel terreno di crescita (ovvero, 25% LCFS = 150 μL di terreno di crescita + 50 μL di LCFS).
- Estrarre la piastra di coltura cellulare contenente gli sferoidi dall'incubatore e rimuovere la maggior parte possibile del terreno di crescita da ciascun pozzetto utilizzando una pipetta da 200 μl.
- Aggiungere il terreno di coltura con LCFS sulle cellule e incubare a 37 °C in un incubatore al 5% di CO2 per 24 - 48 h.
nota: Il volume da utilizzare dipenderà dalle dimensioni della piastra come segue: 2 mL per piastre per colture cellulari a 6 pozzetti; 200 μl per piastre per colture cellulari a 96 pozzetti.