26 aprile 2010
Vi presentiamo un protocollo per la piegatura di cellule batteriche filamentose attaccato ad una copertura antiscivolo della superficie di un dispositivo ottico per misurare la rigidità cellulare flessione.
Al fine di determinare la rigidità alla flessione delle singole cellule coli, in primo luogo, far crescere i batteri in fase esponenziale e poi attaccarli a una superficie di vetrino coprioggetti trattata chimicamente. Lascia che le cellule già attaccate alla superficie crescano ulteriormente in modo che sviluppino estremità flessibili. Quindi fluire in perline dielettriche, intrappolare una perlina e piegarla alla punta flessibile di una cella.
La fase finale della procedura consiste nel piegare la cella con la trappola ottica e misurare i dati di spostamento forzato risultanti. La rigidezza flessionale della cella può essere calcolata mediante un adattamento lineare ai dati di spostamento forzato. Ciao, sono Steven Wong del laboratorio del professor Joshua Shere presso il Louis Sickler Institute of Integrative Genomics e il Dipartimento di Fisica dell'Università di Princeton.
Oggi vi mostreremo una procedura di piegatura delle singole cellule ecologiche e la rigidità delle celle coniugali. Utilizziamo questa procedura nel nostro laboratorio per studiare i contributi di diverse strutture intracellulari all'integrità meccanica delle cellule batteriche. Quindi iniziamo.
Per iniziare questa procedura, coltivare tre millilitri di qualsiasi cellula di e coli in LB da medio a esponenziale. Una volta che le cellule raggiungono una densità ottica a 600 nanometri compresa tra 0,2 e 0,4, integrare la coltura con 50 microgrammi per millilitro di cefalexina per 15 minuti per indurre la crescita filamentosa. Durante questi 15 minuti, creare una camera di flusso.
Attacca due pezzi di nastro biadesivo con uno spazio di tre millimetri tra i pezzi a un vetrino e fissa un vetrino coprioggetti sopra. Lo spazio tra i pezzi di nastro crea un canale per il flusso del liquido. Rivestire il vetrino coprioggetto con PEI facendo scorrere 10 microlitri di polietalina all'1% diluita in acqua nella camera di flusso con una micropipetta, incubare per cinque minuti.
Quindi lavare facendo scorrere 200 microlitri di acqua ad un'estremità della camera e raccogliendo all'altra estremità con un aspirapolvere. Dopo 15 minuti di crescita dei batteri in presenza di cefalexina, centrifugare un millilitro di cellule in una microcentrifuga e risospendere in 200 microlitri di LV con cefalexina. Quindi, di nuovo, utilizzare una micropipetta su un'estremità e aspirare sull'altra estremità per far fluire 50 microlitri della coltura cellulare concentrata nella camera che tiene in incubazione il vetrino coprioggetto rivestito per tre minuti.
Quindi lavare con 50 microlitri di Vel B integrato con cefalexina. Per rimuovere le cellule non attaccate, incubare la camera a 37 gradi Celsius per 30 minuti a un'ora per consentire alle cellule attaccate di crescere prima di posizionarle sullo strumento di intrappolamento ottico mentre le cellule sono in incubazione. Preparare le perle rivestite di polilisina incubando tre microlitri di perle di polistirene di diametro 0,5 micrometri in una di polilisina allo 0,1% diluita in acqua per 30 minuti.
Quando le perle hanno finito di incubare, lavarle tre volte facendole girare verso il basso in una microcentrifuga e sospendendole in un millilitro d'acqua, procedere a legare le perle ai batteri e misurare la rigidità di legame delle cellule. L'aspetto più difficile di questo protocollo è essere in grado di riconoscere, localizzare e riconoscere una buona cella per le misure di flessione, rigidità. E una buona cella è quella con un'estremità bloccata ben definita e un'estremità libera Luogo.
La camera di flusso al microscopio cerca una cellula con un'estremità bloccata ben definita. Alcune celle sono attaccate solo a una punta e la forza di flessione all'altra punta porta a un'intera cellula che ruota piuttosto che piegarsi. Per trovare una cella adatta, piega rapidamente ogni cella con la trappola utilizzando il movimento del palco controllato dal joystick.
Quando viene trovata una cellula adatta, diluire la soluzione di microsfere di un fattore due in libbre con cefalexina, aggiungere 30 microlitri di soluzione di perline alla camera di flusso pipettandola in un'estremità e facendo fuoriuscire delicatamente all'altra estremità con un panno Kim wipe, intrappolare otticamente una perlina galleggiante e toccarla con la punta libera di una cellula. Lavare nuovamente la camera con micropipetta e utilizzando un fazzoletto bianco Kim con 50 microlitri di cefalexina in LB per rimuovere le perle non attaccate. Successivamente, esegui un programma di visualizzazione lab scritto personalizzato per applicare le forze di flessione alla cella e registrare i dati sullo spostamento forzato.
Innanzitutto, calibrare la risposta del rivelatore scansionando RA il cordone attaccato all'interno del raggio laser di rilevamento e registrando i segnali di tensione PSD 3D. Quindi identificare l'asse lungo della cellula in un'immagine al microscopio. Dopo aver identificato l'asse lungo della cella, spostare la cella a passi in una direzione perpendicolare all'asse lungo mentre si sposta il record della cella, la distanza percorsa e lo spostamento del cordone dal centro della trappola ottica.
Infine, convertire i valori di spostamento in forza applicata utilizzando la rigidezza dell'intrappolamento misurata in precedenza e salvare. Lo spostamento della punta e la forza da limare qui sono dati di spostamento forzato per una singola cella. La pendenza di questa linea è la rigidità alla flessione della cella.
Ti abbiamo appena mostrato come sposare la rigidità alla flessione dell'e coli con una trappola ottica. Quando si utilizza questa procedura, è importante ricordare di trovare una buona cella con un'estremità bloccata ben definita e un'estremità libera. Quindi questo è tutto.
Grazie per aver guardato e buona fortuna con i tuoi esperimenti.
Questo articolo presenta un protocollo per la misurazione della rigidità flessionale di cellule batteriche filamentose mediante tecniche di trappolamento ottico. Il metodo prevede la coltivazione di cellule di E. coli, il loro fissaggio su un coprivetrino e l'applicazione di forze flettenti per valutarne le proprietà meccaniche.
La misurazione della rigidità delle cellule batteriche fornisce un'indicazione quantitativa dell'integrità strutturale che può supportare la validazione del bersaglio nella scoperta di agenti antimicrobici. Questo saggio biofisico consente una riduzione del rischio meccanicistica collegando perturbazioni genetiche o chimiche a fenotipi meccanici funzionali. Il metodo supporta la verifica di ipotesi in fase iniziale, in cui variazioni nella rigidità flessionale riflettono alterazioni nella biosintesi della parete cellulare o nell'organizzazione del citoscheletro.
Il saggio si inserisce nel percorso di scoperta che va dalla validazione del bersaglio all'ottimizzazione del composto leader, fornendo dati meccanici ortogonali per integrare i saggi biochimici e quelli basati sulla crescita.