La valutazione della resa finale si basa sul livello di purezza e sulla quantità di cellule isolate e può essere determinata mediante RT-qPCR, conteggio delle cellule e quantificazione delle proteine. La purezza delle cellule magnetiche isolate dall'ipotalamo è stata confermata dall'analisi dell'espressione genica di CD11b, C1qa, Gad1 e GFAP con RT-qPCR (Figura 1). CD11b e C1qa sono espressi prevalentemente dalle microglia in uno stato stazionario, CNS16 e Gad1 e GFAP fungono rispettivamente da marcatore neuronale e astrocitico. Il cDNA totale di un ipotalamo variava da 55 a 98 ng. È interessante notare che solo la frazione positiva mostrava l'espressione di CD11b e C1qa, indicando l'assenza di qualsiasi potenziale perdita di cellule microgliali nella frazione negativa. I primer sono forniti nella Tabella 2.
Inoltre, i livelli minori dei marcatori neuronali e astrocitici assicurano che la stragrande maggioranza delle cellule isolate siano microglia, poiché i macrofagi e i monociti residenti costituiscono solo il 10% del panorama totale delle cellule immunitarie di un cervello sano10,11. Questi risultati dimostrano l'efficacia della selezione magnetica e aprono la strada all'applicazione della RT-qPCR per valutare i livelli di espressione di tutti i geni di interesse nelle cellule microgliali ipotalamiche appena selezionate. Allo stesso modo, un'analisi RNAseq può essere eseguita su microglia selezionate ipotalamiche per avere una visione completa del loro trascrittoma.
La quantità delle cellule isolate è stata determinata mediante il conteggio delle cellule ed è risultata essere di ~15.000 cellule per ipotalamo (menzionato nella fase 4.10 del protocollo). Inoltre, è stata quantificata la concentrazione proteica nelle microglia selezionate, rivelando una concentrazione media di 0,5 μg/μL nelle cellule CD11b+ isolate da due ipotalami raggruppati (Figura 2). Questa conoscenza consente di eseguire diversi saggi a seconda di una soglia minima proteica. Inoltre, mettendo in comune più ipotalami, è possibile ottenere una concentrazione più elevata, ampliando la portata delle potenziali analisi. Le proteine estratte dalla microglia ipotalamica facilitano diverse tecniche, tra cui i saggi immunologici AlphaLISA e i saggi di attività chinasica.
Inoltre, il protocollo descritto consente ai ricercatori di eseguire diverse analisi ex vivo , consentendo l'esplorazione dell'attività microgliale e del loro ruolo nell'ipotalamo in contesti sia fisiologici che patologici. La quantificazione della produzione di ROS rappresenta un aspetto cruciale della risposta immunitaria microgliale17. Pertanto, dopo la separazione, la microglia può essere trattata con reagenti disponibili in commercio che consentono la rilevazione di ROS in cellule vive esibendo un aumento del segnale fluorescente dopo l'ossidazione. La microglia isolata magneticamente da tre ipotalami raggruppati è sufficiente per rilevare i ROS mediante FACS, come mostrato nella Figura 3A, sebbene i nostri risultati mostrino una variabilità piuttosto elevata della produzione di ROS cellulari tra le condizioni che abbiamo analizzato. È interessante notare che, con il kit commerciale sopra menzionato (vedi la Tabella dei Materiali), siamo stati anche in grado di valutare la vitalità delle cellule Cd11b+ selezionate, grazie a una colorazione di cellule morte immuni che mostra un aumento della fluorescenza al legame del DNA. In particolare, i nostri dati mostrano che il 99% delle cellule è vivo (Figura 3B). Le strategie di gating sono state utilizzate per distinguere tra cellule vive e morte, nonché cellule ossidativamente stressate e non stressate, in base alle loro proprietà di fluorescenza.
Un'altra caratteristica principale dell'attività microgliale è la fagocitosi, un processo dinamico e strettamente regolato che svolge un ruolo chiave nella sorveglianza immunitaria, nella riparazione dei tessuti e nell'omeostasi generale del sistema nervoso centrale18. Sorprendentemente, le cellule Cd11b+ selezionate con biglie accoppiate magneticamente possono essere coltivate per 24 ore e poi incubate con microsfere di lattice fluorescenti in diversi punti temporali per valutare, mediante FACS o microscopia a fluorescenza, alterazioni dell'attività fagocitaria in diverse condizioni. Le microglia appena selezionate possono anche essere esposte a microsfere fluorescenti o a qualsiasi tipo di particelle accoppiate a pHrodo (ad esempio, sinaptosomi) direttamente all'interno della provetta e la fagocitosi può essere valutata mediante analisi FACS.
