La raccolta del campione è stata approvata dall'Università di Pittsburgh Institutional Review Board (IRB # PRO16060443, PRO10110387). Tutti gli esperimenti sono eseguiti sotto una cappa di biosicurezza con i dispositivi di protezione personale.
1. dispositivo fabbricazione e Litografia Soft
Nota: Litografia soft Standard tecniche15,16 sono stati utilizzati per creare il microchannel di polidimetilsilossano (PDMS).
- Mescolare il precursore PDMS in un rapporto di 10:1 di base e polimerizzazione di agente.
- Versare 30 g della miscela precursore PDMS sullo stampo in alluminio micro-lavorato (vedere la Figura 1 per le dimensioni) e 20 g della miscela precursore PDMS sul 100mm di Petri.
Nota: La capsula di Petri è utilizzato per rendere la pellicola spessa di PDMS (~ 3 mm) per strato di supporto. Strato di supporto di PDMS fornisce proprietà superficie fisica uniformi in tutta la microfluidica. In alternativa, può essere utilizzato un sottile film PDMS su vetrino. Lo stampo master con dimensioni canale specifico è stato progettato e fabbricato da micro-fresatura sul foglio di alluminio. Il canale spirale utilizzato in questo studio era un microchannel 8-anello a spirale con un ingresso e due uscite, con il raggio aumentando da 8 mm a 24 mm per la separazione efficiente basato su dimensioni.
- Inserire lo stampo e la capsula di Petri in un essiccatore sotto vuoto per degassare fino a quando non ci sono bolle sono visibili sulla superficie, in genere 5-10 min uso casa-vuoto per un essiccatore.
- Rilasciare il vuoto e inserire lo stampo e la capsula di Petri in forno a 90 ° C per 1 h.
Nota: Una piastra riscaldante o altri strumenti di riscaldamento possono essere utilizzati invece di un forno.
- Rimuovere la muffa e la capsula di Petri dal forno e lasciar raffreddare a temperatura ambiente per 10 min.
- Accuratamente tagliare il contorno e perforare i fori di accesso fluido sul dispositivo utilizzando un perforatore di 2 mm.
Nota: La dimensione del punzone può variare a seconda delle dimensioni della guida tubolare o fluida.
- Aderire un nastro sul lato del canale del dispositivo e pellicola spessa di PDMS e sbucciare accuratamente con una pinza per rimuovere la polvere.
- Trattare entrambi i lati del canale del dispositivo e pianura PDMS con plasma ad aria e legame con strato di supporto preparato di pianura PDMS (Figura 1A).
- Posizionare il chip sul vetrino 50 x 70 mm e metterlo in forno a 70 ° C per almeno 30 min migliorare la forza di legame.
2. tracheale secrezione raccolta dai pazienti ventilati meccanicamente
Nota: Secrezioni tracheali possono essere ottenute da pazienti ventilati meccanicamente durante la cura normale routine delle vie respiratorie utilizzando un protocollo modificato rispetto ai metodi convenzionali per accogliere il paziente ventilato standard, adulto. I campioni sono stati de-identificati e inviati immediatamente per l'elaborazione.
- Se l'aspirazione trachea è indicato, è possibile utilizzare un catetere per estrarre delle secrezioni bronchiali.
- Far avanzare il catetere attentamente a metà strada nel tubo endotracheale e instillare 5 mL di soluzione salina normale sterile 0,9% da una siringa preriempita da 10 mL.
- Quando il catetere viene fatto avanzare completamente o si incontra resistenza, aspirare le secrezioni e raccogliere in un contenitore di raccolta dell'espettorato sterili.
- Raccogliere 10 mL di secrezioni tracheali in un contenitore sterile dell'espettorato e posizionarlo sul ghiaccio. Inviare campioni immediatamente per l'elaborazione.
3. preparazione del campione tracheale secrezione
Nota: Tutti gli esperimenti devono essere eseguiti sotto una cappa di biosicurezza con i dispositivi di protezione personale.
- Disperdere 1ml di campioni di secrezione delle vie respiratorie in 9 mL di tampone fosfato salino (PBS) utilizzando una siringa di plastica da 10 mL (per una diluizione di 10 x). Utilizzare una pipetta smussata per omogeneizzare il campione di muco.
- Ceppo il diluente con un colino di cella di nylon 40 µm per rimuovere grandi blocchi o coaguli di sangue, che possono bloccare il foro di accesso di microfluidica o il canale. Posizionare il campione sul ghiaccio dopo l'elaborazione.
- Disperdere il diluente di ciascun campione utilizzando un volume di 100 x di tampone PBS, risultante in un 1.000 x sospensione diluita. Posizionare il campione sul ghiaccio durante l'operazione di dissociazione intero.
