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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Qui descriviamo un test di fagocitosi usando le cellule embrionali disperse di Drosophila . Ci permette di quantificare con facilità e precisione i livelli di fagocitosi in vivo e di identificare nuove molecole necessarie per la fagocitosi delle cellule apoptotiche.
I meccanismi molecolari alla base della fagocitosi delle cellule apoptotici devono essere chiariti in modo più dettagliato a causa del suo ruolo in malattie intractable e immunitarie e infiammatorie. Noi qui abbiamo sviluppato un metodo sperimentale per studiare la fagocitosi in modo quantitativo utilizzando la mosca Drosophila di frutta, in cui la rete genica che controlla le reazioni di engulfment è evolutamente conservata dai mammiferi. Al fine di rilevare e contare con precisione i fagociti inghiottiti e inattivi con animali interi, gli embrioni di Drosophila sono stati omogeneizzati per ottenere le cellule disperse, compresi i fagociti e le cellule apoptotiche. L'uso di cellule embrionali disperse ci permette di misurare i livelli di fagocitosi in vivo come se avessimo eseguito un test di fagocitosi in vitro in cui è possibile osservare tutti i fagociti e le cellule apoptotiche in embrioni interi e precisamente quantificare il livello di fagocitosi. Abbiamo confermato che questo metodo riproduce quelli di studi precedentiChe ha identificato i geni richiesti per la fagocitosi delle cellule apoptotiche. Questo metodo permette di analizzare l'engulfment di cellule morte e, in combinazione con la potente genetica di Drosophila , rivelerà le complesse reazioni fagocitiche che comprendono la migrazione, il riconoscimento, l'engulfment e il degrado delle cellule apoptotiche mediante fagociti.
Negli animali metazoi, ad es. Il nematode Caenorhabditis elegans , la mosca di frutta Drosophila melanogaster , e topi e umani, un gran numero di cellule subiscono apoptosi durante lo sviluppo per modellare i loro corpi e in età adulta per mantenere l'omeostasi 1 , 2 . Le cellule apoptotiche devono essere rapidamente rimosse perché inducono l'infiammazione nei tessuti circostanti liberando materiali intracellulari immunogenici se non completamente rimossi 3 . Al fine di facilitare la rimozione rapida, le cellule apoptotiche presentano i cosiddetti segnali alimentari riconosciuti dai recettori di engagement dei fagociti e vengono eliminati dalla fagocitosi 3 , 4 , 5 , 6 . Pertanto, la fagocitosi svolge un ruolo cruciale nel mantenimento dell'omeostasi ospite e, dunque, illustra la molecola Lar meccanismi alla base della fagocitosi delle cellule apoptotiche è di importanza.
I meccanismi responsabili della fagocitosi delle cellule apoptotici sembrano evoluzionalmente conservati tra le specie nei nematodi, mosche e topi 7 . Attualmente sono disponibili diversi dosaggi di fagocitosi per valutare l'ingrasso di cellule apoptotiche in questi animali modello. In C. elegans , 131 cellule somatiche subiscono una morte cellulare programmata durante lo sviluppo, ei cadaveri cellulari sono fagocitati dalle cellule vicine, che sono fagociti non professionali 8 . Quindi, contando il numero di restanti cellule di cellule in C. elegans indica il livello di fagocitosi in vivo . Cercando mutanti di nematodi che mostrano un numero crescente di cellule morte, sono stati identificati diversi geni richiesti per la fagocitosi e caratterizzati geneticamente da 9 , 10 ,S = "xref"> 11 , 12 .
I campioni di fagocitosi ex vivo con fagociti di coltura primaria, generalmente macrofagi, vengono spesso utilizzati nei topi. Le cellule apoptotiche vengono preparate utilizzando linee cellulari come le cellule Jurkat e sono mescolate con fagociti primari. Dopo un'incubazione per diverse ore, il numero totale di fagociti e fagociti inghiottiti vengono contati per valutare il livello della fagocitosi. Come una sofisticata modifica di questo metodo, il gruppo di Nagata ha sviluppato un test di fagocitosi ex vivo con le cellule che esprimono un ICAD resistente alla caspasi (inibitore della DNasi attivata da caspasi), in cui le cellule apoptotiche non subiscono la frammentazione del DNA apoptotica, ma il DNA è ancora ceduto quando Le cellule sono fagocitose. Quando queste cellule vengono utilizzate come obiettivi apoptotici in un dosaggio di fagocitosi, solo il DNA delle cellule apoptotiche inghiottite viene frammentato e macchiato mediante etichettatura TUTT-mediata di dUTP (TUNEL). Pertanto, la levaL di ingrasso cellulare apoptotico è misurato contando i segnali TUNEL in una miscela di fagociti e di cellule apoptotiche 13 .
