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Articolo di ricerca

Meccanismi molecolari della decoczione di Dachengqi nella sindrome da difficoltà respiratoria acuta: un'analisi di farmacologia di rete e bioinformatica

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DOI:

10.3791/69651

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27 marzo 2026

 , 
1Department of Emergency Medicine, The Fourth Affiliated Hospital of Soochow University

In questo articolo

Sommario

Questo studio chiarisce i meccanismi molecolari della Decoczione Dachengqi (DCQD) contro la sindrome da difficoltà respiratoria acuta (ARDS) utilizzando la farmacologia di rete, la bioinformatica e il docking molecolare. Sono stati identificati obiettivi e percorsi chiave. L'aggancio molecolare ha convalidato interazioni robuste ligando-bersaglio, supportando il potenziale terapeutico multi-bersaglio della DCQD per l'ARDS.

Abstract

La sindrome da difficoltà respiratoria acuta (ARDS) è una complicanza potenzialmente letali della sepsi, caratterizzata da iposemia refrattaria e infiammazione polmonare. Attualmente, gli interventi farmacologici efficaci rimangono limitati. La medicina tradizionale cinese (MTC), esemplificata dalla Decoczione Dachengqi (DCQD), ha dimostrato potenziale terapeutico nel modulare risposte infiammatorie complesse. Per indagare il meccanismo della DCQD nel trattamento dell'ARDS, i componenti attivi della DCQD e i loro bersagli associati sono stati prima recuperati da database pubblici. I target correlati all'ARDS sono stati identificati tramite analisi bioinformatica di dataset pubblici. Intersecando bersagli specifici del farmaco con bersagli correlati alla malattia, è stata costruita una rete di interazione DCQD-ARDS utilizzando l'analisi di interazione proteina-proteina (PPI) e l'arricchimento funzionale. Un'analisi completa ha rivelato 32 geni sovrapposti critici per l'efficacia terapeutica della DCQD nell'ARDS. L'analisi di arricchimento ha evidenziato vie chiave, tra cui la via di segnalazione della chemocina, la segnalazione dei recettori simili a NOD e la formazione di trappola extracellulare neutrofila (NET), implicate nell'immunomodulazione e nell'infiammazione. La rete PPI ha identificato HSP90AB1, MMP9, HSP90AA1, ARG1 e MYC come obiettivi principali. L'aggancio molecolare ha confermato forti affinità di legame tra questi bersagli e i componenti DCQD. I nostri risultati svelano la base meccanicistica che supporta la DCQD come promettente terapia aggiuntiva per la SDRA indotta dalla sepsi.

Introduzione

La sindrome da disabilità respiratoria acuta (ARDS) è una sindrome clinica altamente eterogenea causata da vari fattori polmonari o extrapolmonari, caratterizzata principalmente da lesioni polmonari diffuse e iposemiarefrattaria 1. Dalla sua prima definizione nel 1967, la comprensione dell'ARDS si è evoluta continuamente, portando a revisioni iterative dei suoi criteridiagnostici 2. Inoltre, l'implementazione di strategie terapeutiche, tra cui la ventilazione protettiva polmonare, il supporto ex vivo e la posizione prona, ha influenzato profondamente sia la gestione clinica sia il progresso della ricerca3. Tuttavia, la mortalità da ARDS rimane allarmantemente alta. Un sondaggio globale ha rivelato che i pazienti con ARDS rappresentano il 10,4% di tutti i ricoveri nelle unità di terapia intensiva (ICU). Nonostante i notevoli progressi nella terapia intensiva negli ultimi decenni, i tassi di mortalità (sia in terapia intensiva che dopo la dimissione) persistono tra il 35% e il 45%.

La fisiopatologia dell'ARDS è complessa, coinvolgendo lesioni epiteliali alveolari e capillari endoteliali, risposte infiammatorie polmonari e sistemiche, e lesioni polmonari indotte daventilatori 5. È importante notare che l'ARDS associato al COVID-19 presenta caratteristiche fisiopatologiche distinte rispetto all'ARDS classico, con il COVID-19 che potrebbe indurre trombosi microvascolare più grave e infiammazione eterogenearegionale 6,7. Data la fisiopatologia complessa della malattia e l'elevata eterogeneità, attualmente non esiste una farmacoterapia definitiva per l'ARDS. Oltre ai corticosteroidi e agli agenti bloccanti neuromuscolari — raccomandati condizionatamente per i benefici sulla mortalità — altre terapie farmacologiche (ad esempio, ossido nitrico [NO], prostaciclina, interferone-β, tensioattivi polmonari e proteina C attivata) non hanno dimostrato efficacia clinica. Al contrario, i β-agonisti (ad esempio, albuterolo) e il fattore di crescita dei cheratinociti si sono dimostratidannosi 8,9. Di conseguenza, lo sviluppo di terapie sicure e multifunzionali rimane una priorità fondamentale nella ricerca.

