| REAGENTI - Macchina per | | | |
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| Detergente | Identificazione e marcatura degli animali Systems, Inc. | NMCR3 | Viene utilizzato per pulire gli aghi e il supporto dopo il tatuaggio. |
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| Agente essiccante a macchina | Sistemi di identificazione e marcatura degli animali, Inc. | NDAR4 | Viene utilizzato per asciugare gli aghi e il supporto dopo la pulizia. |
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| Neonato Tatuaggio Pigmento Nero | Animale Identificazione E Sistemi Di Marcatura, Inc. | NBP01 | |
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| Applicatore per la preparazione della pelle | Sistemi di identificazione e marcatura degli animali, Inc. | NSPA1 | Q-tip. |
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| Soluzione per la preparazione della pelle | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NSP01 | Questo reagente rilascia un sottile strato di olio che migliora l'efficienza del tatuaggio e previene lo sbiadimento del tatuaggio, (informazioni dal venditore): 1) impedendo che la pelle non tatuata venga macchiata temporaneamente, consentendo così di valutare facilmente la qualità di un tatuaggio del cuscinetto della zampa prima che il cucciolo venga restituito alla sua gabbia di casa - la superficie della pelle macchiata può essere confusa con la pelle tatuata, 2) riducendo il danno alla pelle durante il tatuaggio... Ammorbidire la pelle e lubrificare l'ago aiuterà l'ago a penetrare nella pelle senza causare danni alla pelle e 3) impedirà all'ossigeno molecolare di entrare nella pelle, riducendo così le risposte infiammatorie alle specie reattive dell'ossigeno che possono essere generate. |
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| REAGENTI - genotipizzazione | | | |
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| Kit di genotipizzazione EZ Fast Tissue/Tail PCR (formato provetta a strisce) | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | |
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| 2X PCR Ready Mix II | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Nella soluzione 2X PCR Ready Mix è incluso un colorante rosso di caricamento per l'elettroforesi. |
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| Soluzione di lisi tissutale A | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Preparare la soluzione di estrazione del DNA mescolando 20 e micro; l di soluzione di lisi tissutale A e 180 µ l di soluzione di lisi tissutale B per campione. |
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| Soluzione di lisi tissutale B | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Preparare la soluzione di estrazione del DNA mescolando 20 & micro; l di soluzione di lisi tissutale A e 180 µ l di soluzione di lisi tissutale B per campione. |
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| Acido acetico, glaciale | VWR | BDH 3092 | |
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| Agarosio grado ottimizzato, grado di biologia molecolare | rpi | A20090-500 | Utilizziamo gel di agarosio al 2% in tampone TAE contenente il colorante gel SYBR Safe DNA (diluito 10.000 volte) o bromuro di etidio (0,5 & micro; g/ml di volume del gel). |
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| Bromuro di etidio | Sigma-Aldrich | E7637-1G | |
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| Acido etilendiammina tetraacetico, sale disodico diidrato (EDTA) | Fisher | BP120-500 | |
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| Punte per pipette filtrate, senza aerosol, 0,1-10 e micro; l | Dot Scientific Inc | UG104-96RS | Utilizzare puntali per pipette sterili e privi di DNA, RNasi e DNasi. Per tutte le fasi che coinvolgono il DNA, utilizzare puntali per pipette filtrati per evitare la contaminazione incrociata. |
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| Punte per pipette filtrate, punte per filtri Premium Fit, 0,5-20 e micro; l | Dot Scientific Inc | UG2020-RS | Utilizzare puntali per pipette sterili e privi di DNA, RNasi e DNasi. Per tutte le fasi che coinvolgono il DNA, utilizzare puntali per pipette filtrati per evitare la contaminazione incrociata. |
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| Puntali per pipette filtrati, puntali filtranti Premium Fit, 1-200 &; l | Dot Scientific Inc | UG2812-RS | Utilizzare puntali per pipette sterili e privi di DNA, RNasi e DNasi. Per tutte le fasi che coinvolgono il DNA, utilizzare puntali per pipette filtrati per evitare la contaminazione incrociata. |
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| Marcatore di peso molecolare, EZ DNA Even Ladders 100 bp | EZ BioResearch LLC | L1001 | Utilizziamo uno di questi tre marcatori di peso molecolare. |
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| Marcatore di peso molecolare, EZ DNA Even Ladders 1000 bp | EZ BioResearch LLC | L1010 | |
