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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Il protocollo descritto qui descrive l'analisi di immunofluorescenza, biocitina recupero e ricostruzioni di alta qualità di hippocampal CA2 interneuroni seguendo le registrazioni elettrofisiologiche intracellulari in vitro, permettendo un neurone caratterizzazione e infine bene anatomia un neurone per essere studiato.
Come attività di rete corticale elabora informazioni sono di importanza per un gran numero di domande scientifiche di base e cliniche. Il protocollo descritto qui identifica i componenti di base di questo circuito. Studi approfonditi di regioni corticali in definitiva fornirà altri scienziati con i componenti del circuito necessaria per la comprensione di come il cervello acquisisce, elabora e memorizza le informazioni e ciò che va storto nella malattia, mentre l'elettrofisiologici e sui dati morfologici sono ampiamente utilizzati dai neuroscienziati computazionali nella costruzione di reti di modello che esplorano l'elaborazione delle informazioni. Il protocollo descritto qui descrive come cellule piene di biocitina registrate nella regione CA2 dell'ippocampo sono recuperate e poi ricostruite in 3D. Inoltre, il protocollo descrive la dimostrazione della proteina obbligatoria del calcio o peptide contenuto in interneuroni registrati.
La corteccia e nell'ippocampo sono strutture di tale complessità che la classificazione di un neurone sottotipi1,2,3,4, mappe delle connessioni tra loro5,6 , 7 , 8 , 9 , 10 , 11 e come questo circuito supporta funzioni cognitive12,13,14,15 sono ancora in fase di intenso studio e oggetto di continuo dibattito. Ad esempio, per capire i dettagli e le complessità dei circuiti e di coordinare i dati ottenuti da diversi studi, è estremamente utile essere in grado di definire e descrivere i componenti, ma rimane una questione di dibattito come molti differenti classi di neuroni esiste, o anche se è possibile definire tutti i neuroni come appartenenti a una classe specifica. Strumenti di calcolo che possono costruire e collaudare i circuiti con diversi gradi di complessità sono essendo sviluppato16,17,18, ma centrale di questi sforzi è la necessità di studi dettagliati dei tipi cellulari e delle proprietà delle connessioni tra loro. Una grande quantità di informazioni sui circuiti locali della neocorteccia dei ratti adulti sono già stati raccolti utilizzando il protocollo descritto qui10,19,20,21, 22. anche se lo "schema elettrico" è lungi dall'essere completo, alcuni chiari schemi o regole sono emerse. Inoltre, anche se alcuni dettagli possono variare, queste regole sono comuni due specie di mammiferi (gatto e topo) e da altra parte parecchie regioni neocorticali, permettendo lo sviluppo di blocchi predefiniti di base che sono suscettibili di essere ugualmente applicabile a neocortex umano. La tecnica qui descritta è utilizzata per estendere la nostra comprensione della mappa funzionale dei circuiti corticali identificando i neuroni presinaptici e postsinaptici coinvolti nelle connessioni nelle regioni che non sono state studiate in dettaglio prima, utilizzando un protocollo che permette di tessuto eccellente conservazione e recupero notevole colorazione nel tessuto del cervello adulto. Dati sulle proprietà neuronali in questo sottocampo e il circuito di locale in CA2 sono stati raccolti con questo metodo combinando le registrazioni elettrofisiologiche intracellulari (registrazioni accoppiate con taglienti microelettrodi) con biocitina riempimento, immunofluorescenza, procedure istologiche e altamente dettagliate ricostruzioni neuronale, permettendo un confronto diretto con le vicine CA regioni23,24,25.
