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Il paziente fornito il consenso informato scritto e il progetto è stato approvato dal comitato etico di ricerca della facoltà di medicina dell'Università di Juntendo. Gli esperimenti del mouse sono stati approvati dal comitato etico di ricerca animale della facoltà di medicina Juntendo.
1. istituzione del CRC PDXs in topi immunodeficienti
Procedure sperimentali per stabilire PDXs CRC (passaggio 1) sono descritti nella Figura 1A.
- Preparare il tessuto primario di CRC subito dopo resezione chirurgica del tumore dal paziente.
- Lavare il tessuto primario di CRC di movimentazione delicata parecchie volte in 30 mL di fosfato sterile ghiacciato tampone salino (PBS) in una provetta conica da 50 mL e tenerlo sul ghiaccio.
- Posizionare il tessuto su una piastra Petri 10cm con pinzette sterili, rimuovere le aree necrotiche ampiamente possibili utilizzando forbici sterili e tagliare i tessuti del tumore solido a piccoli pezzi (5 x 5 x 5 mm3 dimensioni) utilizzando lame di rasoio sterile.
Nota: Le zone necrotiche sono spesso più bianca, più morbido e più friabile rispetto alle aree circostanti.
- Posto i pezzi piccoli di tumore con pinzette sterili in 2 mL di PBS sterile ghiacciata su una piastra a 6 pozzetti.
- Razza 6 mouse week-old IL2Rγ Shi-NOD/scid (NOG) null altamente immunodeficienti condizioni libero libero e specifico patogeno–germe–.
- Anestetizzare i topi con inalazione isoflurane utilizzando il dispositivo di anestesia per inalazione animale piccolo e disinfettare la pelle con etanolo al 70%. Assicurare il tasso normale e la profondità della respirazione e l'assenza di un riflesso di pizzico di punta per corretto amputate. Unguento veterinario sugli occhi è un'opzione, per prevenire la secchezza oculare mentre sotto anestesia.
- Sterilizzare tutti gli strumenti chirurgici mediante sterilizzazione a calore secco e quindi utilizzare questi strumenti per tutte le procedure per prevenire le infezioni di ferita in topi destinatari.
- Posizionare il mouse anestetizzato in posizione prona su banco di laboratorio. Praticare una piccola incisione sulla parte inferiore dei fianchi destro e sinistro del mouse destinatario per generare tasche sottocutanee per l'impianto di tessuto usando forbici sterili. Fare attenzione a non per forare la membrana peritoneale. Ci dovrebbe essere piccolo sanguinamento con questa procedura.
- Immergere delicatamente sopra preparato frammenti di tumore in 50 µ l di matrice extracellulare artificiale e impiantarli poi nelle parti inferiori delle tasche sottocutanee destra e sinistra.
- Sutura l'incisione con clip di ferita nei topi sottoposti a procedure chirurgiche. Assicurarsi che i tessuti del tumore impiantato si trovano ad una certa distanza dall'incisione sotto la pelle.
Nota: In conformità riducendo al minimo le procedure chirurgiche, nessun trattamento per dolore post-operatorio e l'infezione sono stato amministrato in questo studio.
- Posizionare il mouse su un pad caldo e mantenere la posizione di decubito sternale fino al ripristino della coscienza sufficiente. Una volta completamente recuperati e in grado di sedersi su tutte e quattro le gambe, i topi possono essere restituiti alla loro casa gabbie. Per evitare la predazione, non consentono l'allevamento con animali non operati nella stessa gabbia.
- Controllare eventuali perdite di sutura e confermare che i topi sono in condizioni stabili il giorno successivo, nel gruppo trattato chirurgicamente. Controllare i topi per i segni della malattia e misurare le dimensioni del tumore in ogni mouse, una volta a settimana, che impiegano pinze.
2. dissezione di CRC PDXs dai topi
Procedure sperimentali per la dissezione di CRC PDXs (passaggio 2) sono illustrate in Figura 1B.
- Consentire il tumore a crescere per via sottocutanea a ~ 1 cm3 dimensioni, che di solito prende circa 1 – 3 mesi.
- Anestetizzare il mouse con inalazione isoflurane utilizzando il dispositivo di anestesia per inalazione animale piccolo e disinfettare la pelle con etanolo al 70%.
- Posizionare il mouse in posizione prona su banco di laboratorio. Incidere la pelle, esporre il tumore e staccare con cura la pelle dal tumore usando forbici sterili. Dopo aver rimosso il tumore, posto su un 10cm di Petri e rimuovere eventuali regioni grossolanamente necrotici del tumore, quindi sciacquare due volte con 5 mL di PBS.
