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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Fonte: Iredale, J. A., et al. Registrazione dell'attività di rete nei circuiti nocicettivi spinali utilizzando array di microelettrodi. J. Vis. Exp. (2022).
Questo video mostra un test basato su array di microelettrodi per studiare l'attività della rete neuronale in sezioni di midollo spinale di topo. In primo luogo, viene registrata l'attività elettrofisiologica del corno dorsale superficiale (SDH) della fetta. Quindi, viene introdotto un inibitore del canale del potassio per prolungare la depolarizzazione, con conseguente attività ritmica sincrona attraverso la rete neuronale.
Tutte le procedure che prevedono la raccolta dei campioni sono state eseguite in conformità con le linee guida IRB dell'istituto.
1. Elettrofisiologia in vitro
2. Liquido cerebrospinale artificiale sostituito con saccarosio
NOTA: L'aCSF sostituito con saccarosio viene utilizzato durante la dissezione e il taglio del midollo spinale. Come indicato dal nome, il saccarosio viene sostituito al NaCl per ridurre l'eccitazione neuronale durante queste procedure mantenendo l'osmolarità. Vedere la Tabella 1 per la composizione dettagliata.
3. Preparazione dell'array di microelettrodi
NOTA: La superficie di contatto del MEA richiede un pretrattamento per renderlo idrofilo.
4. Preparazione acuta della fetta del midollo spinale
5. Registrazioni di array di microelettrodi
NOTA: I seguenti passaggi descrivono in dettaglio come utilizzare i dati di registrazione da esperimenti basati su MEA su fette di midollo spinale. A seconda dell'esperimento, è possibile utilizzare diversi design MEA. I dettagli di progettazione per i MEA utilizzati in questi esperimenti sono mostrati nella Tabella 2 e nella Figura 2. Informazioni dettagliate sulla progettazione sono state pubblicate da Egert et al. e Thiebaud et al. rispettivamente per MEA planari e tridimensionali (3D). Entrambi i tipi MEA sono composti da 60 elettrodi in nitruro di titanio, con uno strato isolante in nitruro di silicio e piste e piazzole di contatto in nitruro di titanio.
Tabella 1: Composizioni del Liquido Cerebrospinale Artificiale.
| chimico | aCSF (mM) | aCSF (g/100 mL) | ACSF sostituito con saccarosio (mM) | ACSF sostituito con saccarosio (g/100 mL) | ACSF ad alto contenuto di potassio (mM) | ACSF ad alto contenuto di potassio (g/100 mL) |
| Cloruro di sodio (NaCl) | 118 | 0,690 | - | - | 118 | 0,690 |
| Carbonato acido di sodio (NaHCO3) | 25 | 0,210 | 25 | 0,210 | 25 | 0,210 |
| glucosio | 10 | 0,180 | 10 | 0,180 | 10 | 0,180 |
| Cloruro di potassio (KCl) | 2.5 | 0,019 | 2.5 | 0,019 | 4.5 | 0,034 |
| Diidrogeno fosfato di sodio (NaH2PO4) | 1 | 0,012 | 1 | 0,012 | 1 | 0,012 |
| Cloruro di magnesio (MgCl2) | 1 | 0,01 | 1 | 0,01 | 1 | 0,01 |
| Cloruro di calcio (CaCl2) | 2.5 | 0,028 | 2.5 | 0,028 | 2.5 | 0,028 |
| saccarosio | - | - | 250 | 8.558 | - | - |
Tabella 2: Layout di array di microelettrodi.
| Layout dell'array di microelettrodi | ||||
| Modello di array di microelettrodi | 60MEA 200/30iR-Ti | 60-3DMEA 100/12/40iR-Ti | 60-3DMEA 200/12/50iR-Ti | 60MEA 500/30iR-Ti |
| Planare o tridimensionale (3D) | planare | 3d | 3d | planare |
| Griglia di elettrodi | 8 x 8 | 8 x 8 | 8 x 8 | 6 x 10 |
| Spaziatura degli elettrodi | 200 μm | 100 μm | 200 μm | 500 μm |
| Diametro dell'elettrodo | 30 μm | 12 μm | 12 μm | 30 μm |
| Altezza elettrodo (3D) | N/A | 40 μm | 50 μm | N/A |
| Esperimenti | Sezione trasversale | Sezione trasversale | Sagittale + Orizzontale | Sagittale + Orizzontale |

Figura 1: Orientamenti della fetta del midollo spinale, metodi di montaggio e taglio. (A) Le fette trasversali richiedono un blocco di taglio in polistirolo con una scanalatura di supporto tagliata. Il midollo spinale è appoggiato contro il blocco nella scanalatura di supporto, il lato dorsale del midollo è rivolto lontano dal blocco. Il blocco e il cavo sono incollati su una fase di taglio con adesivo cianoacrilato. (B) Le fette sagittali vengono preparate posizionando una sottile linea di adesivo cianoacrilato sulla fase di taglio e quindi posizionando il midollo spinale su un lato sulla colla. (C) Le fette orizzontali vengono preparate posizionando una linea sottile di adesivo cianoacrilato sulla fase di taglio e quindi posizionando il lato ventrale del midollo spinale rivolto verso il basso sulla colla.

