Articolo metodologico

Creazione di Sub-50 Nm nanofluidic giunzioni in PDMS Microfluidic Chip tramite processo di auto-assemblaggio di particelle colloidale

DOI:

10.3791/54145

13 marzo 2016

In questo articolo

Sommario

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Proponiamo una semplice tecnica di auto-assemblaggio di nanoparticelle colloidali di silice per creare una giunzione nanofluidica tra due microcanali in polidimetilsilossano (PDMS). Utilizzando questa tecnica, una membrana a microsfere nanoporose con una dimensione dei pori fino a ~ 45 nm è stata costruita all'interno di un microcanale e applicata alla preconcentrazione elettrocinetica di campioni di DNA.

Abstract

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Polidimetilsilossano (PDMS) è il materiale da costruzione prevalente di rendere i dispositivi microfluidici per la sua facilità di stampaggio e di incollaggio e la sua trasparenza. A causa della morbidezza del materiale PDMS, tuttavia, è difficile da utilizzare per la costruzione di PDMS nanocanali. I canali tendono a collassare facilmente durante l'incollaggio plasma. In questo articolo, presentiamo un metodo di auto-assemblaggio di evaporazione-driven di nanoparticelle silice colloidale per creare giunzioni nanofluidic con sub-50 nm pori tra due microcanali. La dimensione dei pori e la carica superficiale della giunzione nanofluidic è sintonizzabile semplicemente cambiando il colloidale di silice tallone dimensioni e la superficie funzionalizzazione esterno del dispositivo microfluidico assemblato in una fiala prima che il processo di auto-assemblaggio. Utilizzando l'auto-assemblaggio di nanoparticelle con un formato del branello di 300 nm, 500 nm e 900 nm, è stato possibile realizzare una membrana porosa con dimensione dei pori di ~ 45 nm, ~ 75 nm e ~ 135 nm, rispettivamente. sotto elettricoal potenziale, questo nanoporous membrana avviato concentrazione di ioni di polarizzazione (ICP) agisce come membrana cationi selettiva concentrarsi DNA da ~ 1.700 volte entro 15 min. Questo processo nanofabbricazione non litografica apre una nuova possibilità di costruire una giunzione nanofluidic sintonizzabile per lo studio dei processi di trasporto nanoscala di ioni e molecole all'interno un chip microfluidico PDMS.

Introduzione

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Nanofluidics è un settore emergente della ricerca di μ TAS (Micro Total Analysis Systems) per studiare i processi biologici o fenomeni di trasporto di ioni e molecole alla scala di lunghezza di 10 GENNAIO - 10 FEBBRAIO nm. Con l'avvento degli strumenti nanofluidic quali nanocanali, processi di trasporto di molecole e ioni possono essere monitorati con una precisione senza precedenti e manipolati, se necessario, sfruttando le caratteristiche che sono disponibili solo in questa scala di lunghezza per la separazione e la rilevazione. 1,2 Uno dei queste caratteristiche nanoscala è un elevato rapporto tra superficie e massa di carica (o numero Dukhin) in nanocanali che può causare uno squilibrio di carica e avviare la polarizzazione concentrazione di ioni (ICP) tra il nanochannel e microcanali. 3

