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Macchiatura del tetramero è un protocollo piuttosto semplice e senza complicazioni per analizzare il fenotipo e peptide specificità di un linfocita T. L'utilizzo di sangue per l'analisi, come descritto qui, è come minimo dilagante e consente il monitoraggio continuo, ad esempio negli studi di vaccinazione. Nel campo della vaccinazione, la quantificazione delle risposte antigene-specifiche e di vettore è di interesse, come le risposte specifiche del vettore potrebbero ostacolare un'efficace risposta immunitaria contro il vaccino antigene28. Di nota è che con il protocollo descritto qui, entrambe le popolazioni possono essere quantificate simultaneamente in un singolo tetramero di macchiatura, riducendo la variabilità di colorazione e quantità di campione. Tuttavia, a pochi passi devono essere fatte con cura per garantire la corretta misurazione e dati affidabili. Se si utilizza sangue dalla vena caudale per analisi, uno dovrebbe assicurarsi che preriscaldare gli animali per indurre vasodilatazione24. Quindi, sufficiente sangue può essere raccolto in breve tempo, lo stress sugli animali è ridotto e l'analisi è molto meglio, rispetto a se il sangue viene raccolto lentamente. Inoltre, dopo la raccolta dei campioni (sangue o organi), macchiatura diretta è consigliabile per evitare risultati falsi negativi a causa di TCR downregulation. Lo stesso vale per tutti i passaggi successivi: la procedura non deve essere interrotta e tutti i passaggi del lavaggio ridotto al minimo numero (come indicato nel protocollo). Per garantire la corretta colorazione, dovrebbe prestare attenzione a vortice tutte le soluzioni e i campioni prima e dopo incubazione. Ciò è particolarmente importante prima di fissare i campioni per evitare grumi di cellule.
In termini di modifica del protocollo, possono essere utilizzati altri marcatori di superficie e tetrameri, a seconda l'obiettivo dell'analisi. Tuttavia, tutti i reagenti quindi necessario dosare in modo ottimale in combinazione con l'intero pannello di colorazione. Per alcuni i tetrameri specificati qui, ottimizzazione ha rivelato che possiamo aumentare la diluizione consigliata dal produttore (01:10 consigliato, ottimizzato 01:25) (tabella 1). Per compensare la sovrapposizione spettrale, perline di compensazione può essere utilizzato invece di cellule marcate. Per quanto riguarda la scelta del fluorocromo tetramero-accoppiati, si dovrebbe prevedere di utilizzare fluorocromi brillanti, che facilita la rilevazione - soprattutto quando il segnale è basso. Come Dolton e colleghi29, preferiamo usare tetrameri PE - o APC-accoppiati, che possono essere perfettamente combinati in un'unica colorazione e CD8+ T cellule con una specificità del singolo antigene possono essere ben rilevato (Figura 2). Per quanto riguarda la temperatura e l'incubazione volte, esiste una varietà di tetramero condizioni di colorazione. Nel nostro processo di ottimizzazione, abbiamo affrontato questo problema ed abbiamo effettuato tetramero che macchia a condizioni diverse (ad esempio 4 ° C, temperatura ambiente o 37 ° C). Dai risultati ottenuti, si consiglia a macchiare per 20 min a 37 ° C, che è in concordanza con letteratura30,31. Incubazione prolungata dovrebbe essere evitato, come questo può portare a interiorizzazione dei risultati negativi del tetramero30 e false.
La scelta dell'anticorpo giusto per il rilevamento di CD8+ cellule è un'altra questione importante, che ha attentamente considerati (e potenzialmente adattato). Ciò deriva dal fatto che alcuni cloni dell'anticorpo anti-CD8 blocco associazione di tetrameri di TCR, in umano32 così come mouse33 campioni. Per il nostro tetramero protocollo di colorazione, abbiamo selezionato clone 53 – 6.7 a macchiare per CD8 murino+ cellule — un clone che non blocca, ma piuttosto migliora tetramero macchiatura.
