Name: Campionamento di acqua di mare e di raccolta (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-06-17T19:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 23 s
Description: Scopri le tecniche di campionamento dell'acqua marina per analisi biologiche, chimiche e fisiche utilizzando dispositivi go flow e kin. Questo metodo consente di studiare i parametri oceanografici degli ecosistemi marini.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Vorremmo ringraziare la Fondazione canadese per l&#39;innovazione, la British Columbia Fondo di conoscenza per lo sviluppo e la Nazionale di Scienze e Ingegneria Research Council (NSERC) del Canada per sostenere gli studi in corso sulle regioni di scarsità di ossigeno delle acque costiere oceaniche e aperto. Inoltre, DAW è stata sostenuta da borse di studio da NSERC, Killam e la fondazione TULA Centro finanziato per la diversità microbica e Evolution.

Parte 1: raccolta delle acque <ol><li> Fondali sono assegnati ad ogni cast. </li><li> Profondità da campionare e il volume totale da raccogliere per il cast di corrente sono determinati. </li><li> E &#39;garantito che il Go-Flo e bottiglie Niskin sono aperti e che le valvole ei rubinetti sono chiusi. </li><li> Il CTD viene caricato sul fondo della linea e inferiore in acqua. </li><li> Una bottiglia per la profondità campionate nel primo cast viene caricato sulla linea dopo il CTD, ma è garantito che la linea sia inserito correttamente nel supporto e le viti sono serrate. </li><li> Un messaggero è allegato ad ogni bottiglia (se non il più profondo) prima di abbassare. </li><li> La linea si abbassa la distanza tra la profondità prima e la successiva; un&#39;altra bottiglia viene poi caricata. Va notato che per profondità, dove sono raccolti 20L per la filtrazione, per un totale di 2 bottiglie 12L sono caricati consecutivamente circa 0,75 m di distanza. </li><li> Una volta che tutte le bottiglie sono in linea, la linea si abbassa fino alla profondità desiderata e 2 minuti sono autorizzati a passare. </li><li> Un messaggero viene inviato verso il basso e pochi minuti sono autorizzati a passare per assicurare che tutti i vicini bottiglie. </li><li> La linea è annaspato e le bottiglie vengono scaricati via via emergenti sul rack. </li><li> Per profondità che richiedono campioni 20L per DNA e RNA, due bottiglie Niskin vengono raccolti. Una bottiglia è usato per esempio i parametri chimici (vedi sotto), mentre l&#39;altra è prosciugato in damigiana. RNA è raccolto immediatamente dal Niskin secondo. Il resto del primo è anche drenato in damigiana per dare ~ volume di 20L finale. Per bassa risoluzione campioni solo 1L di acqua viene messa da parte per la filtrazione sterile in bottiglie Nalgene. </li></ol> Parte 2: raccolta dei campioni di gas <ol><li> Se i campioni di ossigeno sono necessari, sono raccolti per primo. </li><li> Un pezzo di tubo sottile è collegato al Niskin / Go-Flo rubinetto e l&#39;altra estremità del tubo è posizionato posto in bottiglie di siero del vetro. </li><li> La bottiglia siero è risciacquata con acqua 3 volte campione, e riempito fino a traboccare in modo che non siano presenti bolle d&#39;aria. </li><li> 50μl di cloruro di mercurio (HgCl 2) vengono aggiunti alla bottiglia siero in un modo che non introduce bolle d&#39;aria nel campione. </li><li> La bottiglia è sigillata con un tappo di gomma e crimpati con una ghiera di alluminio, e viene quindi memorizzato sul ghiaccio in un dispositivo di raffreddamento. </li></ol> Parte 3: la raccolta dei campioni di nutrienti <ol><li> Una siringa da 60 cc è risciacquata con acqua campione, un (0,2 micron) è collegato in linea e l&#39;acqua viene spinta attraverso il Acrodisc. </li><li> Una bottiglia in polietilene è risciacquata con ~ 10 ml di acqua filtrata 3 volte (agitare bottiglia quando il risciacquo). </li><li> Campione di acqua filtrata viene aggiunto alle bottiglie, circa ¾. </li><li> Il campione viene memorizzato sul ghiaccio nel radiatore. </li></ol> Parte 4: esempio di raccolta ammoniaca <ol><li> Provette vengono sciacquati con acqua campione. </li><li> Provette sono riempiti completamente con acqua campione. </li><li> 5 ml di acqua campione sono portati con l&#39;ausilio di una pipetta da 10 ml, il resto dell&#39;acqua nel tubo viene scartata e il 5 ml a la punta della pipetta sono sostituiti nella provetta del campione. </li><li> 7.5ml di reagente di ammonio di lavoro è aggiunto ad ogni provetta una volta campioni provenienti da tutte le profondità sono stati raccolti. </li></ol> Parte 5: Raccolta dei campioni per il conteggio delle cellule <ol><li> Un pre-etichettati tubo Falcon da 50 ml contenente 5,4 ml di formaldeide al 37% è riempito in cima per una concentrazione finale del 4%. Si fa attenzione a non rovesciare. </li></ol> Parte 6: Raccolta dei campioni per le misurazioni di idrogeno solforato <ol><li> Un pre-etichettati tubo Falcon da 50 ml contiene acetato di zinco 20% (Zn (O 2 CCH 3) 2) si riempie verso l&#39;alto. Si fa attenzione a non rovesciare. </li></ol> Parte 7: raccolta di piccolo volume per la concentrazione della biomassa <ol><li> Bottiglie da 1 litro sono riempiti fino alla cima. </li></ol> Parte 8: raccolta di grande volume per la concentrazione della biomassa <ol><li> Damigiane da 20 litri sono pieni. </li></ol> Parte 9: Risultati Rappresentante Il risultato finale di campionamento di acqua di mare si traduce in circa 12 campioni di ossigeno disciolto, 32-48 campioni di gas, 16 campioni di nutrienti, 32 campioni di ammonio, acido solfidrico 16 campioni, 16 campioni per la conta delle cellule, 6 damigiane da 20 litri, 16 bottiglie da 1 litro e 4 Sterivex 0.22μm filtri contenenti biomassa microbica conservato con RNA più tardi.

