Schisi oro-facciali sono i difetti più frequenti cranio-facciali, che colpiscono 1,5 nel 1000 1,2 neonati in tutto il mondo. Palatoschisi orofacciale è causata da abnorme 3 Sviluppo del viso. In mouse e dell'essere umano, la crescita iniziale ed il modello del volto si basa su diversi piccoli boccioli di tessuto, le sporgenze del viso 4,5. Il volto è derivato da sei coppie di protuberanze principali: i processi frontali nasali (FNP), protuberanze mascellari (MXP) e protuberanze mandibolari (MdP). Tali prominenze consistono rigonfiamenti di mesenchima che sono incassati in un epitelio sovrastante. Gli studi condotti su specie diverse hanno dimostrato che la segnalazione crosstalk tra ectoderma e mesenchima del viso è fondamentale per plasmare il volto 6. Tuttavia, i dettagli meccanicistici riguardanti i geni coinvolti in questi relè di segnalazione sono carenti. Un modo per ottenere una comprensione globale di espressione genica, il fattore di trascrizione vincolante e marchi associati alla cromatina sviectoderma ping viso e mesenchima è quello di isolare e caratterizzare i compartimenti separati.
Qui vi presentiamo un metodo per separare ectoderma del viso e del mesenchima al giorno embrionale (E) 10.5, una fase critica dello sviluppo nella formazione del mouse facciale che precede la fusione delle protuberanze. Il nostro metodo è adattato da un approccio che abbiamo utilizzato in precedenza per sezionare protuberanze facciali 7. In questo studio abbiamo utilizzato inbred C57BL / 6 topi come questo ceppo è diventato uno standard per la genetica, la genomica e la morfologia del viso 8. Qui, tuttavia, sia per le quantità più limitata di tessuto disponibili, abbiamo utilizzato la outbred CD-1 ceppo che è conveniente per l'acquisto, più robusto per l'allevamento, e tende a produrre più embrioni (12-18) per cucciolata di qualsiasi inbred topo strain 8. Dopo aver isolato embrione, neutro proteasi dispasi II è stato usato per trattare l'embrione intero. Poi, le protuberanze facciali sono stati sezionareed out, e l'ectoderma facciale è stato separato dal mesenchima. Questo metodo mantiene sia l'ectoderma e mesenchima viso intatto. I campioni cosi ottenuti possono essere utilizzati per le tecniche di rilevamento tra proteine, immunoprecipitazione della cromatina (ChIP) assay, studi di microarray, e RNA-seq.