Una piattaforma dispositivo comune per lo studio dei fenomeni nanofluidic consiste in un sistema a due microcanali collegati da una serie di nanocanali come una giunzione. 4-6 Il materiale di scelta per la costruzione di un dispositivo quale nanofluidic è il silicio causa della sua elevata rigidità che impedisce il canale di collassare durante i processi di incollaggio. 7 Tuttavia, dispositivo di silicio fabbricazione richiede maschere costose e notevoli quantità di elaborazione nella struttura camera sterile. 8- 10 Data la particolarità di fabbricazione di dispositivi per stampaggio e di legame al plasma, polidimetilsilossano (PDMS) è stata ampiamente accettata come materiale da costruzione per la microfluidica e sarebbe un materiale ideale per nanofluidica pure. Tuttavia, il modulo suo basso di Young intorno 360-870 KPa, rende il canale PDMS facilmente comprimibile durante l'incollaggio al plasma. Il rapporto minimo aspetto del nanochannel (larghezza profondità) deve essere inferiore a 10: 1 che significa che la fabbricazione di dispositivi PDMS tramite fotolitografia principio diventerà estremamente difficile se la profondità nanochannel deve essere inferiore a 100 nm, che richiedono una larghezza di canale inferiore al limite di corrente di fotolitoografia a circa 1 micron. Per superare questo limite, ci sono stati tentativi di creare nanocanali in PDMS utilizzando metodi non litografiche come lo stretching di avviare le crepe con profondità media di 78 nm 11 o per formare le rughe dopo il trattamento al plasma. 12 Crollare un canale PDMS con pressione meccanica permesso un altezza nanochannel partire da 60 nm. 13

Anche se questi metodi non-litografici altamente inventive ammessi nanocanali costruzione di sotto di 100 nm in profondità, la controllabilità dimensionale della fabbricazione nanochannel pone ancora un ostacolo per una vasta accettazione di PDMS come materiale da costruzione per i dispositivi nanofluidic. Un altro problema critico delle nanocanali, sia in silicio o PDMS, è la funzionalizzazione superficiale nel caso vi è la necessità di modificare la carica superficiale sulla parete del canale per la manipolazione di ioni o molecole. Dopo il montaggio dispositivo tramite incollaggio, i nanocanali sono estremamente difficili daraggiungere per funzionalizzazione superficiale dovuto al trasporto a diffusione limitata. Per creare un canale nanoscala con alta fedeltà dimensionale e facile funzionalizzazione superficiale, il metodo di auto-assemblaggio di particelle colloidali indotte mediante evaporazione 14-16 in dispositivi microfluidici può essere uno degli approcci promettenti. Oltre la controllabilità della dimensione dei pori e proprietà di superficie, c'è anche la possibilità di regolare la dimensione dei pori quando si utilizzano in-situ particelle colloidali rivestite polielettroliti controllando la temperatura, pH 17, 18,19 e forza ionica. 18 A causa di queste vantaggi, il metodo di auto-assemblaggio di particelle colloidali ha già trovato applicazioni per electrochromatography, 20 biosensori, concentrazione 21 proteine ​​22 e la separazione delle proteine ​​e DNA in microfluidica. 14,23 in questo studio abbiamo dispiegati questo metodo autoassemblaggio per costruire un dispositivo preconcentrazione electrokinetic inPDMS che richiede una giunzione tra due nanofluidic microcanali. 24 Il meccanismo fondamentale dietro la concentrazione electrokinetic si basa sulla polarizzazione concentrazione di ioni (ICP). 25 Una descrizione dettagliata di produzione e di assemblaggio passi è inclusa nella seguente protocollo.

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Protocollo

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1. Preparazione del cordone Sospensioni silice colloidale

