Il presente metodo fornisce dettagli sull'iniezione della vena della coda del topo con un catetere, l'acquisizione di immagini al microscopio a due fotoni per pile di profondità, i filmati di segnalazione del calcio cellulare, la creazione di kymografi emodinamici e l'analisi del calcio e dell'emodinamica con i nostri algoritmi di elaborazione delle immagini17 (Figura 1). Ci sono diversi vantaggi di queste tecniche che migliorano il risultato dell'imaging in vivo e riducono il tempo, le risorse e lo stress animale durante la sessione. In primo luogo, l'uso di un catetere per l'iniezione della vena della coda fornisce un maggiore controllo sull'ago, sulla siringa e sulla quantità di sostanza iniettata nella circolazione del topo. Inoltre, impedisce l'iniezione di colorante nel tessuto della coda, risparmiando costosi reagenti. In secondo luogo, utilizziamo topi transgenici che esprimono sensori di calcio geneticamente codificati nei periciti che si avvolsero e dimostrano come localizzarli all'interno della rete vascolare cerebrale con uno z-stack di profondità, che facilita l'identificazione e il trasferimento delle cellule nelle successive sessioni di imaging a lungo termine. Questo è un fattore importante negli studi sui periciti e garantisce una corretta classificazione cellulare6,7. In terzo luogo, forniamo i nostri parametri per la raccolta di filmati di calcio e dati di scansione emodinamica della linea che sono un buon punto di partenza per misurare i segnali cellulari dinamici. Infine, presentiamo i nostri algoritmi di elaborazione delle immagini17, una cassetta degli attrezzi completa per l'elaborazione delle immagini che contiene più approcci per la pre-elaborazione delle immagini (come lo smixing spettrale), l'analisi delle immagini di calcio e l'analisi emodinamica (diametro, velocità, ecc.). Questi algoritmi possono generare grafici per una visualizzazione rapida e semplice dei dati, riducendo al minimo il livello di competenza dell'utente richiesto per analizzare i risultati. Inoltre, può essere automatizzato con poche righe di codice per elaborare rapidamente in batch più set di dati con gli stessi parametri. Ciò può potenzialmente migliorare la visualizzazione dei dati e l'investimento di tempo del ricercatore.
La chiave per raccogliere buoni dati di imaging del calcio è regolare la potenza del laser e le impostazioni PMT per una chiara acquisizione del segnale di fluorescenza, ma anche raccogliere dati a un frame rate sufficiente per catturare l'intero evento di calcio. I dati in questo protocollo sono stati acquisiti a 10-11 fotogrammi al secondo, che cattura le oscillazioni di calcio più lente nei periciti che si riscaldano. Ci sono anche diversi passaggi durante l'analisi che possono migliorare il risultato dell'analisi. In primo luogo, l'unmixing spettrale è utile se vi è una sovrapposizione significativa tra gli spettri di emissione dei fluorofori (Figura 2). La fluoresceina-destrano è stata utilizzata in questo protocollo perché è un coniugato destrano economico e disponibile in commercio che viene comunemente usato per le misurazioni emodinamiche5. L'unmixing spettrale aiuta a ripulire i dati per una migliore rilevazione dei segnali di calcio, ma potrebbero essere utilizzati anche fluorofori alternativi con spettri di emissione più stretti. In secondo luogo, la selezione manuale delle strutture cellulari come ROI (Figura 3) è utile per classificare gli eventi di calcio in diverse regioni subcellulari come il soma o i rami di processo. La selezione del ROI basata sull'attività (Figura 4)16 fornisce maggiori informazioni spaziali e temporali sui singoli eventi di calcio. Questo può essere utile quando si determina la frequenza degli eventi di calcio in una determinata area o la propagazione degli eventi ad altre aree cellulari. L'uso di software di programmazione per analizzare i dati di imaging può far risparmiare ai ricercatori ore di tempo quando i dati vengono elaborati in batch, ma richiede un investimento iniziale di tempo per regolare i parametri per risultati ottimali. I fattori più importanti sono la dimensione prevista (in μm2) della regione attiva e la durata del segnale (devono essere definiti il tempo minimo del segnale e il tempo massimo del segnale). I ricercatori devono prima esaminare alcuni film di esempio della serie T per determinare al meglio quali parametri si adattano ai loro dati. Infine, i dati di scarsa qualità acquisiti al microscopio possono ostacolare notevolmente l'analisi del calcio e dell'emodinamica (Figura 6). Pertanto, è necessario prestare attenzione per ottimizzare le impostazioni di acquisizione del microscopio all'inizio. Con questi fattori in mente, questo protocollo che può essere adattato per adattarsi all'imaging del calcio o all'analisi di altri segnali cellulari dinamici (ad esempio, sodio fluorescente, potassio, metabolita o fluttuazioni di tensione) in altri tessuti o tipi di cellule.