La Medicina Tradizionale Cinese (MTC), con una storia che si estende per oltre 3.000 anni, è stata utilizzata per prevenire e trattare varie malattie respiratorie. Attraverso millenni di applicazioni cliniche e la modernizzazione della ricerca sulla MTC, ha dimostrato potenziale nella gestione di ARDS 10,11. La MTC esercita i suoi effetti terapeutici attraverso meccanismi multi-componenti, multi-percorso e multi-bersaglio, in particolare mitigando le risposte infiammatorie, modulando la funzione immunitaria e proteggendo i tessutipolmonari 12. Ad esempio, l'iniezione di Xuebijing (XBJ), una preparazione derivata dalla MTC composta da radici di Paeonia lactiflora, rizomi di Ligusticum chuanxiong, radici di Salvia miltiorrhiza, fiori di Carthamus tinctorius e radici di Angelica sinensis, contiene molteplici componenti attivi. Allevia l'ARDS regolando la funzione immunitaria, lo stress ossidativo e l'infiammazione attraverso le vie di segnalazione IL-17, HIF-1 eTNF 13. Studi clinici hanno inoltre dimostrato che i pazienti sottoposti al trattamento XBJ hanno mostrato tassi di mortalità ridotti, ricoveri in terapia intensiva più brevi e livelli più bassi di citochineinfiammatorie 14. Durante la pandemia di COVID-19, un'eccessiva attivazione immunitaria innescata da risposte infiammatorie gravi è emersa come fattore critico nei casigravi 15,16. Inoltre, alcuni componenti della MTC possiedono proprietà antiossidanti, che permettono loro di assorbire radicali liberi e attenuare i danni polmonari indotti dallo stress ossidativo. L'ARDS è spesso accompagnato da disfunzione microcircolatoria polmonare, che compromette lo scambio gassoso. Alcune formulazioni della MTC mostrano effetti attivatori del sangue e di risoluzione della stasi, migliorando la microcircolazione per mitigare l'edema polmonare e migliorare l'ossigenazione. Inoltre, la MTC può mitigare il danno polmonare regolando le vie della mortecellulare 12,17,18. Collettivamente, questi risultati sottolineano il notevole potenziale clinico della MTC nel trattamento dell'ARDS.

Il Decotto Dachengqi (DCQD), una formula essenziale nella MTC per condizioni acute, è composto da quattro componenti erboristici: rabarbaro, mirabilite, corteccia di magnolia e arancia amaraimmatura 19. Come formulazione composta, la DCQD presenta interazioni multi-componente e multi-bersaglio, inibendo efficacemente la produzione di vari mediatori infiammatori e specie reattive dell'ossigeno, tra cui fattore di necrosi tumorale alfa (TNF-α) e interleucina-6 (IL-6)20,21. Il gruppo ad alta mobilità box 1 (HMGB1), un profondo mediatore infiammatorio, svolge un ruolo fondamentale nella patogenesi e nella progressione della sepsi. Il recettore tipo Toll 4 (TLR4), un recettore espresso sulle cellule immunitarie, attiva le vie infiammatorie di segnalazione a valle, come il fattore nucleare-kappa B (NF-κB) e la proteina chinasi attivata dal mitogeno (MAPK), quando si lega a HMGB1, portando a un aumento del rilascio di citochine infiammatorie. La DCQD esercita effetti terapeutici modulando l'asse di segnalazione HMGB1-TLR4, sopprimendo così l'attivazione di NF-κB e p38 MAPK, riducendo la produzione di citochine infiammatorie e mitigando l'infiammazionesistemica 22,23. Inoltre, i costituenti della DCQD esercitano effetti terapeutici modulando le vie di segnalazione pro-infiammatorie, lo stress ossidativo, l'apoptosi e la piroptosi 24,25,26,27. La DCQD svolge anche un ruolo fondamentale nel trattamento dell'ARDS attenuando le risposte iperinfiammatorie indotte da lipopolisaccaridi (LPS) e i danni epiteliali polmonari. Meccanicamente, sopprime l'assemblaggio della proteina chinasi 1 (RIPK1)-PANoptosoma (RIPK1) che interagisce con la proteina che si lega al DNA 1 (ZBP1) (si riferisce al processo di formazione di un complesso multiproteico che può scatenare la morte infiammatoria delle cellule), mitigando così la PANoptosi28 indotta da LPS. La somministrazione terapeutica orale di DCQD aumenta l'espressione delle proteine acquaporina-1 (AQP-1) e acquaporina-5 (AQP-5) nei tessuti polmonari, inibendo al contempo la via di segnalazione TLR4/NF-κB e la produzione di citochine infiammatorie, migliorando infine l'infiammazione associata all'ARDS.