  1. Preparazione di 300 nm e 500 nm silice sospensioni tallone
    1. Vortex la sospensione di silice tallone stock (10% w / v in acqua) per 30 sec. per ottenere una sospensione omogenea. Pipettare un totale di 600 microlitri sospensione madre in una provetta da 1,5 ml e centrifugare a 2.600 xg per 1 min.
    2. Sostituire il surnatante con 400 microlitri di tampone 1 mM sodio fosfato (PB, pH 7,0).
    3. Sospendere le perline di silice in una concentrazione finale del 15% in 1 mM soluzione di fosfato di sodio a pH 7,0 mediante vortex.
  2. Superficie funzionalizzare perline carbossilici silice 500 nm con poli (allilamina cloridrato, PAH), e con poli polielettroliti (sodio stirene solfonato, PSS)
    1. Sospendere 0,1 g di 500 perline di silice nm con gruppo carbossilico con 10 ml 1 M NaCl (pH 7,0) per 1% (w / v) sferette.
    2. Preparare 0,4% PAH (MW 65K) in 1 M NaCl sciogliendo 300 ml di soluzione madre (20% w / v in acqua) in 15 ml di 1 M NaCl. Preparare 0,9% PSS (MW 70K) in soluzione 1 M NaCl sciogliendo 0,18 g PSS in 20 ml di soluzione 1 M NaCl. Vortex sia soluzioni per 1 min. per sciogliere completamente i polielettroliti.
    3. Aggiungere 200 ml di soluzione di IPA a 9,8 ml di 1% sfere carbossilici silice in una provetta da 15 ml per depositare uno strato di polielettrolita carica positiva su perline di silice con carbossile gruppo funzionale. Agitare la sospensione di sferette per 1 min. e incubare su un rotatore tubo per 60 min. a RT.
    4. Centrifugare la sospensione di sferette a 1801 xg per 1 min. e lavare i non legate PAH cinque volte con acqua deionizzata 10 ml. Dopo ogni centrifuga e la rimozione del supernatante, le perle sono state densamente sul fondo della provetta. Interrompere il ciuffo tallone pipettando vigorosa con 2 ml di acqua deionizzata prima di aggiungere 8 ml di acqua deionizzata in modo che le perle possono essere ri-sospesi e lavato via prima della fase successiva centrifugazione.
    5. Seguirela procedura descritta in 1.2.3 e 1.2.4 per la verniciatura PSS di depositare uno strato di carica negativa sulle perle. Risospendere le sfere in 9,8 ml di 1 M NaCl prima della deposizione di PSS dopo aver rimosso il surnatante acqua deionizzata dalla fase di lavaggio 5 ° di 1.2.4.
      1. Utilizzare la stessa fase di pipettaggio vigoroso con 2 ml di 1 M NaCl per rompere il ciuffo tallone sul fondo della provetta 15 ml e aggiungere 8 ml di 1 M NaCl. Aggiungere 200 ml di soluzione PSS a 9,8 ml delle perline di silice depositati con un singolo strato di IPA. Dopo vortex per 1 min. e incubazione per 60 min. sul rotatore tubo, ripetere 5 fasi di lavaggio con acqua deionizzata.
      2. Misurare il potenziale zeta delle perline prima e dopo ogni rivestimento polielettrolita utilizzando un sistema di dispersione della luce dinamica secondo il protocollo del produttore per verificare la procedura di deposizione polielettrolita è stata eseguita correttamente (vedi Tabella 1).
    6. Ripetere cinque fasi di lavaggio con acqua deionizzata seguenti strato singolo PSSdeposizione e risospendere le sfere in 650 ml di 1 mM tampone fosfato di sodio con 0,05% Tween 20 (15% w / v) prima dell'uso nel dispositivo microfluidico per migliorare la sua scorrevolezza.
  3. Seguire la procedura sopra descritta da 1.2.5 a 1.2.6 per 500 perle nm silice con ammina gruppo funzionale per depositare un singolo strato di PSS.