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| Marcatore di peso molecolare, TrackIt, 100 bp DNA Ladder | GIBCO-Invitrogen | 10488-058 | |
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| Provette per PCR, 8 strisce di provette con tappi superiori a cupola fissati singolarmente, naturale, 0,2 ml | USA Scientific | 1402-2900 | Utilizzare provette sterili e prive di DNA, RNasi e DNasi. Una striscia da 8 provette è facile da maneggiare e da raggruppare i campioni rispetto ai singoli tubi. |
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| Provette per PCR, Ultraflux Individual | rpi | 145660 | Utilizzare provette sterili e prive di DNA, RNasi e DNasi. |
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| Provetta per microcentrifuga Seal-Rite da 0,5 ml, naturale | USA Scientific | 1605-0000 | Utilizzare provette sterili e prive di DNA, RNasi e DNasi. |
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| SYBR Safe DNA gel stainin * 10.000x concentrazione in DMSO | GIBCO-Invitrogen | S33102 | |
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| Tris base | rpi | T60040-1000 | |
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| Primer per amplificare il gene Tor1a in Δ Topi knock-in E-torsinA | | | Questi primer sono stati utilizzati a una concentrazione finale di 1,0 ng/µ l (~0,16 µ M) (riferimento 2). |
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| Primer per l'amplificazione del gene Tfap2a in topi wild-type: | | | 5'-GAA, AGG, TGT, AGG, CAG, AAG, TTT, GTC, AGG, GC-3' (avanti), 5'-CGT, GTG, GCT, GTT, GGG, GTT, GCT, GAG, GTA-3' (inverso) per l'amplicone da 498 bp, 5'-CAC, CCT, ATC, AGG, GGA, GGA, CAA, CTT, TCG-3' (in avanti), 5'-AGA, CAC, TCG, GGC, TTT, GAT, GAT, CAT, TC-3' (inverso) per l'amplicone da 983 bp, e 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CTT TCG-3' (avanti), 5'-ACA GTG TAG TAA GGC AAA GCA AGG AG-3' (retro) per l'amplicone da 1990 bp. Questi primer vengono utilizzati a 0,5 µM. |
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| REAGENTI - colture | | | |
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| 5-Fluoro-2′-deossiuridina | Sigma-Aldrich | F0503-100MG | Vedere la sezione commenti di uridina per ulteriori informazioni. |
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| Integratore B-27 | GIBCO-Invitrogen | 17504-044 | |
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| Piastre per colture cellulari 35 x 10 mm, | 353001 | | falco |
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| tissutale, T25, trattato per colture tissutali, collo inclinato, tappo a tappo, 25 cm2 Area di crescita, 70 ml | di 353082 | | |
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| BD falconFiasche per colture cellulari, T75, trattate per coltura tissutale, collo inclinato, tappo ventilato, 75 cm2 Area di crescita, 250 ml | BD falcon | 353136 | |
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| tubo conico, polipropilene, 15 ml | BD falcon | 352095 | |
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| Countess (contatore del numero di cellule) vetrini per camera | GIBCO-Invitrogen | C10312 | |
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| Citosina β-D-Arabinofuranoside cloridrato (Ara-C cloridrato) | Sigma-Aldrich | C6645-100mg | |
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| D-(+)-Glucosio (Destrosio) anidro, SigmaUltra, 99,5% (GC) | Sigma-Aldrich | G7528-250G | |
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| Piatto, vetro Petri 100 x 15 mm | Pyrex | 3160-101 | |
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| Acqua distillata | GIBCO-Invitrogen | 15230-147 | |
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| DNasi Tipo II | Sigma-Aldrich | D4527-200KU | La soluzione madre è preparata a 1.500 unità/20 μ l = 75.000 unità/ml in acqua distillata. |
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| Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM), alto glucosio, GlutaMAX, piruvato | GIBCO-Invitrogen | 10569-010, | |
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| , 250 ml, membrana diametro 50 mm, 0,2 e micro; m Dimensione dei pori | Nalgene | 568-0020 | |
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| Unità filtrante PES veloce, 500 ml, membrana diametro 90 mm, 0,2 & micro; m Dimensione dei pori | Nalgene | 569-0020 | |
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| Siero fetale bovino (FBS) | GIBCO-Invitrogen | 26140-079 | |
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| Vetrino coprioggetti, 12 mm rotondo, spessore 0,09– 0,12 mm, n. 0 | Carolina | 633017 | |
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| GlutaMAX-I | GIBCO-Invitrogen | 35050-061 | |
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| Sali bilanciati di Hanks | Sigma-Aldrich | H2387-10X | |