Nota: Le zone necrotiche sono spesso più bianca, più morbido e più friabile rispetto alle aree circostanti.
-
Mettere il tumore sul ghiaccio e dividere in parti uguali in almeno 4 parti per diverse applicazioni tra cui 1) la cultura di organoid CRC, 2) trapianto in topi secondari, 3) istologico e 4) di congelamento e la conservazione dei frammenti del tumore.
- Per la generazione dei organoids CRC, posizionare il tessuto del tumore solido su una piastra Petri 6 cm contenente 1 mL di PBS sterile. Mantenere il tessuto sul ghiaccio fino al procedimento (passaggio 3).
- Per stabilire il modello PDX per CRC umano, passaggio il fresco PDXs CRC in un mouse secondario. Tagliare il tessuto del tumore in piccoli pezzi (5 x 5 x 5 mm3 dimensioni) utilizzando lame di rasoio sterile e immergere delicatamente questi frammenti di tessuto in 50 µ l di matrice extracellulare artificiale. Quindi, impiantare questi frammenti nelle parti inferiori delle tasche sottocutanee destra e sinistra del mouse NOG, come descritto al punto 1.8 – 1.11.
- Per l'analisi istologica, fissare i campioni in 5 mL di formalina tamponata al 10% neutra in una provetta conica da 15 mL a temperatura ambiente per 2 giorni.
- Per la crioconservazione, tagliare il tessuto del tumore in piccoli pezzi (5 x 5 x 5 mm3 dimensioni) e immergere delicatamente i campioni in 500 µ l di soluzione in 1 – 1,5 mL cryovial provette di congelamento delle cellule. Quindi, il tubo di trasferimento di un congelatore a-80 ° C.
3. estrazione di PDXs nella sospensione cellulare per la cultura di Organoid CRC
Procedure sperimentali per la dissociazione di CRC PDXs (passaggio 3) sono illustrate in Figura 1B.
- Posto sopra (punto 2.4.1) preparato tumore frammenti su una piastra di Petri di 10 cm.
- Tritare i frammenti utilizzando lame di rasoio sterile e trasferirli in una provetta conica da 15 mL contenente 8 mL di siero fetale di vitello 10% (FCS)-Medium (DMEM dell'Aquila per volta di Dulbecco) con 80 µ l di brodo di enzima collagenasi (Vedi Tabella materiali).
- Chiudere saldamente la provetta e avvolgere il tappo con parafilm per evitare perdite. Per dissociare i frammenti di tumore macinate in una sospensione cellulare, agitare delicatamente per 2 ore a 37 ° C. Si noti che ci saranno ancora molti frammenti di tessuto non digerito restanti nel tubo.
- Centrifugare la provetta a 300 x g per 5 min a 4 ° C e rimuovere il surnatante. Risolvere il pellet cellulare utilizzando 10 mL di 10% FCS-DMEM per rendere la sospensione cellulare.
- Per eliminare i detriti dei tessuti non digerito, filtrare la sospensione cellulare due volte utilizzando il filtro di cella di 40 µm impostato su una provetta conica da 50 mL. Poi, centrifugare il flusso continuo a 300 x g per 5 min a 4 ° C. Rimuovere il supernatante e tenere la pallina sul ghiaccio.
4. generazione della Organoids CRC coltivate sulla matrice extracellulare artificiale
Procedure sperimentali per la coltura di organoid CRC della PDXs del colon (passaggio 4) sono illustrate in Figura 1B.
- Stabilire un terreno di coltura adatto per il organoids CRC PDX-derivati (Vedi Tabella materiali, "il terreno di coltura organoid CRC") che impiegano supporti precedentemente descritti per umano del colon organoids11.
- Applicare 150 µ l di matrice extracellulare artificiale (Vedi Tabella materiali) per bene su un piatto di 12-pozzetti su ghiaccio e incubare per 30-60 minuti a 37 ° C, 5% CO2 incubatore per solidificare il gel.
- Sospendere il pellet cellulare da passo 3.5 con il terreno di coltura organoid CRC (dal punto 4.1) con 5% FCS per ottenere regolazione a 3 x 105 cellule/mL. Allora, seed 1 mL di terreno sulla artificiale extracellulare rivestite con matrice piastra preparata al punto 4.2. e incubare per una notte a 37 ° C inferiore al 5% di CO2. Utilizzare un emocitometro per conteggiare il numero di cellule del tumore compreso unicellulari e pluricellulari mazzi (un gruppo di cellule aderenti) in sospensione delle cellule.