La tecnica descritta in questo articolo è stata sviluppata nel corso degli anni per ottenere dettagliata anatomia di un neurone permettendo la corretta classificazione delle cellule e di alta qualità e accurate ricostruzioni di entrambi loro dentritici ed axonal pergole, dati che possono essere correlato con dati elettrofisiologici raccolti da registrazioni accoppiate usando degli elettrodi affilati. Il protocollo istologico è stato ottimizzato per preservare l'ultrastruttura dei neuroni e ottenere eccellente recupero di entrambi (tra cui delle spine dendritiche) e pergole assonale. Ad esempio, il principio della tecnica doppia fissazione in primo luogo immergendo in una soluzione fissante e in secondo luogo post-fissazione in tetrossido di osmio dà un buon contrasto per microscopia chiara26. Una piccola quantità di soluzione di acido picrico e glutaraldeide vengono aggiunti alla soluzione fissante per migliorare la penetrazione dell'anticorpo e preservare l'ultrastruttura delle cellule come suggerito in un precedente studio27. La permeabilizzazione delle fette del cervello utilizzando il metodo di congelamento-scongelamento combinato con cryo-protezione con saccarosio, piuttosto che un detersivo tradizionale, fornisce anche una conservazione ottimale dei tessuti per dettagliate analisi morfologica delle cellule registrate. Inoltre, la visualizzazione in particolare di strutture molto belle è migliorata riducendo la colorazione di fondo, con le incubazioni con perossido di idrogeno (H2O2) e sodio boroidruro (NaBH4). L'aggiunta di cloruro di nichel (Burundi2) per la perossidasi di rafano (HRP) reazione per ottenere un prodotto di reazione di pigmento nero aumenta anche il contrasto.
Il seguente protocollo descrive le procedure per accertare la conservazione dei tessuti eccellenti e altamente dettagliate ricostruzioni 3D neuronale dopo registrazioni intracellulari in vitro. La descrizione della preparazione fetta, intracellulare accoppiate registrazioni utilizzando sharp elettrodi e successive procedure istologiche utilizzate nel nostro laboratorio sono stati precedentemente segnalati28. Sebbene il protocollo si applica alla celle riempite intracellulare con biocitina in fette spesse di 450 – 500 μm, può essere utilizzato lo stesso protocollo seguito cellule intere registrazioni. Tuttavia, l'uso delle fette più sottili si tradurrà in meno complete ricostruzioni delle cellule.
Tutte le procedure usate nel corso di questo studio sono state eseguite secondo le normative del British Home Office per quanto riguarda l'animale scientifico procedure Act del 1986.
1. determinazione del calcio Binding Protein o contenuto proteico di interneuroni e visualizzazione di biocitina seguito registrazioni elettrofisiologiche e riempimento biocitina
Nota: Al termine delle registrazioni elettrofisiologiche, sezioni che contengono le cellule piene di biocitina corretti durante la notte prima delle procedure istologiche. La soluzione fissante verrà sostituita con un singolo cambiamento di tampone fosfato 0,1 M la mattina successiva, se il resto della procedura viene effettuato in un altro giorno, al fine di prevenire danni ai tessuti. La soluzione di fissazione (paraformaldeide al 4%, 0,2% saturi acido picrico soluzione, soluzione di glutaraldeide 0.025% in tampone fosfato 0,1 M (PB)) deve essere fatta fresca il giorno delle registrazioni per ottenere i migliori risultati.
2. 3D ricostruzioni neuronale
Nota: Il software Neurolucida viene utilizzato. Istruzioni fornite di seguito si applicano solo a un sistema di ricostruzione del neurone specifico (Tabella materiali). Le sezioni ottenute dal taglio sono abbinate prima le ricostruzioni utilizzando un microscopio.
3. ricerca guasti
Neuroni hippocampal CA2 erano pieni di biocitina seguito registrazioni elettrofisiologiche (figure 1Ac, annuncio e 1Bc, Bd). Le fette sono state fissate a seguito durante la notte le registrazioni e la neurochimica e caratterizzazione morfologica dei neuroni sono stati rivelati seguendo il protocollo descritto qui.
La proteina obbligatoria del calcio o il contenuto proteico di interneuroni riempiti è stata determinata incubando le fette prima con gli anticorpi primari e poi con gli anticorpi secondari coniugati fluorescente. Le caratteristiche di cottura di interneuroni durante le registrazioni a dettare la scelta di anticorpi primari utilizzati. Avidina-AMCA è stato usato per prevedere l'interneurone biocitina-riempito e anti-topo isotiocianato di fluoresceina (FITC) e capra anti-coniglio Texas Red (TR) era usate per caratterizzare la neurochimica interneuronale (Figura 1 BB).
Dopo la visualizzazione di fluorescenza, un protocollo HRP è stato usato per rivelare la biocitina (Figura 1Ab). Anatomia dettagliata bene di interneuroni CA2 quindi è stato disegnato in 3D utilizzando un software di ricostruzione del neurone (Figura 2 e Figura 3a). Un video di una ricostruzione 3D di una cellula di cesto registrata e riempito in CA2 viene visualizzato a Video. Ricostruzioni di un neurone sono stati considerati come completa se entrambe le pergole dentritici ed axonal furono confinati all'interno della profondità della fetta 450-500 μm. Povero arbor axonal macchiatura è stata valutata la presenza di rami troncati con finali aperti nella parte superiore o parte inferiore della sezione o da una colorazione che è stata limitata al segmento iniziale dell'assone e rami molto prossimale. Figura 4 rappresenta gli esempi di una buona e una povera HRP colorazione seguente visualizzazione biocitina.
