1. Immunocolorazione di fette di organoidi
- Posizionare i vetrini del microscopio contenenti sezioni di organoidi in un barattolo di copertura con 50 ml di PBS 1x preriscaldato, che può contenere fino a 10 vetrini uno dopo l'altro.
nota: Tutte le sezioni dell'organoide devono essere immerse in un liquido.
- Incubare per 45 minuti a 37 °C per degelatinizzare i vetrini.
- Lavare 1 volta con 50 mL di PBS 1× per 5 minuti a RT: trasferire i vetrini in un barattolo contenente 1× PBS fresco.
- Trasferire i vetrini in un barattolo contenente 50 mL di glicina appena preparata (Tabella 1) e incubare per 10 minuti a RT.
- Trasferire i vetrini in una baracca contenente 50 mL di tritone allo 0,1% (Tabella 1) e permeabilizzare per 10 minuti a RT.
- Lavare con 1× PBS per 5 minuti 2x.
- Preparare la piastra di immunocolorazione con carta da 3 mm imbevuta di PBS 1×. Asciugare i vetrini con un fazzoletto di carta tutto intorno alle fette e posizionarli su carta da 3 mm. Con una pipetta Pasteur, coprire l'intera superficie dei vetrini con una soluzione bloccante (Tabella 1), 0,5 ml per vetrino. Incubare per 30 minuti a RT.
- Rimuovere la soluzione bloccante in eccesso e asciugare i vetrini con un fazzoletto tutto intorno alle fette. Porre 50 μl dell'anticorpo primario (Tabella 2) diluito in soluzione bloccante sulle sezioni e coprire con i vetrini. Mettere le fette in un piatto di immunocolorazione precedentemente preparato. Incubare per una notte a 4 °C.
- Trasferire i vetrini in un barattolo con 50 ml di TBST (Tabella 1), lasciare cadere i vetrini coprioggetti e lavare con TBST per 5 minuti 3 volte.
- Porre 50 μl dell'anticorpo secondario diluito in soluzione bloccante sulle sezioni e coprire con i vetrini. Mettere le fette nella capsula di immunocolorazione precedentemente preparata. Incubare per 30 minuti a RT, al riparo dalla luce.
- Trasferire nuovamente i vetrini in un barattolo di copertura e lavare con 50 ml di TBST per 5 minuti 3 volte.
- Asciugare i vetrini con la velina tutt'intorno alle fette e posizionare le fette in una capsula di immunocolorazione precedentemente preparata. Con una pipetta Pasteur, aggiungere 0,5 mL di soluzione DAPI su tutta la superficie dei vetrini. Incubare per 5 minuti a RT.
- Ripetere il passaggio 1.9.
- Asciugare accuratamente i vetrini con un fazzoletto. Aggiungere 50 μl di mezzo di montaggio goccia a goccia lungo il vetrino, quindi abbassare con cautela un vetrino coprioggetti su ciascun vetrino, piegandolo leggermente per evitare bolle.
Tabella 1: Soluzioni per la preparazione di organoidi per criosezione e immunocolorazione. Sono elencati tutti i componenti e i volumi utilizzati per preparare le soluzioni utilizzate nella preparazione di organoidi per criosezione e immunocolorazione.
| Gelatina/Saccarosio<br />
Concentrazione finale: 7,5%/15% p/p | 1. Pesare 15 g di saccarosio e 7,5 g di gelatina in una bottiglia di vetro Schott sterile e mescolare bene
2. Preriscaldare il PBS 1 volta a 65 °C
3. Aggiungere PBS 1x preriscaldato fino a un peso finale di 100 g e mescolare bene
4. Mettere la bottiglia di vetro Schott in una piastra riscaldante a 65 °C e agitare fino a quando la gelatina non si scioglie
5. Incubare a 37 °C fino a quando la soluzione non si stabilizza |
Glicina
Concentrazione finale: 0,1 M | Aggiungere 0,37 g di glicina a 50 ml di PBS 1x appena preparato. |
Soluzione Triton
Concentrazione finale: 0,1 % p/v | 1. Preparare un brodo Triton X-100 al 10%: 5 g di Triton X-100 in 50 ml di PBS 1x
2. Aggiungere 0,5 mL di stock Triton X-100 a 50 mL di PBS 1x. |
TBST
20 mM Tris-HCl pH 8,0, 150 mM NaCl, 0,05 % p/v Tween-20 | 20 ml Tris 1 M
30 mL di NaCl 5 M
5 mL di Tween-20 (10 % di brodo: 5 g di Tween-20 in 50 mL di acqua)
Riempire fino a 1 L con acqua. |
| Soluzione di blocco | Aggiungere 5 mL di siero fetale bovino (FBS, concentrazione finale: 10 % v/v) a 50 mL di TBST. |
| Soluzione DAPI | Aggiungere 15 μL di soluzione madre DAPI (1 mg/mL) a 10 mL di acqua distillata |
| Mowiol | 1. Aggiungere 2,4 g di Mowiol a 6 g di glicerolo e agitare per 1 ora in una piastra preriscaldata a 50 °C
2. Aggiungere 6 ml di acqua distillata e agitare per 2 h
3. Aggiungere 12 mL di Tris 200 mM (pH 8,5) e agitare per 10 min
4. Centrifugare a 5.000 × g per 15 min5. Aliquotare e conservare a -20 °C. |
Tabella 2: Anticorpi primari. Vengono elencati gli anticorpi primari, i cloni e le diluizioni ottimizzate utilizzate per l'immunocolorazione.
1
| anticorpo | Specie ospiti | diluizione |
| BARHL1 | coniglio | 1/500 |
| CALBINDINA | coniglio | 1/500 |
| MAP2 | topo | 1/1000 |
| N-CADHERIN | topo | 1/1000 |
| NESTINA | topo | 1/400 |
| OLIG2 | coniglio | 1/500 |
| PAX6 | coniglio | 1/400 |
| SOX2 | topo | 1/200 |
| Da definire | coniglio | 1/200 |
| TBR2 | coniglio | 1/200 |
| TUJ1 | topo | 1/1000 |