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APTrack è un plugin software da utilizzare con la piattaforma Open Ephys. Abbiamo scelto questa piattaforma in quanto è open-source, flessibile ed economica da implementare. Escludendo il costo dello stimolatore a corrente costante, tutte le attrezzature necessarie per iniziare a utilizzare il plugin potrebbero essere acquistate per circa $ 5.000 USD al momento della scrittura. Speriamo che ciò consentirà ai ricercatori di implementare APTrack nei loro studi di elettrofisiologia dei nervi periferici più facilmente. Inoltre, i ricercatori possono modificare liberamente il software per soddisfare le loro esigenze sperimentali. È importante sottolineare che questo strumento ha permesso il tracciamento della soglia elettrica di singoli nocicettori in fibra C, per la prima volta, negli esseri umani.
Maggiore è il rapporto segnale-rumore, meglio gli algoritmi possono identificare i potenziali d'azione. Il rapporto segnale-rumore durante la microneurografia era sufficiente nella maggior parte delle nostre registrazioni, ma gli utenti devono essere attenti al rischio di degradazione del segnale nel tempo. Ciò è particolarmente importante per protocolli sperimentali più lunghi, perché se l'ampiezza del potenziale d'azione tracciato scende al di sotto della soglia di rilevamento, l'ampiezza della stimolazione verrà aumentata erroneamente; Questo può essere mitigato dagli sperimentatori che monitorano il plugin e quindi regolano le impostazioni, se necessario. Il rapporto segnale/rumore è migliorato con il filtraggio passa banda, ma i transienti più grandi possono ancora essere identificati erroneamente come potenziali d'azione se dovessero arrivare durante la finestra temporale della casella di ricerca. Il rischio di identificare erroneamente il rumore transitorio come potenziale d'azione può essere ridotto restringendo la finestra temporale durante la quale il plugin cerca i potenziali d'azione e ottimizzando le impostazioni di soglia. Tuttavia, ci sono ancora situazioni che si possono incontrare che impediscono le prestazioni del plugin. L'attività spontanea può causare difficoltà se i potenziali d'azione di ampiezza maggiore rientrano nella finestra della casella di ricerca dell'algoritmo, poiché verranno erroneamente identificati come potenziali d'azione target. Inoltre, l'attività spontanea nel neurone di interesse può significare che la stimolazione elettrica cade durante il suo periodo refrattario, causando l'incapacità di generare un potenziale d'azione. Le difficoltà nell'uso del software possono anche sorgere quando i neuroni afferenti primari mostrano flip-flop, per cui vengono stimolati rami terminali alternativi di un singolo neurone, facendo così sì che il potenziale d'azione evocato abbia due (o più) latenze basali che si escludono a vicenda20. Durante le registrazioni da neuroni che mostrano flip-flop con alti rapporti segnale-rumore, abbiamo eseguito con successo il tracciamento della latenza e della soglia elettrica aumentando la larghezza della casella di ricerca per incapsulare tutte le potenziali velocità di conduzione esibite dal neurone. Tuttavia, la soglia elettrica può variare a seconda del ramo terminale del neurone che viene eccitato, il che è probabilmente in parte dovuto alle differenze nella distanza dal sito della stimolazione elettrica ai terminali nocicettori alternativi. È possibile un ulteriore lavoro sul processo di identificazione del potenziale d'azione per includere, ad esempio, la corrispondenza dei modelli e potrebbe essere integrato in questo software. I plugin GUI per il band-stop o la filtrazione adattiva del rumore potrebbero anche essere utilizzati a monte di APTrack nella catena del segnale se dovessero essere sviluppati.
Consideriamo la soglia elettrica determinata come la corrente richiesta per suscitare un potenziale d'azione il 50% del tempo, su un numero definito dall'utente di stimoli elettrici, tipicamente 2-10. La morfologia della stimolazione elettrica è di 0,5 ms e impulsi positivi a onda quadra. Questo non è lo stesso che determinare la reobase, una misura comunemente usata di eccitabilità neuronale. Il plugin potrebbe essere adattato per determinare la reobase. Tuttavia, abbiamo perseguito una misura più semplice, poiché i cambiamenti dinamici nell'eccitabilità, come quelli ipotizzati durante il riscaldamento, sarebbero stati più difficili da quantificare con i cambiamenti della reobase rispetto alla nostra stima della soglia elettrica.
Questo software può essere utilizzato in esperimenti sia umani che di roditori. Ciò è reso possibile dal supporto flessibile per i sistemi di stimolazione elettrica. Il software funzionerà con qualsiasi stimolatore che accetta una tensione di comando analogica o può essere interfacciato manualmente con un motore passo-passo. Per la microneurografia, lo abbiamo usato con uno stimolatore a corrente costante marcato CE che è stato progettato per l'uso nella ricerca umana e aveva la sua stimolazione controllata da un quadrante. Gli stimolatori che accettano comandi di tensione analogici possono essere rumorosi in quanto non scollegano il circuito tra gli stimoli, il che significa che qualsiasi ronzio o rumore a 50/60 Hz sull'ingresso analogico verrà trasmesso alla registrazione. Uno stimolatore che richiede un segnale di trigger TLL aggiuntivo per collegare il circuito, consentendo di generare uno stimolo a una corrente analoga all'ingresso di tensione analogico, è ideale per l'uso con il plugin. Ciò impedisce che il rumore venga trasmesso alla registrazione tra gli stimoli.