Esistono diverse limitazioni a questo protocollo. In primo luogo, i dati vengono raccolti in anestesia, che influisce sull'attività cerebrale e potrebbe influire sul flusso sanguigno. Immagini simili possono essere eseguite in topi svegli che sono addestrati ad accettare la fissazione della testa per risultati più fisiologici. Inoltre, è importante ricordare che raccogliamo immagini 2-dimensionali di una cellula tridimensionale e di un vaso sanguigno in vivo. Pertanto, possiamo catturare solo una fazione degli eventi di calcio all'interno di queste cellule o il flusso sanguigno in una singola sezione del vaso sanguigno alla volta.
Un'altra limitazione da notare è che l'imaging del calcio a due fotone è sensibile agli artefatti di movimento, in cui il movimento dentro e fuori dal piano focale può essere scambiato per fluttuazioni di calcio. Questo protocollo è stato eseguito in anestesia, che limita il movimento dell'animale; tuttavia, gli artefatti di movimento possono essere introdotti dalla frequenza respiratoria del topo, dalla frequenza cardiaca, dal possibile gonfiore dei tessuti e, nel caso di periciti incatenanti, contrazione dei vasi o vasomozione 4,6,18,19. Gli artefatti di movimento possono essere mitigati da diverse strategie. I pacchetti di elaborazione delle immagini utilizzati in questo protocollo includono una fase di correzione del movimento opzionale, che utilizza un motore di convoluzione 2D per allineare le immagini all'interno della serie T in base allavascolarizzazione visibile 13,17. I fotogrammi con cambiamenti significativi nel piano focale sono identificati da questo algoritmo e possono essere esclusi dall'analisi. Inoltre, è possibile utilizzare strategie statistiche all'interno dei pacchetti di elaborazione dell'imaging, come un punteggio Z quando si generano le tracce di fluorescenza per normalizzare le fluttuazioni di calcio indotte dal movimento20. L'approccio più robusto per tenere conto degli artefatti di movimento nell'imaging a due fotoli è quello di combinare l'espressione di due indicatori fluorescenti all'interno della stessa cellula, come un indicatore di calcio (ad esempio, GCaMP) e un reporter fluorescente (ad esempio, mCherry) che è indipendente dal calcio. Le fluttuazioni nel reporter fluorescente possono quindi essere attribuite al movimento e vengono sottratte dal segnale dell'indicatore del calcio per normalizzare gli artefatti di movimento.
Lo scopo di questo protocollo è quello di fornire una chiara comprensione di come raccogliere dati ottimali di imaging del calcio e del flusso sanguigno in vivo e di presentare nuovi metodi e strumenti di analisi che i ricercatori possono implementare al fine di migliorare i loro risultati. Queste tecniche possono essere applicate per studiare il ruolo di diverse popolazioni di periciti nel controllo del flusso sanguigno o in diversi stati di malattia cerebrale. Questi parametri di imaging possono anche essere utilizzati per studiare il calcio e il flusso sanguigno in altri tipi di cellule e sistemi di organi e principi simili si applicano ad altre tecniche di imaging dinamico rese possibili da altri sensori geneticamente codificati, oltre al calcio.