Nella tumorigenesi mammaria, lo stadio metastatico della malattia rappresenta la più grande minaccia per l'individuo affetto. Le cellule mammarie normali con genotipi alterati ora possiedono la capacità di invadere e sopravvivere in altri tessuti. In questo protocollo, i tumori mammari di topo vengono rimossi e le cellule primarie vengono preparate dai tumori. Le cellule isolate da questa procedura sono quindi disponibili per esperimenti di profilazione genica. Per una metastasi di successo, queste cellule devono essere in grado di intravasare, sopravvivere in circolo, stravasare in organi distanti e sopravvivere in quel nuovo sistema di organi. I polmoni sono il bersaglio tipico delle metastasi del cancro al seno. È stato scoperto un insieme di geni che media la selettività delle metastasi al polmone. Qui descriviamo un metodo per studiare le metastasi polmonari da un modello murino geneticamente modificato. Inoltre, è incluso un altro protocollo per l'analisi dei fibroblasti embrionali di topo (MEF) dall'embrione di topo. Le cellule MEF dello stesso tipo animale forniscono un indizio dell'espressione genica delle cellule non tumorali. Insieme, queste tecniche sono utili nello studio della tumorigenesi mammaria del topo, dei meccanismi di segnalazione associati e delle vie delle anomalie negli embrioni.