Passaggi critici
L'ottimizzazione di tre passaggi aumenterà notevolmente il successo di questo protocollo. Innanzitutto, nel passaggio 1.5, sii parsimonioso con la colla adesiva applicata al coperchio. Se viene aggiunta troppa colla adesiva, le pupe possono essere sepolte in uno spesso strato di colla adesiva solidificata, che renderà impossibile la dissezione, e se copre il notum stesso, la colla adesiva occluderà la luce dal campione. In secondo luogo, durante i passaggi 2.3-2.6, assicurarsi di rimuovere solo la cupola superiore del notum, escludendo il più possibile il tessuto laterale. Se incluso, il tessuto laterale si comprimerà durante il montaggio e farà sì che il centro del notum si pieghi verso l'interno, spesso posizionandolo al di fuori della distanza di lavoro degli obiettivi ad alta apertura numerica. In terzo luogo, durante la fase di pulizia 2.9, è necessario prestare estrema attenzione a non danneggiare l'epitelio monostrato. Se il tessuto ha grandi porzioni mancanti o nessun segnale può essere rilevato, questo passaggio è probabile che la colpa sia.
Risoluzione dei problemi
Problema 1: Dopo il montaggio, la pupa si stacca dal nastro biadesivo durante la dissezione. Questo è un problema comune, soprattutto per i principianti. Il miglior rimedio è quello di garantire che l'esterno della custodia delle pupe sia completamente asciutto / privo di detriti alimentari. Rimuovere il cibo con un paio di pinze smussate e lasciare asciugare la custodia all'aria per 10-15 minuti aiuterà ad aderire al nastro. In alternativa, utilizzare la mano non dominante e un paio di pinze smussate per tenere le pupe contro il nastro durante la dissezione. Se il problema persiste, applicare una piccola goccia di smalto da 5-10 μL alla base dell'estremità posteriore della custodia e permettergli di indurirsi generalmente fornisce un'adesione sufficiente anche per la più in regola delle pupe.
Problema 2: Notum collassa durante il passaggio 2.3 o la violazione iniziale attraverso il tegumento non è liscia. Se il tegumento è difficile da violare, potrebbe esserci troppa colla adesiva dalle fasi di immobilizzazione. Posizionare le pupe sezionate in meno colla adesiva migliorerà questo problema. Inoltre, assicurarsi che le forbici per microdissezione siano affilate. Le forbici smussate non saranno in grado di tagliare il tegumento e tendono a farlo collassare verso l'interno. Una volta che l'emolinfa fuoriesce dalle pupe, assicurarsi che una delle lame da taglio possa entrare nella pupa senza causare la deformazione del notum. Se il notum collassa e la lama non entra nella pupa, continua a tagliare fino a quando una lama entra nelle pupe.
Problema 3: Durante il passaggio 2.4, le forbici catturano o trascinano il tegumento. Se le forbici iniziano a catturare o trascinare il tegumento, spesso aiuta a passare al lato opposto delle pupe e procedere ad "allentare" il tegumento. Ulteriori forbici da microdissezione smussate renderanno difficile ottenere tagli puliti attraverso il tegumento e devono essere utilizzate forbici affilate.
Problema 4: Il campione viene aspirato accidentalmente durante la colorazione (passaggi 3.1-3.6). Il notum sezionato è difficile da vedere perché è trasparente. Può essere utile posizionare un foglio blu scuro o nero sotto il coperchio per fornire contrasto (un vecchio rack portapunta pipetta funziona bene). Inoltre, tutte le modifiche alla soluzione possono essere eseguite al microscopio di dissezione.
