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Articolo metodologico

Identificazione di inibitori EGFR e RAS utilizzando Caenorhabditis elegans

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DOI:

10.3791/61788

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5 ottobre 2020

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In questo articolo

Sommario

Il nematode geneticamente trattabile Caenorhabditis elegans può essere utilizzato come modello semplice ed economico per la scoperta di farmaci. Qui è descritto un protocollo per identificare terapie antitumorali che inibiscono la segnalazione a valle delle proteine RAS ed EGFR.

Abstract

I cambiamenti nella localizzazione della membrana plasmatica del recettore del fattore di crescita epidermico (EGFR) e del suo effettore a valle RAS sono stati implicati in diverse malattie tra cui il cancro. Il nematode C. elegans a vita libera possiede una cascata di segnali EGFR-RAS-ERK MAP evolutivamente conservata e funzionalmente conservata che è centrale per lo sviluppo della vulva. Le mutazioni di guadagno di funzione nell'omologo RAS LET-60 e nell'omologo EGFR LET-23 inducono la generazione di pseudovulva ectopica non funzionale visibile lungo la parete corporea ventrale di questi vermi. In precedenza, il fenotipo multivulvale (Muv) in questi vermi ha dimostrato di essere inibito da piccole molecole chimiche. Qui descriviamo un protocollo per l'utilizzo del worm in un test a base liquida per identificare gli inibitori che aboliscono le attività delle proteine EGFR e RAS. Usando questo test, mostriamo che la R-fendilina, un inibitore indiretto di K-RAS, sopprime il fenotipo Muv espresso nei vermi mutanti let-60(n1046) e let-23(sa62). Il test è semplice, poco costoso, non richiede molto tempo per l'installazione e può essere utilizzato come piattaforma iniziale per la scoperta di terapie antitumorali.

Introduzione

Le vie cellulari che regolano gli eventi di sviluppo all'interno degli organismi sono altamente conservate tra tutti i metazoi. Una di queste vie è la cascata di segnalazione della proteina chinasi attivata dal mitogeno EGFR-RAS-ERK (MAPK) che è una via critica che governa la proliferazione cellulare, la differenziazione, la migrazione e la sopravvivenza1,2. I difetti in questa via di segnalazione possono portare a stati patologici o patologici come il cancro. Il recettore del fattore di crescita epidermico (EGFR) ha dimostrato di essere altamente espresso nei tumori umani, tra cui il 50% dei carcinomi a cellu....

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Protocollo

1. Preparazione della piastra del mezzo di crescita dei nematodi (NGM)

  1. Aggiungere 2,5 g di peptone e 3 g di NaCl a 970 ml di acqua deionizzata contenuta in un matraccio Erlenmeyer da 2 L. Mescolare il contenuto usando una barra di agitazione magnetica. Successivamente, aggiungere 20 g di agar al matraccio. Autoclave il contenuto del matraccio a 121 °C e una pressione di 15 lb/in2 per 30 min. Dopo la sterilizzazione, posizionare il matraccio su una piastra di agitazione e lasciare raffreddare il mezzo fino a quando la temperatura raggiunge i 50 °C.
  2. Per preparare le piastre NGM aggiungere i seguenti reagenti al mezzo raffreddato: 25 mL di ....

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Risultati

Per prima cosa dimostriamo che la R-fendilina è in grado di sopprimere il fenotipo Muv nel ceppo mutante let-60 (n1046) rispetto ai vermi trattati con DMSO. I nostri dati mostrano che la R-fendilina è in grado di bloccare il fenotipo Muv nel let-60(n1046) in modo dose-dipendente (Figura 2A,B). Tuttavia, la non inversione del fenotipo Muv è stata osservata nel ceppo mutante nullo lin-1 in risposta all'aumento delle concentrazioni di R-fendilina (

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Discussione

I saggi che descriviamo usando il worm sono semplici e poco costosi per identificare gli inibitori della funzione EGFR e RAS. C. elegans è un modello interessante per la scoperta di farmaci perché è facile da coltivare in laboratorio a causa del breve ciclo di vita (3 giorni a 20 ° C) e della capacità di generare un gran numero di larve. Ancora più importante, il percorso EGFR-RAS-ERK MAPK è evolutivamente e funzionalmente conservato con mammiferi che forniscono un sistema geneticamente trattabile per analizzare.......

