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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo protocollo descrive l'uso di biosensori basati su BRET per la misurazione in tempo reale dell'attivazione della proteina G nelle cellule HEK293 viventi dopo stimolazione del ligando del recettore accoppiato alla proteina G. Qui, il recettore β2-adrenergico e il recettore dei cannabinoidi di tipo 1 servono come esempi per dimostrare l'efficienza dei sensori per diversi sottotipi di proteine G e in vari GPCR.
I recettori accoppiati a proteine G (GPCR) costituiscono la più grande famiglia di recettori transmembrana, svolgendo un ruolo cruciale nella segnalazione cellulare trasducendo gli stimoli extracellulari in risposte intracellulari. L'attivazione dei GPCR porta a cambiamenti conformazionali che consentono interazioni con le proteine G eterotrimeriche. Dopo l'attivazione, la subunità Gα subisce uno scambio GDP-GTP, dissociandosi dal dimero Gβγ e innescando cascate di segnalazione a valle. Per studiare l'attivazione della proteina G mediata da GPCR, i biosensori basati sul trasferimento di energia per risonanza di bioluminescenza (BRET) sono un approccio altamente sensibile e non invasivo. I sensori di attività tricistronica basati su proteine G (biosensori G-CASE), sviluppati da Schihada et al., rilevano la dissociazione eterotrimera come proxy per l'attivazione e consentono il monitoraggio in tempo reale dell'attività di GPCR utilizzando una singola trasfezione plasmidica, superando i limiti degli approcci di co-trasfezione. I saggi BRET offrono diversi vantaggi rispetto alle tecniche basate sulla fluorescenza, come la riduzione del rumore di fondo, la riduzione del fotosbiancamento e una migliore sensibilità. In questo protocollo, i biosensori G-CASE basati su BRET sono stati utilizzati in cellule vive e piastre a 96 pozzetti. In particolare, valutiamo l'attività del recettore β2-adrenergico (β2-AR) e del recettore dei cannabinoidi di tipo 1 (CB1R) in termini di attivazione della proteina G. Utilizzando cellule HEK 293T wild-type trasfettate transitoriamente con β2-AR e cellule HEK293T che esprimono stabilmente CB1R, la robustezza dei biosensori Gs e Gi3 G-CASE è confermata. Questo protocollo supporta l'utilità di questo approccio per gli studi farmacologici e lo screening GPCR ad alto rendimento per comprendere meglio la capacità dei ligandi di attivare percorsi specifici, ad esempio, tramite una segnalazione distorta e quindi facilitare la scoperta di nuovi composti terapeutici.
I recettori accoppiati a proteine G (GPCR) rappresentano la più grande superfamiglia di recettori transmembrana, responsabili della trasduzione di stimoli extracellulari in cascate di segnalazione intracellulare con conseguenti risposte biologiche specifiche. Sono bersagli farmacologici fondamentali, con circa il 30% dei farmaci commercializzati che agiscono sui GPCR1. Il legame del ligando GPCR induce cambiamenti conformazionali nel recettore, facilitando le interazioni con le proteine G eterotrimeriche e/o le chinasi GPCR (GRKs) e le β-arrestine, avviando così la segnalazione a valle o l'internalizzazione del recettore2.
Le proteine G eterotrimeriche fungono da trasduttori intracellulari primari della segnalazione GPCR e sono costituite da tre subunità: Gα, Gβ e Gγ. Questi eterotrimeri sono classificati in quattro famiglie - Gi/o, Gs, Gq e G12/13 - in base al sottotipo Gα , ognuna delle quali attiva vie di segnalazione distinte: il sottotipo Gi/o inibisce l'adenilato ciclasi mentre Gs la stimola, Gq attiva la fosfolipasi C-β e G12/13 regola le GTPasi della famiglia Rho.