L'analisi morfometrica di ricostruzioni 3D (Figura 3) possono essere effettuata per dimostrare la complessità di ramo, soma superficie e la superficie e il volume delle pergole dentritici ed axonal.

Figura 1 : Un neurone ricostruzioni di due tipi di cellule del cestino registrata e riempito nella regione hippocampal CA2 e correlato dati elettrofisiologici ottenuti seguendo le registrazioni intracellulari in vitro. Questa figura è stata modificata da precedenti studi23,24. COSÌ Stratum Oriens, SP Stratum Pyramidale, SR strato radiato, SLM Stratum Lacunosum molecolare. (A), Aa: ricostruzione di una cella di cesto CA2 con limitato arbor dentritici ed axonal, utilizzando un tubo di disegno (1000 X). I dendriti sono in nero, e l'assone è in rosso. AB: Immagine della cella cesto pieno di biocitina seguendo il protocollo di avidina-HRP descritto qui. AC: Rappresentanza traccia delle risposte di tensione a hyperpolarizing e depolarizzando iniezione corrente di una cella di cesto CA2 con limitato arbor dentritici ed axonal. Annuncio: Esempio di una piramide di CA2 per restringere le connessioni arbor canestro cella registrato utilizzando degli elettrodi affilati. Composito potenziale post-sinaptico eccitatorio (EPSP) medie mostrano treno breve depressione apparente durante le risposte ai treni di tre punte. (B) Ba: ricostruzione 2D di una cella di cesto CA2 con ampia dentritici ed axonal pergole utilizzando un tubo di disegno (1000 X). L'albero dendritico di questa cella cesto (in nero) esteso radialmente attraverso tutti gli strati della regione CA2 e orizzontalmente in SO e SP delle regioni CA2 e CA3. Un dendrite orizzontale raggiunto anche la regione CA1. L'assone (in rosso) esteso alle regioni CA3 e CA1. BB: La piena di biocitina (AMCA macchiatura) canestro cella era PV-immunopositive (FITC colorazione) e CB-immunonegative (colorazione rosso-Texas). BC: Rappresentanza traccia delle risposte di tensione a hyperpolarizing e depolarizzando iniezione corrente di una cella di cesto CA2 con ampia dentritici ed axonal arbor. BD: Composito EPSP medie mostrano breve treno facilitazione apparente durante le risposte ai treni di tre punte. Esempi di altri tipi di interneuroni registrate in CA2 possono essere trovati in precedenti studi25,30. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2 : Ricostruzione 3D delle cellule del corpo. (A) l'analisi 3D del corpo cellulare. Vista dei contorni diversi tracciati a posizioni diverse z mentre messa a fuoco attraverso il corpo cellulare. (B) vista 3D dei contorni diversi. (C) vista 3D del corpo delle cellule ad un angolo differente. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3 : Analisi di morfometria di ricostruzioni 3D di un neurone. (A) ricostruzione 3D di una cellula di cesto stretto arbor CA2. Ogni ramo dendritica è rappresentato da un colore (verde, blu, rosso e rosa) e dell'assone è in azzurro. (B) dendrogramma della cella cesto che rappresenta il numero delle ramificazioni dendritiche e la lunghezza di ogni segmento contenuta all'interno di sfere concentriche con il soma e a 100 μm intervalli dal soma. I colori il dendrogramma corrispondono a quelle di dendriti in a. (C) esempio di analisi morfometrica eseguita su cellule piramidali CA2 (adattate da un precedente studio23). Il numero delle ramificazioni dendritiche era tramato contro la distanza dal soma delle cellule piramidali CA2. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4 : Esempi di buona (A) e poveri (B) HRP macchiatura. (A) biocitina recupero ha rivelato un interneurone molto ben riempito in CA2. Il corpo delle cellule (CB) è macchiato scuro e ha contorni chiari. I dendriti sono in rilievo e visualizzate alcune spine (rappresentati da stelle rosse). L'arbor assonale (A) è denso e presenta piccole boutons. (B) esempio di un povero dentritici ed axonal macchiatura delle 2 cellule piramidali in CA2. La colorazione della CB è debole con nessun contorno chiaro. Povero di colorazione è spesso associato con più brevi registrazioni elettrofisiologiche, con conseguente presenza di pochissimi rami biocitina-riempito. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Video 1: 3D ricostruzione neuronale di una cella di cesto CA2 con limitato arbor dendritiche (noto anche come cellula di cesto stretto arbor CA2) con sua soma nel corneum pyramidale, dendriti che attraversa tutti gli strati e assone in CA2 corneum pyramidale e adiacente strato oriens e radiato. Molto pochi rami ha raggiunto la prossimale CA3 strato oriens e CA3 corneum pyramidale. Questa cella è stata riempita con biocitina seguito registrazioni elettrofisiologiche e sezioni sono stati elaborati con avidina-HRP seguendo il protocollo descritto qui. A causa di affettare, solo l'assone all'interno della profondità della fetta è stato recuperato, anche se i dendriti sono intatti. Dendriti sono in rosa scuro e assone in bianco. I limiti di strato e regione sono state aggiunte all'inizio del video. Ricostruzione 3D da video di Georgia Economides-3D da Svenja Falk. Il video è stato registrato con un software di ricostruzione del neurone come indicato nel passo 2.17 e modificato con un software di editing video. Link al video:30. Per favore clicca qui per scaricare questo video.
| Soluzioni utilizzate | Composizione/istruzioni |
| Soluzione di fissazione | paraformaldeide al 4%, 0,2% saturi acido picrico soluzione, soluzione di glutaraldeide 0.025% in tampone fosfato 0,1 M (PB) |
| 0,1 tampone fosfato M a pH 7,6 | Aggiungere 100 mL di brodo 1 M fosfato tampone a 900 mL di acqua distillata |
| Tampone fosfato salino (PBS) pH 7,4/7.5 | Aggiungere 10 mL di tampone fosfato 0.1M, 0,2 g di KCl e 8,76 g di NaCl a 990 mL di acqua distillata |
| Tampone TRIS pH 7.5 | Sciogliere 5,72 g di Tris cloridrato e 1,66 g di Tris Base in 50 mL di acqua distillata. Quindi apportare fino a 1 L con acqua distillata. |
| Soluzione fissante glutaraldeide e paraformaldeide tamponata | paraformaldeide al 4%, 0,2% saturi acido picrico soluzione, soluzione di glutaraldeide 0.025% in tampone fosfato 0,1 M. |
| Soluzione di ABC | Soluzione da effettuarsi almeno 30 min prima dell'uso del kit di ABC. Aggiungere 1 goccia di soluzione A e 1 goccia di soluzione B a 2,5 mL di PBS. |
| Resina epossidica di Durcupan: | Fare 20 vasi: 20 g di componente A, 20 g di componente B, 0,6 g di componente C e 0,4 g di componente D - |
| Proteggere l'equilibrio da sversamenti accidentali di coprire la piastra con un cerchio di carta da filtro. Valutare attentamente i reagenti in un becher di tripour nelle proporzioni sopra indicato. Miscelare accuratamente agitando vigorosamente utilizzando due bastoni di legno per almeno 5 min. La miscela dovrebbe trasformarsi in un colore marrone scuro di densità uniforme. Porre il becher in forno a ~ 50 ° C per un massimo di 10 min per rimuovere come molte bolle di aria possibile. Nota: La resina inizia a curare se si lascia il bicchiere nel forno più di 10 min. decantare la resina in vasi di plastica o siringhe da 5 mL, datarle e riporre nel congelatore di-20 ° C pronto per l'uso. |
Tabella 1: Tabella delle soluzioni.
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Il protocollo descritto qui descrive l'analisi di immunofluorescenza, biocitina recupero e ricostruzioni di alta qualità di hippocampal CA2 interneuroni seguendo le registrazioni elettrofisiologiche intracellulari in vitro, permettendo un neurone caratterizzazione e infine bene anatomia un neurone per essere studiato.