<ol><li>Cline, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spectrophotometric+determination+of+hydrogen+sulfide+in+natural+waters%5BTitle%5D)+AND+%22Limnology+%26+Oceanography%22%5BJournal%5D)">Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters.</a> Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).</li>
<li>Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+precise+method+for+measuring+ammonium+in+marine+and+freshwater+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+fisheries+and+Aquatic+Science%22%5BJournal%5D)">A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems.</a> Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).</li>
</ol>

Gli autori non hanno nulla da dichiarare.

In generale, c&#39;è una grande quantità di preparazione e di pianificazione necessari per questo tipo di campionamento, in modo bilancio 2 giorni prima del viaggio per ottenere le cose in ordine e un giorno dopo, per la pulizia di tutto. In generale, non lasciare che l&#39;acqua salata entrare in contatto con la pompa peristaltica o nel box in alluminio Zarges usato per trasportare l&#39;attrezzatura campo. Trattare l&#39;apparecchio con rispetto e che si esibirà anche per lungo tempo a venire.

<table><tbody><tr><td>Carboy da 20 L</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>02-960-15</td><td></td></tr><tr><td>Tubazione Tygon da 3/8&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-36</td><td></td></tr><tr><td>Filtri Sterivex</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>SVG010RS</td><td></td></tr><tr><td>Unità alloggiamento prefiltro</td><td></td><td>AMD</td><td>501200</td><td></td></tr><tr><td>Connettore Luer</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>31507-27</td><td></td></tr><tr><td>Tubazione Tygon da 1/4&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Tubazione Tygon da 1/4&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Tubazione Tygon da 1/4&quot;</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Provette di plastica da 50 ml</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Flaconi in vetro per sieri</td><td></td><td></td><td></td><td>Raccolta campioni in vetro</td></tr><tr><td>Setti e tappi in alluminio per flaconi in vetro per sieri</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pinzatrice manuale</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pipetta e punte da 20-200 µl</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Provette in vetro</td><td></td><td></td><td></td><td>Raccolta campioni di ammonio</td></tr><tr><td>Flaconi di plastica da 30 ml</td><td></td><td></td><td></td><td>Raccolta nutrienti</td></tr><tr><td>Filtri Acrodisc</td><td></td><td>EMD Millipore</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Provette da 5 ml</td><td></td><td></td><td></td><td>Raccolta campioni di nitrito</td></tr><tr><td>Formaldeide al 37%</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td>Per campioni di conteggio cellulare</td></tr><tr><td>Acetato di zinco al 20%</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td>Per campioni di solfuro</td></tr><tr><td>Cloruro mercurico</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td>Per campioni gassosi</td></tr><tr><td>Acqua milliQ</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Reagente di lavoro per ammonio</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td>Tampone borato, solfito di sodio, ortoftalaldeide</td></tr><tr><td>Sulfanilamide</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td>5 g in 450 ml di acqua e 50 ml di HCl</td></tr><tr><td>Soluzione di N-(1-naftil)-etilendiammina diidrocloruro</td><td>Reagente</td><td></td><td></td><td>0,5 g in 500 ml di acqua</td></tr></tbody></table>

