Tutte le procedure che prevedono la raccolta dei campioni sono state eseguite in conformità con le linee guida IRB dell'istituto.
Prepara la soluzione di miscela di terreni di centrifugazione a densità inserendo 90 ml di 10x PBS in 264 ml di acqua deionizzata ultrapura (3.93x) in un contenitore di plastica sterile. Titolare a pH 7,0-7,2 con HCl e sterilizzare il filtro attraverso un filtro da 0,22 μm. Conservare a 4 °C.
Preparare il terreno di centrifugazione con densità al 70% combinando 18 ml di soluzione di miscelazione per terreni di centrifugazione a densità con 30 ml di terreno di centrifugazione a densità (vedere l'elenco dei materiali per i dettagli) in una provetta da centrifuga in polipropilene da 50 ml. Conservare a 4 °C, ma portare a RT prima dell'uso.
Prepara il terreno di centrifugazione con densità del 37% combinando 9,6 ml di DPBS con 10,4 ml di terreno di centrifugazione con densità al 70% in una provetta da centrifuga da 50 ml. Conservare a 4 °C, ma portare a RT prima dell'uso.
1. Isolamento delle PBMC infiltranti il glioma
- Usando una lama di rasoio pulita e a taglio singolo, isolare l'area del cervello contenente il tumore praticando un taglio sagittale al centro del cervello per dividere in due i due emisferi. Capovolgere il lato mediale dell'emisfero omolaterale verso il basso ed eseguire due tagli coronali a livello del cervelletto e del bulbo olfattivo per isolare il tessuto bersaglio contenente l'impianto tumorale (Figura 1A). Una porzione equivalente dell'emisfero controlaterale può anche essere isolata e utilizzata come controllo negativo.
- Posizionare il tessuto bersaglio nel macinatore di carta Dounce in vetro contenente 1 ml di DPBS, spingere lo stantuffo fino in fondo e ruotare 7 volte per interrompere inizialmente il tessuto. Sollevare lo stantuffo per consentire al liquido di depositarsi sul fondo del macina fazzoletti. Ripeti questo passaggio tre volte; Tuttavia, ruotare lo stantuffo solo 4 volte durante le due ripetizioni successive e 3 volte durante l'ultima ripetizione per evitare di triturare eccessivamente il tessuto.
- Utilizzando una micropipetta P-1000, applicare in sequenza tre volumi da 1 ml di DPBS ghiacciato lungo i lati dello stantuffo da risciacquare nel macinatore di fazzoletti.
- Risospendere la materia cerebrale triturata pipettandola su e giù e mettendola in una provetta da centrifuga da 15 ml etichettata su ghiaccio. Sciacquare i lati del macina fazzoletti Dounce con 1 ml aggiuntivo di DPBS ghiacciato e aggiungere alla stessa provetta da centrifuga da 15 ml. Conservare tutte le provette contenenti materia cerebrale triturata su ghiaccio fino a quando tutti i campioni non sono stati elaborati.
- Una volta che tutti i campioni sono stati processati, centrifugare la materia cerebrale triturata nelle provette da centrifuga da 15 ml a 740 x g (RCF max) per 20 minuti a 4 °C.
- Rimuovere il surnatante con una pipetta sierologica da 10 ml e una pistola per pipette e risospendere la materia cerebrale pellettata in 1 ml di enzimi digestivi collagenasi/DNasi-I precedentemente preparati utilizzando un P-1000. Mettere le provette da centrifuga da 15 ml in un rack per provette e metterle a bagnomaria a 37 °C per 15 minuti.
- Agitare delicatamente i campioni due volte durante il periodo di incubazione muovendo le provette per facilitare la disaggregazione dei tessuti.
- Aggiungere 6 ml di DPBS ghiacciato utilizzando una pipetta sierologica da 10 ml a ciascuna provetta per diluire gli enzimi digestivi. Pipettare su e giù per risospendere e filtrare i volumi totali attraverso filtri sterili a rete di nylon da 70 μm in nuove provette da centrifuga da 15 ml etichettate su ghiaccio.
- Far girare la sospensione di cellule cerebrali verso il basso a 740 x g (RCF max) per 20 minuti a 4 °C per ottenere un pellet a cellula singola (Figura 1B). Dopo aver tolto le provette da 15 ml dalla centrifuga, metterle sul ghiaccio e aumentare la temperatura impostata sulla centrifuga a circa 21 °C in preparazione per il passaggio successivo.
- Rimuovere completamente il surnatante da ciascuna provetta contenente le cellule cerebrali e risospendere inizialmente i pellet in 1 ml di terreno di centrifugazione con densità al 70% utilizzando una micropipetta P-1000. Quindi aggiungere altri 4 millilitri di terreno di centrifugazione con densità al 70% in ciascuna provetta utilizzando una pipetta sierologica da 10 ml. Avvitare saldamente i tappi e omogeneizzare la sospensione cellulare capovolgendola delicatamente in tubi più volte.
- Rimuovere dal ghiaccio le provette da centrifuga da 15 ml contenenti cellule cerebrali risospese in un mezzo di centrifugazione con densità al 70% e metterle in un rack per provette a RT. Uno alla volta, sovrapporre con cura 2 ml di soluzione di terreno di centrifugazione con densità al 37% sui 5 ml di terreno di centrifugazione con densità al 70% con una micropipetta P-1000 per formare un'interfaccia pulita tra i due strati di terreno di centrifugazione a densità (Figura 1C).
- Utilizzare un pennarello a punta fine per indicare la posizione dell'interfaccia in modo che possa essere facilmente identificata dopo la centrifugazione, quando la distinzione diventa meno evidente.
- Centrifugare le provette da centrifuga da 15 ml a 740 x g (RCF max) per 20 minuti a RT senza interruzioni per evitare di interrompere l'interfaccia.
- Dopo la centrifugazione, raccogliere le PBMC che si sono accumulate all'interfaccia tra i due strati di terreno di centrifugazione a densità (Figura 1D) introducendo una micropipetta P-200 nella provetta lungo il suo lato, bypassando accuratamente lo strato lipidico.
- Una volta raggiunto il livello della banda PBMC, estrarre lentamente 200 μl dalla superficie dello strato di terreno di centrifugazione con densità del 70% e posizionarlo in una provetta FACS in polipropilene rispettivamente etichettata su ghiaccio. Ripetere una volta per un volume totale di 400 μl per campione.
- Aggiungere 3 ml di tampone di flusso a ciascuna provetta FACS contenente 400 μl di PBMC per diluire sufficientemente il mezzo di centrifugazione a densità, quindi centrifugare le cellule a 660 x g (RCF max) per 20 minuti a 4 °C.