La complessa composizione della MTC, caratterizzata dagli effetti sinergici di molteplici composti, presenta sia vantaggi che sfide nel chiarire i suoi meccanismi farmacologici. Diversi componenti della MTC possono esercitare effetti terapeutici attraverso bersagli molecolari e vie molecolari distinti, mentre le potenziali interazioni tra questi componenti complicano ulteriormente la comprensione completa dei loro meccanismiintegrati 29,30. In particolare, i fitochimici coinvolti nel trattamento dell'ARDS e le loro vie meccanicistiche rimangono sfuggenti. Per colmare queste lacune di conoscenza, la bioinformatica, un campo interdisciplinare emergente che integra analisi dei big data e intelligenza artificiale, offre potenzialità per identificare gli ingredienti farmaceutici attivi e decifrare i meccanismi farmacologicisottostanti 31,32,33. Di conseguenza, questo studio utilizza approcci bioinformatici, inclusa la farmacologia di rete e il docking molecolare, per identificare sistematicamente i fitochimici essenziali, i bersagli molecolari e le vie alla base degli effetti terapeutici della DCQD nel trattamento dell'ARDS.

Sulla base della motivazione sopra, ipotizziamo che la DCQD eserciti effetti terapeutici sull'ARDS modulando sinergicamente processi patologici chiave, inclusa la disregolazione infiammatoria e l'attivazione delle cellule immunitarie, attraverso la sua rete multicomponente. Per testare questa ipotesi e andare oltre i limiti della tradizionale previsione dei bersagli, abbiamo adottato un approccio integrato di bioinformatica. L'innovazione chiave di questa strategia risiede nell'intersezione dei potenziali bersagli della DCQD con geni correlati all'ARDS derivati non solo da database pubblici ma, cosa più importante, dal dataset trascrittomico clinico (GSE32707) dei pazienti con ARDS indotto da sepsi. Questo screening a tre livelli mira a migliorare la rilevanza clinica dei nostri risultati e a identificare i geni e le vie hub fondamentali attraverso cui la DCQD può migliorare ARDS, fornendo così un quadro teorico più preciso e affidabile per il suo meccanismo d'azione.

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Protocollo

Tutti i materiali, inclusi database, software e reagenti sperimentali, utilizzati in questo studio sono elencati nella Tabella dei Materiali. Tutte le procedure sperimentali sono state approvate dal Comitato Etico Animale dell'Ospedale del Lago Suzhou Dushu (numero di permesso: 2410008).