2. Realizzazione della PDMS Microfluidic Chip

  1. Microfabbricazione del maestro di silicio
    1. Realizzare il maestro di silicio per lo stampaggio PDMS utilizzando tecniche di microfabbricazione come segue.
      1. cappotto Spin un sottile fotosensibile 1 micron a 4.000 giri su un wafer di silicio. Modello il livello utilizzando la litografia di proiezione (tempo di esposizione 170 msec.) E 700 Nm incidere nanocanali planari profonde e 2 micron di larghezza (in qualità di nanotraps per le perline di silice) con ioni reattivi.
      2. Utilizzare i seguenti parametri di incisione per ottenere una velocità di attacco di 3,5 nm / s: CHF 3 (45 sccm), CF 4 (15 SCCM), Ar (100 SCCM), pressione 100 mTorr, potenza RF 200 W.
    2. cappotto Spin il secondo spesso strato di resina fotosensibile 1 micron a 2.000 giri ed eseguire un allineamento alle nanotraps precedenza fantasia. Motivo microcanali tramite contatto litografia e da una profonda incisione ioni reattivi (DRIE) di silicio. Utilizzare la DRIE parametri 26 nella tabella 2.
  2. Fabbricazione di stampo PDMS
    1. Silanizzare il maestro silicio con triclorosilano (50 ml) in un vaso vuoto O / N.
      ATTENZIONE: Tricholorosilane è un materiale tossico e corrosivo. Usare sempre in una cappa chimica con un equipaggiamento di protezione personale.
    2. Miscelare la base per il catalizzatore nel rapporto 10: 1 e fuso PDMS sul master silicio silanizzato e curare a 70 ° C per 2 ore in un forno a convezione.
    3. Rimuovere la lastra PDMS dal master silicio con un coltello e plasma legame su un wafer vuoto utilizzando un detergente plasmatica dopo una pltrattamento asma in un pulitore plasma per 1 min. Attaccare i nastri lungo il bordo per segnare una linea di partizione per i seguenti PDMS colata passo.
    4. Silanizzare lo stampo PDMS in un barattolo vuoto con triclorosilano (50 ml) O / N.
    5. PDMS Cast (base: catalizzatore in rapporto 10: 1) sullo stampo PDMS silanizzata e curare a 70 ° C per 2 ore in un forno a convezione.
  3. Fabbricazione del dispositivo PDMS
    1. Rimuovere la lastra PDMS curato dallo stampo PDMS lungo la linea divisoria contrassegnato con il nastro.
    2. fori serbatoio punzone con 1,5 millimetri biopsia, pulito, con un nastro, lavare con alcool isopropilico (IPA) e asciugare con azoto.
    3. legame Plasma il dispositivo PDMS su un x 75 mm vetrino da microscopio a 25 mm dopo un trattamento al plasma e un detersivo plasma per 1 min.
  4. Ultrasonicate la sospensione di sferette per 60 min. in un bagno ad ultrasuoni prima del riempimento. Pipetta una sospensione tallone 10 ml (300 nm di silice non-funzionalizzato essereannunci o 500 perline carbossilici nm silice con strati PAH-PSS, o 500 nm silice perline amminici con uno strato PSS) nelle insenature 4 e 6 ciascuno (vedi Figura 1 A, B) immediatamente dopo l'incollaggio plasma della piastrina PDMS a un substrato di vetro. Toccare delicatamente sul chip PDMS con un puntale per migliorare l'imballaggio tallone.
    1. Dopo aver riempito i canali di distribuzione di perline, coprire tutte le prese ad eccezione di 1 e 9 con del nastro adesivo. Far asciugare il dispositivo per 3 ore e conservare a + 4 ° C prima dell'uso. Figura 2 fornisce uno schema passo-passo del processo di auto-assemblaggio colloidale.

3. Esperimento per electrokinetic Concentrazione di DNA

  1. Riempire i serbatoi 3, 7 con una soluzione tampone (10 microlitri di 1 mM PB) e serbatoio 5 con un campione di DNA (10 ml di 10 nM in 1 mM PB) e applicare una leggera pressione negativa con un puntale capovolta su serbatoi 2 , 8 e 10 per riempire i canali con le soluzioni senza bolle (vedi Figura 1B).
  2. Aggiungere 10 ml di 1 mM PB di serbatoi 2 e 8 e 10 ml di 10 nM DNA al serbatoio 10 per equilibrare la pressione ed attendere 5 min. per raggiungere l'equilibrio.
  3. Inserire i fili Pt in serbatoi 3, 5, 7, 10.
  4. Applicare tensione attraverso la giunzione nanofluidic utilizzando un partitore di tensione collegato ad un misuratore di sorgente e fili Pt. applicare First 30 V su serbatoi 5, 10 e GND serbatoi 3, 7.
  5. Diminuire la tensione di 25 V sul serbatoio 10 dopo ~ 30 sec.
  6. Utilizzare un otturatore meccanico con apertura periodica ogni 5 s per minimizzare photobleaching del campione durante la registrazione dei segnali di fluorescenza del DNA.