Questa ricerca ha ricevuto un finanziamento da Novartis Pharma (Basilea) e del Medical Research Council assegnato a Prof Alex Thomson, la biotecnologia e di Biological Sciences Research Council (BBSRC-BB/G008639/1), la società fisiologica, l'Unione europea Orizzonte 2020 programma quadro per la ricerca e l'innovazione sotto l'accordo di sovvenzione specifiche n ° 720270 (Human Brain Project SGA1) e sotto l'accordo di sovvenzione specifiche n ° 785907 (Human Brain Project SGA2). Siamo estremamente grati al Prof Alex Thomson per la configurazione del protocollo in altre regioni corticali, garantire il finanziamento e per il suo continuo sostegno per questo progetto. Contributi dei membri di laboratorio che hanno contribuito a ottimizzare il protocollo di recupero e ricostruito CA2 neuroni sono ringraziano: J. Deuchars, D. I. Hughes e H. Pawelzik, A. P. Bannister, K. Eastlake, H. Trigg, N. A. Botcher.
| Anticorpo dell'acido avidina-7-ammino-4-metilcumarina-3-acetico (Avidin-AMCA) - 20,8 mg/mL | Laboratori vettoriali | A2008 | |
| Biocitina ≥ 98% (TLC) | Sigma | B4261 | |
| 3,5 diaminobenzidina (DAB) compresse, Per preparare 5 mL | di resina epossidicaSigma | D4293 | |
| Durcupan A | Sigma | 44611 | |
| Resina epossidica Durcupan B | Sigma | 44612 | |
| Resina epossidica Durcupan C | Sigma | 44613 | |
| Resina epossidica Durcupan D | Sigma | 44614 | |
| Etanolo, purizzato. p.a., assoluto, ≥ 99,8% | Sigma | 32221 | |
| Gelatina | Sigma | 48723 | |
| Soluzione di glutaraldeide, grado I, 25 % in H2O | Sigma | G5882 | |
| Glicerolo, ≥ 99% | Sigma | G5516 | |
| Siero di capra | Sigma | G9023 | |
| Isotiocianato di fluoresceina anti-topo di capra (FITC)- 14,3 mg/mL | Sigma | F2653 | |
| Capra anti-coniglio Texas Red (TR)- 3,3 mg/mL | Invitrogen | T2767 | |
| Perossido di idrogeno, soluzione al 30% | Sigma | H-1009 | |
| Olio da immersione, viscosità 1.250 cSt (lett.) | Sigma | I0890 | |
| Cloruro di nichel (NiCl2 . 6H2O) | Sigma | N5756 | |
| Tetrossido di osmio, per microscopia elettronica, 4% in H2O | Sigma | 75632 | |
| Paraformaldeide, grado reagente, cristallino | Sigma | P6148 | |
| Acido picrico, inumidito con acqua, ≥ 98% | Sigma | 197378 | |
| Tampone fosfato 1 M | Sigma | P3619 | |
| Ossido di propilene (C3H6O), 99% | Alfa Aesar | 30765 | |
| Tetraidroborato di sodio | VWR | 27885.134 | |
| Saccarosio | Fisher scientific | S/8600/53 | |
| Trizma cloridrato, ≥ 99.0% | Sigma | T5941 | |
| Trizma base, ≥ 99,9% | Sigma | T6066 | |
| Vectashield Antifade Montaggio Medio, , indice di rifrazione 1,45 | Vector laboratories | H-1000 | |
| Vectastain Elite ABC HRP kit | Vector laboratories | PK6100 | |
| Attrezzatura utilizzata | |||
| Vibratome | Agar Scientific | ||
| C4A Planchette in alluminio a coppa | GA-MA & ASSOCIATI, INC. | ||
| Microscopio Leica DMR | Leica Microsystems | ||
| X-Cite 120PC Q Sorgente luminosa a fluorescenza | Excelitas Technologies | ||
| Fotocamera per microscopio digitale Leica DFC450 | Leica Microsystems | ||
| Penna da disegno tecnica Rapidograph 0,18 mm | London graphics centre | ||
| pennino rapidograph da 0,18 mm | London graphics centre | ||
| penna da disegno tecnico Rapidograph 0,25 mm | Centrografico di Londra | ||
| Pennino rapidograph da 0,25 mm | Centro | grafico di Londra | |
| Sistema Neurolucida che include workstation PC, palco, telecamera e joystic per il controllo di scena XYZ | Microbrighfield (MBF) Bioscience | ||
| Neurolucida versione software 2017 | Microbrighfield (MBF) Bioscience | ||
| CorelDRAW graphics Suite X5 | Corel | ||
| Software di editing video | Adobe Premiere Pro | ||
| Fiale di vetro 14 ml | Fisher scientific |