È richiesta un abbonamento a JoVE per visualizzare questo contenuto. Accedi o inizia la tua prova gratuita.

Articolo metodologico

Glycoengineering metabolica di acido sialico utilizzando N-acil-per volta Mannosamines

12.5K visualizzazioni

⸱

DOI:

10.3791/55746

⸱

25 novembre 2017

 , 

In questo articolo

Sommario

Acido sialico è una tipica unità di monosaccaride trovata nei glycoconjugates. È coinvolto in una pletora di interazioni cellulari e molecolari. Qui presentiamo un metodo per modificare l'espressione di superficie acido sialico cellulare utilizzando glycoengineering metabolica con N- monosaccaridico derivati.

Abstract

Acido sialico (Sia) è un costituente importante di glicoconiugati, quali N- e O- glicani o glicolipidi. Grazie alla sua posizione presso le estremità non riducente di oligo - e polisaccaridi, come pure le sue caratteristiche chimiche uniche, acido sialico è coinvolto in una moltitudine di interazioni recettore-ligando diverso. Modificando l'espressione di acido sialico sulla superficie delle cellule, interazioni acido sialico-dipendente di conseguenza saranno influenzati. Questo può essere utile per indagare le interazioni acido sialico-dipendente e ha il potenziale per influenzare determinate malattie in modo benefico. Via metabolica glycoengineering (MGE), l'espressione di acido sialico sulla superficie delle cellule può essere modulata. Nel presente documento, cellule, tessuti o addirittura interi animali sono trattati con derivati C2-modificati del N- monosaccaridico (ManNAc). Questi zuccheri amminici fungere da molecole di acido sialico precursore e pertanto sono metabolizzati della corrispondente specie di acido sialico ed espressi sulla glycoconjugates. L'applicazione di questo metodo produce effetti intriganti su vari processi biologici. Ad esempio, e può drasticamente ridurre l'espressione di acido polisialico (polySia) in cellule di un neurone trattate e quindi colpisce differenziazione e crescita neuronale. Qui, indichiamo la sintesi chimica di due dei più comuni C2-modificato N- acilmannosammina derivati, N- propionylmannosamine (ManNProp) così come N- butanoylmannosamine (ManNBut) e ulteriormente mostrano come questi non-naturali aminici possono essere applicati in esperimenti della coltura cellulare. L'espressione di acido sialico modificato specie è quantificata mediante cromatografia liquida ad alta prestazione (HPLC) e ulteriormente analizzato tramite spettrometria di massa. Gli effetti sull'espressione acido polisialico sono chiariti tramite Western blot usando un anticorpo acido polisialico commercialmente disponibili.

Introduzione

Acido sialico è un monosaccaride che è reperibile in genere le estremità non riducente dei glicoconiugati, quali N- e O- glicani o glicolipidi. Tra tutti i monosaccaridi, acido sialico ha alcune caratteristiche chimiche uniche. Ha una spina dorsale C-atomo 9, un gruppo carbossilico in posizione C-1, che è deprotonato e quindi negativamente caricate sotto condizioni fisiologiche e una funzione amminica nella posizione C-5. Anche se oltre 50 varianti di acido sialico naturali sono stati caratterizzati a data1, la forma predominante di acido sialico trovato in esseri umani è acido N- acetilneuraminico (Neu5Ac). Altri mam....

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Protocollo

1. preparazione dei tamponi e reagenti

  1. Preparazione della soluzione di idrossido di sodio 3 mM
    1. Sciogliere metossido di sodio 8,1 mg in 50 mL di metanolo (3 mM) in una bottiglia di vetro 100ml con un'ancoretta. Conservare a temperatura ambiente (TA) per diverse settimane.
  2. Preparazione del tampone Tris-HCl
    1. Combinare 8,766 g NaCl, 157 mg Tris-HCl e 146 mg EDTA in un flacone di vetro da 100 mL con un'ancoretta e sciogliere in 80 mL di acqua.
    2. Aggiungere alla soluzione mescolando, idrossido di sodio (1 M, in acqua) o HCl (20%, in acqua) rispettando il pH con un pH-metro e reg....

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Risultati

Cromatogrammi HPLC di fluorescente etichettati Neu5Ac e gli standard di Neu5Gc sono rappresentati in Figura 2. Utilizzando il metodo qui descritto, Neu5Gc DMB-labeled eluisce in genere tra 7-9 min tempo di eluizione e DMB-Neu5Ac tra 10-12 min. Parecchi più piccoli picchi nel cromatogramma appaiono in genere tra 2-6 min. Questi picchi rappresentano non reagito DMB e reazione intermedi25.

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Discussione

Se i derivati chimicamente sintetizzati di ManNAc, ManNProp e ManNBut vengono analizzati tramite spettrometria di massa, solo il picco di massa corretto per entrambi gli esemplari deve essere identificato. Di conseguenza, i prodotti possono essere presupposto per avere una purezza superiore al 99%. Piccole quantità di Neu5Gc, che normalmente non viene trovato in cellule umane29, vengono rilevati nelle frazioni della membrana delle cellule lisate. Questo si verifica più probabilmente attraverso una.......