campionamento di acqua di mare e di raccolta

Seawater Sampling and Collection

Questo video documenta i metodi per la raccolta di campioni di acqua marina costiera e il loro trattamento per varie applicazioni a valle compresa la concentrazione della biomassa, purificazione degli acidi nucleici, l&#39;abbondanza delle cellule, nutriente e analisi gas tracciante. Per i campioni manifestazione di oggi sono stati raccolti dal ponte della HMS operativo John Strickland a Inlet Saanich. Un A-frame Derrick, con un multi-purpose verricello e sistema di cavi, viene usato in combinazione con Niskin o Go-Flo bottiglie di campionamento delle acque. Conducibilità, temperatura e profondità (CTD) sensori sono utilizzati anche per esempio la massa d&#39;acqua sottostante. Per ridurre al minimo degassamento, campioni di gas traccia sono raccolti per primo. Poi, i nutrienti, chimica dell&#39;acqua, e conta delle cellule sono determinate. Infine, le acque sono raccolte per la filtrazione delle biomasse. Il set-up e tempi di raccolta per un singolo getto è ~ 1,5 ore ad una profondità massima di 215 metri. Pertanto, per un totale di 6 ore è generalmente necessario a completare la serie di raccolta qui descritto.

Questo video documenta i metodi per la raccolta di campioni di acqua marina costiera e il loro trattamento per varie applicazioni a valle compresa la concentrazione della biomassa, purificazione degli acidi nucleici, l&#39;abbondanza delle cellule, nutriente e analisi gas tracciante.

Campionamento di acqua di mare e di raccolta

Questo video documenta i metodi per la raccolta di campioni di acqua marina costiera e la loro elaborazione per diverse applicazioni a valle, tra cui la biomassa...

Ciao, sono Elena Kova del Laboratorio di Stephen Hallam del Dipartimento di Microbiologia e Immunologia dell'Università della British Columbia. Oggi vi mostreremo una procedura per il campionamento dell'acqua di mare destinata ad analisi fisiche, chimiche e biologiche. Utilizziamo questa procedura nel nostro laboratorio per studiare i parametri oceanografici delle acque marine.Iniziamo. Prima di tutto, si assegna il numero di calate e le profondità per ciascuna calata, quindi si determinano le profondità da campionare e il volume totale da raccogliere per la calata corrente. Assicurarsi che i dispositivi di campionamento per il flusso in entrata e per l'acqua di chiesuola siano in posizione aperta e che tutte le valvole e i rubinetti siano chiusi.Collegare il CTD alla base della fune e calarlo in acqua fino alla profondità massima del profilo. Posizionare immediatamente dopo il CTD un dispositivo di campionamento sulla fune. Assicurarsi che la fune sia correttamente inserita nel supporto del dispositivo e che le viti siano ben serrate.Collegare un messaggero pesato a ciascun dispositivo, ad eccezione di quello relativo alla profondità di campionamento più profonda, prima di calarlo

Research

Ricerca

JoVE Journal

Biology

Biologia

Questo volume video di documenti di grandi dimensioni (≥ 20 L) filtrazione di biomassa microbica, compresa tra 0.22μm e 2.7μm di diametro, dalla colonna d'acqua.

Volume di grandi dimensioni (20L +) Filtrazione di campioni d&#39;acqua di mare costiero

Questo volume video di documenti di piccole dimensioni (~ 1 L) filtrazione di biomassa microbica dalla colonna d'acqua.

