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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
La segnalazione sistemica del calcio extracellulare innescata dal glutammato è fondamentale per l'induzione delle risposte della difesa delle piante al mento meccanico e all'attacco di erbivoro nelle piante. Questo articolo descrive un metodo per visualizzare la dinamica spaziale e temporale di entrambi questi fattori utilizzando piante di thaliana arabidopsis che esprimono biosensori fluorescenti sensibili al calcio e al glutammato.
Gli impianti rispondono a sollecitazioni meccaniche come ferite ed erbivori inducendo risposte di difesa sia nelle parti danneggiate che in quelle non danneggiate. Al momento del mento di una foglia, si verifica un aumento della concentrazione citosolica di ioni di calcio (segnale Ca2 +) nel sito della ferita. Questo segnale viene rapidamente trasmesso a foglie non danneggiate, dove vengono attivate le risposte della difesa. La nostra recente ricerca ha rivelato che il glutammato che fuorie' dalle cellule ferite della foglia nell'apoplasto che li circonda serve come segnale di ferita. Questo glutammato attiva canali permeabili Ca2+ simili al recettore del glutammato, che quindi porta alla propagazione del segnale Ca2+ a lunga distanza in tutta la pianta. Le caratteristiche spaziali e temporali di questi eventi possono essere catturate con l'imaging in tempo reale di piante viventi che esprimono biosensori fluorescenti geneticamente codificati. Qui introduciamo un metodo di imaging in tempo reale a livello vegetale per monitorare la dinamica dei segnali Ca2 + e i cambiamenti nel glutammato apoplastico che si verificano in risposta al mento. Questo approccio utilizza un microscopio a fluorescenza a campo ampio e piante transgeniche di Arabidopsis che esprimono biosensori Ca2+ a base di proteina fluorescente verde (GFP) e biosensori glutammati. Inoltre, presentiamo una metodologia per suscitare facilmente la propagazione del segnale Ca2+ indotta da ferite, innescata dal glutammato e rapida e a lunga distanza. Questo protocollo può anche essere applicato a studi su altre sollecitazioni dell'impianto per aiutare a studiare come la segnalazione sistemica degli impianti potrebbe essere coinvolta nelle loro reti di segnalazione e risposta.
Le piante non possono sfuggire agli stress biotici, ad esempio gli insetti che si nutrono di loro, quindi hanno sviluppato sofisticati sistemi di rilevamento dello stress e trasduzione del segnale per rilevare e quindi proteggersi da sfide come l'erbivoro1. Al momento del mento o dell'attacco di erbivoro, le piante avviano risposte rapide di difesa tra cui l'accumulo dell'acido jasmonico fitoormone (JA) non solo nel sito ferito ma anche negli organi distale non danneggiati2. Questo JA quindi innesca risposte di difesa nei tessuti direttamente danneggiati e induce preemptive difese nelle parti non danneggiate della pianta. In Arabidopsis, l'accumulo di JA indotto dal mento è stato rilevato in foglie distale e intatte entro pochi minuti dai danni altrove nella pianta suggerendo che un segnale rapido e a lunga distanza viene trasmesso dalla fogliaferita 3. Diversi candidati, come Ca2+,specie reattive dell'ossigeno (ROS) e segnali elettrici, sono stati proposti per servire come questi segnali di ferita a lunga distanza nellepiante 4,5.
Ca2+ è uno dei secondi elementi messaggeri più versatili e onnipresenti negli organismi eucarioti. Nelle piante, la masticazione del bruco e il mento meccanico causano drastici aumenti della concentrazione citosolica di Ca2 + ([Ca2+]cyt) sia nella foglia ferita che nelle foglie lontane non liche6,7. Questo segnale ca2+ sistemico viene ricevuto dalle proteine intracellulari ca2+,che portano all'attivazione di vie di segnalazione della difesa a valle, tra cui biosintesi JA8,9. Nonostante numerosi rapporti di questo tipo supportano l'importanza dei segnali Ca2+ nelle risposte delle ferite delle piante, le informazioni sulle caratteristiche spaziali e temporali dei segnali Ca2+ indotti dal ferimento sono limitate.
