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Qui, descriviamo un metodo per isolare e analizzare le cellule del microambiente pancreatico. Questo metodo può essere utilizzato per isolare le cellule mesenchimali dal tessuto pancreatico embrionale e adulto. Inoltre, abbiamo utilizzato con successo questo protocollo per isolare le cellule endoteliali dal pancreas adulto e neonatale 5,17. Tuttavia, potrebbe non essere adatto per ottenere una sospensione riproducibile di cellule epiteliali pancreatiche (protocolli alternativi sono descritti nei riferimenti 18, 23 e 24). Utilizzando questo metodo, le cellule marcate in fluorescenza, che esprimono proteine fluorescenti o immunocolorate per i marcatori di superficie, possono essere purificate mediante FACS o analizzate mediante citometria a flusso. L'RNA può essere estratto da cellule purificate per profilare il loro modello di espressione genica. In alternativa, le cellule purificate possono essere coltivate per stabilire una linea cellulare per la successiva analisi proteomica. Questo metodo consentirà la caratterizzazione dei fattori espressi dal microambiente del pancreas, che ne governano l'organogenesi, la fisiologia e la fisiopatologia.
Il mesenchima pancreatico supporta l'organogenesi tissutale favorendo la proliferazione dei precursori e delle cellule differenziate 5,9. Queste cellule hanno dimostrato di supportare l'espansione dei progenitori pancreatici derivati da cellule staminali embrionali umane (hESC) 17,25,26. Pertanto, delineare l'identità dei fattori mesenchimali embrionali faciliterebbe gli attuali sforzi per generare cellule beta produttrici di insulina da hESC e cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) come potenziale cura per il diabete. Studi genetici sui topi hanno permesso l'identificazione di fattori di crescita, come Fgf10, che sono prodotti dal mesenchima per promuovere l'espansione dell'epitelio pancreatico durante le prime fasi di sviluppo del pancreas 3,9. Con l'obiettivo di identificare ulteriori fattori espressi nel mesenchima embrionale, abbiamo isolato queste cellule utilizzando la microdissezione catturata al laser, estratto il loro RNA ed eseguito l'analisi dell'espressione genica26. Tuttavia, oltre ad essere laborioso, questo metodo si basa sull'identificazione delle cellule in base alle loro caratteristiche morfologiche, il che ne limita l'uso alle fasi di sviluppo precedenti alla ramificazione dell'epitelio nel mesenchima circostante (cioè e12.5). Per caratterizzare le cellule mesenchimali nelle fasi successive dello sviluppo, abbiamo impiegato il metodo qui descritto 5,17.
Abbiamo usato questo metodo per analizzare l'espressione dei marcatori di superficie da parte del mesenchima pancreatico neonatale5. Inoltre, le cellule mesenchimali sono state isolate dal tessuto pancreatico embrionale e neonatale di Nkx3.2-Cre; I topi R26-EYFP, in base alla loro marcatura fluorescente in questa linea di topi, sono stati coltivati per stabilire linee cellulari17. L'analisi proteomica di queste cellule ha permesso l'identificazione di fattori secreti dal mesenchima pancreatico con la capacità di promuovere i progenitori pancreatici derivati da hESC17. Abbiamo inoltre utilizzato questo metodo di isolamento cellulare per purificare le cellule mesenchimali da tessuti pancreatici adulti per l'estrazione dell'RNA e l'analisi dell'espressione genica17. Pertanto, questo metodo può essere utilizzato per identificare geni e proteine espressi dal mesenchima pancreatico, con la capacità di supportare lo sviluppo delle cellule pancreatiche.
È stato inoltre dimostrato che le cellule mesenchimali pancreatiche svolgono un ruolo nella tumorigenesi del pancreas. Il PDAC è caratterizzato dalla formazione di uno stroma desmoplastico ricco di fibroblasti composto da fibroblasti, cellule immunitarie e ECM27. Sebbene si pensasse che lo stroma promuovesse lo sviluppo di molti tipi di cancro, è stato dimostrato che frena la progressione del PDAC 15,16,28. Ciò suggerisce che i componenti dello stroma pancreatico secernono fattori che inibiscono la tumorigenesi. Inoltre, i cambiamenti nella composizione cellulare dello stroma e nel fenotipo cellulare possono essere alla base del loro effetto sulle cellule epiteliali 15,16,28. Il metodo qui descritto può quindi aiutare a caratterizzare i diversi tipi di cellule che compongono uno stroma PDAC rispetto al tessuto pancreatico sano. Consentirebbe inoltre la purificazione dei diversi tipi di cellule stromali per caratterizzare potenziali cambiamenti nei loro profili di espressione genica durante la progressione del PDAC. Tuttavia, a causa dei cambiamenti nella composizione della ECM pancreatica durante la tumorigenesi27, possono essere necessari aggiustamenti dei parametri di digestione dei tessuti, come l'inclusione di ulteriori tipi di collagenasi o l'aumento del tempo di incubazione.