Figura 2: Posizionamento del tessuto sull'array di microelettrodi. (A) L'immagine mostra un headstage MEA aperto con un MEA posizionato in posizione. (B) Come A con l'headstage MEA chiuso per le registrazioni e il sistema di perfusione tissutale in atto. (C) L'immagine mostra un MEA fornito dal produttore. Vengono mostrati i cuscinetti di contatto, che si interfacciano con le molle dorate dell'headstage, e il bagno di tessuto MEA che contiene la soluzione per il bagno di tessuto e la fetta di tessuto. L'area evidenziata dal quadrato rosso al centro è la posizione dell'array di elettrodi. (D) Gli schemi mostrano le due configurazioni di elettrodi MEA utilizzate in questo studio, con ulteriori dettagli presentati nella Tabella 2. L'elettrodo di riferimento è indicato dal trapezio blu. Il layout degli elettrodi MEA a sinistra mostra una configurazione quadrata a 60 elettrodi, utilizzata maggiormente nei modelli di lavoro presentati 60MEA200/30iR-Ti con elettrodi di diametro 30 μm distanziati di 200 μm l'uno dall'altro, o MEA tridimensionali distanziati di 200 μm e 100 μm (60MEA200/12/50iR-Ti e 60MEA100/12/40iR-Ti) con elettrodi di 12 μm di diametro e 50 μm o 40 μm di altezza, rispettivamente. Il layout dell'elettrodo MEA sinistro mostra un layout rettangolare dell'elettrodo 6 x 10-60MEA500/30iR-Ti. (E) Immagine ad alto ingrandimento di un MEA quadrato 60MEA100/12/40iR-Ti con fetta trasversale del midollo spinale posizionata per la registrazione. La fetta si trova sulle file di elettrodi 3-8. La fila superiore di elettrodi, che non entrano in contatto con alcun tessuto, funge da elettrodo di riferimento. L'area SDH appare come una banda semitrasparente. In questo caso, l'SDH si sovrappone agli elettrodi nelle righe 4, 5 e 6 e nelle colonne 2, 3, 4, 5 e 7 del MEA. Barra della scala = 200 μm. Abbreviazioni: MEA = array di microelettrodi; SDH = corno dorsale superficiale.

Figura 3: Layout degli strumenti di registrazione e analisi dei dati ed esempi di registrazioni di array di microelettrodi che mostrano il potenziale d'azione extracellulare e le forme d'onda del potenziale di campo locale. (A) Lo schema mostra il modello di registrazione preconfigurato utilizzato per l'acquisizione dei dati MEA. Il collegamento del MEA2100 e dello strumento di registrazione (headstage/amplificatore) consente di denominare e salvare i dati. Quattro tracce esemplificative di dati grezzi (a destra, epoche di 5 minuti) sono state raccolte da un canale MEA che mostrava l'attività al basale, 12 minuti dopo l'applicazione di 4-AP, altri 15 minuti dopo l'attività di 4-AP stabilita e dopo l'applicazione in bagno di TTX (1 μM). Si noti che l'aggiunta di 4-AP (seconda traccia) produce un chiaro aumento del rumore di fondo e dell'attività EAP/LFP. È importante sottolineare che l'attività rimane relativamente stabile per almeno 15 minuti dopo che l'attività indotta da 4-AP è stata stabilita (terza traccia). L'aggiunta di TTX (1 μM) abolisce tutta l'attività (traccia inferiore). (B) Lo schema (a sinistra) mostra la configurazione del software dell'analizzatore per l'analisi dei dati. Lo strumento di esplorazione dei dati grezzi viene utilizzato per importare le registrazioni raccolte dal software di registrazione. Questi dati vengono quindi fatti passare attraverso uno strumento di filtro cross-channel che sottrae i segnali degli elettrodi di riferimento selezionati dagli altri elettrodi per rimuovere il rumore di fondo. I dati passano attraverso il filtro EAP e gli strumenti di filtro LFP per ottimizzare le relazioni segnale-rumore per ciascuna forma d'onda. Al termine di questo passaggio, i dati del percorso EAP vengono inseriti nello strumento di rilevamento EAP, in cui vengono impostate le soglie. Gli EAP vengono rilevati e quindi inviati allo strumento di analisi EAP, dove le latenze di ciascun evento vengono registrate ed esportate come txt. file. Un flusso di lavoro identico si verifica per i dati LFP utilizzando un toolkit LFP corrispondente. Le tracce a destra mostrano i dati di un singolo canale MEA contenente varie forme d'onda extracellulari. La posizione dei segnali EAP e LFP è evidenziata nei "raster di conteggio" di cui sopra. Le tracce inferiori sono epoche della registrazione superiore (indicate da barre rosse) che mostrano forme d'onda su una scala temporale estesa, inclusi vari segnali LFP (notare la varietà di apparizioni) e singoli EAP extracellulari (cerchi rossi). Si noti che la forma d'onda e la polarità LFP/EAP variano in relazione al numero di neuroni che producono questi segnali, alla loro vicinanza all'elettrodo di registrazione e alla loro posizione in relazione all'elettrodo o agli elettrodi vicini. Abbreviazioni: MEA = array di microelettrodi; EAP = potenziale d'azione extracellulare; LFP = potenziale di campo locale; 4-AP = 4-amminopiridina; TTX = tetrodotossina.