Nota: 5% FCS è utilizzato per placare l'attività enzimatica residua della collagenosi in questo studio.
- Raccogliere con cura il terreno di coltura, tra cui le cellule che hanno staccato dalla artificiale piastra rivestite con matrice extracellulare, in un 1,5 mL di galleggiamento Centrifugare la provetta il giorno seguente ed e centrifugare a 1.400 x g per 5 min. Quindi, rimuovere il supernatante e risospendere il pellet in 70 µ l di matrice extracellulare artificiale sul ghiaccio.
- Per aumentare la vitalità cellulare CRC, sovrapposizione di tumore delle cellule contenenti artificiale matrice extracellulare sul tumore organoid cellule fissato alla piastra di rivestite con matrice extracellulare artificiale ed incubare per 30 min in un 37 ° C, 5% CO2 incubatore a solidificare il rivestimento di matrice extracellulare artificiale. Quindi, viene quindi incubato con 1 mL di terreno di coltura cellulare organoid CRC con 1% FCS a 37 ° C inferiore 5% CO2.
- Cambiare il terreno di coltura ogni secondo giorno. Il CRC organoids riempire il mezzo, potrebbe essere necessario cambiare il mezzo ogni giorno.
5. generazione e arricchimento delle particelle lentivirali GFP
Procedure sperimentali per la generazione e l'arricchimento delle particelle lentivirali GFP (passo 5) sono descritti nella Figura 1.
- Cultura di HEK293T cellule con Roswell Park Memorial Institute (RPMI) 1640 Media contenente 10% FCS e preparare sei piatti 10 cm (2 x 106 cellule per piatto) per la seguente procedura di trasfezione.
- Per la transfezione per ogni piatto, preparare 500 µ l della miscela tra cui 20 µ l di reagente di transfezione in DMEM con un PRRL-GFP vector (5 µ g)12 e due plasmidi lentivirali imballaggio, quali pCMV-VSV-G (1 µ g) e pCMV-dR8.2 dvpr (5 µ g), in una sterile mL 1,5 microprovetta. Mantenere la miscela a temperatura ambiente per 20 minuti e poi sovrapporre su ognuno dei piatti 10 cm e li Incubare per 18 h.
- Rimuovere il mezzo, aggiungere 5 mL di terreno di nuovo 10% FCS-RPMI 1640 ad ogni piatto e lasciare riposare per 24 h.
- Raccogliere il medium condizionato da ogni piatto in una provetta da centrifuga 50ml e memorizzare un totale di 30 mL di terreno a 4 ° C durante la notte. Aggiungere 5 mL della fresca RPMI 1640 su ogni piatto e lasciare riposare per 24 h.
- Raccogliere il medium condizionato da ogni piatto in una provetta da centrifuga 50ml e mantenere, in totale, 30 mL di terreno sul ghiaccio. Quindi, eliminare le celle.
- 60 mL di terreno (dal punto 5.4 – 5.5) filtrare su filtro da 0,45 µm per rimuovere le cellule e dividere questa quantità in dodici provette da centrifuga in polipropilene da 5 mL per ultracentrifugazione.
- Per concentrare il virus, centrifugare utilizzando un rotore oscillante (Vedi Tabella materiali) a 85.327 x g per 1,5 h a 4 ° C.
- Rimuovere immediatamente il mezzo. Per risolvere il pellet di virus concentrati, mettere 250 µ l di miscela di F-12 di nutrienti prosciutto (F12) / medium DMEM senza FCS in ognuno dei dodici tubi e mantenerlo durante la notte a 4 ° C. Si noti che il pellet di virus è spesso invisibile.
- Pipettare delicatamente il mezzo per raccogliere 3 mL di concentrato stock lentivirus della x GFP 5, in totale, di cui presumibilmente le particelle lentivirali GFP con 10 unità di trasduzione di8 ml (TU/mL). Quindi, è possibile memorizzare le microprovette da 1,5 mL dodici (tra cui 250 µ l per provetta) in condizioni sterili a-80 ° C per fino a un anno. Preparare tante piccole aliquote della soluzione originale per evitare più cicli di scongelamento freeze–.
6. etichettatura delle cellule Organoid CRC con GFP particelle lentivirali coltivate sulla matrice extracellulare artificiale
Procedure sperimentali per l'etichettatura delle cellule di organoid CRC con lentivirus GFP (passaggio 6) sono descritti nella Figura 1.