In D. melanogaster , fagociti professionali chiamati emociti, macrofagi Drosophila , sono responsabili della fagocitosi delle cellule apoptotiche 14 , 15 . Oltre ai dosaggi di fagocitosi in vitro con linee di cellule di coltura, sono disponibili test di fagocitosi in vivo con tutti gli embrioni Drosophila . Gli embrioni di Drosophila sono un potente strumento per esaminare il livello di induzione di cellule apoptotiche perché molte cellule subiscono l'apoptosi e sono fagocitate da emociti durante lo sviluppo embrionale 14 , 15 , 16 . Un esempio di un test di fagocitosi in vivo è il metodo sviluppato dal gruppo di Franc. Nel loro metodo, gli emociti sono deTossicodipendente perossidasina, un marker emocitico, le cellule apoptotiche vengono colorate utilizzando il colorante nucleare, 7-amino actinomicina D negli embrioni interi Drosophila e il numero di cellule doppie positive viene contato come segnale di fagocitosi 17 . Un altro esempio di un test di fagocitosi sugli embrioni si basa sul concetto del metodo di Nagata descritto in precedenza; tuttavia, fagocitosi in vivo è valutata utilizzando gli embrioni di DCAD (Drosophila caspasi-attivato DNasi) mutante vola 18, 19. Questi test di fagocitosi in vivo sono utili per osservare direttamente la fagocitosi in situ . Tuttavia, le difficoltà sono associate ad escludere ogni possibile polarizzazione nella fase di conteggio delle cellule fagocitose perché è difficile osservare tutti i fagociti e le cellule apoptotiche in embrioni interi a causa dello spessore.
Al fine di superare questa limitazione, ci sviluppiamoEd un nuovo dosaggio di fagocitosi negli embrioni di Drosophila . Nel nostro metodo, per poter facilmente contare gli emociti fagocitosi, tutti gli embrioni vengono omogeneizzati per preparare cellule embrionali disperse. I fagociti sono rilevati mediante l'immunostaining di un marker di fagocita e le cellule apoptotiche sono rilevate da TUNEL con queste cellule embrionali disperse. L'uso di cellule embrionali disperse ci permette di misurare i livelli di fagocitosi in vivo come se abbiamo effettuato un test di fagocitosi in vitro che precisamente quantifica il livello della fagocitosi. Tutti i genotipi di mosche possono essere impiegati in questo saggio se si sviluppano allo stadio 16 degli embrioni 20 , lo stadio di sviluppo in cui la clearance delle cellule apoptotiche mediante la fagocitosi è la più abbondante. Questo metodo ha il vantaggio di valutare quantitativamente il livello della fagocitosi e, quindi, può contribuire all'identificazione di nuove molecole coinvolte nella fagocitosi delle cellule apoptotiche in vivo .
1. Preparazione
2. Stage 16 Embryo Collection
3. PrepaRazione delle cellule embrionali
4. La colorazione degli emociti
5. Staccare le cellule apoptotiche di TUNEL
6. Misurare il livello di fagocitosi delle cellule apoptotiche
Al fine di esaminare la fagocitosi delle cellule apoptotiche, gli embrioni Drosophila dello stadio di sviluppo sono stati raccolti e preparati come cellule disperse. Gli emociti, i macrofagi Drosophila , sono stati macchiati mediante immunocitochimica per il marcatore emocitario "Croquemort" 17 , 22 utilizzando un anticorpo specifico 19 , 21 e le cellule apoptotiche sono state macchiate da TUNEL in cellule embrionali disperse ( Figura 1A ). Croquemort, un recettore Drosophila correlato al CD36, è espressamente espresso in tutti gli emociti embrionali 22 e è stato dimostrato geneticamente di essere coinvolto nella clearance delle cellule apoptotiche negli embrioni Drosophila 17 . Le cellule Croquemort-positive hanno segnali viola nei piccoli granuli delle loro cellule. Le cellule positive di TUNEL mostrano abRown in corpi interi. Le cellule TUNEL-positive sono più piccole di altre cellule, e alcune sono all'interno delle cellule Croquemort positive, considerate cellule morte fagocitose. Tra le cellule croquemort positive e le cellule positive di TUNEL da 1 a 5% sono normalmente osservate in tutte le cellule embrionali tra 2 e 10%.