L'attivazione dei GPCR porta ai loro riarrangiamenti conformazionali, consentendo un rapido coinvolgimento della proteina G entro cinetiche inferiori al secondo. Questo processo induce cambiamenti conformazionali della proteina G, promuovendo lo scambio GDP-GTP nella subunità Gα. Il legame con il GTP altera ulteriormente la conformazione della subunità Gα, determinando la sua dissociazione dal dimeroG βγ, consentendo la propagazione del segnale. Le proteine G sono quindi cruciali nel modulare la specificità e la dinamica temporale delle risposte cellulari regolando diverse proteine effettrici come l'adenilato ciclasi o i canali ionici 3,4,5.
Questo protocollo delinea la misurazione dell'attivazione o dell'inattivazione della proteina G utilizzando biosensori basati sul trasferimento di energia della risonanza di bioluminescenza (BRET) dopo la stimolazione del ligando GPCR in cellule vive. Ispirato dal lavoro pionieristico sui biosensori delle proteine G 6,7,8,9, il sistema G-CASE (G protein tri-cistronic activity sensors), introdotto da Schihada et al.10, si basa su BRET tra le subunità Gα marcate e G βγ e offre un approccio semplificato che richiede solo una singola trasfezione plasmidica. Questa caratteristica migliora la sensibilità e mitiga le sfide associate alla co-trasfezione di più plasmidi che codificano per le tre subunità (Gα, Gβ e Gγ) della proteina G eterotrimerica. Questi sensori sono stati messi a disposizione di gruppi di ricerca accademici in commercio (vedi Tabella dei materiali).
BRET offre vantaggi significativi rispetto al trasferimento di energia di risonanza (FRET) Förster. In BRET, il trasferimento di energia avviene tra un donatore bioluminescente e un accettore fluorescente senza la necessità di sorgenti luminose esterne. Questa bioluminescenza intrinseca riduce i problemi associati alla FRET, come l'autofluorescenza e la diffusione della luce, con conseguente riduzione del segnale di fondo e miglioramento della sensibilità del saggio 6,7,11.
Questa assenza di eccitazione esterna in BRET riduce al minimo il fotobleaching e gli effetti fototossici, portando a segnali di fondo inferiori rispetto a FRET. Di conseguenza, i saggi BRET mostrano più spesso una maggiore sensibilità, consentendo la misurazione dell'attivazione della proteina G di GPCR costitutivamente attivi. La maggiore sensibilità dei dosaggi BRET facilita il rilevamento di sottili interazioni biologiche, il che è particolarmente prezioso negli studi farmacologici in cui la misurazione precisa dell'attività del recettore è fondamentale.
Questi biosensori possono essere tradotti in screening ad alto rendimento in piastre da 96 pozzetti o 384 pozzetti, come recentemente dimostrato da Scott-Dennis et al., dove è stato sviluppato un metodo che utilizza questi biosensori in un saggio a 384 pozzetti basato su membrana per analizzare l'attività dei recettori dei cannabinoidi CB1R e CB2R12. Questo articolo descrive l'uso di questi biosensori in piastre a 96 pozzetti in cellule viventi misurando l'attività del β2-AR come GPCR prototipico di classe A, che lega la proteinaG s e il CB1R che appartiene ai GPCR di classe A e attiva la proteina della famiglia Gi/o . L'uso di due biosensori G-CASE è convalidato: Gs e Gi3 in cellule HEK 293T con il GPCR espresso in modo transitorio (con il β2-AR) o stabilmente espresso (con il CB1R).
È importante notare che questo esperimento può essere eseguito in varie linee cellulari, dimostrando la versatilità e la robustezza di questa tecnica in vari contesti cellulari. Ciò garantisce che il metodo possa essere applicato a diversi modelli sperimentali, rendendolo uno strumento prezioso per lo studio della segnalazione GPCR in diversi contesti fisiologici e farmacologici. La Figura 1 illustra il principio dei sensori di attività della proteina G basati su BRET.

