Articolo metodologico

Ricostituzione dell'assemblaggio di septina alle membrane per lo studio delle proprietà e delle funzioni biofisiche

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DOI:

10.3791/64090

28 luglio 2022

* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

La ricostituzione senza cellule è stata uno strumento chiave per comprendere l'assemblaggio del citoscheletro e il lavoro nell'ultimo decennio ha stabilito approcci per studiare la dinamica della settina in sistemi minimi. Qui sono presentati tre metodi complementari per osservare l'assemblaggio della settina in diversi contesti di membrana: doppi strati planari, supporti sferici e supporti per aste.

Abstract

La maggior parte delle cellule può percepire e cambiare la propria forma per eseguire processi cellulari fondamentali. In molti eucarioti, il citoscheletro della settina è una componente integrante nel coordinare i cambiamenti di forma come la citochinesi, la crescita polarizzata e la migrazione. Le settine sono proteine che formano filamenti che si assemblano per formare diverse strutture di ordine superiore e, in molti casi, si trovano in diverse aree della membrana plasmatica, in particolare nelle regioni di curvatura positiva su scala micron. Il monitoraggio del processo di assemblaggio della settina in vivo è ostacolato dalle limitazioni della microscopia ottica nelle cellule, nonché dalla complessità delle interazioni sia con le membrane che con gli elementi citoscheletrici, rendendo difficile quantificare la dinamica della settina nei sistemi viventi. Fortunatamente, ci sono stati progressi sostanziali nell'ultimo decennio nella ricostituzione del citoscheletro della settina in un sistema privo di cellule per sezionare i meccanismi che controllano l'assemblaggio della settina ad alte risoluzioni spaziali e temporali. Le fasi principali dell'assemblaggio della settina includono l'associazione e la dissociazione dell'eterooligomero della settina con la membrana, la polimerizzazione in filamenti e la formazione di strutture di ordine superiore attraverso le interazioni tra i filamenti. Qui, presentiamo tre metodi per osservare l'assemblaggio della settina in diversi contesti: doppi strati planari, supporti sferici e supporti per aste. Questi metodi possono essere utilizzati per determinare i parametri biofisici delle settine in diverse fasi di assemblaggio: come singoli ottameri che legano la membrana, come filamenti e come gruppi di filamenti. Utilizziamo questi parametri abbinati a misurazioni del campionamento della curvatura e dell'adsorbimento preferenziale per capire come funziona il rilevamento della curvatura in una varietà di scale di lunghezza e tempo.

Introduzione

Le forme delle cellule e molti dei loro compartimenti interni dipendono dalle membrane lipidiche che le circondano. Le membrane sono strutture viscoelastiche che possono essere deformate attraverso interazioni con proteine, selezione lipidica e forze interne ed esterne che agiscono per generare una varietà di forme 1,2,3,4. Queste forme sono spesso descritte in termini di curvatura della membrana. Le cellule utilizzano una suite diversificata di proteine in grado di assemblarsi preferenzialmente su particolari curvature di membrana per garan....

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Protocollo

NOTA: la formazione di doppi strati lipidici supportati richiede la preparazione di piccole vescicole unilamellari monodisperse (SUV). Si prega di fare riferimento a un protocollo24 precedentemente pubblicato sulla formazione di SUV. In breve, tutti i SUV sono formati dalla sonicazione della sonda per 12 minuti in totale al 70% di ampiezza attraverso periodi di sonicazione di 4 minuti seguiti da periodi di riposo di 2 minuti in acqua ghiacciata. Le soluzioni SUV devono essere ben chiarite e monodisperse nelle dimensioni. Le distribuzioni dimensionali dei SUV possono essere misurate, ad esempio, mediante la diffusione dinamica della luce