Volume piccoli (1-3L) Filtrazione di campioni d&#39;acqua di mare costiero

Fonte: Villela, H. D. M. , et al. Prospezione di ceppi microbici per la biorimediazione e lo sviluppo di probiotici per la ricerca e la conservazione dei metaorganismi. J. Vis. Esp. (2019)Questo video dimostra l'isolamento selettivo dei batteri marini degradanti del petrolio arricchendo campioni di acqua di mare su mezzi a base di petrolio, permettendo il recupero di ceppi puri con potenziali applicazioni nella biorimediazione del petrolio greggio e nella pulizia ambientale.

Arricchimento selettivo e isolamento di batteri marini degradanti del petrolio da campioni di acqua di mare

Qui, presentiamo un protocollo completo per valutare la disponibilità di nutrienti organici e inorganici e l'abbondanza e la struttura delle comunità microbiche e virali in ambienti marini remoti.

Svelare i giocatori invisibili del Mare - Una guida del campo di Acqua Chimica e microbiologia marina

È necessaria un'attenzione particolare utilizzando "tecniche pulite" per raccogliere ed elaborare correttamente campioni d'acqua per studi di metalli in tracce in ambienti acquatici. Viene presentato un protocollo per il campionamento, l'elaborazione e le procedure analitiche con l'obiettivo di ottenere dati di monitoraggio ambientale affidabili e risultati con elevata sensibilità per studi dettagliati sui metalli in tracce.

Pulire campionamento e analisi del fiume e di estuario Acque per Trace Studi di metallo

Qui, presentiamo piccole incubazioni di nuclei per la misura dello scambio di sedimenti-acqua, gas e soluti. Questi forniranno misurazioni affidabili dello scambio sedimento-acqua che valutano il ruolo dei sedimenti nell'influenzare i processi biologici e biogeochimici negli ecosistemi acquatici.

La Borsa bentonici di O<sub&gt; 2</sub&gt;, N<sub&gt; 2</sub&gt; e nutrienti disciolti Utilizzo piccolo nucleo Incubazioni

Plancton e particelle in sospensione giocano un ruolo importante nei cicli biogeochimici nell'oceano. Qui, forniamo un metodo ultra-pulito, basso sforzo per la raccolta di varie dimensioni delle particelle e plancton in mare con la capacità di gestire grandi volumi di acqua di mare.

Un apparato multistrato ultra-pulito per la raccolta di plancton marino dimensioni frazionato e particelle in sospensione

Maggior parte della ricerca microplastic fino ad oggi si è verificato nei sistemi marini dove sono relativamente bassi livelli di solidi sospesi. Attenzione si sta ora spostando ai sistemi d'acqua dolce, che possono caratterizzato da carichi di alta sedimenti e detriti galleggianti. Questo protocollo risolve raccogliendo ed analizzando campioni di microplastic provenienti dagli ambienti acquatici che contengono carichi elevati di solidi sospesi.

Campionamento, ordinamento e caratterizzando microplastiche negli ambienti acquatici con carichi di materiale solido in sospensione alta e grandi detriti galleggianti

Qui, presentiamo un nuovo protocollo per recuperare l'eDNA marino attraverso la raccolta e la filtrazione di campioni di acqua di mare da traghetti operativi e altre navi commerciali.

Il laboratorio galleggiante: procedura operativa standard per la raccolta e il filtraggio di campioni di acqua di mare dai traghetti operativi per l'analisi del DNA ambientale

Qui, descriviamo i metodi di campionamento dalle zone eufotiche degli ecosistemi marini e d'acqua dolce per isolare i cianofagi (e i loro ospiti) e i processi post-campionamento che arricchiscono i singoli genotipi e caratterizzano le dinamiche di interazione virus-ospite.

Campionamento ambientale di microbi fotosintetici e dei loro virus: dal campo al laboratorio

Questo protocollo descrive un flusso di lavoro standardizzato per la raccolta di campioni di DNA ambientale dei cetacei (eDNA) da navi per l'osservazione delle balene. La fattibilità per ricercatori e scienziati cittadini formati è prioritaria, mentre le condizioni ambientali, i tempi di filtrazione, la torbidità e la logistica a bordo definiscono i limiti pratici della sua applicazione.

Campionamento del DNA ambientale da navi per l'osservazione delle balene per il monitoraggio dei cetacei

Scopri le tecniche di campionamento dell'acqua marina per analisi biologiche, chimiche e fisiche utilizzando dispositivi go flow e kin. Questo metodo consente di studiare i parametri oceanografici degli ecosistemi marini.

Campionamento di acqua di mare e di raccolta

Esplora altri video