Figura 1: Principio dei sensori di attività della proteina G basati su BRET. I sensori di proteine G sono costituiti da tre subunità: Gα, Gnativo β e Gγ. La subunità Gα è fusa con la piccola e luminosa NanoLuciferasi (Nluc), mentre la subunità Gγ è marcata N-terminale con Venere permutata circolarmente (cpVenus173). I geni che codificano per queste subunità proteiche G ingegnerizzate sono combinati in un unico plasmide. Il legame del ligando ai GPCR induce cambiamenti conformazionali dei GPCR, promuovendo il reclutamento della proteina G e la successiva dissociazione seguita dall'idrolisi del GTP. Questa dissociazione interrompe il trasferimento di energia tra i partner, con conseguente diminuzione del segnale BRET. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
I reagenti e le attrezzature utilizzate in questo studio sono elencati nella Tabella dei materiali.
1. Semina su piastra a pozzetti (giorno 1)
NOTA: Seguire tutti i protocolli di coltura cellulare in una cappa a flusso laminare sterile per mantenere le condizioni di sterilità. Le piastre a pozzetti bianchi con fondo piatto trasparente vengono utilizzate per seguire la crescita e la vitalità cellulare. Utilizzare la piastra a pozzetti completamente bianca per evitare di utilizzare un adesivo nel passaggio 3.2.1.
2. Trasfezione plasmidica (Giorno 2)
NOTA: La trasfezione cellulare può essere eseguita il primo giorno su celle sospese prima della piastra, durante la fase 1.2.7, e l'acquisizione dei dati il giorno 3.
3. Acquisizione dati (Giorno 3)
4. Analisi dei dati
NOTA: Raccogli i dati di ciascuna lettura in file di fogli di calcolo separati.




Figura 2: Passaggi chiave per l'esecuzione del test BRET. Panoramica delle tre principali fasi sperimentali delineate in questo protocollo (semina cellulare, trasfezione cellulare e acquisizione del segnale BRET) e guida dettagliata passo passo per l'acquisizione dei dati. Configurazione sperimentale: il giorno 1, le cellule vengono seminate in una piastra bianca a 96 pozzetti prerivestita PLL con un fondo piatto e chiaro a una densità di 30.000 cellule/pozzetto. Il giorno 2, le cellule vengono trasfettate con il sensore di proteina G selezionato insieme ai plasmidi GPCR o pcDNA3.1 studiati. Dopo 24 ore di incubazione, l'attività del sensore di proteina G viene misurata attraverso letture di bioluminescenza e fluorescenza dopo l'aggiunta del ligando. Acquisizione dei dati: Dopo il lavaggio HBSS delle celle, 80 μL di HBSS vengono aggiunti ai pozzetti e l'emissione di fluorescenza di cpVenus173 viene misurata tra 500 nm e 600 nm utilizzando un monocromatore da 535/30 nm (1). Successivamente, la bioluminescenza Nluc viene misurata tra 400 nm e 600 nm utilizzando un monocromatore da 450/40 nm, sia prima ( 2) che dopo (3) l'aggiunta di furimazina. Infine, il segnale BRET per l'attività della proteina G indotta dal basale e dal ligando viene misurato utilizzando monocromatori a 450/40 nm e 535/30 nm, rispettivamente, per 3 minuti (3 cicli di 60 s con un intervallo di misurazione di 0,30 s) (4) e 16 minuti (16 cicli di 60 s con un intervallo di misurazione di 0,30 s) (5). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Uno schema generalizzato della configurazione e dell'esecuzione sperimentale è dettagliato nella Figura 2. L'attivazione delle proteine della famiglia Gs o Gi/o in seguito all'attivazione del ligando di due GPCR è stata valutata utilizzando i biosensori G-CASE. In primo luogo, è stato studiato un GPCR prototipico della famiglia A, il β2-AR trasfettato transitoriamente in cellule HEK 293T. Quando un agonista (ad es. isoproterenolo) è stato applicato a cellule hek wt che esprimono il β2-AR insieme al sensore proteico Gs(short)-CASE, è stata osservata una diminuzione dipendente dalla concentrazione del segnale BRET, indicando l'attivazione della proteina Gs (Figura 3B). I valori di ΔBRET diminuivano con la concentrazione del ligando fino al raggiungimento della saturazione, con un plateau osservato circa 5 minuti dopo la stimolazione del ligando. Al contrario, le cellule wt HEK trasfettate con il plasmide pcDNA3.1 vuoto e il sensore proteico Gs(short)-CASE hanno mostrato una risposta inversa ma bassa e non significativa alla stimolazione con isoproterenolo (Figura 3B). In questo protocollo, vengono tracciati i valori ottenuti dopo 15 minuti di stimolazione del ligando. Per garantire la coerenza dei risultati e l'indipendenza dalla selezione del tempo, è necessario testare altri punti temporali, assicurandosi che l'equilibrio sia stato raggiunto. Inoltre, per confrontare i risultati tra diversi esperimenti, la selezione del tempo deve essere regolata in base alla cinetica di attivazione di ciascun esperimento.
