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Tre coltura tridimensionale (3D) di cellule epiteliali mammarie sulla membrana basale ricostituita è un importante sistema modello per studiare il complesso fenotipo e segnalazione associato di seno normale e cancro al seno 2,3. L'unità funzionale del seno è il terminale condotto unità lobulare (TDLU) che consiste in un piccolo dotto che si dirama in acini. Gli acini sono strutture altamente organizzate, composto da due strati di cellule, cellule epiteliali e mioepiteliali, che sono circondate da una membrana basale 5. Le caratteristiche più distintive di acini normali sono polarizzazione cellulare, attacco alla membrana basale sottostante e comunicazione varie cellule specializzate. Questa organizzazione intricato è interrotto nei carcinomi invasivi. Le culture 2D ampiamente utilizzato, dove le cellule sono coltivate in monostrato, non consentono la formazione di acini. Così, la coltura monostrato manca nel fornire un sistema per catturare l'intricata relazione tra le cellule epitelialiin seno normale e la loro deregolamentazione nel cancro al seno. Culture epiteliali monotipica funzionali delle cellule mammarie sono state sviluppate in diversi laboratori 2,3. Cultura 3D coinvolge la crescita delle cellule del seno su Matrigel, che è un estratto solubilizzato derivato da cellule di topo sarcoma Engelbreth-Holm-Swarm ed è disponibile in commercio. Altri substrati 3D come il collagene che vengono utilizzati anche. Le cellule del seno possono essere coltivate in 3D da 3D saggio incorporato, in cui le cellule sono coltivate incorporato in Matrigel 2. In alternativa, le cellule possono essere coltivate da 3D sul dosaggio superiore, chiamato anche saggio overlay 3D, che è conveniente in quanto richiede minor volume di Matrigel, e facilita il controllo di lasso di tempo di formazione della colonia mediante imaging a contrasto di fase ed è ideale per l'imaging in situ 2 -3. Il 3D sulla cima saggio è stato usato per definire la correlazione tra il fenotipo acinose e profilo di espressione genica 7.
Cultura 3D può essere effectively utilizzato per distinguere le cellule normali e benigne da carcinoma invasivo. Cellule del seno normale e benigni formano la crescita arrestato strutture polarizzate con un lume ben definite nel centro di Matrigel mentre le cellule di carcinoma invasivo crescono prolifico e casaccio, senza compensazione del lume. E6/E7 immortalato cellule epiteliali mammarie umane e linea cellulare MCF10A, che è una linea cellulare spontaneamente immortalato isolato da un paziente di 36 anni con i cambiamenti fibrocistica, sono stati utilizzati con successo per riconquistare il fenotipo benigna del seno in 3D 3,8 e hanno servito come un sistema modello per studiare la funzione di soppressore tumorale oncogenica e di diverse molecole 8,9. Queste cellule benigne può essere progettato per manipolare gene (s) di interesse con l'introduzione di lentivirus / retrovirus. Se il gene (s) di interesse è un soppressore del tumore, l'abbattimento shRNA mediata porterà ad una trasformazione maligna mentre se il gene di interesse è una sovraespressione oncogene in cellule benignedovrebbe mostrare un fenotipo maligno. In entrambi i casi le strutture acinose formate in 3D possono catturare la trasformazione maligna.
Benigni singole cellule placcato in 3D iniziano a proliferare e formare rotondo strutture sferiche. Di giorno 5-8 questo aggregato sferico delle cellule sarà differenziarsi in uno strato circostante polarizzata di celle che è in contatto con la Matrigel, e una massa interna di cellule meno polarizzate, che mancano contatto con la Matrigel. Nei prossimi 10-15 giorni le cellule interne inizieranno a morire per apoptosi formando un chiaro lume. Le cellule maligne cresceranno a casaccio perdere la loro polarità. Cellule altamente maligne di solito formano ramificazione delle strutture. Queste differenze nel fenotipo possono essere catturati da tempo di imaging a contrasto di fase, periodo e in situ immunoistochimica con marcatori molecolari rilevanti. I marcatori più comunemente utilizzati sono alfa 6-integrina, un marcatore polarità basale, in combinazione con il marcatore di proliferazione fosfo-istone 3 e il apoptotic marcatore spaccati caspasi-3. Quest'ultimo è importante determinare se vi è formazione di lumen nel centro degli acini, una caratteristica delle cellule normali del seno e benigne. Altri marcatori di polarità e di contatto cellula-cellula comprendono GM130, laminina, ERM, E-caderina. Alternativamente le linee di cellule di cancro al seno può essere progettato per manipolare il gene di interesse. In questo caso reversione ad una maggiore crescita arrestata fenotipo benigno può essere utilizzato come lettura per distinguere dal fenotipo cancro.
Cultura 3D può essere utilizzato anche con attenzione a delineare le vie di segnalazione coinvolte nella trasformazione maligna 10-11. Utilizzando il sopra citato le letture, inibitori farmacologici, anticorpi bloccanti o proteine ricombinanti può essere utilizzato da individuare nella segnalazione molecolare che porta alla trasformazione maligna. Con un impegno costante da vari laboratori è possibile estrarre le cellule dal 3D per isolare l'RNA e anche preparare lisati per immunoblotting e immunitànoprecipitation. Queste strategie sono descritte in un graduale e modo dettagliato nel protocollo.