Le cellule neuronali sono cellule altamente polarizzate che ospitano stereotipicamente diversi dendriti e un assone. La lunghezza di un assone richiede un efficiente trasporto bidirezionale da parte delle proteine motorie. Vari studi hanno suggerito che i difetti nel trasporto assonale sono associati a malattie neurodegenerative. Inoltre, il meccanismo di coordinazione di più proteine motrici è stato un argomento interessante. Poiché l'assone ha microtubuli unidirezionali, è più facile determinare quali proteine motorie sono coinvolte nel movimento. Pertanto, la comprensione dei meccanismi alla base del trasporto del carico assonale è fondamentale per scoprire il meccanismo molecolare delle malattie neurodegenerative e la regolazione delle proteine motorie. Qui, introduciamo l'intero processo dell'analisi del trasporto assonale, compresa la coltura di neuroni corticali primari di topo, la trasfezione di plasmidi che codificano proteine cargo e le analisi direzionali e di velocità senza l'effetto di pause. Inoltre, viene introdotto il software ad accesso aperto "KYMOMAKER", che consente la generazione di un chimografo per evidenziare le tracce di trasporto in base alla loro direzione e consentire una più facile visualizzazione del trasporto assonale.