Screening dei componenti attivi e acquisizione del bersaglio del DCQD
I componenti attivi delle erbe costituenti rabarbaro, mirabilite, corteccia di magnolia e arancia amara immatura nella Decocción Da-Cheng-Qi (DCQD) sono stati selezionati dal database della farmacologia dei sistemi di medicina tradizionale cinese (TCMSP) utilizzando i seguenti criteri: biodisponibilità orale (OB) ≥30% e somiglianza farmaco-farmaco (DL) ≥0,18. I corrispondenti bersagli dei componenti attivi identificati sono stati quindi raccolti. Queste soglie sono ampiamente adottate negli studi di farmacologia di rete per filtrare composti con proprietà farmacocinetiche favorevoli e un maggiore potenziale di essere molecole simili a un farmaco34,35. Per migliorare l'affidabilità della selezione dei composti e ridurre il bias derivante dallo screening a singolo database, è stata effettuata la validazione incrociata utilizzando il database BATMAN-TCM. BATMAN-TCM è un database integrativo che memorizza interazioni note e previste tra ingredienti della MTC e proteine bersaglio, aiutando nell'esplorazione dei meccanismi farmacologici della MTC e nella scoperta di farmaci. La versione aggiornata 2.0 offre un dataset TTI significativamente ampliato e funzionalità migliorate, rendendola una risorsa preziosa per comprendere i meccanismi molecolari della MTC e sviluppare nuovi trattamenti per malattie complesse. I composti senza bersagli previsti o con punteggi BATMAN-TCM inferiori a 20 sono stati esclusi. Inoltre, composti con valori OB relativamente bassi ma con bersagli previsti in BATMAN-TCM e attività farmacologiche ben documentate (ad esempio, antracinoni e flavonoidi) sono stati mantenuti tramite la selezione della letteratura. Per ridurre ulteriormente i potenziali componenti falsi positivi, ormoni endogeni e sostanze simili a neurotrasmettitori (ad esempio, progesterone e serotonina) sono stati esclusi manualmente. Il set composto finale veniva utilizzato per la successiva previsione dei bersagli e la costruzione della rete. Il flusso di lavoro dettagliato è illustrato nella Figura Supplementare 1. L'elenco finale dei componenti attivi è fornito nella Tabella Supplementare 1.

Gli identificatori SMILES (un metodo di notazione lineare che utilizza stringhe ASCII per descrivere la struttura chimica delle molecole. Utilizzando simboli e regole specifiche, codifica atomi, legami chimici e topologia molecolare in una stringa continua di caratteri senza spazi, permettendo una memorizzazione concisa, inequivocabile e leggibile al computer di informazioni molecolari di ogni componente attivo dal database PubChem e i potenziali target venivano previsti utilizzando la previsione svizzera dei bersagli, impostando il parametro dell'organismo su 'Homo sapiens' e applicando un cutoff di punteggio di probabilità di >0. I set target ottenuti da entrambi i database sono stati uniti e le voci duplicate sono state rimosse per generare il set target candidato finale per DCQD.

È importante notare che Mirabilitum (Mangxiao, Na₂SO₄·10H₂O), un farmaco minerale nel DCQD, non è incluso nel TCMSP o nei database composti-target simili. Di conseguenza, a causa di questa limitazione del database, la rete componente-bersaglio costruita in questo studio non comprende i potenziali contributi di Mirabilitum. La rete si basa quindi sui costituenti fitochimici degli altri tre componenti erboristici: Rheum palmatum, Magnolia officinalis e Citrus aurantium.

Analisi dell'arricchimento dei target DCQD
I bersagli DCQD sono stati importati nel database metascape per l'analisi di arricchimento, con la specie limitata a "Homo sapiens". Sono state effettuate analisi di arricchimento dell'ontologia genica (GO) e della Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG), con le prime che comprendevano processi biologici (BP), componenti cellulari (CC) e funzioni molecolari (MF). Sono stati selezionati i primi 6 risultati di arricchimento GO e i primi 20 risultati di arricchimento KEGG. I grafici a barre KEGG e GO sono stati generati utilizzando lo strumento online di bioinformatica. I dati venivano importati tramite il pacchetto DOSE in R per costruire il grafico a barre dell'ontologia della malattia (DO).

Costruzione della rete "Erboristica-Componenti-Bersaglio"
I componenti rilevanti di DCQD e i loro corrispondenti target sono stati importati in Cytoscape 3.10.3 per costruire un diagramma di rete che illustrasse le relazioni "medicina erboristica-componente-bersaglio". Il plugin CytoNCA è stato utilizzato per calcolare i valori dei Degree, e i primi 5 componenti attivi sono stati selezionati in base al ranking.

Recupero di target ARDS da database pubblici
Utilizzando "sindrome da difficoltà respiratoria acuta" come parola chiave, i bersagli correlati all'ARDS sono stati recuperati dai database OMIM e GeneCards. Nelle Gene Card, venivano selezionati bersagli con un punteggio di rilevanza >5. Dopo la fusione e la rimozione dei duplicati da entrambi i database, è stato ottenuto un set di target candidato per ARDS.