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Risultati

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Un chip concentratore electrokinetic in PDMS che contiene una giunzione nanofluidic auto-assemblato tra due microcanali è mostrato nella Figura 1A). Il canale al centro del dispositivo viene riempito con una soluzione campione di DNA e fiancheggiata da due canali di soluzione tampone per lato con 50 micron di larghezza canale di recapito tallone (Figura 1B). La sospensione colloidale di silice è volato nel canale di mandata tallone subito dopo l'incollag...

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Discussione

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Seguendo lo schema di progettazione dispositivo comune per studiare nanofluidica, abbiamo inventato un incrocio nanofluidic tra due canali microfluidica utilizzando l'auto-assemblaggio di evaporazione-driven di nanoparticelle colloidali invece di litografia patterning una serie di nanocanali. Quando scorre le particelle colloidali nel canale consegna tallone, una matrice di nanotraps con una profondità di 700 nm e una larghezza di 2 micron su entrambi i lati del canale di recapito tallone con una larghezza totale di...

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Dichiarazioni

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Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Ringraziamenti

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Questo lavoro è stato sostenuto da NIH R21 EB008177-01A2 e New York University di Abu Dhabi (NYUAD) Fund Research Enhancement 2013. Esprimiamo il nostro ringraziamento al personale tecnico del MIT MTL per il loro supporto durante la microfabbricazione e James Weston e Nikolas Giakoumidis di NYUAD per la loro supporto a scattare foto al SEM e la costruzione di un partitore di tensione, rispettivamente. La fabbricazione di dispositivi di PDMS è stato condotto nella struttura di base microfabbricazione di NYUAD. Infine, vorremmo ringraziare Rebecca Pittam dal NYUAD Centro per la borsa di studio digitale per riprese e montaggio video.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Sale di sodio poli(acido stirensolfonico)Polysciences 08772
Soluzione di poli(allilammina)Sigma Aldrich479144-5G
Microsfera di silice - 300 nmPolysciences 24321
Microsfera di silice - 500 nmPolysciences 24323
Microsfera di silice carbossile funzionale - 500 nmPolysciences 24753
Microsfera di silice ammina funzionale - 500 nmPolysciences 24756
Sylgard 184 Kit elastomero siliconicoDow Corning
TrichlorosilaneSigma Aldrich175552
Pulitore ad ultrasuoniBranson3510
Rotatore di tubi...VWR10136-084
Miscelatore a vorticeWiseMixVM-10
MicrocentrifugaVWRMicro 1207
Pulitore al plasmaHarrick PlasmaPDC-001-HP
Miscelatore PDMSThinkyARE-250
FornoThermo ScientificPR305220M
Microscopioa epifluorescenzaNikonEclipse Ti CCD
CameraAndorClara
Elettrodi in platinoAlfa Aesar43014
Misuratore di sorgenteKeithley2400
Multimetro digitaleExtech410
Vetrini per microscopiaThermo Scientific2951-001
Tween 20Merck Millipore822184
Cloruro di sodioFisher Scientific7646-14-5
Fosfato di sodio monobasicoSigma Aldrich71505
Fosfato di sodio bibasicoSigma AldrichS3264
DNAIDTCAA CCG ATG CCA CAT CAT TAG CTA C
B-FicoeritrinaLife TechnologiesP-800
Sistema di diffusione dinamica della luce per la misurazione del potenziale ZetaMalvernZetasizer Nano S
PhotoresistShipleySPR700-1.0
Litografia a proiezioneNikonNSR2005i9
Incisore ionico reattivoMateriali applicatiAME P5000
ICP incisore ionico reattivo profondoSTSSTS-6 "
Litografia a contattoVisioni elettronicheEV620
Photoresist Coater DeveloperSSISSI 150
Profilatrice di superfici senza contattoWykoNT 9800

Riferimenti

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