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| HEPES, ≥ 99,5% (titolazione) | Sigma-Aldrich | H3375-250G | |
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| Acido cloridrico, 37%, reagente A.C.S. | Sigma-Aldrich | 258148-100 ML | |
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| Insulina | Sigma-Aldrich | I5500-250 mg | |
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| Solfato di magnesio eptaidrato, MgSO4•( 7H2O), BioUltra, ≥ 99,5% (Fluka) | Sigma-Aldrich | 63138-250G | |
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| Soluzione di matrice di membrana basamentale Matrigel, senza rosso fenolo | BD Biosciences | 356237 | Questo è il materiale di rivestimento per vetrini coprioggetti e fiasche. 1) Per prepararlo, scongelare la soluzione di matrice di membrana basale Matrigel su ghiaccio, che di solito richiede ~ 1 giorno. Utilizzando una pipetta preraffreddata, aliquotare la soluzione scongelata in palloni di T25 preraffreddati su ghiaccio e conservare i palloni a -20 °C. Per preparare la soluzione di Matrigel funzionante, scongelare il Matrigel aliquotato in un pallone su ghiaccio, diluire 50 volte aggiungendo una soluzione MEM preraffreddata e mantenere la soluzione diluita a 4 °C. È importante pre-raffreddare tutti i materiali di coltura e i terreni che entrano in contatto con Matrigel, tranne durante e dopo il rivestimento dei vetrini, per evitare che si formi prematuramente un gel. 2) Per rivestire i vetrini coprioggetti o i palloni di coltura con Matrigel, applicare la soluzione Matrigel sulla superficie. Prima di placcare le celle, è importante asciugare completamente la superficie. A questo scopo, potrebbe essere utile aspirare Matrigel durante la centrifugazione cellulare immediatamente prima di placcare le cellule e lasciare abbastanza tempo per l'essiccazione. |
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| Terreno minimo essenziale (MEM) | GIBCO-Invitrogen | 51200-038 | |
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| Estensore di siero MITO+, 5 ml | di piastre multipozzetto BD Biosciences | 355006 | |
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| , piastra a 24 pozzetti trattata con coltura tissutale | BD falcon | 353047 | |
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| piastre multipozzetto, piastra a 6 pozzetti trattata con coltura tissutale | BD falcon | 353046 | |
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| Neurobasal-A Medium (1X), liquido | GIBCO-Invitrogen | 10888-022 | |
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| Acido nitrico | VWR | bdh 3044 | |
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| NS (integratore neuronale) 21 | preparato in laboratorio | | Fonte: referenza 69 |
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| pipette Pasteur, 5 ¾ ” | Fisher | 13-678-6A | Usa questo tappo in cotone 5 ¾ ” Pipetta Pasteur per triturazione cellulare. Lucidare preventivamente la punta a fuoco per levigare la superficie di taglio e ridurre il diametro interno al 50-80% dell'originale. Una punta troppo piccola distruggerà le cellule e ridurrà la vitalità cellulare, ma una punta troppo grande diminuirà l'efficienza della triturazione. |
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| Pipette Pasteur, 9" | Fisher | 13-678-6B | |
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| Cloruro di potassio (KCl), SigmaUltra, ≥ 99,0% | Sigma-Aldrich | P9333-500G | |
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| , 2 ml | BD falcon | 357507 | |
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| Pipetta sierologica, 5 ml | BD falcon | 357543 | |
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| Pipetta sierologica, 10 ml | BD falcon | 357551 | |
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| Pipetta sierologica, 25 ml | BD falcon | 357525 | |
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| Pipetta sierologica, 50 ml | BD falcon | 357550 | |
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| Bicarbonato di sodio (NaHCO3, carbonato acido di sodio), SigmaUltra, ≥ 99,5% | Sigma-Aldrich | S6297-250G | |
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| Cloruro di sodio (NaCl), SigmaUltra, ≥ 99,5% | Sigma-Aldrich | S7653-250G | |
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| Idrossido di sodio (NaOH), pellet, 99,998% di metalli in tracce | Sigma-Aldrich | 480878-250G | |
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| Fosfato di sodio bibasico eptaidrato (Na2HPO4•( 7H2O)), ≥ 99,99%, Aldrich | Sigma-Aldrich | 431478-250G | |
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| Saccarosio, SigmaUltra, ≥ 99,5% (GC) | Sigma-Aldrich | S7903-250G | |
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| Filtro per siringa, sterile, 0,2 & micro; m | Corning | 431219 | |
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| Siringa, 3 ml | falcon | 309585 | |
