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'3,4-Metilendiossimetamfetamina (MDMA; ecstasy) può causare cambiamenti region-specifici nell'espressione dell'mRNA serotoninergico a causa della sindrome acuta da serotonina (5-idrossitriptamina; 5-HT). Questa ipotesi può essere testata utilizzando l'ibridazione in situ per rilevare il gene del recettore della serotonina 5-HT2A htr2a. In passato, tali procedure, che utilizzavano la ribosonda radioattiva, erano difficili a causa del complicato flusso di lavoro che richiede diversi giorni per essere eseguito e della difficoltà aggiuntiva che la tecnica richiedeva l'uso di tessuti freschi congelati mantenuti in un ambiente privo di RNasi. Recentemente, lo sviluppo di sonde corte di oligonucleotidi ha semplificato le procedure di ibridazione in situ e ha permesso l'uso di sezioni cerebrali con prefisso di paraformaldeide, che sono più ampiamente disponibili nei laboratori. Qui, descriviamo un protocollo dettagliato utilizzando sonde oligonucleotidiche non radioattive sui tessuti cerebrali prefissati. Le sonde di ibridazione utilizzate per questo studio includono dapB (un gene batterico che codifica per la diidrodipicolinato reduttasi), ppiB (un gene di housekeeping che codifica per la peptidilprolil isomerasi B) e htr2a (un gene della serotonina che codifica per i recettori 5-HT2A). Questo metodo è relativamente semplice, economico, riproducibile e richiede meno di due giorni per essere completato.