Macchiatura del tetramero è piuttosto semplice quando si analizzano le risposte immunitarie prominente al picco della risposta delle cellule T, ad esempio. Tuttavia, potrebbero esistere delle popolazioni che sono un po' più "problematiche". Questi esempi includono cellule specifiche per antigeni di bassa affinità (tumore, self), recentemente attivato cellule che successivamente giù-regolato loro recettori o sottoinsiemi di cellule rare (ad es.. ingenuo precursore o memoria popolazioni di cellule). In questi casi, il tetramero classico protocollo di colorazione potrebbe essere necessario essere migliorato o combinato con altri metodi. Ad esempio, il proteina chinasi inibitore (PKI) dasatinib inibisce l'interiorizzazione di TCR e potrebbe essere inserito prima della colorazione tetramero. Tetrameri possono essere stabilizzati anche includendo anti-fluorocromo non coniugata Abs primario dopo la macchiatura tetramero. Inoltre, l'intensità di fluorescenza può essere aumentata tramite l'aggiunta di un secondo anti-Ab fluorocromo-coniugate Ab29,34,35,36. Abbiamo ottimizzato le condizioni in modo selettivo per i tetrameri specificati nel presente protocollo e non include PKI o Abs ulteriori. Tuttavia, per qualsiasi altro tetramero, le condizioni ottimali devono essere regolata singolarmente. Per quanto riguarda le popolazioni rare, tetramero colorazione potrebbe essere necessario essere combinati con arricchimento magnetico11.
Per facilitare e convalidare analisi Citofluorimetrica del tetramero macchiatura, controlli positivi e negativi devono essere inclusi. Come controllo negativo, abbiamo sempre macchia le cellule del mouse ingenui dello stesso ceppo con nostro tetramero di interesse. In alternativa, i campioni possono essere macchiati con tetrameri con peptidi irrilevanti, ma con il fluorocromo stesso come il tetramero di interesse. Tali controlli sono essenziali per escludere falsi segnali positivi, ad esempio., che proviene dalle cellule morenti. Oltre a questo, si consiglia di includere una macchia vive/morte, ad esempio ioduro di propidio (PI). Questo è di particolare importanza se le cellule non sono macchiate direttamente dopo l'isolamento. Un'altra strategia per rimuovere autofluorescence sfondo potrebbe essere di includere diversi marcatori di cellule non-T in un canale. Escludendo le cellule positive in questo canale, popolazioni di cellule non-T possono essere escluso. Come controllo positivo, un campione da un mouse di OT-1 può essere utilizzato per tetramero OVA, ad esempio. Per altri tetrameri, questo deve essere scelto individualmente (ad es.., campione da un mouse, che è stato immunizzato più volte). Allo stesso modo gli altri37, osserviamo anche una down-regulation del recettore CD8 durante l'attivazione di CTL al 7 ° giorno della risposta delle cellule T effettrici. Pertanto, per evitare la perdita di cellule T effettrici attivato tetramero+ , si consiglia di includere le cellule CD8basso nell'analisi (almeno se la misurazione nella fase effettrice).
La qualità e la quantità di informazioni che si possono recuperare da questo protocollo dipende dalla conoscenza circa l'antigene da studiare, la disponibilità e la specificità del tetramero e la qualità della macchina FACS (numero di rivelatori disponibili e laser). Se si lavora con campioni animali, variazione nella risposta immunitaria è naturale e inevitabile. Pertanto, per ottenere risultati significativi da tetramero macchiatura, almeno 3-5 animali dovrebbero essere analizzati. Se fatto, il protocollo descritto qui darà risultati affidabili e riproducibili (esemplare risultato da un esperimento può essere trovato nella Tabella supplementare 1). Come accennato prima, questo metodo è perfettamente adatto per quantificare il fenotipo e la specificità dell'antigene di CD8+ T cellule (Figura 3, 4; Supplemental Figura 1), non solo nel topo ma anche negli esseri umani. Tuttavia, per analizzare CD8+ delle cellule T effettrici le funzioni, come la morte delle cellule indotta da granzyme, ICS e/o ELISpot devono essere eseguite. Tuttavia, si dovrebbe tenere a mente che funzioni a cellula T, come misurato dalla stimolazione in vitro potrebbero non rappresentare la reale situazione in vivo. In vivo, un ambiente soppressivo potrebbe impedire le funzioni delle cellule T che vengono misurate in vitro.
Il relativi propri, tetramero macchiatura non fornisce tutte le informazioni, ma si è evoluto per diventare un metodo essenziale per caratterizzare le risposte delle cellule T e quantificare i sottoinsiemi a cellula T in vitro in un modo molto sensibile38. Tetrameri non possono essere utilizzati solo per quantificare determinati sottoinsiemi, ma anche per isolare quelli39, li localizzare l'ibridazione in situ19,20 e studiare gli antigeni di bassa affinità, come tumore-collegati40, 41. dalla scoperta del tetramero tecnologia4, tetramero macchiatura è diventato uno strumento essenziale in analisi a cellula T e la gamma di applicazioni.