$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Tutti gli embrioni di pesce zebra utilizzati in questa procedura sono stati allevati e allevati seguendo i protocolli IACUC stabiliti27. Questi protocolli sono stati approvati dall'Università del Texas ad Austin e dall'Università di Louisville.
NOTA: La linea di pesce zebra Tg(fli1:EGFP)y1 è stata utilizzata in questo studio28. Tutta l'acqua utilizzata in questa procedura è acqua sterile di osmosi inversa. Tutte le analisi statistiche sono state eseguite utilizzando Graphpad Prism v8.2.1.
1. Fare i media embrionali
- Per fare uno stock 20x di supporti embrionali, sciogliere 17,5 g di NaCl, 0,75 g di KCl, 2,9 g di CaCl2, 0,41 g di K2HPO4, 0,142 g di NA2HPO4e 4,9 g di MgSO4-7H2O in 1 L di acqua. Ignorare il precipitato bianco che si forma; ciò non avrà alcun impatto sui media. Filtrare sterilizzare la soluzione di magazzino e conservare a 4 gradi centigradi.
- Per creare la soluzione di supporto embrionale funzionante, sciogliere 1,2 g di NaHCO3 in 1 L di 20x di brodo di media embrionali e aggiungere 19 L di acqua. Mantenere la soluzione di supporto embrionale funzionante a 28 gradi centigradi.
2. Misurazione del volume embrionale mediante lo spostamento dell'acqua
NOTA: In questo protocollo vengono utilizzati 24 embrioni successivi alla fecondazione (hpf)(Figura 1). Gli embrioni utilizzati nelle misurazioni del volume non vengono utilizzati nell'analisi dell'etanolo.
- Mettere 10 embrioni e fluidi extraembryonici in un tubo di microcentrifuga da 1,5 mL contrassegnato con un volume di 250 l (Figura 2A). Aggiungere acqua alla linea di riempimento di 250 L (vedere esempio con acqua tinta nella figura 2B).
- Ripetere il passaggio 2.1 per impostare i recipienti per gli embrioni a cui sono stati rimossi i courioni.
- Per rimuovere il chorion, mettere gli embrioni nei loro chorions in un piatto Petri da 100 mm con 2 mg/mL di cocktail proteasi in embriomi a temperatura ambiente (RT) per 10 min. Ogni pochi minuti, ruotare delicatamente gli embrioni per rompere il chorion.
- Una volta che tutti gli embrioni sono liberi dal loro coro, rimuovere gli embrioni dechorionati dal cocktail proteasi/ mezzi di embrione e mettere in un nuovo piatto Petri 100 mm con mezzi embrionali freschi per lavare gli embrioni. Ripetere questo lavaggio passo 1 più tempo (per un totale di 2 lavaggi). Trasferire gli embrioni in una parabola Petri fresca di 100 mm.
- Utilizzando la punta più piccola possibile e senza danneggiare gli embrioni, rimuovere con attenzione tutto il liquido da circa gli embrioni utilizzando un micropipettore p200 (Figura 2C) e pesare l'acqua con una scala con precisione <0,1 mg. Per determinare il volume del campione di 10 embrioni, sottrarre il peso/volume dell'acqua (1 mL di acqua e 1 g di acqua.) rimossa da 250 l. Per determinare il volume di un singolo embrione, dividere la differenza tra 250 l e il peso dell'acqua rimossa da 10.


3. Trattamento di embrioni con etanolo
- Raccogliere gli embrioni dai serbatoi di accoppiamento e metterli in una parabola Petri standard da 100 mm. Contare non più di 100 embrioni per singola parabola Petri e incubare a 28,5 gradi centigradi.
NOTA: Se il chorion deve essere rimosso (passaggio 2.2), deve essere rimosso prima di aggiungere l'etanolo.
- A 6 hpf, aggiungere fino a 100 embrioni a un nuovo piatto Petri standard da 100 mm con mezzi embrionali o multimediali embrionali , ovvero l'1% di etanolo (v/v). Coprire, ma NON sigillare il piatto Petri. Collocare gli embrioni in un'incubatrice a bassa temperatura impostata a 28,5 gradi centigradi per 18 ore, o fino a quando gli embrioni raggiungono il punto di tempo di sviluppo di 24 hpf.
4. Preparazione del flusso di lavoro prima dell'elaborazione degli embrioni per la cromatografia del gas spaziale della testa
- Fare una soluzione di 5 M NaCl in acqua (450 s sarà necessario per ogni tubo campione) per denaturare tutte le proteine e prevenire il metabolismo dell'etanolo. Preparare il cocktail proteasi (Tabella dei Materiali) ad una concentrazione di 2 mg/mL nei mezzi embrionali.