L'imaging in tempo reale utilizzando indicatori Ca2+ geneticamente codificati è un potente strumento per monitorare e quantificare la dinamica spaziale e temporale dei segnali Ca2+. Ad oggi, sono state sviluppate versioni di tali sensori che consentono la visualizzazione di segnali Ca2 + a livello di una singola cellula, a tessuti, organi e persino piante intere10. Il primo biosensore geneticamente codificato per Ca2+ utilizzato nelle piante è stata l'aequorina proteica bioluminescente derivata dalla medusa Aequorea victoria11. Sebbene questa proteina chemiluminescente sia stata utilizzata per rilevare cambiamenti Ca2+ in risposta a varie sollecitazioni nelle piante12,13,14,15,16,17,18, non è adatta per l'imaging in tempo reale a causa del segnale luminescente estremamente basso che produce. Gli indicatori Ca2+ basati su Förster Resonance Energy Transfer (FRET), come i camelioni gialli, sono stati utilizzati con successo anche per indagare la dinamica di una serie di eventidi segnalazione Ca 2 + negliimpianti 19,20,21,22,23,24. Questi sensori sono compatibili con gli approcci di imaging e più comunemente sono composti dalla calmodulina proteica legante Ca2+ (CaM) e da un peptide legante CaM (M13) da una chinasi della catena leggera della miosina, tutti fusi tra due proteine fluorofori, generalmente una proteina fluorescente ciano (CFP) e una variante della proteina fluorescente gialla (YFP)10. L'associazione Ca2+ a CaM favorisce l'interazione tra CaM e M13 portando a un cambiamento conformazionale del sensore. Questo cambiamento promuove il trasferimento di energia tra la PCP e l'YFP, il che aumenta l'intensità di fluorescenza dell'YFP riducendo al contempo le emissioni di fluorescenza della PCP. Il monitoraggio di questo passaggio dalla PCP alla fluorescenza YFP fornisce quindi una misura dell'aumento del livello Ca2+. Oltre a questi sensori FRET, i biosensori Ca2+ a base di proteine fluorescenti singole (FP), come GCaMP e R-GECO, sono anche compatibili con gli approcci di imaging vegetale e sono ampiamente utilizzati per studiare [Ca2+]cambiamenti del cito a causa della loro elevata sensibilità e facilità d'uso25,26,27,28,29,30. I GCAMP contengono un singolo GFP permutato circolare (cp), nuovamente fuso a CaM e al peptide M13. L'interazione dipendente da Ca2+tra CaM e M13 provoca un cambiamento conformazionale nel sensore che promuove uno spostamento dello stato di protonazione del cpGFP, migliorando il suo segnale fluorescente. Pertanto, conl'aumento dei livelli di Ca 2+, il segnale cpGFP aumenta.
Per indagare la dinamica dei segnali Ca2+ generati in risposta a ferite meccaniche o alimentazione di erbivori, abbiamo utilizzato piante transgeniche arabidopsis thaliana che esprimono una variante GCaMP, GCaMP3, e un microscopio a fluorescenza a campolargo 6. Questo approccio è riuscito a visualizzare la trasmissione rapida di un segnale Ca2+ a lunga distanza dal sito della ferita su una foglia a tutta la pianta. Pertanto, un aumento del cito [Ca2+]è stato immediatamente rilevato nel sito della ferita, ma questo segnale Ca2 + è stato poi propagato alle foglie vicine attraverso la vascucolatura entro pochi minuti dal mento. Inoltre, abbiamo scoperto che la trasmissione di questo rapido segnale di ferita sistemica è abolita nelle piante arabidopsis con mutazioni in due geni simili al recettore del glutammato, Glutammato Recettore Like (GLR), GLR3.3 e GLR3.66. I GLR sembrano funzionare come canali Ca2+ recintati da amminoacidi coinvolti in diversi processi fisiologici, tra cui rispostaalle ferite 3,crescita del tubo di polline31,sviluppo delle radici32,risposta alfreddo 33e immunità innata34. Nonostante questa ben compresa, ampia funzione fisiologica dei GLR, le informazioni sulle loro proprietà funzionali, come la loro specificità ligando, la selettività ioniche e la localizzazione subcellulare, sonolimitate 35. Tuttavia, studi recenti hanno riferito che GLR3.3 e GLR3.6 sono localizzati rispettivamente nel phloem e nello xilema. I GLR vegetali hanno somiglianze con i recettori del glutammato ionotropico (iGluRs)36 nei mammiferi, che vengono attivati dagli amminoacidi, come glutammato, glicina e D-serina nel sistema nervoso dei mammiferi37. Infatti, abbiamo dimostrato che l'applicazione di glutammato di 100 mM, ma non di altri amminoacidi, nel sito della ferita induce un segnale Ca2 + rapido e a lunga distanza in Arabidopsis, indicando che il glutammato extracellulare agisce probabilmente come un segnale di ferita nelle piante6. Questa risposta è abolita nel mutante glr3.3/glr3.6 suggerendo che il glutammato possa agire attraverso uno o entrambi questi canali simili a recettori e, in effetti, AtGLR3.6 è stato recentemente dimostrato essere gated da questi livelli di glutammato38.
