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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo video mostra il monitoraggio del recupero interneuromastocitario nel pesce zebra utilizzando la microscopia confocale, monitorando la morte e la riparazione cellulare attraverso l'imaging a fluorescenza time-lapse.
1. Imaging post-ablazione e microscopia time-lapse per studiare la rigenerazione

Figura 1: Ablazione selettiva di cellule interneuromast mediante irradiazione laser. (A) Le cellule interneuromast tra i neuromasti primIL3 e primIL4 sono state selezionate per l'ablazione. Queste cellule mostrano una caratteristica forma a fuso con proiezioni allungate che si sovrappongono ai corpi cellulari adiacenti. (B) L'imaging pre-ablazione ha identificato i corpi cellulari che potrebbero essere ablati per produrre un gap. (C) L'imaging post-ablazione conferma il successo dell'ablazione, come indicato dall'assenza di corpi cellulari nella regione del gap. Barre della scala = 10 μm.

Figura 2: L'imaging post-ablazione dimostra la morte cellulare in risposta all'esposizione al laser in cellule interneuromasti marcate con GFP (Green fluorescent protein). L'imaging con fotomoltiplicatore a luce trasmessa (T-PMT) indica la presenza di una cellula necrotica con un aspetto granulare (cerchiata) e il reclutamento di cellule di forma irregolare che sono probabilmente macrofagi (*). La fusione dei canali GFP e T-PMT conferma che la morte cellulare e l'attività dei macrofagi si sono verificate nel sito di ablazione. Barre di scala = 10 μm.
| diapositive stampate PTFE a 12 pozzetti | Scienze di microscopia elettronica | 63425-05 | |
| 15 mM Tricaine stock solution | Sigma | E10521 | 15 mM Tricaina in acqua di osmosi inversa |
| 1X E3 + 600 μM Tricaine | Diluisci 15 mM di stock di Tricaina 25X in supporti 1X E3 | ||
| 1X E3 media | < | td style='overflow:nascosto;imbottitura:0px 3px;allineamento-verticale:fondo;'>Diluire 60X E3 media a 1X in acqua ad osmosi inversa (16.7 ml/L) | |
| 60 X E3 media | Tutti i componenti acquistati da Sigma-Aldrich | 34.4 g Nacl, 1.52 g Kcl, 5.8 g CaCl2.2H2O, 9.8 g MgSO4.7H20 in 1 litro di acqua ad osmosi inversa | |
| Bx60 Microscopio composto con lampada ad arco di mercurio fluorescente | Olimpo | ||
| Microscopio confocale LSM 700 dotato di laser da 405 nm, 488 nm e 555 o 561 nm | Carl Zeiss Microscopy, LLC | Per l'ablazione è stato utilizzato un laser da 5 mW 405 nm; Le ablazioni e l'imaging sono state eseguite attraverso un obiettivo Plan-Apochromat 63x con un NA di 1.40 | |
| FIJI/ImageJ Software di elaborazione delle immagini | Contributori multipli | Scaricabile a https://fiji.sc/ | |
| Ago da dissezione modificato in coltello per capelli | Fisher Scientific | 19010 | Una ciglia è stata incollata sull'estremità di un ago da dissezione con manico in legno |
| software Microsoft Excel | Microsoft Corp. | Google sheets è un'alternativa gratuita a Microsoft Excel | |
| Piatti da 35 mm con n. 1.5 vetrino coprioggetti, finestra da 20 mm | Mattek Corporation | P35G-1.5-20-C | Piastra di Petri da 35 mm, finestra di vetro da 20 mm |
| Immersol 518F Olio da immersione | Fisher Scientific | 12-624-66A | |
| Agarosio gelificante basso | Scienze della vita Sigma | A9414-256 | |
| Inserto Corning Netwell con rete in poliestere da 74 um, inserto da 24 mm< | td style='famiglia di caratteri:Roboto;dimensione-carattere:7pt;peso del carattere:normale;overflow:nascosto;imbottitura:0px 3px;allineamento verticale:fondo;spazio-bianco:normale;word-wrap:break-word;strategia-avvolgente:4;'>Millipore SigmaCLS3479-48EA | ||
| Rstudio software | Rstudio PBC | Scaricabile su https://rstudio.com/ | |
| SMX-168-BL Stereomicroscopio | Motic | ||
| Pipetta di trasferimento | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
| ZEN software | Carl Zeiss Microscopy, LLC |