4. organizzazione sperimentale
Nota: Tutti gli esperimenti devono essere eseguiti sotto una cappa di biosicurezza con i dispositivi di protezione personale.
- Assemblare il PDMS chip con la guida fluida da applicare flusso uniforme a ciascuno dei microcanali quattro spirale (Figura 1B).
Nota: I quattro canali sono stati utilizzati per aumentare il throughput di parallelizzazione, nonché ottimizzazione della densità delle cellule e del volume della sospensione risultante. La guida fluida è progettata e realizzata con una stampante 3D del tipo di stereolitografia con resina trasparente. L'ingresso e la porta di uscita della guida fluida utilizzare connettori Luer femmina per facilità di connessione e stabile tenuta durante l'operazione.
- Collegare un connettore Luer maschio da 1/16 pollici per l'ingresso e la presa di parete interna (IW) porta di uscita del muro esterno (OW) della guida fluida e un tubo in silicone per la sospensione del campione.
- Inserire le punte smussate a ciascuna estremità dell'ingresso e uscite per raggiungere il fondo del serbatoio del campione.
- Collegare la pompa peristaltica con il tubo di aspirazione.
- Posizionare l'estremità della tubazione di aspirazione e tubo di uscita di IW nel serbatoio del campione e posizionare l'estremità del tubo di uscita di OW nel serbatoio dei rifiuti (Figura 1, D).
- Posizionare il tubo da 50 mL di filtrato PBS senza calcio e magnesio al serbatoio del campione.
- Inizi a pompare ad un tasso di flusso debole (~ 1 mL/min) per innescare il dispositivo.
Nota: Quando bolle vengono catturate nel canale, spingere la parte superiore del canale con la pinzetta per destabilizzare ed eliminare bolle d'aria. Quando il dispositivo è completamente riempito con soluzione tampone, sostituire il tubo di PBS per preparare la provetta del campione di secrezione delle vie respiratorie.
- Quando il campione è posto nel serbatoio del campione, accendere la pompa peristaltica e impostare la velocità di flusso a 4 mL/min (Figura 1, D).
- Quando il volume del campione raggiunge il volume designato (~ 1 mL), spegnere l'apparecchio e scollegare la tubazione del silicone.
Nota: Il metodo proposto è più efficiente a ridurre un grande volume di diluente (> 50 mL) in un volume di micro-provetta (~ 1 mL) (Figura 2).
5. analisi di citometria a flusso di
Nota: Per confrontare i metodi di dissociazione (microfluidica e Lisi), citometria a flusso con immunofluorescenza è stato utilizzato.
- Aggiungere isotiocianato di fluorescina (FITC) - anticorpo monoclonale di topo coniugato anti-umano CD66b e allophycocyanin (APC) - mouse anti-CD45 anticorpo monoclonale umano alle sospensioni iniziale (punto 3.3) e sospensioni risultante (passo 4.9) (200 µ l di coniugato di ciascun anticorpo) nel rapporto di 01:25 v/v.
- Incubare i campioni a 4 ° C al buio per 30 min.
- Analizzare entrambi i campioni su un citometro a flusso per quantificare il PMNs.
Nota: La popolazione che è positiva doppia FITC-APC, CD45 e CD66b positivo era considerata neutrofili. Recupero è stato calcolato dal rapporto tra il numero totale delle cellule dell'input e la sospensione risultante.
6. NE rilascio analisi
Nota: Per confrontare le funzionalità dell'isolato del neutrofilo dal metodo microfluidica e Lisi, un kit di test NE è stato utilizzato.
- Aggiungere PMA (fornito nel kit di dosaggio) per ogni sospensione risultante (ottenuta al punto 4.9) ad una concentrazione finale di 50 nM.
- Incubare i campioni a 37 ° C per 2 h.
- Centrifugare le sospensioni a 300 x g per 10 min.
- Trasferire 10 µ l di ciascun supernatante a una piastra a 96 pozzetti (fornita nel kit di dosaggio).
Nota: Una micropiastra da 96 pozzetti con fondo piatto e polistirolo nero può essere utilizzata come bene.
- Aggiungere 90 µ l di tampone diluito (fornito nel kit di dosaggio) in ciascun pozzetto.
- Aggiungere 10 µ l del substrato dell'elastasi (Z-Ala-Ala-Ala-Ala 2Rh110, fornito nel kit di dosaggio).
- Incubare per 1,5 h a 37 ° C.
- Leggere la piastra a 96 pozzetti utilizzando un fluorometro ad una lunghezza d'onda di eccitazione di 485 nm e una lunghezza d'onda di emissione di 525 nm.
Nota: Il livello di NE era diviso per il numero PMN dall'analisi di citometria a flusso.