Quattro pazienti con GBM e uno con LGG sono stati inclusi dopo la conferma patologica da parte di un neuropatologo esperto (CMM). La maggior parte dei pazienti presentava un promotore di MGMT non metilato e tutti i pazienti affetti da GBM erano IDH1 e IDH2 wild type (Tabella 1). In media, il processo di produzione è durato 88,8 minuti (+/- 6,3 minuti) nell'approccio C e 322 minuti (+/- 17,2 minuti) nell'approccio M. Il tasso di successo complessivo è stato dell'87% nell'approccio manuale e del 93% nell'approccio chopper dopo 4 settimane di coltura (n = 5). Inoltre, i PDO derivati dal gruppo C hanno raggiunto la forma arrotondata desiderata entro 1 settimana ed erano abbastanza maturi da poter essere utilizzati in esperimenti in vitro , mentre i PDO del gruppo M sono rimasti per lo più nettamente spigolosi e indefiniti (Figura 2). Il tessuto tumorale processato con l'approccio C ha portato a un totale di 281 PDO (Media per paziente = 56 +/- 43) dopo la prima settimana di coltura, mentre 250 PDO (Media per paziente = 50 +/- 41) si sono sviluppati con l'approccio M. Durante la seconda settimana di coltura, il tessuto di tutti e cinque i pazienti ha prodotto un numero più elevato di PDO quando sono stati generati con l'approccio C (801; Media per paziente = 130 +/- 38) rispetto all'approccio M (601; Media per paziente= 76 +/- 44; P = 0,018). Durante la terza settimana di coltura, l'approccio C ha accumulato complessivamente 1105 PDO da tutti i pazienti (Media per paziente = 221 +/- 32) rispetto a 771 PDO (Media per paziente = 155 +/- 34) nell'approccio M (P = 0,032). Inoltre, un totale di 1195 PDO (Media per paziente = 239 +/- 50) si è formato dopo quattro settimane di coltura quando è stato generato con l'approccio C rispetto a 784 (Media per paziente = 157 +/- 36) utilizzando l'approccio M (P < 0,01). Pertanto, il metodo C ha mostrato un numero significativamente più elevato di PDO a partire dalla seconda settimana (Figura 3). Inoltre, sono state valutate le fluttuazioni relative nella conta dei PDO per esplorare le tendenze dinamiche tra le settimane successive. L'analisi ha rivelato un'impressionante impennata del numero di PDO durante la transizione iniziale dalla prima alla seconda settimana nell'approccio C (265%), che è stato indicativo di rapidi progressi. Successivamente, c'è stato un aumento inferiore dei conteggi durante la terza settimana (75%), riflettendo un aggiustamento temporaneo. Al contrario, l'approccio M ha dimostrato un aumento consistente e costante della conta dei PDO (92% nella seconda settimana, rispettivamente 67% nella terza settimana), che ha contribuito a una notevole stabilità della conta durante la quarta settimana. Questa costante tendenza al rialzo del numero di PDO sottolinea l'affidabilità e la resilienza dell'approccio C per tutto il periodo di osservazione.
Due pazienti con GBM e un paziente con LGG sono stati inclusi per l'analisi del numero di astrociti (GFAP) all'interno dei PDO, della proliferazione delle cellule PDO (Ki67) e dell'apoptosi (CC3). La conta degli astrociti determinata non ha rivelato differenze significative tra i due metodi di elaborazione, con una media del 43% nell'approccio C e del 45% nell'approccio M (Figura 4 e Figura 5, Figura 1 supplementare e Figura 2 supplementare). Analogamente, i tassi di proliferazione all'interno delle DOP erano comparabili tra gli approcci C (3%) e M (1%). Solo i PDO generati con l'approccio C dal paziente 5 hanno mostrato un tasso di proliferazione del 26% rispetto all'1% con l'approccio M (P = 0,001; Figura 4C). Nel complesso, sono stati rilevati bassi tassi di apoptosi nei PDO trattati con l'approccio C (3%) rispetto al 2% dell'approccio M per tutti i pazienti, che non erano significativamente diversi (Figura 5C). Inoltre, non c'era alcuna differenza significativa tra i due metodi per quanto riguarda il numero di astrociti sottoposti ad apoptosi (Figura 5D).