- Consentire il CRC organoids preparata al punto 4.6 di crescere senza interferenze per 7 – 10 giorni e raccoglierle meccanicamente con una spatola sterile cella e poi trasferirli in una microprovetta 1,5 mL.
Nota: La crescita dei organoids CRC nella cultura dipende dalla natura dei tumori originale dai pazienti. Evitare la crescita eccessiva dei organoids CRC, mantenendo loro confluenza di 60 – 70% prima del trasferimento a un rapporto di 1:2 divisione sul nuovo extracellulare artificiale rivestite con matrice 12-pozzetti piatto.
- Centrifugare la provetta per 3 min a 1.400 x g, rimuovere il terreno di coltura e risolvere il pellet cellulare in 500 µ l di PBS di picchiettando.
- Centrifugare la provetta per 3 min a 1.400 x g ed eliminare PBS.
- Per dissociare il organoids CRC aderente, aggiungere 500 µ l di una soluzione di distacco delle cellule di proteolitico e collagenolytic enzimi alla cella della pallina nel tubo e mescolano con un tocco delicato. Quindi, lasciare i tubi a stabilirsi per 10 min a temperatura ambiente.
- Pipettare molto delicatamente la sospensione cellulare con un ulteriori 500 µ l di 1% FCS-DMEM più volte in una microprovetta 1,5 mL circa dissociare le cellule. Generazione di cellule singole dalla organoids CRC pipettando duro riduce notevolmente la vitalità cellulare. Quindi, è essenziale per lasciare la massa delle cellule visivamente rilevabili in sospensione delle cellule pipettando delicatamente in una microprovetta 1,5 mL.
- Centrifugare la sospensione cellulare per 3 min a 1.400 x g e rimuovere il surnatante.
- Risolvere il pellet cellulare con una miscela della 100 µ l di brodo di lentivirus 5 x GFP (> 108 TU/mL) e 400 µ l di terreno di coltura organoid CRC in una microprovetta 1,5 mL di picchiettando per regolare ad una concentrazione di 5 x 105 dissociato le cellule del tumore a 500 µ l . Utilizzare un emocitometro per conteggiare il numero delle cellule del tumore, tra cui cellule singole e gruppi di cellule in sospensione delle cellule, come descritto in precedenza (punto 4.3).
- Preparare un artificiale extracellulare matrice 12-pozzetti lamiera verniciata, come descritto al punto 4.2. Quindi, posizionare 500 µ l di sospensione cellulare preparata al punto 6.7 sulla piastra e lasciarlo per 18 h a 37 ° C inferiore 5% CO2.
- Raccogliere il mezzo con le cellule flottante staccate dalla piastra rivestite con matrice extracellulare artificiale in una provetta di centrifugazione di 1,5 mL. E centrifugare a 1.400 x g e quindi rimuovere il supernatante e risospendere il pellet in 70 µ l di matrice extracellulare artificiale sul ghiaccio.
- Per aumentare la vitalità cellulare CRC, sovrapposizione tumore contenenti cellule artificiali matrice extracellulare sul tumore organoids fissato artificiale extracellulare rivestite con matrice 12-pozzetti la piastra, come descritto al punto 4.5. Successivamente, incubare la piastra per 30 min in un 37 ° C, 5% CO2 incubatore per solidificare il rivestimento di matrice extracellulare artificiale e cultura quindi di con 1 mL di terreno di coltura organoid CRC con 1% FCS a 37 ° C inferiore 5% CO2.
- Osservare le cellule in 3 giorni dopo l'infezione con un microscopio a fluorescenza per confermare la positività GFP a quasi 100% a causa dell'uso di un alto titolo di particelle lentivirali (Vedi Figura 2A).
- Per periodi di 7 – 10 giorni per espandere la crescita delle cellule prima dell'iniezione in topi destinatari della coltura il organoids CRC.
7. generazione di metastasi da CRC GFP-etichettata Organoids in topi destinatari
Procedure sperimentali per la generazione delle metastasi utilizzando la GFP-etichettata CRC organoids (passaggio 7) sono descritti nella Figura 1.
- Per dissociare il organoids CRC GFP-etichettata nella sospensione cellulare, raccoglierle meccanicamente con una spatola sterile cellulare e trasferirli in una microprovetta 1,5 mL, come descritto in precedenza (punto 6.1).
- Centrifugare la provetta per 3 min a 1.400 x g, rimuovere il terreno di coltura e risolvere il pellet cellulare in 500 µ l di PBS di picchiettando.
- Centrifugare la provetta per 3 min a 1.400 x g ed eliminare PBS.