Problema 5: non viene rilevato alcun segnale/viene rilevato un segnale irregolare. Dopo aver escluso problemi specifici della macchia, se non viene rilevato alcun segnale o è irregolare, il passaggio 2.9 (pulizia) è probabilmente il colpevole. Un segnale assente o irregolare può provenire da danni e rimozione del tessuto epiteliale durante la pulizia. Al contrario, un segnale scarso può essere causato dall'occlusione dalle bande muscolari / cellule del corpo adiposo se non vengono rimosse, in quanto possono limitare la diffusione di macchie e anticorpi nel notum rispetto al tessuto circostante. Se il tessuto è danneggiato, essere più delicati durante la pulizia è la soluzione migliore. Se, invece, la macchia è visibile ma irregolare, aumentando il vigore/tempo dedicato alla fase di pulizia si consiglia di rimuovere il più possibile il muscolo e il grasso corporeo. Inoltre, aumentare la durata della macchia può aiutare a risolvere questo problema con una migliore pulizia.
Problema 6: Il tessuto notum ha un aspetto deformato / rugoso durante l'imaging. La deformazione e le rughe del tessuto provengono da due fonti. In primo luogo, la compressione del notum durante il montaggio causerà la fibbia e la deformazione. La soluzione migliore è quella di rimuovere il più possibile i tessuti laterali in modo che la cupola sia il più corta possibile e possa adattarsi tra i distanziali di copertura. In secondo luogo, se il notum è piegato durante la dissezione, questa curva non si raddrizzerà durante il montaggio, quindi è necessario prestare particolare attenzione a non deformare il notum durante la dissezione. La flessione accidentale del notum è più comune quando si taglia il tegumento lontano dal resto delle pupe. Si è tentati di avere le forbici di dissezione ad un angolo rispetto alle pupe invece di tenerle nel piano campione come le pupe. Tuttavia, le forbici angolate fanno sì che il tegumento si allaccia verso l'alto quando viene tagliato invece di rimanere piatto.
Metodi, limitazioni e applicazioni future esistenti
Wang et al.20 hanno riportato un protocollo di dissezione comparabile per l'isolamento dell'epitelio pupale. Questa tecnica richiede che la pupa rimanga all'interno del suo caso e sia rapidamente tagliata in due con un bisturi. Questo protocollo non è compatibile con i campioni precedentemente ripresi dal vivo, poiché l'imaging dal vivo richiede la rimozione di un'ampia sezione del caso pupale. Poiché le pupe mancano di rigidità, la bisezione pupale al di fuori del caso ha rovinato il tessuto, ispirando la creazione di questo protocollo. La tecnica qui descritta consente l'isolamento e la fissazione del notum e potrebbe essere utilizzata come primo passo per una vasta gamma di altri metodi come la criosezione, l'ibridazione in situ o la microscopia elettronica.
Questa tecnica ha alcune limitazioni. In primo luogo, sezionare, fissare e colorare il notum richiede più tempo rispetto alle proteine marcate fluorescenti nel notum, che richiede solo una semplice dissezione per rimuovere il caso pupale 9,23. In secondo luogo, rispetto alle dissezioni di altri tessuti Drosophila, questa dissezione è più difficile a causa del tessuto sottile e fragile e della cuticola idrofoba. Per la semplice visualizzazione delle proteine negli epiteli di Drosophila, l'immunoistochimica su embrioni fissi, dischi delle ali larvali o ovaie è più facile. Tuttavia, questa tecnica consente di abbinare la potenza dell'imaging dal vivo alla fissazione e alla colorazione, rendendolo uno strumento potente una volta padroneggiato.
Una tecnica di dissezione / fissazione ha alcuni vantaggi rispetto all'imaging dal vivo. Le strutture basali (interne) possono essere risolte meglio con una vista basale (Figura 5L,J). Ancora più importante, l'imaging dal vivo è limitato ai fluorofori che devono essere forniti geneticamente, spesso richiedendo lunghi schemi di incrocio genetico. Al contrario, il presente protocollo consente l'applicazione di macchie, immunoistochimica e altre tecniche che richiedono dissezione e fissazione. Ciò aumenta drasticamente il numero di segnali sondati nel tessuto, riducendo potenzialmente il tempo per i risultati sperimentali.