Analisi bioinformatica
Il dataset correlato a sepsi-ARDS GSE32707 (piattaforma GPL570, n = 45), che comprende dati RNA-seq da cellule mononucleari del sangue periferico di 30 pazienti con ARDS indotti da sepsi e 15 controlli sani, è stato scaricato dal database GEO NCBI. I dati venivano importati utilizzando il pacchetto GEOquery in R, e la normalizzazione veniva eseguita usando il pacchetto limma per minimizzare la variabilità tra campioni. I geni espressi differenzialmente (DEG) sono stati identificati utilizzando le soglie |log 2FC| > 1 e p < 0,05. La visualizzazione è stata condotta tramite grafici vulcanici e heatmap. Sono state effettuate analisi di arricchimento GO e KEGG per l'analisi dei percorsi, con i risultati presentati come bubble plot e bar plot.

Previsione dei potenziali target per DCQD nel trattamento ARDS
Un diagramma di Venn è stato generato utilizzando lo strumento bioinformatica online per confrontare i DEG, i target correlati all'ARDS dai database pubblici e i target dei farmaci DCQD, identificando così potenziali target terapeutici della DCQD per ARDS.

Costruzione della rete di interazione proteina-proteina (PPI) e screening dei target principali
I bersagli sovrapposti sono stati importati nel database STRING con la specie impostata su "Homo sapiens" e una soglia di punteggio di interazione di 0,4. I dati della rete PPI sono stati esportati in formato TSV e visualizzati utilizzando Cytoscape 3.10.3. Il plugin CytoHubba è stato applicato per selezionare i primi 10 obiettivi basandosi su MCC, MNC, grado, EPC, intermedio, vicinanza, radialità e punteggi di stress. L'intersezione di questi obiettivi ha prodotto 5 obiettivi principali.

Costruzione della rete "Medicina-Erboristica-Componente-Target-Malattia"
Sulla base dei bersagli sovrapposti, sono stati identificati i corrispondenti componenti DCQD. I componenti rilevanti, insieme ai loro target associati e ai collegamenti con la malattia, sono stati importati in Cytoscape 3.10.3 per costruire un diagramma di rete che illustrasse le relazioni "medicina erboristica-componente-bersaglio-malattia".

Analisi dell'arricchimento dei target principali e costruzione della rete "componente di medicina erboristica-bersaglio-percorso malattia"
Per esplorare le potenziali funzioni biologiche e le vie chiave di segnalazione della DCQD nel trattamento ARDS, i bersagli principali sono stati sottoposti ad analisi di arricchimento GO e KEGG in Metascape (specie: "Homo sapiens"). Sono stati selezionati i primi 10 risultati di arricchimento GO e i primi 13 dei risultati di arricchimento KEGG. La visualizzazione è stata effettuata utilizzando strumenti bioinformatici per generare grafici a bolle KEGG, grafici a barra GO e grafici a bolle Sankey. Inoltre, sulla base dei risultati dell'arricchimento funzionale, è stato costruito un diagramma di rete in Cytoscape 3.10.3 per illustrare le relazioni "componente di medicina erboristica-bersaglio-percorso malattia".

Aggancio molecolare e visualizzazione
Le strutture molecolari secondarie dei composti sono state recuperate dal database PubChem, mentre le strutture 3D dei target principali sono state ottenute dal database PDB (http://www.rcsb.org/). Le molecole d'acqua e i residui di amminoacidi sono stati rimossi utilizzando PyMOL. Proteine e composti bersaglio venivano importati in AutoDock per il docking molecolare e calcolare le energie di legame. La visualizzazione è stata effettuata utilizzando PyMOL. Una heatmap dell'energia di legame è stata generata utilizzando il pacchetto pheatmap in R, con obiettivi centrali sull'asse x, composti sull'asse y e un gradiente di colore che rappresenta le energie di legame. Diagrammi di interazione bidimensionali dei risultati dell'attracco sono stati generati utilizzando Discovery Studio Visualizer 4.5. Il docking molecolare è stato eseguito per valutare la fattibilità del legame tra composti e bersagli, piuttosto che per prevedere l'effettiva efficacia inibitoria.