- 500 µ l della soluzione di distacco delle cellule sul pellet e nel tubo di sovrapposizione e mescolarlo con un tocco delicato. Quindi, lasciare la condizione di miscela per 10 min a temperatura ambiente enzimaticamente dissociare l'aderente organoids CRC, come descritto in precedenza (punto 6.4).
- Pipettare molto delicatamente la sospensione cellulare con un ulteriori 500 µ l di 1% FCS-DMEM più volte in una microprovetta 1,5 mL circa di dissociare le cellule, come descritto in precedenza (punto 6.5). Generazione di cellule singole dalla organoids CRC pipettando duro riduce notevolmente la vitalità cellulare. Così, lascia la massa delle cellule visivamente rilevabili in sospensione delle cellule pipettando delicatamente in una microprovetta 1,5 mL.
- Centrifugare la sospensione cellulare per 3 min a 1.400 x g e rimuovere il surnatante.
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Per stabilire un modello murino di metastasi spontanea di CRC PDXs:
- Preparare una sospensione di cellule tra cui 5x105 cellule in 50 µ l di PBS con 50% matrice extracellulare artificiale per topo. Mantenere la sospensione sul ghiaccio prima dell'uso. Utilizzare un emocitometro per contare le cellule tumorali, come indicato al punto 4.3.
- Anestetizzare un mouse con inalazione isoflurane utilizzando il dispositivo di anestesia per inalazione animale piccolo e disinfettare la pelle con etanolo al 70%, come indicato al punto 1.6.
- Posizionare il mouse NOG in posizione supina sul banco di laboratorio. Afferrare la mucosa rettale con pinzette sterili ed estrarlo delicatamente l'ano. Quindi, iniettare immediatamente la sospensione cellulare preparata al punto 7.7.1 nel submucosa rettale del mouse usando una siringa (dimensione dell'ago: 22 G). Ordinariamente, 4 – 6 topi per ogni gruppo sono utilizzati per valutare i risultati.
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Per stabilire un modello di metastasi sperimentale di CRC PDXs:
- Preparare una sospensione di cellule di organoid CRC compreso 4 x 104 cellule in 50 µ l di PBS per topo. Mantenere la sospensione sul ghiaccio prima dell'uso. Utilizzare un emocitometro per contare le cellule tumorali (punto 4.3).
- Anestetizzare un mouse con inalazione isoflurane utilizzando il dispositivo di anestesia per inalazione animale piccolo e disinfettare la pelle con etanolo al 70%, come indicato al punto 1.6.
- Posizionare il mouse NOG anestetizzato in posizione prona su banco di laboratorio. Praticare una piccola incisione sulla parte inferiore del fianco sinistro e poi tagliare il peritoneo per esporre accuratamente la milza utilizzando pinzette e forbici sterili. Afferrare il tessuto grasso attaccato alla milza con pinzette sterili, quindi iniettare lentamente 50 µ l di sospensione cellulare (preparata come sopra, passo 8.1) nella milza. Essere certi che la sospensione cellulare viene iniettata in modo appropriato senza perdite verso l'esterno, dalla milza. Ordinariamente, 4 topi per ogni gruppo sono utilizzati per valutare i risultati.
- Posizionare tutti i topi su un pad caldo dopo l'intervento chirurgico e mantenere in posizione di decubito sternale fino al ripristino della coscienza sufficiente, come descritto al punto 1.11. Una volta che i topi hanno pienamente recuperato, restituirli alla loro casa gabbie. Per evitare la predazione, non consentono l'allevamento con animali non operati nella stessa gabbia.
- Controllare eventuali perdite di sutura e confermare che i topi sono vivi, nel gruppo trattato chirurgicamente, il giorno successivo. Controllare i topi per i segni di malattia e misura dimensioni del tumore, che impiegano pinze, in tutti i topi una volta a settimana.
- Osservare topi per rilevare metastasi sperimentale (1 mese) e la metastasi spontanea (per periodi fino a 2,5 mesi) dopo l'iniezione.
- Sacrificare i topi tramite anestesia e dislocazione cervicale nei giorni indicati. Sezionare i tumori primari e vari tessuti, compreso il fegato ed i polmoni. Posizionare i tumori dissecati ed organi in 5 mL di PBS ghiacciato su un 10cm di Petri e memorizzarli sul ghiaccio.
- Per rilevare le cellule GFP-positive CRC organoid, osservare i tessuti dissecati sotto un microscopio stereo-fluorescenza. Acquisire immagini con una telecamera CCD e preparare utilizzando il software di elaborazione dell'immagine standard.