Articolo metodologico

Metodo per ripiegamento efficiente e purificazione del chemocettore Ligand Binding Domain

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DOI:

10.3791/57092

12 dicembre 2017

In questo articolo

Sommario

Una procedura è presentata per il ripiegamento del dominio legante dCACHE periplasmico ligando di Campylobacter jejuni del chemocettore Tlp3 da corpi di inclusione e la purificazione per produrre quantità di milligrammo di proteina.

Abstract

Identificazione di ligandi naturali dei chemocettori e studi strutturali mirati a delucidazione delle basi molecolari della specificità ligando può essere notevolmente facilitata mediante la produzione di quantità di milligrammo di domini di legame del ligando puro, piegato. Tentativi di heterologously express domini di legame del ligando periplasmico di chemocettori batteriche in Escherichia coli (Escherichia coli) spesso provocare mirati nei corpi di inclusione. Qui, un metodo è presentato per recupero di proteina da corpi di inclusione, suo ripiegamento e purificazione, utilizzando il dominio di legame del ligando dCACHE periplasmico di jejuni del campilobatterio (c. jejuni) del chemocettore Tlp3 come esempio. L'approccio implica espressione della proteina di interesse con un spaccabili sua6-tag, isolamento e urea-mediata solubilizzazione dei corpi di inclusione, proteina ripiegamento di esaurimento dell'urea e la purificazione mediante cromatografia di affinità seguita da cromatografia di rimozione e di esclusione dimensionale di tag. La spettroscopia di dicroismo circolare viene utilizzata per confermare il ripiegamento della proteina pura. È stato dimostrato che questo protocollo è in genere utile per la produzione di quantità di milligrammo di domini di legame ligando periplasmico dCACHE di altri chemocettori batteriche in forma solubile e cristallizzabili.

Introduzione

Chemiotassi e motilità hanno dimostrati di svolgere i ruoli importanti nella patogenesi di jejuni del campilobatterio promuovendo la colonizzazione batterica e l'invasione dei host1,2,3. Chemiotassi permette ai batteri di muoversi verso un ambiente ottimale per la crescita, come guidati da segnali chimici. Questo processo prevede il riconoscimento dei segnali chimici intracellulari ed ambientale da un insieme di proteine chiamati chemocettori, o simil-trasduttore (TLP). Maggior parte dei chemocettori sono proteine di membrana incorporato con un extracitoplasmatico li....

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Protocollo

1. espressione dei suoi6-Tlp3-LBD in e. coli

  1. Inoculare 150 mL di brodo di Luria-Bertani (LB) sterile contenente 50 µ g ampicillina di-1 mL con Plus-codone-BL21 (DE3) - cellule RIPL trasformate con il vettore di pET151/D-TOPO per l'espressione della sua6- Tlp3-LBD (residui dell'amminoacido 42-291), e Incubare a 37 ° C in un agitatore (diametro orbita, 25 mm) con 200 giri/min durante la notte.
  2. Preparare sei matracci di Erlenmeyer 2L contenente 800 mL di brodo LB sterile e 50 µ g mL-1 ampicillina. Inoculare ciascuna beuta con 20 mL della coltura durante la notte ottenuta dal punto 1.1. Li Incubare a....

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Risultati

L'espressione ricombinante di suo6-Tlp3-LBD dentro e. coli ha provocato la deposizione di proteine in corpi di inclusione. La resa di espressione da 1 L di coltura batterica calcolata al punto 2.13 era circa 100 mg di sua6-Tlp3-LBD depositato in corpi di inclusione. La procedura di isolamento di proteine, qui descritta e illustrata in Figura 1, è costituito dalla solubilizzazione dei corpi di inclusione, il ripiegamento proteico.......

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Discussione

Una procedura semplice per espressione e ripiegamento dai corpi di inclusione di LBD periplasmico della chemoreceptor batterica Tlp3 è presentata. Preparazione della proteina pura coinvolge sovra-espressione del gene codificato con animali-plasmide in Escherichia coli, la purificazione e la solubilizzazione dei corpi di inclusione, di ripiegamento della proteina denaturata e sua purificazione di affinità consecutivi e passaggi di cromatografia di esclusione dimensionale. La denaturazione dell'urea-facilitato e d.......

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Dichiarazioni

Gli autori non dichiarano concorrenti interessi finanziari.

Ringraziamenti

Ringraziamo Yu C. Liu per i suoi primi lavori sulla produzione Tlp3-LBD. Mayra A. Machuca è in debito con Departamento Admistrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación COLCIENCIAS per una borsa di dottorato.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Tris baseAMRESCO497
Cloruro di sodio (NaCl)MERK MILLIPORE1064041000
AmpicillinaG-BIOSCIENCESA051-B
Fenilmetansulfonilfluoruro (PMSF)MERCK52332
Triton x-100AMRESCO694
Isopropil β-D-tiogalattoside (IPTG)ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD
UreaAMRESCOVWRC0568
DitiotreitoloASTRAL SCIENTIFIC PTY LTDC-1029
L-arginina monocloridratoSIGMA-ALDRICHA5131
L-glutatione ridottoSIGMA-ALDRICHG4251
L-glutatione ossidatoSIGMA-ALDRICHG4376
Fosfato di sodio bibasico (Na2HPO4)SIGMA-ALDRICH7558-79-4
Fosfato di sodio monobasico (NaH2PO4)SIGMA-ALDRICH10049-21-5
Acido etilendiamminotetraacetico sale disodico disidratato (EDTA)AMRESCOVWRC20302.260
ImidazoloSIGMA-ALDRICHI2399
GliceroloASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD
Cloruro di nichel (NiCl2)SIGMA-ALDRICH339350
GlicinaAMRESCOVWRC0167
Sodio dodecil solfato (SDS)SIGMA-ALDRICHL4509
Scala proteica non colorata, ampia Gamma (10-250 kDa)NEW ENGLAND BIOLABSP7703
Concentratore centrifugo Amicon Ultracel (Millipore)MERCKUFC901096
Provetta Falcon da 50 mL Tubo
Tubo per dialisiLIVINGSTONE INTERNATIONAL PTYDialisi
pelle di serpenteTHERMO SCIENTIFIC™68100
Colonna HP chelante HiTrap preconfezionataGE HEALTHCARE LIFE SCIENCES17-0408-01
Omogeneizzatore ad alta pressione EmulsiFlex-C5AVESTINEmulsiFlex™ - Pompa
P-1GE HEALTHCARE LIFE SCIENCES18-1110-91
Colonna Superdex 200 HiLoad 26/60 ad esclusione dimensionale 
AST0487 BIOGB0232 per dialisi FALCON BDAA352070 Tubo per dialisi in peristaltica C5 Spettropolarimetro JASCO J-815 28989336 GE HEALTHCARE LIFE SCIENCES

Riferimenti

  1. Dasti, J. I., Tareen, A. M., Lugert, R., Zautner, A. E., Gross, U. Campylobacter jejuni: a brief overview on pathogenicity-associated factors and disease-mediating mechanisms. Int J Med Microbiol. 300 (4), 205-211 (2010).
  2. Josenhans, C., Suerbaum, S.

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Tag

Rifolding proteicosolubilizzazione dei corpi di inclusionesolubilizzazione mediata da ureacromatografia di affinitcromatografia a esclusione dimensionalespettroscopia di dicroismo circolarescissione del tag His6trattamento con proteasi TEVscambio di buffer per dialisi

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