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Dichiarazioni

Gli autori non hanno nulla a rivelare.

Ringraziamenti

Ringraziamo L. D. Nguyen per la correzione del manoscritto e per discussioni fruttuose. Inoltre, ringraziamo J. Dernedde e H. G. Nguyen per aiutarci a preparare le riprese video. La maggior parte delle scene del video sono state girate nei laboratori di R. Tauber. Ringraziamo anche il Max Planck Institute per i colloidi e le interfacce e per averci dato libero accesso alla loro funzione di spettrometria di massa. RH è stata sostenuta dal DFG (ProMoAge).

....

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
CelluleSigma-Aldrich92110411
RPMI mediumSigma-AldrichR8758
Palloni per coltura tissutale da 75 mlGreiner690175
piastre a 48 pozzettiCorning3548
FCSPAAA15-102
Pen/StrepGibco15140-122
TripsinaGibco15400-054
EDTARothX986.1
TrisServa37190.03
SDSRoth2326.2
SDS-PAGE attrezzature (serbatoi, vetreria ecc., macchinaVWRSDS Gel/Blot
AcrilammideRoth3019.1
Scala proteicaFisher Scientific267620
NitrocellulosaGE Healthcare10600002
Ponceau rossoRoth5938.2
Latte in polvereRothT145.3
ECLMilliporeWBLUF 0500
Unità filtrante centrifuga da 0,5 ml con membrana da 3 kDaMerck-MilliporeUFC500324
provette da centrifuga da 15 mLSigma-Aldrich (Corning)CLS430791-500EA
2-MercaptoetanoloSigma-AldrichM6250-10ML
2-PropanoloSigma-Aldrich34965-1LHPLC grado
gradiente 4,5-metilenediossi-1,2-fenilendiammina dicloridratoSigma-AldrichD4784-50MG
48 pozzetti, piastra per coltura tissutale a fondo piattoSigma-Aldrich (Corning)Provette da centrifuga CLS3548-100EA
da 50 mLSigma-Aldrich (Corning)CLS430829-500EA
AcetonitrileSigma-Aldrich34967-1Ldi grado HPLC
da polmone bovinoSigma-AldrichA1153-10MGpolvere liofilizzata, 3-8 TIU/mg
cloruro di butirrileSigma-Aldrich109614-250G
C18 colonna RPPhenomenex00F-4435-E0110 Å, 3 µ m dimensione delle particelle, 4,6 x 150 mm
D-mannosamina cloridratoSigma-AldrichM4670-1G
Soluzione salina tamponata con fosfato di DulbeccoPAN BiotechP04-36500
Acido etilendiamminotetraaceticoSigma-AldrichE9884-100G
Acido formicoSigma-Aldrich56302-50ML-GL
Soluzionedi acido cloridricoSigma-AldrichH1758-100ML36,5-38,0%, in acqua
LeupeptinaSigma-AldrichL2884-10MG
MetanoloCarl-RothT169.2Grado di gradiente HPLC
N-Acetil D-mannosaminaSigma-AldrichA8176-250MG
Acido N-acetilneuraminicoSigma-AldrichA0812-25MG
Acido N-glicolilneuraminicoSigma-AldrichG9793-10MG
FenilmetansulfonilfluoruroSigma-AldrichP7626-250MG
Cloruro di propionilSigma-AldrichP51559-500G
Provette Safe-Lock, 1,5 mL, ambra (protezione dalla luce)Eppendorf30120191
Provette Safe-Lock, 1,5 mL, incoloreEppendorf30120086
Sodico soluzione di bisolfitoSigma-Aldrich13438-1L-R-D40%, in acqua
Cloruro di sodioSigma-Aldrich746398-500G-D
Idrossido di sodioSigma-Aldrich795429-500G-D
Soluzione di idrossido di sodioSigma-Aldrich319511-500ML1.0 M, in acqua
Metossido di sodioSigma-Aldrich164992-5G
Acido trifluoroaceticoSigma-AldrichT6508-100ML-D
Tris cloridratoSigma-AldrichT5941-100G
Tripsina 0,25 %/EDTA 0,02 % in PBSPAN BiotechP10-019100
AcquaCarl-RothT905.1HPLC gradiente grado
Gel di silice 60Carl-Roth9779.1
HPLCAgilent
Sistema ESI-MSDAgilent
Aprotinina solido

Riferimenti

  1. Angata, T., Varki, A. Chemical diversity in the sialic acids and related alpha-keto acids: An evolutionary perspective. Chem Rev. 102, 439-469 (2002).
  2. Schauer, R., Schoop, H. J., Faillard, H. On biosynthesis of glycolyl group of N-glycolylneuraminic acid. oxidation of N-acetyl group to glycolyl group. Hoppe-Seylers Zeitschrift Fur Physiologische Chemie.

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Ristampe e permessi

Esplora altri articoli

Modifica dell'acido sialicoN-acil mannosaminaanalisi dell'acido polisialicocromatografia liquida ad alta prestazionespettrometria di massaWestern Blottrattamento di colture cellularimarcatura fluorescenteanalisi HPLC