- Etichettare un tubo di microcentrifuga da 1,5 ml e una fiala cromatografica a gas da 2 mL per ogni campione. Etichettare ulteriori fiale di cromatografo a gas da 2 mL per gli standard di etanolo descritti di seguito, così come aria, acqua e gli spazi vuoti da cocktail 5 M NaCl/proteasi.
- Impostare tre micropipettori p200 due impostati su 50 l, e il terzo impostato su 200 L; un micropipettore p1000 impostato su 450 l e un micropipettore p2 impostato su 2 L. Per le pipette di vetro utilizzate per trasferire gli embrioni dai piatti Petri ai tubi di microcentrifuga da 1,5 mL, passare rapidamente la punta della pipetta attraverso una fiamma per lisciare i bordi per non danneggiare gli embrioni quando li si disegna nella pipetta.
5. Lavorazione degli embrioni per la cromatografia del gas spaziale capo
NOTA: Entrambi gli embrioni nei loro chorion e quelli precedentemente rimossi dai loro chorions sono trattati allo stesso modo per coerenza nel calcolo dei fattori di diluizione.
- Utilizzando i due micropipettori p200 impostati su 50 l, si innunci 50 - l della soluzione cocktail proteasi e disegna 50 l di acqua nel secondo.
- Utilizzando la pipetta di vetro e il micropipettore, posizionare rapidamente 10 embrioni (dal punto 3.2) in un tubo di microcentrifuga da 1,5 mL e chiudere il tappo (come descritto nella Figura 2A). Ripetere l'operazione per tutti i campioni da testare, i controlli e gli embrioni trattati con etanolo.
- Utilizzando il micropipettore p200 impostato su 200 , aprire rapidamente il tappo e rimuovere tutti i supporti embrionali residui (come descritto nella Figura 2C). Posizionare rapidamente il pipetta contenente 50 l di acqua nel tubo e aggiungere rapidamente (per non danneggiare gli embrioni), quindi rimuovere l'acqua. Aggiungere rapidamente 50 l della soluzione di cocktail protease dal pipettor in attesa e chiudere il tappo del tubo (Figura 2D).
NOTA: eseguire questo processo un campione alla volta.
- Lasciare che il campione si sieda a RT per 10 min per consentire al cocktail di proteasi di degradare il chorion. Quindi, aggiungere rapidamente 450 luna di 5 M NaCl e chiudere il tappo del tubo (Figura 2E). Vortice i campioni per 10 min. Per accelerare il processo, impostare il mixer per vortice più campioni contemporaneamente.
NOTA: Aggiungere una piccola quantità di una miscela di perline di silice (2 dimensioni, 0,5 mm e 1 mm di perline) a qualsiasi tubo con embrioni più vecchi di 24 cvf. Negli embrioni più vecchi, il notocordo rimarrà intatto indipendentemente da quanto tempo sono omogeneizzati.
- Dopo aver omogeneizzato per 10 min, rimuovere rapidamente 2 -L di supernatante embrionale omogeneizzato e aggiungere a una fiala cromatografo a gas. Sigillare rapidamente la fiala con il cappuccio in politetrafluoroetilene.
6. Preparazione delle norme sui supporti e sugli etanoli
- Per preparare gli standard dei media, diluire i supporti con un fattore 10 con una soluzione cocktail NaCl/protease da 5 M. Aggiungere 2 l di ciascun campione a una fiala cromatografica a gas e sigillare con un tappo in politetrafluoroetilene.
- Per preparare gli standard di etanolo, creare una diluizione seriale di 100% etanolo nella soluzione cocktail NaCl/protease da 5 M alle seguenti concentrazioni: 0.3125, 0.625, 1.25, 2.5, 5, 10, 20 e 40 mM. Aggiungete 2 l di ogni standard in una fiala cromatografica a gas e si guarniscono con un cappuccio in politetrafluoroetilene.
7. Preparazione del cromatografo del gas dello spazio della testa
NOTA: questa configurazione e protocollo potrebbe essere necessario modificare a seconda del cromatografo a gas utilizzato. La cromatografia del gas spaziale della testa viene utilizzata per quantificare i livelli di etanolo, non per la separazione.
- Impostare il riscaldatore per l'autocampionatore a 58 gradi centigradi e accenderlo. Lasciare che il riscaldatore raggiunga i 58 gradi centigradi e accendere le linee di gas ad aria e idrogeno che alimentano il cromatografo a gas (per la ionizzazione della fiamma utilizzata per quantificare l'etanolo).