Figura 1: Panoramica grafica del processo di produzione di organoidi derivati dal paziente (PDO) utilizzando un chopper automatizzato rispetto a un approccio manuale. L'illustrazione illustra le varie fasi coinvolte, tra cui (A) la raccolta del campione, (B) la dissezione del materiale tumorale, (C) il lavaggio e (D) l'incubazione. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Morfologia della DOP durante la prima settimana di coltura. Confronto della formazione di PDO dopo la dissezione utilizzando sia il trituratore automatizzato che il metodo manuale. Barre di scala = 1000 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Conta dei PDO durante le prime quattro settimane di coltura. L'asse x visualizza il tempo in settimane (W) e l'asse y il numero di PDO dell'approccio C (blu) e M (rosso) (n = 5). Ogni punto dati rappresenta il conteggio medio, con barre di errore che indicano l'errore standard della media. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Tassi di proliferazione cellulare all'interno dei PDO. (A) Immagini rappresentative di immunofluorescenza (n = 3) di cellule GFAP-positive (verde), cellule Ki67-positive (rosse) e DAPI (blu) nei PDO dei pazienti 3, 4 e 5 (Tabella 1). Tutte le DOP sono state lavorate utilizzando i metodi trituratore (C) e manuale (M). Barre di scala = 100 μm. (B) Confronto dei due metodi per quanto riguarda il numero relativo di cellule GFAP-positive, (C) cellule Ki67-positive e (D) Ki67/GFAP-doppie positive. I risultati non significativi sono indicati da "ns". Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5: Tassi di apoptosi all'interno dei PDO. (A) Immagini rappresentative di immunofluorescenza (n = 3) di cellule GFAP-positive (verde), cellule CC3-positive (rosso) e DAPI (blu) nei PDO dei pazienti 3, 4 e 5 (Tabella 1). Tutte le DOP sono state lavorate utilizzando i metodi trituratore (C) e manuale (M). Barre di scala = 100 μm. (B) Confronto dei due metodi per quanto riguarda il numero relativo di cellule GFAP-positive, (C) cellule CC3-positive, e (D) CC3/GFAP-doppie positive. I risultati non significativi sono indicati da "ns". Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Tabella 1: Caratteristiche dei pazienti e parametri clinici. GBM = glioblastoma, tipo IDH-wild, SNC WHO grado 4; LGG = glioma di basso grado; KPS = punteggio delle prestazioni di Karnofsky; MGMT = O 6-metilguanina-DNA metiltransferasi; IDH1 = isocitrato deidrogenasi 1, IDH2 = isocitrato deidrogenasi 2, ATRX = α-talassemia/ritardo mentale, gene legato all'X; M = morfologia; CC = numero di cellule; p = proliferazione; A = apoptosi. Clicca qui per scaricare questa tabella.
Tabella 2: Composizioni medie. H-GPSA = Ibernate A-Glutamax pencillin streptomicina amfotericina B. PDO = organoidi derivati da pazienti DMEM: Dulbecco's Modified Eagle's Medium. NEAA: aminoacidi non essenziali. Pen Strep: Penicillina/Streptomicina Fare clic qui per scaricare questa tabella.
Tabella 3: Panoramica delle tecniche utilizzate per generare modelli di coltura cellulare. Clicca qui per scaricare questa tabella.
Figura supplementare 1: Singoli canali di colorazione della proliferazione delle DOP. (A) DAPI (blu), (B) cellule GFAP-positive (verde), (C) cellule Ki67-positive (rosso) e (D) canale di sovrapposizione nei PDO dei pazienti 3, 4 e 5. Barre di scala = 100 μm. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura 2 supplementare: Singoli canali di colorazione per apoptosi dei PDO. (A) DAPI (blu), (B) cellule GFAP-positive (verde), (C) cellule CC3-positive (rosso) e (D) canale di sovrapposizione nei PDO dei pazienti 3, 4 e 5. Barre di scala = 100 μm. Clicca qui per scaricare questo file.