Nelle piante, oltre al suo ruolo di amminoacido strutturale, il glutammato è stato proposto anche come regolatore chiave dello sviluppo39; tuttavia, le sue dinamiche spaziali e temporali sono poco comprese. Proprio come per Ca2+,sono stati sviluppati diversi indicatori geneticamente codificati per il glutammato per monitorare la dinamica di questo amminoacido nelle celluleviventi 40,41. iGluSnFR è un biosensore glutammato single-FP basato su GFP composto da cpGFP e una proteina legante il glutammato (GltI) di Escherichia coli42,43. Il cambiamento conformazionale di iGluSnFR, indotto dal legame del glutammato con GltI, si traduce in una maggiore emissione di fluorescenza GFP. Per indagare se il glutammato extracellulare agisce come una molecola di segnalazione nella risposta della ferita vegetale, abbiamo collegato la sequenza iGluSnFR con la sequenza di secrezione peptidica del segnale chitinasio di base (CHIB-iGluSnFR) per localizzare questo biosensore nello spazio apoplastico6. Questo approccio ha permesso di imaging di eventuali cambiamenti nella concentrazione di glutammato apoplastico ([Glu]apo) utilizzando piante transgeniche di Arabidopsis che esprimono questo sensore. Abbiamo rilevato rapidi aumenti del segnale iGluSnFR nel sito di wounding. Questi dati supportano l'idea che il glutammato fuoriesi dalle cellule / tessuti danneggiati all'apoplasto al momento del mento e agisce come un segnale di danno attivando i GLR e portando al segnale Ca2 + a lunga distanza nelle piante6.
Qui, descriviamo un metodo di imaging in tempo reale a livello vegetale utilizzando biosensori geneticamente codificati per monitorare e analizzare la dinamica dei segnali ca2+ a lunga distanza e glutammato extracellulare in risposta almento 6. La disponibilità di microscopia a fluorescenza a campo largo e piante transgeniche che esprimono biosensori geneticamente codificati fornisce un approccio potente ma facilmente implementato per rilevare segnali a lunga distanza trasmessi rapidamente, come le onde Ca2+.
1. Preparazione del materiale vegetale
2. Preparazione chimica
3. Impostazione del microscopio e conduzione di immagini in tempo reale
4. Analisi dei dati
La propagazione del segnale di [Ca2+]cyt e [Glu]apo in risposta al collare è presentata nella Figura 3, Figura 4, Filmato S1e Filmato S2. Il taglio del picciolo della foglia 1 nelle piante che esprimono GCaMP3 (a 0 s) ha portato a un aumento significativo delcit [Ca2+] che è stato rapidamente indotto localmente attraverso la vascucolatura (a 40 s)(Figura 3 e Film S1). Successivamente, il segnale è stato rapidamente propagato alle foglie vicine (foglia 3 e 6) in pochi minuti (a 80 s)(Figura 3 e Film S1).
Al taglio della foglia 1 nelle piante che esprimono CHIB-iGluSnFR, è stato osservato un rapidoaumento dell'apo [Glu] intorno alla regione di taglio (a 2 s). Questo segnale è stato propagato attraverso la vascucolatura localmente in pochi minuti (a 160 s) ma non è stato osservato nelle foglie sistemiche(Figura 4 e Filmato S2).
Per l'imaging in tempo reale della propagazione del segnale Ca2+ innescata dall'applicazione del glutammato, il bordo (a circa 1 mm dalla punta) della foglia 1 nelle piante che esprimono GCaMP3 è stato tagliato come mostrato nella figura 5A e film S3. Il taglio del bordo della foglia 1 ha causato un aumento delcit locale [Ca2+] (a 40 s) ma questo segnale è scomparso in pochi minuti (a 124 s). Dopo aver atteso circa 10 minuti per il recupero della pianta, 10 μL di glutammato di 100 mM sono stati applicati alla superficie tagliata della foglia 1, che ha causato un rapido e significativo aumento del cit [Ca2+]localmente (a 56 s) e la propagazione del segnale alle foglie distale (a 104 s)(Figura 5B e Movie S4).
