$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Inizia inoculando una colonia di batteri geneticamente modificati in un mezzo liquido.
Questi batteri esprimono una proteina di fusione fluorescente nella membrana esterna, uno strato protettivo esterno.
Incubare per consentire ai batteri di rilasciare vescicole extracellulari (EV), nanostrutture legate alla membrana coinvolte nella comunicazione intercellulare, che incorporano la proteina fluorescente.
Trasferire la coltura in una bottiglia e centrifugare a bassa velocità per pellettare le cellule.
Trasferire il surnatante contenente vescicole extracellulari, proteine cellulari e detriti cellulari. Centrifugare ad alta velocità e rimuovere il surnatante contenente detriti.
Filtrare il surnatante attraverso una membrana per eliminare eventuali batteri e detriti residui.
Inoculare un campione su agar e incubarlo. La mancata formazione di colonie batteriche conferma l'assenza di batteri.
Trasferire la soluzione in un dispositivo di ultrafiltrazione con una membrana semipermeabile e centrifugare per intrappolare le vescicole extracellulari eliminando le proteine più piccole.
Raccogliere le vescicole extracellulari concentrate in una provetta per l'analisi a valle.
Inizia inoculando singole colonie di Escherichia coli in 250-1000 millilitri di Luria-Bertani, o brodo LB, utilizzando un ansa sterile. Quindi, incubare la coltura in modo aerobico in un'incubatrice vibrante a 300 rotazioni al minuto e 37 gradi Celsius. Dopo 48 ore di incubazione, chiarificare il terreno di coltura batterica trasferendo le colture cellulari in flaconi da centrifuga puliti in polipropilene da 500 millilitri per centrifugare in un rotore ad angolo fisso di grande capacità a quattro gradi Celsius e 5.000 volte G per 15 minuti.
Trasferire il surnatante nei flaconi da centrifuga puliti versandolo con cura per centrifugare a 10.000 volte G per 15 minuti. Quindi, trasferire il surnatante in un dispositivo filtrante a vuoto in polietersulfone da 0,2 micron di dimensioni adeguate e collegare il dispositivo di filtrazione a un'alimentazione a parete a vuoto. Se la velocità di filtrazione diminuisce in modo significativo, spostare il materiale non filtrato su un nuovo dispositivo.
Il mezzo filtrato può essere conservato a quattro gradi Celsius durante la notte o può essere ulteriormente lavorato immediatamente. Per verificare la completa rimozione delle cellule vitali, stendere un'aliquota del surnatante filtrato su apposite piastre di agar e garantire l'assenza di colonie dopo l'incubazione in condizioni ottimali per il ceppo batterico. Per concentrare il terreno filtrato con un volume di 100 millilitri, caricare 90 millilitri di terreno di coltura filtrato sul serbatoio del dispositivo di ultrafiltrazione centrifuga con un taglio del peso molecolare di 100 kilodalton e centrifugare il terreno nel rotore a secchio oscillante a quattro gradi Celsius e 2.000 volte G per intervalli da 15 a 30 minuti fino a quando il volume del mezzo nel serbatoio superiore è stato concentrato a meno di 0,5 millilitri.
Per rabboccare il serbatoio con il terreno di coltura filtrato rimanente, rimuovere il flusso nella parte inferiore del dispositivo per riequilibrarlo. Se la viscosità del mezzo concentrato nel serbatoio è visibilmente aumentata, diluire il terreno con PBS e riconcentrare mediante centrifugazione per ridurre eventuali vescicole non extracellulari, o proteine EV, più piccole del limite di peso molecolare di 100 kilodalton. Quindi, trasferire il terreno concentrato in una provetta a basso contenuto proteico per conservarlo a quattro gradi Celsius durante la notte.