Costruzione del modello topino ARDS
Questo studio è stato approvato dal comitato etico medico dell'Ospedale Suzhou Dushu Lake (2410008). Sono stati raccolti maschi sani di topi C57BL/6J (n = 30; 20 ± 5 g). I topi sono stati divisi in un gruppo di controllo (n = 10), un gruppo LPS (n = 10, LPS 10 mg/kg) e un gruppo DCQD (n = 10, ricevendo DCQD 0,9 g/kg tramite gavage orale combinato con LPS 10 mg/kg). I topi del gruppo LPS hanno ricevuto un'iniezione intraperitoneale di LPS. I topi del gruppo DCQD sono stati somministrati DCQD 0,9 g/kg tramite gavage orale immediatamente dopo l'iniezione intraperitoneale di LPS. Le misurazioni sono state effettuate immediatamente prima e dopo l'estrazione polmonare su tutti i topi. Successivamente, i tessuti polmonari venivano conservati a -80 °C.

Analisi del Western blot (WB)
Le proteine sono state isolate da lisati di tessuto polmonare di topo e le loro concentrazioni sono state misurate utilizzando un kit di quantificazione delle proteine BCA. Successivamente, le proteine sono state denaturate bollendo a 95 °C per 10 minuti. Le proteine denaturate sono state separate su un gel SDS-PAGE al 10% preparato con un kit di preparazione del gel, poi trasferite in una membrana PVDF. Per prevenire il legame aspecifico, le membrane PVDF sono state bloccate a temperatura ambiente per 5 minuti utilizzando un tampone rapido senza proteine. Dopo il lavaggio con PBST, le membrane sono state incubate durante la notte a 4 °C con anticorpi primari contro MMP9, HSP90, MYC e ARG1. Dopo un altro lavaggio con PBST, le membrane sono state incubate per 2 ore a temperatura ambiente con IgG(H+L) anticoniglio di capra coniugato con HRP. Infine, è stato applicato il substrato del kit di rilevamento chemiluminescenza ultra-sensibile e le bande proteiche chemiluminescenti sono state rilevate utilizzando un sistema di imaging chemiluminescente BIO-RAD. L'analisi in scala di grigi è stata effettuata con ImageJ. Gli anticorpi utilizzati in questo esperimento sono elencati nella Tabella Supplementare 2.

Analisi del saggio immunosorbente legato agli enzimi (ELISA)
Per prima cosa, il liquido di lavaggio broncoalveolare (BALF) è stato raccolto eseguendo tre lavaggi con 2 mL di soluzione salina. I fluidi di lavaggio risultanti sono stati raccolti e centrifugati a 10.000 g per 10 minuti per rimuovere le celle. Il soprantantante veniva poi aspirato e conservato congelato in azoto liquido. Successivamente, le concentrazioni delle citochine target sono state determinate seguendo le istruzioni del produttore utilizzando il kit Mouse IL-6 ELISA, il kit IL-18 ELISA del mouse e il kit TNF-alpha ELISA del tomo. Successivamente, la piastra di reazione veniva posta in un lettore di micropiastre e il valore di densità ottica (OD) di ciascun pozzo veniva misurato a una lunghezza d'onda di 450 nm, con il pozzo di controllo a vuoto usato per la regolazione zero. Infine, è stata tracciata una curva standard basata sulle concentrazioni e sui corrispondenti valori OD degli standard. La concentrazione del fattore target in ciascun campione è stata calcolata secondo l'equazione della curva standard.

Analisi statistica
I dati sono stati analizzati utilizzando GraphPad Prism 10.1.2. Il significato delle differenze tra i gruppi è stato valutato statisticamente tramite analisi unidirezionale della varianza o test t di Student. Se il valore P è inferiore a 0,05, la differenza è considerata significativa; se il valore P è inferiore a 0,01, è considerato altamente significativo.

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Risultati

Analisi della bioattività del DCQD
Per districare i meccanismi molecolari alla base della bioattività della DCQD, i potenziali target sono stati identificati inizialmente tramite screening dei database svizzeri di previsione dei bersagli e TCMSP. Sono stati abbinati in totale 16 componenti provenienti da rabarbaro, 17 da arancia amara immatura e 2 da corteccia di magnolia, fornendo 614 potenziali bersagli (Figura 1A). Successivamente, è stato costruito un diagramma a rete...