Per misurare le variazioni delcit [Ca2+] indotto dal mento nella foglia sistemica, due ROI (ROI1 e ROI2) sono state fissate nella regione di base e nella punta della foglia 6 nelle piante che esprimono GCaMP3 come mostrato nella figura 6A. È stato misurato il cambio di rotta del tempo dell'intensità del segnale GCaMP3 in ROI1 e ROI2 al taglio del picceolo della foglia 1(Figura 6B). Un aumento significativo del cit [Ca2+]al ROI1 è stato rilevato prima di quello del ROI2 (Figura 6B). [Ca2+] il cito ha raggiunto il picco di circa 100 s dopo il mento, è durato oltre 10 minuti ed ha mostrato due fasi(Figura 6B).
Per determinare le velocità dell'onda Ca2+ al momento del mento meccanico, è stato determinato il punto di tempo di un segnale significativo al di sopra dei valori pre-stimolati in ROI1 e ROI2 (time-lag; vedi Sezione 4) (Figura 6C). Poiché in questo caso la distanza tra ROI1 e ROI2 era di 2,7 mm(Figura 6A),la velocità del segnale Ca2+ nella foglia 6 è stata calcolata come 0,15 mm/s. Per misurare i cambiamentidell'apo [Glu] in risposta al danno meccanico, ROI1 è stato impostato in prossimità del sito di taglio della foglia contrassegnato come L1 come mostrato nella figura 7A. [Glu] la firma apo al ROI1 ha mostrato un singolo picco a circa 100 s al momento del mento (Figura 7B).

Figura 1: Numerazione delle foglie di rosetta arabidopsis. Le foglie di arabidopsis sono numerate dal più vecchio al più giovane (pannello sinistro). Un diagramma schematico della posizione delle foglie è indicato nel pannello di destra. L: foglia, C: cotyledons. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Un microscopio afluorescenza utilizzato in questo studio. [Ca2+]cit e [Glu]apo dynamics sono stati imageati con uno stereomicroscopio a fluorescenza a campo largo. R: Telecomando, O: obiettivo 1x, C: fotocamera sCMOS, T: tubo basculante trinoculare, S: Stadio, P: Materiale vegetale. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Trasmissione del segnale Ca 2+ a lunga distanzaindotta dalla ferita. Il taglio del picciolo (freccia bianca, 0 s) della foglia 1 (L1) in pianta che esprime GCaMP3 ha innescato un aumento delcito locale [Ca2+] (freccia rossa, 40 s) che è stato trasmesso alle foglie sistemiche [foglia 3 (L3) e foglia 6 (L6)] (frecce arancioni, 80 s). Barra di scala, 5 mm.

Figura 4: Elevazione dell'apo innescatadalla ferita [Glu]. Il taglio della foglia 1 (L1) (freccia bianca, 0 s) nelle piante che esprimono CHIB-iGluSnFR ha causato una rapida elevazionedell'apo [Glu] (freccia rossa, 80 s) che si è propagato attraverso la vascucolatura (freccia arancione, 160 s). Barra di scala, 2 mm.

Figura 5: Trasmissione del segnaleCa 2+ a lunga distanzainnescata dal glutammato. (A) Tagliare il bordo (a circa 1 mm dalla punta) della foglia 1 (L1) nelle piante che esprimono GCaMP3 (freccia bianca, 0 s) ha causato un aumento delcit [Ca2+] (freccia rossa, 40 s). (B) L'applicazione di glutammato di 100 mM sulla superficie tagliata di L1 (freccia bianca, 0 s) ha causato un aumento delcito [Ca2+] locale (freccia rossa, 56 s) che si è rapidamente propagato alle foglie distali [ad esempio, foglia 3 (L3), foglia 4 (L4) e foglia 6 (L6)] (frecce arancioni, 104 s). Barre di scala, 5 mm.