| 4-amminopiridina | Sigma-Aldrich | Codice 275875-5G | |
| 100% etanolo | Thermo Fisher | AJA214-2.5LPL | |
| CaCl2 1M | Banksia Scientifica | 0430/1L | |
| Carbonox (Carbogen - 95% O2, 5% CO2) | Nucleo | di219122 | |
| Forbici a molla a manico lungo curvo | Strumenti per la scienza | Codice: 15015-11 | |
| Camera di incubazione dell'interfaccia dell'aria su misura | |||
| Siero fetale bovino | Thermo Fisher | 10091130 | |
| Pinze Dumont #5 | Strumenti per la scienza | Codice 11251-30 | |
| glucosio | Thermo Fisher | AJA783-500G | |
| Siero per cavalli | Thermo Fisher | 16050130 | |
| Microscopio invertito | Zeiss | Assiovert10 | |
| Kcl | Thermo Fisher | AJA383-500G | |
| Ketamina | Ceva | KETALAB04 | |
| Forbici chirurgiche grandi | Strumenti per la scienza | Codice: 14007-14 | |
| Loctite 454 Adesivo istantaneo | Bulloneria e forniture industriali | L4543G | |
| MATLAB | MathWorks | R2018b | |
| MEA tridimensionali | Sistemi multicanale | 60-3DMEA100/12/40iR-Ti, 60-3DMEA200/12/50iR-Ti | 60 elettrodi in nitruro di titanio (TiN) con 1 elettrodo di riferimento interno, organizzati in una griglia quadrata 8x8. Gli elettrodi hanno un diametro di 12 μm, un'altezza di 40 μm (100/12/40) o 50 μm (200/12/50) e una distanza equidistante di 100 μm (100/12/40) o 200 μm (200/12/50) l'uno dall'altro. |
| Stadio di testa MEA | Sistemi multicanale | MEA2100-HS60 | |
| Scheda di interfaccia MEA | Sistemi multicanale | Avvio multiplo MCS-IFB 3.0 | |
| Rete MEA | Sistemi multicanale | ALA HSG-MEA-5BD | |
| Sistema di perfusione MEA | Sistemi multicanale | PPS2 | |
| MEA, planare | Sistemi multicanale | 60MEA200/30iR-Ti, 60MEA500/30iR-Ti | 60 elettrodi in nitruro di titanio (TiN) con 1 elettrodo di riferimento interno, organizzati in una griglia quadrata 8x8 (200/30) o in una griglia rettangolare 6x10 (500/30). Gli elettrodi hanno un diametro di 30 μm e sono equidistanti tra loro di 200 μm (200/30) o 500 μm (500/30). |
| MgCl2 | Thermo Fisher | AJA296-500G | |
| Fotocamera per microscopio | Motico | Moticam X Wi-Fi | |
| Software di analisi multicanale | Sistemi multicanale | V 2.17.4 | |
| Software per sperimentatori multicanale | Sistemi multicanale | V 2.17.4 | |
| NaCl | Thermo Fisher | AJA465-500G | |
| NaHCO3 | Thermo Fisher | AJA475-500G | |
| NaH2PO4 | Thermo Fisher | ACR207805000 | |
| Rongeurs | Strumenti per la scienza | Codice: 16021-14 | |
| Piccole forbici a molla | Strumenti per la scienza | Codice 91500-09 | |
| Piccole forbici chirurgiche | Strumenti per la scienza | Codice 14060-09 | |
| saccarosio | Thermo Fisher | AJA530-500G | |
| Supercolla | adesivo cianoacrilato | ||
| Tetrodotossina | Abcam | AB120055 | |
| Tabella di isolamento dalle vibrazioni | Newport | VH3048W-OPT | |
| Microtomo vibrante | Leica | VT1200 S |