In Drosophila , ci sono due percorsi di segnalazione per l'ingrasso di cellule apoptotiche. Due recettori di fagocitosi per i corrispondenti percorsi, Draper e integrin α PS3 β ν, riconoscono in modo indipendente le cellule morte 19 , 21 , 23 , 24 , 25 . Draper è una proteina transmembrana che possiede sequenze atipiche di fattore di crescita epidermico (EGF) nella regione extracellulare ei due motivi fosforilabili NPxY e YxxL nel iParte ntracellulare 26 . L'integrin α PS3 β ν è anche un recettore transmembrane costituito da un eterodimero delle subunità α e β 25 . La Figura 1B mostra il rapporto di emociti fagocitosi con emociti totali in embrioni mutanti singoli o pruriti o con singola emarginazione Itgbn . Contando tutte le cellule Croquemort positive (emociti totali) e Croquemort e TUNEL (cellule positive positive), abbiamo calcolato l'indice fagocitico come il numero di emociti fagocitosi al numero totale di emociti. L'indice fagocitico era più basso nel mutante di drpr o Itgbn che nel tipo selvaggio, mentre il numero di emociti e cellule apoptotiche era simile ( Figura 1C- D ), indicando che questi due geni sono necessari per l'induzione di cellule apoptotiche, come precedentementeeported.
Quando non è disponibile un anticorpo anti-Croquemort o si esaminano linee mutanti con espressione alterata di Croquemort, dobbiamo selezionare un'altra opzione per rilevare gli emociti. Gli embrioni con un driver GAL4 controllato da un promotore specifico dell'emocito ( srpHemo-GAL4 ) e il gene GFP controllato da una sequenza di attivazione a monte (UAS) compreso il sito di legame GAL4 ( UAS-EGFP ), hanno emociti 27 , Che ci permette di individuare gli emociti utilizzando anti-GFP. La figura 2A mostra un'immagine ottenuta dopo la rilevazione di emociti e cellule apoptotiche con immunostaining utilizzando un anticorpo anti-GFP e TUNEL in cellule embrionali con srpHemo-GAL4UAS-EGFP . Mentre un anticorpo anti-Croquemort macchia piccoli granuli nelle cellule, un anticorpo anti-GFP macchia gli emociti interi. Simile alla figura 1A , 2 - 6% delle cellule positive GFP e del 1 - 5% TUNEL-positivo Le cellule sono osservate in tutte le cellule embrionali. Alcune cellule positive TUNEL vengono rilevate all'interno di cellule GFP positive, considerate cellule morte fagocitose. La rottura mediata da RNAi è facilmente applicata per valutare i geni per il loro coinvolgimento nella fagocitosi attraversando le mosche con l'UAS-dsRNA dei geni candidati con srpHemo-GAL4UAS-EGFP . La rottura di DRPR o Itgbn mediata da RNAi ha ridotto l'indice fagocitico ( Figura 2B ), mentre il numero di emociti e cellule apoptotiche nelle cellule embrionali è comparabile ( Figura 2C -2D ), indicando ancora che questi recettori di fagocitosi sono coinvolti nella fagocitosi di Cellule apoptotiche. Indici fagocitici simili sono ottenuti sia dai metodi di rilevazione dell'emocito, che suggeriscono che entrambi sono compatibili.
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Figura 1 : colorazione delle cellule embrionali da un anticorpo anti-Croquemort e TUNEL. ( A ) Immagini del campo luminoso delle cellule embrionali disperse dal ceppo 1118 mediante immunosorbimento con un anticorpo anti-Croquemort e TUNEL. Sono visualizzate viste ingrandite di cellule macchiate positivamente o negativamente rappresentate (top 4 pannelli) e un campo a bassa potenza (pannello inferiore). Barre di scala, 5 μm (in alto); 50 μm (in basso). ( B ) Il rapporto di emociti Croquemort positivi con il segnale TUNEL a tutti gli emociti Croquemort positivi nel mutante DRPR o Itgbn è stato analizzato con cellule embrionali disperse. ( C ) Il rapporto di emociti Croquemort positivi a tutte le cellule nel mutante DRPR o Itgbn è stato analizzato con cellule embrionali disperse. ( D ) Il rapporto tra cellule apoptotiche TUNEL-positive a tutte le cellule nel drpr oIl mutante Itgbn è stato analizzato con cellule embrionali disperse. I genotipi; W 1118 (controllo di tipo selvatico), drpr Δ5 (mutante drpr ) e Itgbn 2 (integrin β ν mutante). I dati erano rappresentativi di tre esperimenti indipendenti e sono stati analizzati dal test t dello studente. Circa 300 emociti Croquemort positivi sono stati osservati in ogni esperimento, ei valori rappresentano la media ± SD di tre campi microscopici. *; p <0,05, ns; Differenza non significativa. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Colorazione delle cellule embrionali da AntI-GFP e TUNEL. ( A ) Immagini del campo luminoso delle cellule embrionali disperse del virus srpHemo-GAL4UAS-EGFP / + mediante immunostaining con un anticorpo anti-GFP e TUNEL. Sono visualizzate viste ingrandite di cellule macchiate positivamente o negativamente rappresentate (top 4 pannelli) e un campo a bassa potenza (pannello inferiore). Barre di scala = 5 μm (in alto); 50 μm (in basso). ( B ) Il rapporto di emociti GFP-positivi con il segnale TUNEL a tutti gli emociti GFP-positivi nelle moscelle di Rnoi -mediate di drpr o Itgbn è stato analizzato con cellule embrionali disperse. ( C ) Il rapporto di emociti GFP-positivi a tutte le cellule in RNAi-mediato moscompie mosche di drpr o Itgbn è stato analizzato con cellule embrionali disperse. ( D ) Il rapporto tra le cellule apoptotiche TUNEL-positive a tutte le cellule in mosca di ritiro RNAi-mediate di drpr o Itgbn è stato analizzato con cellule embrionali disperse. I genotipi; RNAi -: Yw / w; SrpHemo-GAL4 UAS-EGFP / + , RNAi drpr: yw / w; SrpHemo-GAL4 UAS-EGFP / +; UAS-drpr-IR / +, RNAi Itgbn : yw / w; SrpHemo-GAL4 UAS-EGFP / +; UAS-Itgbn-IR / + . I dati erano rappresentativi di tre esperimenti indipendenti e sono stati analizzati dal test t dello studente. Circa 300 GFP-positivi emociti sono stati osservati in ogni esperimento, ei valori rappresentano la media ± SD di tre campi microscopici. *; P <0,05, ns; Differenza non significativa. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.
Qui descriviamo un test di fagocitosi usando le cellule embrionali disperse di Drosophila . Ci permette di quantificare con facilità e precisione i livelli di fagocitosi in vivo e di identificare nuove molecole necessarie per la fagocitosi delle cellule apoptotiche.
Siamo grati a Kaz Nagaosa e Akiko Shiratsuchi per il loro consiglio.
| siero di suino intero | MP Biomedicals | 55993 | Per gonfiare |
| la micro provetta Treff (facile da montare) Dnase, provetta senza Rnasi, 1,5 mL | TreffLab | 96. 4625. 9. 01 | Per miscelatore |
| , 1,5 mL | TreffLab | 96. 7339. 9. 03 | Per l'omogeneizzazione |
| Collagenasi | Sigma-Aldrich | C-0130 | Per la preparazione di cellule embrionali |
| Tripsina | Thermo Fisher SCIENTIFIC | 27250-018 | Per la preparazione di cellule embrionali |
| Kpl Anti-Rat IgG (H+L) Ab MSA, AP | KPL | 475-1612 | anticorpo secondario per colorazione di emociti con un anticorpo anti-Croquemort |
| 5-bromo-4-cloro- 3-indolil-fosfato | Roche | 11383221001 | BCIP, Per la colorazione degli emociti |
| nitro blue tetrazolium | Roche | 11383213001 | NBT, Per la colorazione degli emociti |
| Anticorpo | anti-Croquemort | descritto in precedenza in Manaka et al., J. Biol. Chem., 279, 48466-48476 | |
| Anti-GFP da IgG1 di topoκ (cloni 7.1 e 13.1) | Roche | 11814460001 | Per la colorazione degli emociti |
| Capra Anti-Topo IgG-AP Coniugato | Bio-Rad | 170-6520 | anticorpo secondario per la colorazione degli emociti con un anticorpo anti-Croquemort |
| Apop Tag Perossidasi Kit per il rilevamento dell'apoptosi in situ | Millipore | S7100 | Per la colorazione delle cellule apoptoitiche. Questo kit include il tampone di equilibrio, il tampone di reazione, il tampone STOP/lavaggio, l'enzima TdT e l'anti-digossigenina-perossidasi. |
| 3,3'-diaminobenzidina tetraidricloruro | nacalai tesque | 11009-41 | DAB, Per la colorazione di cellule apoptoittiche |
| Table of Fly Strains | |||
| Name | Stock center | Stock ID | Comments |
| w1118 | Control mosche, descritte in Freeman et al., Neuron, 38, 567-580 | ||
| drprΔ mutante 5 | drpr, descritto in Freeman et al., Neuron, 38, 567-580 | ||
| Itgbn2 | Itgbn mutante, descritto in Devenport et al., Development, 131, 5405-5415 | ||
| srpHemoGAL4 UAS-EGFP | descritto in Brü ckner et al., Dev. Cell., 7, 73-84 | ||
| UAS-drpr-IR | VDRC | 4833-UAS-Itgbn-IR | |
| NIG-fly | 1762R-1 | - |