NOTA: il psi deve essere impostato per azionare correttamente il cromatografo secondo le specifiche del produttore. Assicurarsi che la linea dell'elio sia accesa e impostata sul psi corretto.
- Per il setto, assicurarsi che il numero di campioni iniettati non sia >100. Per la fibra di iniezione, assicurarsi che il numero di campioni iniettati non è >500.
NOTA: Se uno dei due è superiore alla quantità di iniezioni, dovranno essere modificate prima di eseguire i campioni di prova.
- Accendere il software di analisi e assicurarsi che la workstation sia configurata correttamente. Memorizzare tutti i dati in base agli standard di laboratorio/reparto. Creare un nuovo elenco di esempio per gli esempi da eseguire.
- Avviare il metodo di avvio e attendere che il rilevatore di ionizzazione della fiamma si stabilizzi prima di eseguire i campioni. Una volta stabile, eseguire il metodo di avvio del software per pulire la fibra.
8. Misurazioni campione con cromatografia a gas dello spazio della testa
- Una volta completato il metodo di avvio, creare 1 nuova riga per ogni campione nell'elenco di esempio. Dal menu dei metodi nel software di analisi, caricare 436 corrente spme etanolo 2013 3min assorbire 2_5min corsa rg. METH per ogni campione nell'elenco di esempio.
- Compilare l'elenco dei campioni, a partire dall'aria, dall'acqua, dagli spazi vuoti dei cocktail 5 M NaCl/protease. Quindi immettere gli standard in ordine, da 0,3125 a 40 mM. Seguire gli standard con un secondo giro di aria, acqua, e 5 M NaCl / protease cocktail spazi vuoti.
- Inserire tutti i campioni di supernata dell'embrione omogeneizzato da testare, dalla concentrazione di etanolo più bassa a quella più alta. Terminare inserendo un terzo e ultimo giro dell'aria, acqua, e 5 M NaCl / protease cocktail vuoti.
- Aggiungere le fiale del cromatografo a gas all'autocampionatore nell'ordine in cui sono stati immessi i campioni. Consentire il riscaldamento dei campioni per 10-15 min. Avviare l'esecuzione dell'esempio nel software.
- Dopo aver eseguito tutti i campioni e gli spazi vuoti finali, attivare il metodo di arresto nel software aggiungendo un campione finale nell'elenco dei campioni ed eseguendo standby. METH. Eseguire il backup di tutti i dati acquisiti durante le esecuzioni dell'esempio. Spegnere l'apparecchiatura nel seguente ordine: riscaldatore autocampionatore, serbatoio di idrogeno e, solo dopo che la temperatura del cromatografo raggiunge i 30 gradi centigradi, il serbatoio dell'aria. Lasciare il serbatoio di elio per preservare la colonna di cera.
9. Esempio di integrazione dei picchi di etanolo e analisi della concentrazione dei campioni
NOTA: tutti i valori a partire da 9.3 sono stati calcolati in un file Excel precompilato.
- Una volta completato il metodo di spegnimento, fare clic su Apri cromatogramma. Aprire la cartella contenente i risultati. I campioni vengono integrati automaticamente in questo programma.
- Nei risultati, assicurarsi che siano stati integrati i picchi corretti (picchi di etanolo tra 2 e 2,5). Una volta che tutti i campioni sono stati confermati, stampare o esportare i risultati.
- Tracciare l'altezza massima degli standard di etanolo su un grafico. Calcolare i valori di pendenza, intercetta Y e R2 per gli standard etanolo (R2 deve essere >0.99).
NOTA: questi valori verranno utilizzati per determinare la concentrazione di etanolo dall'altezza massima del campione.
- Per ogni campione, sottrarre l'altezza massima del campione dall'intercetta Y degli standard di etanolo. Dividere questo valore per la pendenza degli standard di etanolo per ottenere il valore di etanolo per ogni campione nelle fiale GC.

- Per calcolare la concentrazione di etanolo negli embrioni, calcolare innanzitutto il fattore di diluizione per ogni campione. Prendere la misura del volume calcolata al punto 2.3 di questo protocollo e dividerla per la misura del volume più 500 L. Questo rappresenta la soluzione cocktail NaCl/protease da 5 M aggiunta ad ogni campione durante l'elaborazione dell'embrione (passaggi 5.3 e 5.4).

- Usando questo fattore di diluizione del campione, moltiplicare per il valore di etanolo del campione per ogni campione. I risultati saranno in concentrazione mM. Calcolare i campioni di riferimento dei supporti moltiplicando il valore dell'etanolo del supporto per il fattore di diluizione pari a 10.