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Discussione

L'ARDS si è evoluto in una malattia polmonare potenzialmente letale, imponendo un notevole carico sull'assistenza sanitaria globale, con un'incidenza annua di 1,5-79 casi ogni 100.000 individui e tassi di mortalità che variano dal 34,9% al 46,1% su livelli di gravitàvariabili 37. Nonostante i progressi nelle strategie di ventilazione meccanica, inclusa la ventilazione protettiva polmonare e la posizione prona, gli esiti clinici rimangono subottimali a causa dell'e...

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Dichiarazioni

Gli autori affermano che la ricerca è stata condotta in assenza di qualsiasi relazione commerciale o finanziaria che potesse essere interpretata come un potenziale conflitto di interessi. L'IA generativa e le tecnologie assistite dall'IA non sono state utilizzate nella preparazione di questo lavoro.

Ringraziamenti

Questo studio è stato finanziato dalla National Natural Science Foundation of China (Numero di finanziamento: 82570078).

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Anticorpo policlonale arginase-1Protein Tech Group Inc., USA16001-1-AP
AutoDockL'Istituto di Ricerca ScrippsNAhttp://autodock.scripps.edu/
database BATMAN-TCM Università di Medicina Cinese di PechinoNAhttp://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/
Kit di quantificazione della proteina BCAServicebioG2026
BioinformaticaBioinformaticaNAhttps://www.bioinformatics.com.cn/
Sistema di imaging chemiluminescenza BIO-RADThermo Fisher Scientifichttps://www.bio-rad.com/en-in/category/chemidoc-imaging-systems?ID=NINJ0Z15
Topi C57BL/6JHangzhou Ziyuan Laboratory Animal Technology Co., Ltd
anticorpo policlonale c-MYCProtein Tech Group Inc., USA10828-1-AP
CytoscapeCytoscapeVersione 3.10.3https://cytoscape.org/
DCQDIl Dipartimento di Medicina Tradizionale Cinese dell'Ospedale Suzhou Dushu Lake
Discovery Studio Visualizer ScopertaVersione 4.5
GraphPad Prism DotmaticsVersione10.1.2https://www.graphpad.com/
Anticorpo policlonale GAPDHProtein Tech Group Inc., USA10494-1-AP
Kit di preparazione gelServicebioG2003
GeneCards  DatabaseCentro genoma umano coronaNAhttps://previous.genecards.org/
Database GEOCentro Nazionale per l'Informazione Biotecnologica (NCBI)GSE32707 (piattaforma GPL570, n=45)
Affinipure goat anti-coniglio IgG(H+L) coniugato con HRPProtein Tech Group Inc., USASA00001-2
Anticorpo policlonale HSP90Protein Tech Group Inc., USA13171-1-AP
Lipopolisaccaridi (LPS)SolarbioL8880
Database MetascapeNIHNAhttps://metascape.org/gp/index
Lettore di microplaccheBioTeKhttps://www.agilent.com/en/product/cell-analysis/microplate-readers?srs
ltid=AfmBOoqJhJhNJW6vNU
fnskFb9jjcTgXww1A1km-JVP
P1SScq1Mx78HBi
Anticorpo policlonale MMP-9 (N-terminale)Protein Tech Group Inc., USA10375-2-AP
Mouse IL-18 ELISA KitServicebioGEH0010
Mouse IL-6 ELISA KitServicebioGEM0001
Mouse TNF-alpha ELISA KitServicebioGEH0004
Database OMIMUniversità Johns HopkinsNAhttps://www.omim.org/
Omni-ECL e commercio; Kit di rilevamento della chemiluminescenza ultra-sensibileEpizyme BiotechSQ201
Database PDBRCSBNAhttp://www.rcsb.org/
Buffer di blocco rapido senza proteineEpizyme BiotechG2052
Database PubChemCentro Nazionale per l'Informazione Biotecnologica (NCBI)https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
Membrana PVDFMerckNA
PyMOLSchrödingerVersione 3.10.3
Database STRINGCoalizione globale di biodati ed ElisirNAhttps://cn.string-db.org/
Database svizzero di previsione degli obiettiviIstituto Svizzero di BioinformaticaNAhttp://www.swisstargetprediction.cn/
Database dei Sistemi di Farmacologia della Medicina Tradizionale Cinese (TCMSP)Università Politecnica del Nord-OvestVersione 2.3https://www.tcmsp-e.com/

Riferimenti

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