Il software utilizza un semplice metodo up-down per stimare la soglia elettrica. Questo è stato usato nei test di psicofisica per molti decenni25. In linea con il metodo up-down, l'algoritmo di tracciamento della soglia elettrica per modulare l'ampiezza della stimolazione considera solo l'ampiezza e la risposta della stimolazione precedente quando si calcola l'ampiezza della stimolazione successiva. Ciò significa che l'ampiezza della stimolazione oscillerà attorno alla vera soglia elettrica, producendo così una velocità di accensione del 50%, supponendo che la soglia sia stabile. La dimensione minima di un incremento o decremento è 0,01 V; ciò equivale a 0,01 mA supponendo che lo stimolatore abbia un rapporto ingresso-uscita di 1 V:1 mA e una risoluzione sufficiente per ottenere cambiamenti di passo così piccoli. Il plugin aggiornerà la stima in tempo reale della soglia elettrica del potenziale d'azione target ogni volta che raggiunge una velocità di attivazione del 50% su un numero definito dall'utente di stimoli precedenti (2-10). Post hoc, raccomandiamo di utilizzare una media mobile dell'ampiezza della stimolazione negli ultimi 2-10 stimoli per stimare la soglia elettrica, e va notato che questa stima sarà accurata solo quando la velocità di accensione è relativamente stabile al 50%. Sia nelle stime live che post hoc della soglia elettrica, c'è un equilibrio tra risoluzione, affidabilità e tempo da considerare. L'utilizzo di piccoli passi di incremento e decremento aumenterà l'accuratezza della stima della soglia elettrica, ma aumenterà il tempo necessario per trovare la nuova soglia elettrica inizialmente e dopo la perturbazione. Il calcolo della soglia elettrica su un numero maggiore di stimoli precedenti fornirà una migliore affidabilità ma aumenterà il tempo necessario per raggiungere una stima accurata.
APTrack è stato progettato per l'uso nelle registrazioni dei nervi periferici, in particolare per tracciare le soglie elettriche delle fibre C durante perturbazioni sperimentali e patologiche in periodi in cui la latenza potenziale d'azione può variare a seconda dell'attività neuronale sottostante. Questo metodo consentirà l'esame non solo dell'eccitabilità assonale, ma anche dei potenziali generatori di nocicettori in volontari e pazienti sani. Prevediamo che altri campi dell'elettrofisiologia possano adottare e adattare questo strumento per l'uso in qualsiasi esperimento che richieda il monitoraggio della soglia elettrica di un'attività bloccata dallo stimolo. Ad esempio, questo potrebbe essere facilmente adattato per la stimolazione optogenetica con impulsi luminosi guidati da APTrack. Il plugin è open-source e disponibile per i ricercatori sotto licenza GPLv3. È costruito sulla piattaforma Open Ephys, che è un sistema di acquisizione dati adattabile, a basso costo e open source. Il plugin fornisce hook aggiuntivi per i plugin a valle per estrarre le informazioni sul potenziale d'azione e fornire interfacce utente aggiuntive o paradigmi adattivi. Il plugin fornisce una semplice interfaccia utente per la visualizzazione e il monitoraggio della latenza dei potenziali d'azione in tempo reale. Può anche riprodurre i dati precedenti e visualizzarli utilizzando il grafico raster temporale. Inoltre, può anche eseguire il monitoraggio della latenza durante la riproduzione di dati precedenti. Mentre ci sono altri pacchetti software disponibili per il monitoraggio della latenza in tempo reale, non sono open-source e non possono eseguire il tracciamento della soglia elettrica26,27. APTrack ha un vantaggio rispetto ai metodi tradizionali di identificazione dei potenziali d'azione a latenza costante dalle tracce di tensione in quanto utilizza un grafico raster temporale per la visualizzazione dei dati. Inoltre, le nostre esperienze di utilizzo in esperimenti con bassi rapporti segnale-rumore hanno indicato che il metodo di visualizzazione del grafico raster temporale consente l'identificazione di potenziali d'azione a latenza costante che altrimenti sarebbero stati persi.
Il monitoraggio della soglia del nervo intero è un metodo ampiamente utilizzato per valutare l'eccitabilità assonale13. Il tracciamento della soglia elettrica del singolo neurone nelle fibre C dei roditori è stato utilizzato in precedenza per quantificare l'eccitabilità dei nocicettori14 e la sua utilità nell'uomo è riconosciuta10,11; Tuttavia, fino ad ora, questo non era possibile. Forniamo un nuovo strumento open source per misurare direttamente l'eccitabilità dei singoli nocicettori negli studi elettrofisiologici sui roditori e sui nervi periferici umani. APTrack consente per la prima volta il monitoraggio in tempo reale, open-source, della soglia elettrica dei potenziali d'azione dei singoli neuroni negli esseri umani. Prevediamo che faciliterà gli studi traslazionali dei nocicettori tra roditori e umani.