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Dichiarazioni

Gli autori non dichiarano interessi finanziari concorrenti.

Ringraziamenti

Ringraziamo il Dr. Swathi Arur (MD Anderson Cancer Center) per aver fornito il let-60 (n1046). Ringraziamo anche il Dr. David Reiner (Texas A & M Health Science Center Institute of Biosciences & Technology di Houston) per il ceppo lin-1. Infine, ringraziamo la dottoressa Danielle Garsin e il suo laboratorio (The University of Texas, McGovern Medical School) per aver fornito alcuni dei reagenti. Alcuni ceppi di worm sono stati forniti dal CGC, che è finanziato dal NIH Office of Research Infrastructure Programs (P40 OD010440). Questa ricerca è stata sostenuta dalla sovvenzione RP200047 del Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT) a JF ....

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Terreni e prodotti chimici
Agarosio Millipore SigmaA9539-50G
Bacto Peptone Fisher ScientificDF0118-17-0
BD Difco Agar Fisher ScientificDF0145-17-0
BD Difco LB BrodoFisher ScientificDF0446-17-3
Cloruro di calcioFisher ScientificBP510-500
ColesteroloFisher ScientificICN10138201
Solfato di magnesioFisher ScientificBP213-1
NistatinaAcros organics
Fosfato di potassio bibasicoFisher ScientificBP363-500
PFosfato di potassio monobasicoFisher ScientificBP362-500
R-FendilinaSintetizzato commercialmente (grado farmaceutico)
Sodio azideMillipore Sigma S2002-25G
Cloruro di sodio Fisher ScientificBP358-1
Idrossido di sodioFisher ScientificSS266-1
8,25% ipoclorito di sodio Candeggina
Sodio Fosfato Bibasico Fisher ScientificBP332-500
Streptomicina solfato Fisher ScientificBP910-50
(&meno;)-Tetramisolo cloridratomillipore SigmaL9756
UO126 (inibitore MEK)Millipore Sigma 19-147
Materiali di consumo  Provette
15mL Fisher Scientific12-565-269
Provette da centrifuga sterili coniche in polipropilene da 50 mlFisher Scientific12-565-271
Pipette sierologiche monouso in polistirene 10 mlFisher Scientific07-200-574
Pipette sierologiche monouso in polistirene 25 mlFisher Scientific07-200-575
n. 1,5  18 mm X 18 mm Vetrini coprioggettiFisher Scientific12-541A
Piastra di Petri con coperchio trasparente (60 x 15 mm)Fisher ScientificFB0875713A
Piastre di Petri con coperchio trasparente (100X15 mm)Fisher ScientificFB0875712
Vetrini per microscopio in vetro semplice (75 x 25 mm)Fisher Scientific12-544-4
Piastre per coltura tissutale a 12 pozzettiFisher Scientific50-197-4804
Software 
PrismGraphpad
Batteri
E. coli OP50
Worm Ceppi
StrainGenotype TransgeneSource
MT2124  let-60(n1046) IV.CGC
MT7567lin-1(sy254) IV.CGC
PS1839let-23(sa62) II.CGC
AC455500050 da centrifuga sterili coniche in polipropilene

Riferimenti

  1. Marshall, M. Interactions between Ras and Raf: key regulatory proteins in cellular transformation. Molecular Reproduction and Development. 42 (4), 493-499 (1995).
  2. Whelan, J. T., Hollis, S. E., Cha, D. S., Asch, A. S., Lee, M. H.

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Ristampe e permessi

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