Per generare le curve dose-risposta sigmoidale mostrate nella Figura 3C, i valori di ΔBRET misurati a 15 minuti dopo la stimolazione (quando il plateau è stabilizzato) sono stati tracciati rispetto alle diverse concentrazioni di ligando. L'EC50 osservato (9,4 nM ± 2,1 nM) è nell'intervallo dei valori noti del recettore Kd per l'isoproterenolo (13 nM ± 6 nM)13,14 (Figura 3C,D). Questi risultati dimostrano l'efficienza dei sensori G-CASE nel valutare l'attivazione della proteina G con una risposta osservata specificamente associata alla presenza della β2-AR.

Figura 3: Valutazione del sensoredella proteina G s nelle cellule wt HEK. Letture cinetiche del ΔBRET dopo l'aggiunta dell'agonista isoproterenolo alle cellule wt HEK trasfettate con il sensore della proteina Gs e β2-AR (A) o pcDNA3.1 (B). (C) Curve dose-risposta ottenute adattando i valori di ΔBRET (%) dopo 15 minuti di stimolazione del ligando a concentrazioni variabili del ligando. (D) Confronto dei valori massimi di ΔBRET tra le cellule di controllo trasfettate pcDNA3.1 e β2-AR stimolate con isoproterenolo. La differenza statistica rispetto alla condizione pcDNA3.1 è stata testata utilizzando un test di Mann-Whitney non parametrico (**p < 0,01). I dati mostrano ± SEM medio di tre esperimenti indipendenti eseguiti in duplicato. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
In secondo luogo, i biosensori sono stati testati in cellule HEK CB1, una linea cellulare HEK 293T che esprime stabilmente il CB1R. Queste cellule sono state trasfettate transitoriamente con il sensore proteico Gi3-CASE. La stimolazione con l'agonista CB1R WIN-55,212-2 ha indotto un segnale ΔBRET concentrazione-dipendente, indicando l'attivazione della via Gi3 (Figura 4A). Al contrario, le cellule hek wt trasfettate con il sensore proteico Gi3-CASE e stimolate nelle stesse condizioni non hanno mostrato alcuna risposta, confermando la specificità dell'attivazione di CB1R (Figura 4B). Un plateau è stato raggiunto a circa 5 minuti dopo l'attivazione del ligando. La corrispondente curva dose-risposta ha evidenziato la risposta ΔBRET concentrazione-dipendente indotta dalla stimolazione WIN-55,212-2 nelle cellule HEK-CB1, mentre tale risposta non è stata osservata nelle cellule HEK wt (Figura 4C). L'EC50 osservato (112 nM ± 25 nM) è nell'intervallo dei valori noti del recettore EC50 per WIN-55,212-2 (354 nM ± 62 nM)15 (Figura 4C, D). Infine, un confronto tra i valori di ΔBRET ottenuti 15 minuti dopo la stimolazione dell'agonista con 10 μM di WIN-55,212-2 in HEK CB1 e le cellule hek wt illustrano l'attivazione CB1R-dipendente della via di segnalazione Gi3 (Figura 4D).