Figura 6: [Ca2+]firma del cito nelle foglie sistemiche in risposta al mento meccanico. (A) Un'immagine ampliata della foglia 6 (L6) negli impianti che esprimono GCaMP3 è mostrata nella figura 3. ROI1 (cerchio blu) e ROI2 (cerchio rosa) sono stati impostati rispettivamente nella regione di base e punta. La freccia bianca indica il sito di taglio del picciolo della foglia 1 (L1). In questo caso, la distanza tra ROI1 e ROI2 era di 2,7 mm (B) Quantificazione delle firmedi cit [Ca2+] in ROI1 e ROI2. I cambiamenti di intensità della fluorescenza sono stati analizzati utilizzando il software di imaging. (C) Una traccia estesa di dati in (B) compresa tra 0 e 80 s. I punti di rilevamento di un aumento ca2+ del ROI1 e del ROI2 sono stati definiti rispettivamente come t1 e t2, utilizzando come criterio un aumento a 2 volte la deviazione standard dei valori di prestimulazione (2x SD, linea tratteggiata). Il valore di t2 - t1 è stato definito come time-lag (Δt) nel protocollo corrente. La freccia nera indica il tempo di taglio. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 7: Firmadell'apo [Glu] in risposta al collare meccanico. (A) Un'immagine ampliata della foglia 1 (L1) negli impianti che esprimono CHIB-iGluSnFR è mostrata nella figura 4. ROI1 è stato impostato nelle vicinanze del sito di taglio. La freccia bianca indica l'area di taglio. (B) La quantificazione della firmaapo [Glu] nel ROI1 viene monitorata utilizzando un software di imaging. La freccia nera indica il tempo di taglio. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Filmato S1: Trasmissione Ca2+ a lunga distanza dopo un mento meccanico. Il mento meccanico al picciolo della foglia 1 (L1) ha causato un aumento delcito [Ca2+] trasmesso alle foglie distale [ad esempio, foglia 3 (L3) e foglia 6 (L6)]. Clicca qui per scaricare questo film.
Filmato S2: Elevazione dei livelli di glutammato apoplastico in risposta al taglio. Il collare meccanico della foglia 1 (L1) ha causato un aumento immediatodell'apo[Glu]. Clicca qui per scaricare questo film.
Filmato S3: Elevazione dei livelli dicit [Ca2+] in risposta al taglio. Il mento meccanico sul bordo della foglia 1 (L1) ha causato un'immediata elevazione delcit locale [Ca2+]. Clicca qui per scaricare questo film.
Filmato S4: L'applicazione dei trigger glutammati sistemici [Ca2+]cyt aumenta. L'applicazione del glutammato da 100 mM ha innescato la trasmissione Ca2+ alle foglie sistemiche [ad esempio, foglia 3 (L3), foglia 4 (L4) e foglia 6 (L6)]. Clicca qui per scaricare questo film.
Gli autori non hanno conflitti di interesse.
La segnalazione sistemica del calcio extracellulare innescata dal glutammato è fondamentale per l'induzione delle risposte della difesa delle piante al mento meccanico e all'attacco di erbivoro nelle piante. Questo articolo descrive un metodo per visualizzare la dinamica spaziale e temporale di entrambi questi fattori utilizzando piante di thaliana arabidopsis che esprimono biosensori fluorescenti sensibili al calcio e al glutammato.
Questo lavoro è stato supportato da sovvenzioni della Japan Society for the Promotion of Science (17H05007 e 18H05491) a MT, dalla National Science Foundation (IOS1557899 e MCB2016177) e dalla National Aeronautics and Space Administration (NNX14AT25G e 80NSSC19K0126) a SG.
| Arabidopsis esprime GCaMP3 | Saitama University | ||
| Arabidopsis esprime CHIB-iGluSnFR | Saitama University | ||
| GraphPad Prism 7 | GraphPad Software | ||
| L-glutammato | FUJIFILM Wako | 072-00501 | Disciolto in un terreno di coltura liquido [1/2x sali MS, 1% (p/v) di saccarosio e 0,05% (p/v) MES; pH 5,1 regolato con 1N KOH]. |
| Microsoft Excel | Microsoft Corporation | ||
| Murashige and Skoog (MS) medium | FUJIFILM Wako | 392-00591 | composizione: 1x sali MS, 1% (p/v) saccarosio, 0,01% (p/v) mioinositolo, 0,05% (p/v) MES e 0,5% (p/v) gomma di gellano; pH 5,7 regolato con 1N KOH. |
| Stereomicroscopio Nikon SMZ25 | Analisi AR Nikon | ||
| NIS-Elements | Obiettivo Nikon | ||
| 1x (P2-SHR PLAN APO)Fotocamera | Nikon | ||
| sCMOS (ORCA-Flash4.0 V2) | Hamamatsu Photonics | C11440-22CU | |
| Piastra di Petri quadrata in plastica | Simport | D210-16 |