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Risultati

Dopo la preparazione di ogni SLB, le settine o la proteina di interesse possono essere incubate con il supporto desiderato e fotografate tramite TIRFM, microscopia confocale o SEM. I risultati mostrati qui utilizzano settine espresse in modo ricombinante e purificate da E. coli17. Utilizzando TIRFM su SLB planari, è possibile determinare la lunghezza dei filamenti e la loro flessibilità, misurare i coefficienti di diffusione e osservare l'assemblaggio nel tempo28,29

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Discussione

Le membrane cellulari assumono molte forme, curvature e proprietà fisico-chimiche diverse. Per studiare il meccanismo su scala nanometrica attraverso il quale le cellule costruiscono assemblaggi su scala micrometrica, è necessario progettare sistemi di ricostituzione minimi di mimetica a membrana. Questo protocollo presenta tecniche che controllano con precisione sia la curvatura della membrana che la composizione, consentendo all'utente di effettuare facilmente misurazioni quantitative di fluorescenza utilizzando tecnic.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno conflitti di interesse.

Ringraziamenti

Questo lavoro è stato sostenuto dal National Institutes of Health (NIH) Grant no. R01 GM-130934 e National Science Foundation (NSF) Grant MCB- 2016022. B.N.C, E.J.D.V. e K.S.C. sono stati sostenuti in parte da una sovvenzione del National Institute of General Medical Sciences con il premio T32 GM119999.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Provette PCR da 0,2 mL con tappo piatto, NaturalWatson137-211C(EX)
Provette da 0,5 mL a bassa adesioneUSA Scientific1405-2600
Beta mercaptoetanolo (BME)Sigma-AldrichM6250-100ML
Albumina sierica bovina (BSA)Sigma-AldrichA4612-25G
Coverglass per la produzione di vetrini coprioggetti PEGilatiThermo Scientific152450Richard-Allan Scientific SLIP-RITE Vetro di copertura 24x50 #1.5
DOPCAvanti Polar Lipids850375
Uovo Liss Rhodamine PEAvanti Lipidi polari810146
EMS Glutaraldeide acquosa 25%, EM GradeVWR16220
EMS Tampone di sodio cacodilato VWR11652
Etanolo, 200 proofFisher Scientific04-355-223EA
HEPESSigma AldrichH3375-1KG
EsametildisilazanoSigma-Aldrich440191
Cloruro di magnesioVWR7791-18-6
Metilcellulosa 4000cpSigma-AldrichM052-100G
Vetrini coprioggetti in microvetro per bistrati planariMatsunamiFuori produzione22x22
Mini centrifuga
Microsfere di silice non funzionalizzateBangs Laboratories, Inc.Dipende dalle dimensioni: SS0200*-SS0500*Silice in sospensione acquosa
Adesivo otticoNorland ThorlabsNOA 68Adesivo flessibile per vetro o plastica
Tetrossido di osmioMillipore Sigma20816-12-0
ParafilmVWR52858-000
Plasma CleanerPlasma EtchPE-25Tensione: 120V, 60Hz. Corrente: 15 AMPERE
Cloruro di potassioVWR0395-1kg
Coverglass rotondo, #1.5 12mm   VWR64-0712
Bagno sonicatoreBranson1510R-MTBransonic Pulitore ad ultrasuoni. 50-60 Hz. Uscita: 70W
Soia PIAvanti Lipidi polari840044
Centrifuga da tavoloEppendorf22331
Lampada UVSpectrolineENF-260C115 Volt, 60 Hz, 0,20 AMPS
Carta da filtro in microfibra WhatmanGlassVWR28455-030diametro 42,5 mm, grado GF/C

Riferimenti

  1. Zimmerberg, J., Kozlov, M. M. How proteins produce cellular membrane curvature. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 7 (1), 9-19 (2006).
  2. Parthasarathy, R., Groves, J. T. Curvature and spatial organization in biological membranes. Soft Matter. 3 (1), 24-33....

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Ricostituzione di membraneBilayer lipidici supportatiInterazione proteina membranaFormazione di filamenti di settinaRilevamento della curvaturaMicroscopia TIRFMicroscopia confocalePreparazione di liposomi

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