Figura 4: Valutazione del sensore della proteina Gi3 nelle cellule HEK CB1. Letture cinetiche del ΔBRET dopo l'aggiunta dell'agonista WIN-55,212-2 alle cellule HEK CB1 (A) o HEK wt (B). Curve dose-risposta ottenute adattando i valori di ΔBRET (%) dopo 15 minuti di stimolazione del ligando contro la concentrazione del ligando (C). Confronto dei valori massimi ΔBRET tra le cellule HEK wt di controllo e le cellule HEK CB1 stimolate con WIN-55.212-2 (D). La differenza statistica rispetto alla condizione di peso HEK è stata testata utilizzando un test di Mann-Whitney non parametrico (****p < 0,0001). I dati mostrano ± SEM medio di cinque esperimenti indipendenti eseguiti in duplicato. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Questo protocollo descrive l'uso di biosensori basati su BRET per la misurazione in tempo reale dell'attivazione della proteina G nelle cellule HEK293 viventi dopo stimolazione del ligando del recettore accoppiato alla proteina G. Qui, il recettore β2-adrenergico e il recettore dei cannabinoidi di tipo 1 servono come esempi per dimostrare l'efficienza dei sensori per diversi sottotipi di proteine G e in vari GPCR.
Le cellule HEK-CB1 sono state un gentile dono di M. Guzman (Università Complutense, Madrid, Spagna) e il plasmide del recettore β2-adrenergico è stato un gentile dono di D. Perrais (IINS, Istituto Interdisciplinare di Neuroscienze, Bordeaux, Francia). Gi3-CASE e Gs(abbreviato)-CASE è stato un dono di Gunnar Schulte (Addgene plasmid # 168122; Addgene plasmide # 168124). Alcune delle illustrazioni sono state create utilizzando BioRender.com. Questo lavoro è sostenuto dal Ministero francese dell'Enseignement Supérieur et de la Recherche e dai finanziamenti dell'Agenzia nazionale francese per la ricerca (ANR) PolyFADO (ANR-21-CE44-0019), AlzCaBan (ANR-24-CE44-4647) e SCHIZOLIP (ANR-22-CE44-0034).
| Piastra di coltura avanzata a 96 pozzi, bianca con fondo trasparente e piatto, con coperchio, Greiner bio-one | Dutscher | 655983 | |
| Pellicola bianca BrightMax ClearLine | Dutscher | 760245 | |
| ClarioSTAR LVF | BMG Labtech | ||
| Dimetilsolossido (DMSO) | Sigma | D4540 | |
| DPBS Modificato, senza cloruro di calcio e cloruro di magnesio, liquido, sterile-filtrato, adatto per cellule | Sigma | D8537 | |
| Dulbecco' s Eagle modificata s medium (DMEM) GlutaMAX | Sigma | D0822 | Caldo a 37 °C; Bagno maria C prima dell'uso |
| Siero fetale bovino (FBS) | Sigma | F9665 | |
| Galphai3-Nluc-Gbeta1-Ggamma2-Venere | Addgene | 168122 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ Dono di Gunnar Schulte |
| Galphas (isoforma breve)-Nluc-Gbeta3-Ggamma1-Venere | Addgene | 168124 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ Dono di Gunnar Schulte |
| HEK-293T che esprime stabilmente CB1R (HEK CB1) | Gentile dono di M. Guzman (Università Complutense, Madrid, Spagna) | ||
| HEK-293T di tipo selvatico (HEK wt) | |||
| Isoproterenolo | Sigma | I6504 | Solubilizzato in H20 e conservato a – 20 & deg; C |
| Lipofectamina 2000 | Invitrogen | 11668019 | |
| Opti-MEM I Integratore Siero Ridotto Medium GlutaMAX | Fischer | 11564506 | |
| pcDNA3 Flag tag del recettore beta-2-adrenergico FLAG C-ter | Generoso dono di D. Perrais (IINS, Bordeaux) | ||
| pcDNA3.1-(vuoto)-TAG | Addgene | 138209 | |
| Penicillina/streptomicina | Sigma | P4333 | |
| Soluzione di poli-L-lisina (PLL) | Sigma | RNBL7086 | |
| Tripsina-EDTA | Sigma | T3924 | |
| VITTORIA-55.212-2 | Cayman Chemicals | 10009023 | Solubilizzato in DMSO e conservato a – 20 & deg; C |