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| Transferrina, Holo, plasma bovino | Calbiochem | 616420 | |
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| Trypan Blue color, 0,4% | GIBCO-Invitrogen | T10282 | Questo viene utilizzato per contare le cellule vive/morte. Rinnovare una vecchia soluzione di blu di tripano se viene riutilizzata molte volte (ad es più volte alla settimana per diverse settimane), perché formerà precipitati e risulterà in letture errate della densità cellulare. |
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| Tripsina, tipo XI | Sigma-Aldrich | T1005-5G | |
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| Soluzione di tripsina-EDTA, 0,25% | GIBCO-Invitrogen | 25200-056 | |
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| Uridina | Sigma-Aldrich | U3003-5G | La soluzione madre è preparata a 50 mg di 5-fluoro-2'-deossiuridina e 125 mg di uridina in 25 ml di DMEM (8,12 e 20,48 mM, rispettivamente). |
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| REAGENTI - immunocitochimica | | | |
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| Anticorpo, coniglio policlonale anti-MAP2 | Merck Millipore | AB5622 | |
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| Anticorpo, topo monoclonale anti-GFAP | cocktail Merck Millipore | NE1015 | |
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| ATTREZZATURA - tatuaggio | | | |
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| AIMS | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NEO– 9 | Questo sistema di tatuaggio per neonati è un sistema elettrico che funziona spostando rapidamente gli aghi per tatuaggi a 1 o 3 punti verticalmente nella pelle. Attiva la macchinetta per tatuaggi una volta per circa 0,5 secondi, mentre le punte dell'ago per tatuaggi vengono mantenute perpendicolari alla superficie della pelle. Preferiamo il tatuaggio a tre aghi per massimizzare l'area tatuata, ma il tatuaggio a un ago è efficace su aree più strette, ad esempio le dita dei piedi, o se è necessario un controllo meccanico fine, ad es quando vengono tatuati i numeri. Due cicli di tatuaggio alla velocità più bassa (impostando "1" su 3 passaggi) sono in genere sufficienti per produrre un tatuaggio visibile e duraturo dei cuscinetti delle zampe. |
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| ATTREZZATURA - genotipizzazione | | | |
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| Sistema di elettroforesi, orizzontale, Wide Mini– Sottocella GT | BIO– RAD | 170– 4405 | I parametri tipici dell'elettroforesi sono l'intensità del campo elettrico a 6 V/cm e la durata di 25 minuti per un gel di 10 cm. |
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| FluorChem 8800 | ProteinSimple | FluorChem 8800 | |
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| PCR, MJ Mini Termociclatore | BIO-RAD | PTC-1148EDU | Le nostre reazioni PCR per il gene Tor1a in Δ I topi knock-in E-torsinA sono i seguenti: 1 ciclo di denaturazione a 94 ° C per 3 min, 35 cicli di denaturazione a 94 ° C per 30 sec, ricottura a 58 ° C per 30 sec, estensione a 72 ° C per 2 min. Segue l'estensione finale a 72 ° C per 10 min, e tenendo premuto a 4 °C. |
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| Alimentazione, PowerPac Basic | BIO-RAD | 164-5050 | |
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| ATTREZZATURA - coltura | | | |
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| Contatore di cellule automatizzato, Countess | GIBCO-Invitrogen | C10310 | Questo contatore di cellule automatizzato misura separatamente la densità delle cellule vive e morte (non colorate e colorate con blu di tripano, rispettivamente). È importante conoscere l'intervallo ottimale di misure di densità: il contatore che utilizziamo ha la massima precisione nell'intervallo da 1 x 105 a 4 x 106 cellule/ml. Se i valori di densità delle celle misurati non rientrano nell'intervallo consigliato, regolare il volume di risospensione in modo appropriato. |
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| Cabina di sicurezza biologica, Classe II, Tipo A2 | NUAIRE | NU-425-400 | Questa cappa viene utilizzata per tutte le procedure di coltura cellulare, ad eccezione della dissezione cerebrale. |
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| CO2 Incubatore, AutoFlow, controllo dell'umidità Camicia d'acqua | NUAIRE | NU-4850 | |
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| Banco pulito orizzontale | NUAIRE | NU-201-330 | Questo banco pulito viene utilizzato per la dissezione cerebrale (passaggi 3.1.1 e 3.1.2 di "Dissezione cerebrale e dissociazione cellulare)". |
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| Orbit LS Agitatore a bassa velocità | Labnet | S2030-LS-B | |
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| SORVALL RC-6 Plus Centrifuga Superspeed | Fisher | 46910 (centrifuga)/46922 (rotore) | |
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