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Quando il fegato è ferito, il numero di epatociti diminuisce, mentre le dimensioni della cellula, le dimensioni del nucleare e l'aumento della ploidia. L'espansione di cellule non parenchychymal come cholangiociti, miofibromi, progenitori e cellule infiammatorie indicano anche danni epatici cronici, rimodellamento dei tessuti e progressione della malattia. In questo protocollo, descriviamo un semplice approccio ad alto contenuto di velocità per calcolare i cambiamenti nella composizione cellulare del fegato che sono associati a lesioni, malattie croniche e cancro. Mostriamo come le informazioni estratte dalle sezioni di tessuto bidimensionali (2D) possono essere utilizzate per quantificare e calibrare la ploidia nucleare degli epatociti all'interno di un campione e consentire all'utente di individuare specifici sottoinsiemi di ploidia all'interno del fegato in situ. Il nostro metodo richiede l'accesso a materiale epatico fisso/congelato, reagenti di immunocitochimica di base e qualsiasi piattaforma di imaging standard ad alto contenuto. Serve come una potente alternativa alle tecniche di citometria di flusso standard, che richiedono l'interruzione del tessuto appena raccolto, la perdita di informazioni spaziali e potenziale pregiudizio di disaggregazione.