In particolare, abbiamo incubato direttamente nella provetta contenente la sospensione cellulare selezionata, la microglia isolata da due ipotalami raggruppati o un intero cervello con perle di lattice fluorescenti. Le microglia che fagocitano almeno una perlina fluorescente possono essere distinte dalle cellule non fagocitiche mediante citometria a flusso, poiché le microglia fagocitiche mostreranno una maggiore fluorescenza. Per il gating sono stati utilizzati controlli negativi, non incubati con perline. In entrambe le nostre condizioni sperimentali (topi alimentati con cibo vs dieta ricca di grassi (HFD)) abbiamo osservato una percentuale molto bassa di microglia fagocitaria (Figura 4A). Tuttavia, questo risultato è mostrato qui per dimostrare l'efficacia di questo metodo, che, notevolmente, permette anche di differenziare tra cellule che fagocitano 1 perlina, 2 perle, 3 perle e così via (Figura 4B). Infine, tutti gli approcci omici potrebbero essere applicati alla microglia ipotalamica isolata. Suggeriamo di raggruppare tre ipotalami per avere abbastanza cellule per eseguire questi saggi.

Figura 1: Valutazione della purezza delle cellule CD11b+ mediante RT-qPCR. Quantificazione in cellule selezionate dell'espressione dell'mRNA dell'integrina CD11b, della subunità A C1q del complemento C1q, della decarbossilasi dell'acido glutammico Gad1 e della proteina acida fibrillare gliale GFAP normalizzata sui livelli di mRNA dei geni housekeeping Eef1a1 e Sdha. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Quantificazione delle proteine da cellule ipotalamiche dopo lo smistamento cellulare. Quantificazione della concentrazione proteica in cellule CD11b+ e CD11b- . Sia le cellule CD11b+ che CD11b- sono state lisate in 20 μL di tampone di lisi. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Rilevamento di ROS in cellule vive microgliali. Quantificazione di (A) cellule stressate ossidativamente e (B) cellule vive in una popolazione di cellule Cd11b+ selezionate, con relativi grafici di contorno FACS. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Quantificazione dell'attività fagocitaria microgliale. (A) Quantificazione di cellule fagocitiche in cellule Cd11b+ selezionate da due ipotalami o da un cervello, con relativo diagramma di contorno FACS. (B) Percentuale di cellule fagocitiche in base al numero di perle fagocitate con relativo grafico di contorno FACS. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Miscela di enzimi 2 | | |
| Enzima A | Buffer Y | Enzima P | |
| 10 μl | 20 μl | 50 μl | |
| D-PBS | Soluzione per la rimozione dei detriti | Sovrapposizione D-PBS |
| Struttura da 15-100 mg | 1000 μl | 450 μl | 2 ml |
Tabella 1: Preparazione della miscela di dissociazione (i volumi si riferiscono a un singolo campione) e dei gradient overlayer.
| Geni | Proteina | Inoltrare | Inverso |
| Itgam | Integrina alfa M (CD11b) | CTCATCACTGCTGGCCTACAA | GCAGCTTCATTCATCATGTCCTT |
| Sdha | Complesso della succinato deidrogenasi Subunità A della flavoproteina | CCCTCTCATATGTGGACATCAA | CAAGGTCTTGTCGATAACAGGT |
| C1qa | Componente 1 del complemento, sottocomponente q, polipeptide alfa | CGAGGTGTGGATCGAAAAGG | GAAGATGCTGTCGGCTTCAGT |
| Gad1 | glutammato decarbossilasi 1 | GACCAATCTCTGTGACTCGCTTAG | CTGGTCAGTGTATCGGAGGTCTT |
| Gfap | proteina acida fibrillare gliale | AGGTCCGCTTCCTGGAACA | GGGCTCCTTGGCTCGAA |
Tabella 2: Sequenze di primer RT-qPCR.
| Selezione cellulare con citometria a flusso (FACS) | Smistamento cellulare attivato magneticamente (MACS) |
| Anticorpi biochimici marcati con fluorescenza | Sfere magnetiche coniugate ad anticorpi |
| Differenziazione oltre i marcatori di superficie cellulare | Differenziazione solo in base ai marcatori della superficie cellulare |
| Resa iniziale sostanziale | Resa iniziale modesta |
| Più lento del MACS per la gestione simultanea di molti campioni | Più veloce del FACS per la gestione simultanea di molti campioni |
| Meno delicato del MACS | Più delicato del FACS |
Tabella 3: Rappresentazione delle caratteristiche e dei limiti di FACS e MACS