Analisi automatizzata della distribuzione dimensionale dei frammenti basata sull'elettroforesi capillare del cfDNA: un metodo basato su microchip di DNA per studiare la distribuzione dimensionale dei frammenti di DNA isolati dai biofluidi

Una cellula morente rilascia frammenti di cfDNA libero o cfDNA all'esterno della cellula. Per analizzare la distribuzione dimensionale dei frammenti di cfDNA, iniziare con un chip di DNA multipozzetto, un sistema elettroforetico capillare in miniatura. Ogni pozzetto nel chip contiene numerosi canali di separazione microfluidica alla sua base.

Caricare la matrice di gel polisaccaridico e la miscela di colorante a fluorescenza nell'apposito pozzetto sul chip. Posizionare il truciolo sul gruppo di adescamento dotato di siringa vuota. Chiudere il gruppo di adescamento e premere lo stantuffo verso il basso per creare una pressione verso il basso. Ciò facilita l'ingresso del gel viscoso dal pozzetto nel rispettivo canale di separazione.

Aprire il gruppo e riempire i pozzetti rimanenti con una sospensione di cfDNA e una scala di DNA di dimensioni note. Montare il chip sull'analizzatore di frammenti. La forte tensione guida l'ingresso della sospensione di cfDNA dai pozzetti del campione nel canale di separazione precaricato con matrice in gel, dove il DNA viene colorato con il colorante.

Man mano che il DNA si sposta dal catodo verso l'anodo, i frammenti di DNA più piccoli migrano più velo